More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3833 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_3833  polynucleotide adenylyltransferase region  100 
 
 
422 aa  861    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2997  polynucleotide adenylyltransferase region  67.85 
 
 
423 aa  593  1e-168  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.337378  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1064  polynucleotide adenylyltransferase region  52.87 
 
 
423 aa  428  1e-118  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.191372  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0184  Polynucleotide adenylyltransferase region  51.68 
 
 
408 aa  399  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0271  Polynucleotide adenylyltransferase region  50.23 
 
 
424 aa  395  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00875656 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1970  Polynucleotide adenylyltransferase region  51.07 
 
 
420 aa  385  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1997  Polynucleotide adenylyltransferase region  51.07 
 
 
420 aa  383  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.600969  normal  0.0824458 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0791  polyA polymerase  44.06 
 
 
412 aa  295  9e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.11993 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01691  poly A polymerase family protein  27.27 
 
 
415 aa  181  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1507  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  27.9 
 
 
395 aa  177  3e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0143  poly A polymerase family protein  27.32 
 
 
406 aa  172  7.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01601  poly A polymerase family protein  26.79 
 
 
405 aa  160  3e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.100479  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01561  poly A polymerase family protein  29.26 
 
 
397 aa  154  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01581  poly A polymerase family protein  26.56 
 
 
405 aa  153  5.9999999999999996e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.178246  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2392  poly A polymerase family protein  30.86 
 
 
397 aa  149  9e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0301  poly A polymerase family protein  31.4 
 
 
398 aa  144  3e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3120  polynucleotide adenylyltransferase region  31.52 
 
 
450 aa  144  4e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02131  poly A polymerase family protein  28.44 
 
 
395 aa  144  4e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1238  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  26.4 
 
 
500 aa  139  8.999999999999999e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1521  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  25.39 
 
 
469 aa  139  1e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0264  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  40.78 
 
 
517 aa  138  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14390  poly(A) polymerase/tRNA nucleotidyl transferase  28.51 
 
 
478 aa  135  9.999999999999999e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101542  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2184  polyA polymerase family protein  30.63 
 
 
430 aa  134  3e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.459849  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26611  Poly A polymerase family protein  30.86 
 
 
412 aa  129  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2857  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  31.33 
 
 
484 aa  125  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.858546  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0065  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  26.71 
 
 
467 aa  124  3e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000449224  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2285  polynucleotide adenylyltransferase region  29.88 
 
 
431 aa  120  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0369543  normal  0.29262 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0158  metal dependent phosphohydrolase  26.8 
 
 
472 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2216  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  41.18 
 
 
426 aa  119  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0314  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  25.84 
 
 
498 aa  114  3e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000179563  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0334  polyA polymerase family protein  26.53 
 
 
493 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000707313  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9036  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  37.38 
 
 
491 aa  114  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192829  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0612  metal dependent phosphohydrolase  30.97 
 
 
433 aa  113  5e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.319596 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4574  HDIG domain-containing protein  29.51 
 
 
485 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.119435 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1045  Polynucleotide adenylyltransferase region  23.46 
 
 
474 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0756  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  36.04 
 
 
401 aa  111  2.0000000000000002e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.525982  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_276  polymerase  26.91 
 
 
501 aa  109  9.000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000457601  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5092  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  36.62 
 
 
485 aa  108  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000588683 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3712  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  37.5 
 
 
507 aa  108  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.353872  normal  0.0967324 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37890  tRNA adenylyltransferase  35.65 
 
 
488 aa  107  3e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0750  CBS domain containing protein  27.54 
 
 
867 aa  106  8e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.596795  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23340  tRNA adenylyltransferase  27.45 
 
 
483 aa  106  9e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0060  tRNA adenylyltransferase  35.86 
 
 
475 aa  105  1e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.451798 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3571  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  28.73 
 
 
483 aa  104  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.564653 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1645  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  37.91 
 
 
438 aa  104  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000115731  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1889  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  27.25 
 
 
479 aa  104  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.4086 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31840  tRNA adenylyltransferase  40 
 
 
471 aa  103  5e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0308  polynucleotide adenylyltransferase region  28.97 
 
 
427 aa  103  5e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.467855 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3362  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  35.96 
 
 
500 aa  103  5e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0722  HDIG  26.33 
 
