More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1929 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1581  polyA polymerase family protein  64.56 
 
 		 880 aa  1130    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.48144  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2246  CBS domain-containing protein  70.22 
 
 		 875 aa  1273    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1131  polynucleotide adenylyltransferase region  40.27 
 
 		 907 aa  653    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00727527  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1929  CBS domain containing protein  100 
 
 		 875 aa  1781    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1297  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  49.26 
 
 		 888 aa  861    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.795106  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1578  PolyA polymerase family protein  62.73 
 
 		 880 aa  1120    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.507141  normal  0.242793 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1972  CBS  41.73 
 
 		 898 aa  679    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.03578  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2755  CBS domain-containing protein  43.84 
 
 		 896 aa  748    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.1635  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1458  Polynucleotide adenylyltransferase region  43 
 
 		 892 aa  705    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.402567  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1346  cyclic nucleotide-binding protein  42.18 
 
 		 902 aa  716    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.761753 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0679  polynucleotide adenylyltransferase region  44.91 
 
 		 888 aa  783    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.197003  normal  0.0338911 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3306  polynucleotide adenylyltransferase region  56.15 
 
 		 881 aa  969    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102582  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0878  CBS domain containing protein  52.45 
 
 		 880 aa  921    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1433  polynucleotide adenylyltransferase region  41.56 
 
 		 904 aa  687    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.743333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2294  CBS domain containing protein  97.94 
 
 		 875 aa  1746    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1420  polyA polymerase family protein  38.17 
 
 		 880 aa  612  9.999999999999999e-175  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0185526  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1184  Polynucleotide adenylyltransferase region  39.52 
 
 		 905 aa  611  1e-173  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2087  Polynucleotide adenylyltransferase region  38.32 
 
 		 877 aa  577  1.0000000000000001e-163  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.625204 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0684  polynucleotide adenylyltransferase region  35.68 
 
 		 877 aa  566  1e-160  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1654  CBS domain containing protein  36.36 
 
 		 890 aa  545  1e-153  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.873652 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0215  CBS domain-containing protein  36.25 
 
 		 863 aa  530  1e-149  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0213  CBS domain-containing protein  36.45 
 
 		 863 aa  525  1e-147  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0891  polynucleotide adenylyltransferase region  36.92 
 
 		 883 aa  519  1e-146  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1203  CBS domain-containing protein  35.58 
 
 		 873 aa  521  1e-146  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.452152  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3428  Polynucleotide adenylyltransferase region  35.57 
 
 		 873 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000799776  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0750  CBS domain containing protein  35.94 
 
 		 867 aa  492  1e-137  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.596795  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  34.36 
 
 		 845 aa  482  1e-134  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1695  CBS domain-containing protein  33.07 
 
 		 885 aa  469  1.0000000000000001e-131  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1425  CBS domain-containing protein  32.88 
 
 		 859 aa  465  1e-129  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2388  Polynucleotide adenylyltransferase region  32.86 
 
 		 903 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.991166 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2847  polynucleotide adenylyltransferase region  33.89 
 
 		 874 aa  442  9.999999999999999e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1708  phosphoesterase, RecJ-like  32.04 
 
 		 904 aa  435  1e-120  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.833662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2466  polynucleotide adenylyltransferase region  34.08 
 
 		 872 aa  430  1e-119  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.779181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  33.76 
 
 		 769 aa  429  1e-119  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3742  Polynucleotide adenylyltransferase region  33.41 
 
 		 903 aa  422  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3792  Polynucleotide adenylyltransferase region  32.68 
 
 		 903 aa  422  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0358  CBS domain containing protein  40.07 
 
 		 1077 aa  410  1e-113  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0457131 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4294  polynucleotide adenylyltransferase region  31.77 
 
 		 907 aa  410  1e-113  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00498072  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1421  polynucleotide adenylyltransferase region  31.21 
 
 		 909 aa  407  1.0000000000000001e-112  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07150  CBS domain containing protein  31.64 
 
 		 865 aa  405  1e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0367477  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0976  CBS  31.05 
 
 		 909 aa  387  1e-106  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000281258  normal  0.107884 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2030  Polynucleotide adenylyltransferase region  30.53 
 
 		 854 aa  343  7e-93  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.609547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1481  Polynucleotide adenylyltransferase region  27.08 
 
 		 847 aa  296  8e-79  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000006237  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1441  Polynucleotide adenylyltransferase region  27.68 
 
 		 821 aa  279  1e-73  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000556215  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0635  CBS domain-containing protein  32.55 
 
 		 432 aa  228  4e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00186716  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1450  Polynucleotide adenylyltransferase region  31.53 
 
 		 450 aa  197  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1774  polyA polymerase family protein  31.53 
 
