More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_1997 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_1970  Polynucleotide adenylyltransferase region  99.52 
 
 
420 aa  843    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1997  Polynucleotide adenylyltransferase region  100 
 
 
420 aa  850    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.600969  normal  0.0824458 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0184  Polynucleotide adenylyltransferase region  59.27 
 
 
408 aa  465  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3833  polynucleotide adenylyltransferase region  51.07 
 
 
422 aa  383  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2997  polynucleotide adenylyltransferase region  48.69 
 
 
423 aa  366  1e-100  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.337378  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1064  polynucleotide adenylyltransferase region  49.4 
 
 
423 aa  361  1e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.191372  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0271  Polynucleotide adenylyltransferase region  45.5 
 
 
424 aa  338  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00875656 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0791  polyA polymerase  42.82 
 
 
412 aa  293  4e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.11993 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1507  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  30.25 
 
 
395 aa  171  2e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01561  poly A polymerase family protein  32.23 
 
 
397 aa  171  3e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02131  poly A polymerase family protein  31.68 
 
 
395 aa  155  2e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3120  polynucleotide adenylyltransferase region  32.53 
 
 
450 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01601  poly A polymerase family protein  31.68 
 
 
405 aa  154  4e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.100479  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01581  poly A polymerase family protein  31.49 
 
 
405 aa  152  8e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.178246  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0143  poly A polymerase family protein  29.84 
 
 
406 aa  152  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01691  poly A polymerase family protein  28.68 
 
 
415 aa  151  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0301  poly A polymerase family protein  32.77 
 
 
398 aa  149  1.0000000000000001e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2184  polyA polymerase family protein  31.65 
 
 
430 aa  147  5e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.459849  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2392  poly A polymerase family protein  32.59 
 
 
397 aa  145  1e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14390  poly(A) polymerase/tRNA nucleotidyl transferase  28.73 
 
 
478 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101542  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1238  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  26.73 
 
 
500 aa  137  4e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1645  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  30.55 
 
 
438 aa  134  3e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000115731  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1045  Polynucleotide adenylyltransferase region  28.64 
 
 
474 aa  133  5e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1521  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  26.94 
 
 
469 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0334  polyA polymerase family protein  27.13 
 
 
493 aa  125  2e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000707313  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0065  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  27.9 
 
 
467 aa  125  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000449224  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0264  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  41.4 
 
 
517 aa  121  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0314  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  26.26 
 
 
498 aa  119  7.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000179563  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_276  polymerase  26.7 
 
 
501 aa  119  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000457601  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2216  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  29.41 
 
 
426 aa  119  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2285  polynucleotide adenylyltransferase region  38.58 
 
 
431 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0369543  normal  0.29262 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0158  metal dependent phosphohydrolase  42.13 
 
 
472 aa  117  5e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26611  Poly A polymerase family protein  42.35 
 
 
412 aa  116  6e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2535  tRNA adenylyltransferase (tRNA nucleotidyl transferase)  26.32 
 
 
479 aa  110  5e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0872  hypothetical protein  27.05 
 
 
474 aa  105  2e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2857  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  37.43 
 
 
484 aa  103  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.858546  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1564  polynucleotide adenylyltransferase region  31.13 
 
 
388 aa  102  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0756  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  27.21 
 
 
401 aa  102  1e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.525982  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0722  HDIG  26.4 
 
 
476 aa  101  2e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.314731  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6436  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  24.88 
 
 
473 aa  101  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1131  polynucleotide adenylyltransferase region  27.08 
 
 
907 aa  101  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00727527  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2353  tRNA cytidylyltransferase  36.45 
 
 
434 aa  100  7e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.103855  normal  0.215704 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37890  tRNA adenylyltransferase  32.38 
 
 
488 aa  99.8  9e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5092  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  35.02 
 
 
485 aa  99  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000588683 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4574  HDIG domain-containing protein  35.02 
 
 
485 aa  99  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.119435 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3362  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  34.22 
 
 
500 aa  97.8  3e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2415  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  26.13 
 
 
471 aa  97.8  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07150  CBS domain containing protein  26.08 
 
 
865 aa  97.4  4e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0367477  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0026  polyA polymerase family protein  30.07 
 
 
422 aa  97.4  4e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2393  Polynucleotide adenylyltransferase region  37.93 
 
 
529 aa  97.4  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1023  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  25.42 
 
 
464 aa  96.7  7e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5957  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  25.17 
 