 
476 aa  103  6e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.314731  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4531  metal dependent phosphohydrolase  38.58 
 
 
502 aa  103  7e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4849  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  44.53 
 
 
499 aa  102  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4968  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  33.97 
 
 
490 aa  102  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2615  polynucleotide adenylyltransferase region  32.65 
 
 
404 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0405883  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0372  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  33.48 
 
 
450 aa  102  1e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1564  polynucleotide adenylyltransferase region  29.25 
 
 
388 aa  101  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0973  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  28.89 
 
 
474 aa  100  3e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0497  metal dependent phosphohydrolase  25.84 
 
 
454 aa  101  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6436  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  26.5 
 
 
473 aa  100  6e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3182  Poly(A) polymerase, PcnB  34.04 
 
 
457 aa  99.8  7e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.117248 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0684  polynucleotide adenylyltransferase region  25.12 
 
 
877 aa  99.8  8e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0883  Poly(A) polymerase, PcnB  31.82 
 
 
401 aa  99.4  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0632296  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2762  poly(A) polymerase  36.14 
 
 
456 aa  99.4  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.860721  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2535  tRNA adenylyltransferase (tRNA nucleotidyl transferase)  25.86 
 
 
479 aa  99.4  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39600  tRNA adenylyltransferase  30.92 
 
 
523 aa  99  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13942  poly(A) polymerase pcnA  38.38 
 
 
480 aa  99  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00346461  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  31.84 
 
 
845 aa  98.6  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2353  tRNA cytidylyltransferase  32.88 
 
 
434 aa  98.6  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.103855  normal  0.215704 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2542  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  36.28 
 
 
492 aa  98.2  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.277933 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1449  tRNA nucleotidyltransferase  34.6 
 
 
471 aa  98.6  2e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2139  metal dependent phosphohydrolase  35.68 
 
 
525 aa  98.2  3e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2058  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  27.35 
 
 
469 aa  96.7  6e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1864  tRNA adenylyltransferase  26.43 
 
 
420 aa  96.7  7e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.124392  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3827  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  35.58 
 
 
459 aa  95.9  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3376  poly(A) polymerase  32.27 
 
 
443 aa  95.9  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000590256  normal  0.326432 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3063  poly(A) polymerase  34.98 
 
 
473 aa  95.9  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1306  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  31.84 
 
 
489 aa  95.9  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0845  metal dependent phosphohydrolase  37.63 
 
 
497 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0325439  normal  0.188962 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3182  Poly(A) polymerase, PcnB  33.95 
 
 
447 aa  95.1  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0461  tRNA CCA-pyrophosphorylase  28.5 
 
 
402 aa  94.7  2e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1109  metal dependent phosphohydrolase  27.44 
 
 
470 aa  95.5  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.875974  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2046  poly(A) polymerase  32.32 
 
 
461 aa  94.4  3e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9369  hypothetical protein  35.16 
 
 
479 aa  94.7  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.494361 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2407  tRNA adenylyltransferase  29.56 
 
 
471 aa  94.4  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.460481 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1023  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  25.06 
 
 
464 aa  94.4  4e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3067  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  36.72 
 
 
489 aa  94.4  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.263831  hitchhiker  0.000000430788 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0600  poly(A) polymerase  33.65 
 
 
452 aa  94.4  4e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.400634 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0992  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  27.37 
 
 
471 aa  94  4e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7079  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  33.49 
 
 
502 aa  94  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7321  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  36.63 
 
 
508 aa  93.6  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.468389 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0215  CBS domain-containing protein  28.79 
 
 
863 aa  93.6  6e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2544  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  34.23 
 
 
561 aa  93.6  6e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1654  CBS domain containing protein  25.12 
 
 
890 aa  93.2  7e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.873652 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0478  metal dependent phosphohydrolase  34.15 
 
 
490 aa  93.2  7e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.903999  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4207  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  34.76 
 
 
483 aa  93.2  8e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3924  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  31.84 
 
 
502 aa  92.8  9e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0669  poly(A) polymerase  32.16 
 
 
455 aa  93.2  9e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.598779  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1528  poly(A) polymerase  29.6 
 
 
484 aa  92.4  1e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000410456  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0279  hypothetical protein  35.96 
 
 
549 aa  92.4  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4681  HDIG domain-containing protein  37.04 
 
 
483 aa  92.4  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.192705  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>