More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2755 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1581  polyA polymerase family protein  42.89 
 
 
880 aa  727    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.48144  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2246  CBS domain-containing protein  44.97 
 
 
875 aa  791    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1297  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  42.76 
 
 
888 aa  734    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.795106  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1578  PolyA polymerase family protein  43.26 
 
 
880 aa  741    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.507141  normal  0.242793 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1972  CBS  43.94 
 
 
898 aa  731    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.03578  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1346  cyclic nucleotide-binding protein  45.08 
 
 
902 aa  770    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.761753 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2294  CBS domain containing protein  43.72 
 
 
875 aa  764    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1929  CBS domain containing protein  43.84 
 
 
875 aa  764    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1458  Polynucleotide adenylyltransferase region  43.58 
 
 
892 aa  752    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.402567  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0878  CBS domain containing protein  40.2 
 
 
880 aa  677    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1184  Polynucleotide adenylyltransferase region  40.43 
 
 
905 aa  648    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2755  CBS domain-containing protein  100 
 
 
896 aa  1851    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.1635  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0679  polynucleotide adenylyltransferase region  46.22 
 
 
888 aa  831    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.197003  normal  0.0338911 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3306  polynucleotide adenylyltransferase region  42.08 
 
 
881 aa  730    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102582  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1433  polynucleotide adenylyltransferase region  44.61 
 
 
904 aa  747    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.743333  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1131  polynucleotide adenylyltransferase region  38.02 
 
 
907 aa  629  1e-178  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00727527  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1420  polyA polymerase family protein  34.87 
 
 
880 aa  572  1e-161  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0185526  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1654  CBS domain containing protein  35.84 
 
 
890 aa  553  1e-156  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.873652 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2087  Polynucleotide adenylyltransferase region  36.06 
 
 
877 aa  553  1e-156  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.625204 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0213  CBS domain-containing protein  35.33 
 
 
863 aa  524  1e-147  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0215  CBS domain-containing protein  34.92 
 
 
863 aa  518  1.0000000000000001e-145  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0684  polynucleotide adenylyltransferase region  35.22 
 
 
877 aa  513  1e-144  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1203  CBS domain-containing protein  32.69 
 
 
873 aa  503  1e-141  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.452152  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0891  polynucleotide adenylyltransferase region  36.25 
 
 
883 aa  478  1e-133  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0750  CBS domain containing protein  32.05 
 
 
867 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.596795  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3428  Polynucleotide adenylyltransferase region  33.11 
 
 
873 aa  465  1e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000799776  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  35.04 
 
 
845 aa  443  1e-123  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1425  CBS domain-containing protein  32.91 
 
 
859 aa  443  1e-123  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2388  Polynucleotide adenylyltransferase region  30.83 
 
 
903 aa  436  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.991166 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2847  polynucleotide adenylyltransferase region  33.89 
 
 
874 aa  437  1e-121  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0358  CBS domain containing protein  41.37 
 
 
1077 aa  434  1e-120  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0457131 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1695  CBS domain-containing protein  32.13 
 
 
885 aa  436  1e-120  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  33.07 
 
 
769 aa  426  1e-118  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4294  polynucleotide adenylyltransferase region  29.92 
 
 
907 aa  416  9.999999999999999e-116  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00498072  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1708  phosphoesterase, RecJ-like  30.27 
 
 
904 aa  416  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.833662  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07150  CBS domain containing protein  31.61 
 
 
865 aa  417  9.999999999999999e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0367477  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2466  polynucleotide adenylyltransferase region  33 
 
 
872 aa  416  1e-114  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.779181  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3792  Polynucleotide adenylyltransferase region  30.8 
 
 
903 aa  401  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0976  CBS  29.58 
 
 
909 aa  393  1e-108  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000281258  normal  0.107884 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1421  polynucleotide adenylyltransferase region  30.63 
 
 
909 aa  395  1e-108  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3742  Polynucleotide adenylyltransferase region  30.28 
 
 
903 aa  395  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1481  Polynucleotide adenylyltransferase region  28.67 
 
 
847 aa  332  1e-89  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000006237  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2030  Polynucleotide adenylyltransferase region  30.69 
 
 
854 aa  330  1.0000000000000001e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.609547  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1441  Polynucleotide adenylyltransferase region  27.16 
 
 
821 aa  267  7e-70  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000556215  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1450  Polynucleotide adenylyltransferase region  31.86 
 
 
450 aa  215  2.9999999999999995e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1774  polyA polymerase family protein  31.86 
 
 
450 aa  215  2.9999999999999995e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.69358  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0635  CBS domain-containing protein  30.54 
 
 
432 aa  214  3.9999999999999995e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00186716  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1564  polynucleotide adenylyltransferase region  31.36 
 
 
388 aa  191  7e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0409  polyA polymerase family protein  30.3 
 