 
483 aa  96.7  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122928  normal  0.0117202 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0026  polyA polymerase family protein  29.83 
 
 
424 aa  96.3  8e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0218  polyA polymerase family protein  35.8 
 
 
456 aa  95.9  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3067  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  36.17 
 
 
489 aa  95.9  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.263831  hitchhiker  0.000000430788 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0372  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  35.94 
 
 
450 aa  96.3  1e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0396  Polynucleotide adenylyltransferase region  35.8 
 
 
456 aa  95.9  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.220421 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1449  tRNA nucleotidyltransferase  35.27 
 
 
471 aa  95.9  1e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3428  Polynucleotide adenylyltransferase region  27.27 
 
 
873 aa  95.1  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000799776  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0060  tRNA adenylyltransferase  35.24 
 
 
475 aa  94.7  3e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.451798 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7079  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  32.99 
 
 
502 aa  94.4  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2058  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  25 
 
 
469 aa  94  4e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1654  CBS domain containing protein  26.41 
 
 
890 aa  94.4  4e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.873652 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0908  tRNA CCA-pyrophosphorylase  29.1 
 
 
398 aa  94  5e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000445275 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1889  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  40.83 
 
 
479 aa  93.2  7e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.4086 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2087  Polynucleotide adenylyltransferase region  26.63 
 
 
877 aa  93.2  7e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.625204 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0308  polynucleotide adenylyltransferase region  26 
 
 
427 aa  93.2  7e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.467855 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3712  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  33.77 
 
 
507 aa  93.2  8e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.353872  normal  0.0967324 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31840  tRNA adenylyltransferase  33.33 
 
 
471 aa  93.2  8e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4906  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 
495 aa  92.8  9e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3901  polynucleotide adenylyltransferase  30.45 
 
 
496 aa  93.2  9e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000197413  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3800  poly(A) polymerase  30.17 
 
 
421 aa  92.8  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000630801  hitchhiker  0.000152208 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2388  Polynucleotide adenylyltransferase region  28.47 
 
 
903 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.991166 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0854  Polynucleotide adenylyltransferase region  24.95 
 
 
468 aa  92  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00520307 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06110  tRNA nucleotidyltransferase  25.61 
 
 
477 aa  91.7  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39600  tRNA adenylyltransferase  34.91 
 
 
523 aa  91.3  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0872  polyA polymerase  31.84 
 
 
438 aa  90.9  4e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1653  tRNA CCA-pyrophosphorylase  28.03 
 
 
402 aa  90.9  4e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13942  poly(A) polymerase pcnA  34.95 
 
 
480 aa  90.5  5e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00346461  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1525  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  25.06 
 
 
475 aa  90.5  6e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0976  CBS  28.44 
 
 
909 aa  89.7  8e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000281258  normal  0.107884 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0728  poly(A) polymerase  31.39 
 
 
435 aa  89.7  9e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000577304  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4968  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  32.11 
 
 
490 aa  89.4  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4207  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  33.03 
 
 
483 aa  89  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0125  polyA polymerase  31.07 
 
 
457 aa  89  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000172768  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2295  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  27.21 
 
 
448 aa  88.6  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.730804  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1636  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  24.47 
 
 
464 aa  88.2  2e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.841879  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9369  hypothetical protein  32.41 
 
 
479 aa  88.6  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.494361 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1480  polynucleotide adenylyltransferase region  34.92 
 
 
436 aa  88.6  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.846111  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0727  polynucleotide adenylyltransferase  31.22 
 
 
410 aa  88.2  2e-16  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.43886  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1458  Polynucleotide adenylyltransferase region  25.55 
 
 
892 aa  88.6  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.402567  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3406  poly(A) polymerase  30.49 
 
 
435 aa  88.6  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000031653  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23340  tRNA adenylyltransferase  32.26 
 
 
483 aa  89  2e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2475  tRNA cytidylyltransferase  35.14 
 
 
436 aa  87.8  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0152668  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1592  tRNA CCA-pyrophosphorylase  22.99 
 
 
397 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.441077  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2615  polynucleotide adenylyltransferase region  33.19 
 
 
404 aa  87.8  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0405883  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0882  poly(A) polymerase  30.43 
 
 
513 aa  87.8  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000307041  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3294  poly(A) polymerase  30.04 
 
 
435 aa  87.8  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000608896  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0499  tRNA CCA-pyrophosphorylase  32.69 
 
 
404 aa  87.8  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2139  metal dependent phosphohydrolase  33.02 
 
 
525 aa  87.8  3e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>