 		 450 aa  197  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.69358  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1564  polynucleotide adenylyltransferase region  34.99 
 
 		 388 aa  187  6e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_352  polyA polymerase, tRNA nucleotidyltransferase  29.79 
 
 		 418 aa  178  4e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2615  polynucleotide adenylyltransferase region  31.78 
 
 		 404 aa  176  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0405883  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0642  polynucleotide adenylyltransferase region  36.9 
 
 		 374 aa  172  2e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000899541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0388  polynucleotide adenylyltransferase region  29.15 
 
 		 416 aa  170  1e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0409  polyA polymerase family protein  30.71 
 
 		 418 aa  169  2e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1363  polynucleotide adenylyltransferase region  38.79 
 
 		 383 aa  166  1.0000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2260  Polynucleotide adenylyltransferase region  29.83 
 
 		 422 aa  154  8e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.029615  unclonable  0.0000000423985 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0854  Polynucleotide adenylyltransferase region  36.25 
 
 		 468 aa  143  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00520307 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1937  polynucleotide adenylyltransferase  26.6 
 
 		 567 aa  141  3.9999999999999997e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.916376 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2058  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  37.9 
 
 		 469 aa  137  9e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2535  tRNA adenylyltransferase (tRNA nucleotidyl transferase)  36.36 
 
 		 479 aa  132  3e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2415  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  37.93 
 
 		 471 aa  132  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0665  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  37.33 
 
 		 484 aa  129  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0990908 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0872  hypothetical protein  34.76 
 
 		 474 aa  128  4.0000000000000003e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5957  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  33.77 
 
 		 483 aa  127  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122928  normal  0.0117202 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4906  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  35.71 
 
 		 495 aa  125  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0801  polyA polymerase family protein  35.1 
 
 		 483 aa  123  9.999999999999999e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1109  metal dependent phosphohydrolase  31.37 
 
 		 470 aa  122  3e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.875974  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06110  tRNA nucleotidyltransferase  34.8 
 
 		 477 aa  122  3.9999999999999996e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1306  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  32.56 
 
 		 489 aa  119  1.9999999999999998e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0184  polyA polymerase  36.95 
 
 		 403 aa  118  5e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.648939  normal  0.0507556 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3525  Polynucleotide adenylyltransferase region  40.87 
 
 		 448 aa  117  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.224253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1151  polyA polymerase family protein  33.33 
 
 		 475 aa  115  3e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.71029 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2544  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  37.97 
 
 		 561 aa  115  3e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1525  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  30.62 
 
 		 475 aa  114  8.000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0551  polynucleotide adenylyltransferase region  38.61 
 
 		 377 aa  109  3e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0722  HDIG  31.15 
 
 		 476 aa  108  6e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.314731  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0992  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  31.56 
 
 		 471 aa  106  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1213  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  30.77 
 
 		 479 aa  106  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0305  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  34.52 
 
 		 415 aa  104  7e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.535708  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03261  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  33.92 
 
 		 415 aa  104  8e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1668  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  31.32 
 
 		 418 aa  102  2e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03271  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  33.33 
 
 		 415 aa  103  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.163609  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03821  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  31.32 
 
 		 418 aa  102  2e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.150415  normal  0.362341 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25491  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  34.46 
 
 		 415 aa  101  6e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03361  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  30.29 
 
 		 415 aa  100  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0600629  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2857  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 		 484 aa  99.8  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.858546  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1012  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  26.89 
 
 		 399 aa  95.1  6e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.200696  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0212  polyA polymerase  35.59 
 
 		 404 aa  93.6  1e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.809405  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0334  polyA polymerase family protein  30.42 
 
 		 493 aa  93.2  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000707313  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0314  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  29.44 
 
 		 498 aa  92.8  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000179563  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4849  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  32.59 
 
 		 499 aa  93.2  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_276  polymerase  30 
 
 		 501 aa  93.6  2e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000457601  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4118  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  37.32 
 
 		 458 aa  93.2  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00476179 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23340  tRNA adenylyltransferase  32.2 
 
 		 483 aa  92.4  3e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3120  polynucleotide adenylyltransferase region  30.56 
 
 		 450 aa  92  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0608  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  31.95 
 
 		 584 aa  91.7  6e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0767  tRNA CCA-pyrophosphorylase  25.12 
 
 		 403 aa  91.3  7e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.746315  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36397  predicted protein  28.06 
 
 		 759 aa  90.9  9e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31840  tRNA adenylyltransferase  31.73 
 
 		 471 aa  89.4  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1930  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  33.61 
 
 		 459 aa  90.1  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0164337 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0372  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  34.39 
 
 		 450 aa  88.6  4e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>