More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_01601 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0143  poly A polymerase family protein  80.15 
 
 
406 aa  655    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01601  poly A polymerase family protein  100 
 
 
405 aa  796    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.100479  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01581  poly A polymerase family protein  83.7 
 
 
405 aa  675    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.178246  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01691  poly A polymerase family protein  61.48 
 
 
415 aa  502  1e-141  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01561  poly A polymerase family protein  37.78 
 
 
397 aa  259  5.0000000000000005e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1507  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  38.02 
 
 
395 aa  252  7e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02131  poly A polymerase family protein  37.53 
 
 
395 aa  225  1e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0301  poly A polymerase family protein  36.77 
 
 
398 aa  220  3e-56  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26611  Poly A polymerase family protein  35.68 
 
 
412 aa  219  5e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2392  poly A polymerase family protein  33.85 
 
 
397 aa  217  2.9999999999999998e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0791  polyA polymerase  30.38 
 
 
412 aa  179  7e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.11993 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0184  Polynucleotide adenylyltransferase region  31.62 
 
 
408 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0271  Polynucleotide adenylyltransferase region  27.56 
 
 
424 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00875656 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3833  polynucleotide adenylyltransferase region  26.79 
 
 
422 aa  160  3e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2997  polynucleotide adenylyltransferase region  26.93 
 
 
423 aa  154  2e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.337378  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1970  Polynucleotide adenylyltransferase region  30.89 
 
 
420 aa  154  4e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1997  Polynucleotide adenylyltransferase region  31.68 
 
 
420 aa  154  4e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.600969  normal  0.0824458 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1064  polynucleotide adenylyltransferase region  27.34 
 
 
423 aa  139  7e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.191372  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2184  polyA polymerase family protein  27.7 
 
 
430 aa  121  3e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.459849  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3120  polynucleotide adenylyltransferase region  35.12 
 
 
450 aa  109  8.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0854  Polynucleotide adenylyltransferase region  37.37 
 
 
468 aa  106  6e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00520307 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14390  poly(A) polymerase/tRNA nucleotidyl transferase  32.83 
 
 
478 aa  104  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101542  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3067  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  31.67 
 
 
489 aa  103  5e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.263831  hitchhiker  0.000000430788 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0264  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  31.91 
 
 
517 aa  103  7e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1521  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  36.36 
 
 
469 aa  99.4  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0308  polynucleotide adenylyltransferase region  29.59 
 
 
427 aa  98.2  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.467855 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1045  Polynucleotide adenylyltransferase region  30.84 
 
 
474 aa  97.4  4e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0158  metal dependent phosphohydrolase  28.98 
 
 
472 aa  96.7  6e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0314  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  30 
 
 
498 aa  95.1  2e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000179563  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2285  polynucleotide adenylyltransferase region  33.9 
 
 
431 aa  95.1  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0369543  normal  0.29262 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2058  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  32.29 
 
 
469 aa  94.4  3e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0992  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  31.6 
 
 
471 aa  94.4  3e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2535  tRNA adenylyltransferase (tRNA nucleotidyl transferase)  31.96 
 
 
479 aa  94.4  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4906  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  31.43 
 
 
495 aa  92.8  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5957  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  30.21 
 
 
483 aa  92.4  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122928  normal  0.0117202 
 
 
-
 
NC_002936  DET0334  polyA polymerase family protein  30.54 
 
 
493 aa  92  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000707313  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2057  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  29 
 
 
465 aa  92  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000115369  normal  0.734292 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1564  polynucleotide adenylyltransferase region  28.28 
 
 
388 aa  92  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0891  polynucleotide adenylyltransferase region  30.14 
 
 
883 aa  91.3  3e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_276  polymerase  29.56 
 
 
501 aa  90.9  3e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000457601  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0722  HDIG  25.48 
 
 
476 aa  90.9  3e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.314731  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5092  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  25.6 
 
 
485 aa  90.5  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000588683 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1695  CBS domain-containing protein  31.82 
 
 
885 aa  89.7  9e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3712  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  27.85 
 
 
507 aa  89.7  9e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.353872  normal  0.0967324 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1645  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  24.38 
 
 
438 aa  89  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000115731  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4574  HDIG domain-containing protein  28.22 
 
 
485 aa  89  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.119435 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06110  tRNA nucleotidyltransferase  30.7 
 
 
477 aa  88.2  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3924  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  31.12 
 