 
418 aa  186  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_352  polyA polymerase, tRNA nucleotidyltransferase  28.54 
 
 
418 aa  175  2.9999999999999996e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0388  polynucleotide adenylyltransferase region  28.67 
 
 
416 aa  174  7.999999999999999e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2615  polynucleotide adenylyltransferase region  30.53 
 
 
404 aa  172  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0405883  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0642  polynucleotide adenylyltransferase region  43.81 
 
 
374 aa  170  9e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000899541  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1363  polynucleotide adenylyltransferase region  34.33 
 
 
383 aa  161  4e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2535  tRNA adenylyltransferase (tRNA nucleotidyl transferase)  41.35 
 
 
479 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0854  Polynucleotide adenylyltransferase region  37.02 
 
 
468 aa  141  6e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00520307 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5957  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  37.79 
 
 
483 aa  138  4e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122928  normal  0.0117202 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2260  Polynucleotide adenylyltransferase region  28.6 
 
 
422 aa  137  6.0000000000000005e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.029615  unclonable  0.0000000423985 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0872  hypothetical protein  36.05 
 
 
474 aa  134  6.999999999999999e-30  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2058  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  36.44 
 
 
469 aa  134  1.0000000000000001e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0801  polyA polymerase family protein  37.28 
 
 
483 aa  132  3e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1937  polynucleotide adenylyltransferase  25.12 
 
 
567 aa  131  7.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.916376 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4906  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  35.74 
 
 
495 aa  129  3e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0184  polyA polymerase  27.23 
 
 
403 aa  128  4.0000000000000003e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.648939  normal  0.0507556 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2415  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  37.55 
 
 
471 aa  127  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0665  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  34.68 
 
 
484 aa  122  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0990908 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0992  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  34.48 
 
 
471 aa  120  9.999999999999999e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06110  tRNA nucleotidyltransferase  32.1 
 
 
477 aa  118  5e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1109  metal dependent phosphohydrolase  32.37 
 
 
470 aa  117  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.875974  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3525  Polynucleotide adenylyltransferase region  34.82 
 
 
448 aa  114  8.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.224253  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03261  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  30.12 
 
 
415 aa  114  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1151  polyA polymerase family protein  31.06 
 
 
475 aa  113  2.0000000000000002e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.71029 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03271  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  29.32 
 
 
415 aa  111  5e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.163609  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1306  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  31.47 
 
 
489 aa  111  7.000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0305  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  29.72 
 
 
415 aa  110  9.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.535708  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2544  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  31.15 
 
 
561 aa  110  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0722  HDIG  33.06 
 
 
476 aa  109  3e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.314731  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1668  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  33.88 
 
 
418 aa  105  4e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03821  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  33.88 
 
 
418 aa  105  4e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.150415  normal  0.362341 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03361  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  28.4 
 
 
415 aa  104  7e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0600629  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1213  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  32.03 
 
 
479 aa  103  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0212  polyA polymerase  37.58 
 
 
404 aa  103  2e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.809405  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0551  polynucleotide adenylyltransferase region  33.76 
 
 
377 aa  103  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1525  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  34.07 
 
 
475 aa  102  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3120  polynucleotide adenylyltransferase region  34.53 
 
 
450 aa  96.3  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0756  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  28.73 
 
 
401 aa  94.7  6e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.525982  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1012  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  25.94 
 
 
399 aa  94.4  8e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.200696  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1064  polynucleotide adenylyltransferase region  25.91 
 
 
423 aa  94  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.191372  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36397  predicted protein  26.79 
 
 
759 aa  92  4e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1033  polyA polymerase family protein  25 
 
 
448 aa  90.9  1e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0733439  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0077  poly(A) polymerase family protein  24.16 
 
 
410 aa  89.4  2e-16  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.991708  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0314  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  31.19 
 
 
498 aa  89.7  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000179563  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1756  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  33.62 
 
 
473 aa  89.4  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6436  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  30.38 
 
 
473 aa  88.2  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2798  multifunctional tRNA nucleotidyl transferase/2'3'-cyclic phosphodiesterase/2'nucleotidase/phosphatase  29.43 
 
 
410 aa  87.8  9e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2667  multifunctional tRNA nucleotidyl transferase/2'3'-cyclic phosphodiesterase/2'nucleotidase/phosphatase  34.98 
 
 
410 aa  87.4  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0264  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  30.7 
 
 
517 aa  86.3  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3415  multifunctional tRNA nucleotidyl transferase/2'3'-cyclic phosphodiesterase/2'nucleotidase/phosphatase  30.65 
 
 
406 aa  86.7  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.372421  normal  0.617389 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2285  polynucleotide adenylyltransferase region  32.39 
 
 
431 aa  85.9  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0369543  normal  0.29262 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0065  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  27.98 
 
 
467 aa  85.9  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000449224  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>