 
502 aa  87.8  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1425  CBS domain-containing protein  27.85 
 
 
859 aa  87.8  3e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1889  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  28.95 
 
 
479 aa  87.8  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.4086 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23340  tRNA adenylyltransferase  26.61 
 
 
483 aa  87.8  3e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0388  polynucleotide adenylyltransferase region  29.6 
 
 
416 aa  87.4  4e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9369  hypothetical protein  30.46 
 
 
479 aa  87  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.494361 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31840  tRNA adenylyltransferase  28.08 
 
 
471 aa  87  5e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0215  CBS domain-containing protein  28.77 
 
 
863 aa  86.7  6e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4157  metal dependent phosphohydrolase  28.19 
 
 
496 aa  86.7  6e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0213  CBS domain-containing protein  29.22 
 
 
863 aa  85.9  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3362  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  28.65 
 
 
500 aa  85.5  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0409  polyA polymerase family protein  30.89 
 
 
418 aa  85.1  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03361  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  35.4 
 
 
415 aa  85.5  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0600629  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0065  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  30.85 
 
 
467 aa  84.7  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000449224  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2216  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  29.95 
 
 
426 aa  84.7  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4840  tRNA adenylyltransferase  27.68 
 
 
489 aa  84.3  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.305864  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0608  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  27.71 
 
 
584 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0665  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  28.35 
 
 
484 aa  84  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0990908 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1525  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  27.91 
 
 
475 aa  84  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1306  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  28.06 
 
 
489 aa  84  0.000000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5397  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  26.94 
 
 
464 aa  83.6  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7079  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  25.48 
 
 
502 aa  83.6  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3571  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  28.57 
 
 
483 aa  83.6  0.000000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.564653 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9036  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  25.96 
 
 
491 aa  83.6  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192829  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1654  CBS domain containing protein  30.62 
 
 
890 aa  83.2  0.000000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.873652 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0684  polynucleotide adenylyltransferase region  29.39 
 
 
877 aa  82.4  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2415  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  26.38 
 
 
471 aa  82.4  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1213  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  27.41 
 
 
479 aa  82.4  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2087  Polynucleotide adenylyltransferase region  26.17 
 
 
877 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.625204 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3102  metal-dependent phosphohydrolase  28.29 
 
 
552 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2083  tRNA nucleotidyltransferase, putative  30.22 
 
 
368 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.954334  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2803  polynucleotide adenylyltransferase region  28.57 
 
 
510 aa  81.6  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4207  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  28.27 
 
 
483 aa  81.3  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37890  tRNA adenylyltransferase  29.47 
 
 
488 aa  81.3  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0612  metal dependent phosphohydrolase  23.21 
 
 
433 aa  80.9  0.00000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.319596 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13942  poly(A) polymerase pcnA  27.88 
 
 
480 aa  80.9  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00346461  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1592  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  31.82 
 
 
529 aa  80.5  0.00000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2542  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  28.14 
 
 
492 aa  80.5  0.00000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.277933 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1131  polynucleotide adenylyltransferase region  28.35 
 
 
907 aa  80.1  0.00000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00727527  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1151  polyA polymerase family protein  25.75 
 
 
475 aa  80.1  0.00000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.71029 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1389  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 
442 aa  80.1  0.00000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.23743  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1109  metal dependent phosphohydrolase  27.92 
 
 
470 aa  79.7  0.00000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.875974  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4494  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  28.5 
 
 
508 aa  80.1  0.00000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0150465  normal  0.139356 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2615  polynucleotide adenylyltransferase region  28.44 
 
 
404 aa  79.7  0.00000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0405883  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0060  tRNA adenylyltransferase  30 
 
 
475 aa  79.7  0.00000000000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.451798 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1238  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  31.07 
 
 
500 aa  79.7  0.00000000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0872  hypothetical protein  28.12 
 
 
474 aa  79.3  0.0000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0973  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  31.25 
 
 
474 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0679  polynucleotide adenylyltransferase region  24.5 
 
 
888 aa  78.2  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.197003  normal  0.0338911 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39600  tRNA adenylyltransferase  26.63 
 
 
523 aa  78.6  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4849  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  26.37 
 
 
499 aa  78.2  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1449  tRNA nucleotidyltransferase  28.95 
 
 
471 aa  77.8  0.0000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1390  poly(A) polymerase  27.39 
 
 
424 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>