More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0791 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0791  polyA polymerase  100 
 
 
412 aa  810    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.11993 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0184  Polynucleotide adenylyltransferase region  45.43 
 
 
408 aa  308  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1970  Polynucleotide adenylyltransferase region  43.31 
 
 
420 aa  298  1e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3833  polynucleotide adenylyltransferase region  44.06 
 
 
422 aa  295  9e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1997  Polynucleotide adenylyltransferase region  42.82 
 
 
420 aa  293  4e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.600969  normal  0.0824458 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0271  Polynucleotide adenylyltransferase region  44.05 
 
 
424 aa  292  9e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00875656 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1064  polynucleotide adenylyltransferase region  42.26 
 
 
423 aa  285  1.0000000000000001e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.191372  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2997  polynucleotide adenylyltransferase region  39.39 
 
 
423 aa  274  2.0000000000000002e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.337378  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01561  poly A polymerase family protein  33.74 
 
 
397 aa  198  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0143  poly A polymerase family protein  30.08 
 
 
406 aa  187  3e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2392  poly A polymerase family protein  35.73 
 
 
397 aa  180  4.999999999999999e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01601  poly A polymerase family protein  30.38 
 
 
405 aa  179  7e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.100479  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1507  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  31.13 
 
 
395 aa  179  1e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01691  poly A polymerase family protein  28.14 
 
 
415 aa  178  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0301  poly A polymerase family protein  36.7 
 
 
398 aa  177  4e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26611  Poly A polymerase family protein  38.54 
 
 
412 aa  176  9e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01581  poly A polymerase family protein  28.97 
 
 
405 aa  169  7e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.178246  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02131  poly A polymerase family protein  31.63 
 
 
395 aa  157  4e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2184  polyA polymerase family protein  43.65 
 
 
430 aa  137  4e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.459849  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3120  polynucleotide adenylyltransferase region  42.29 
 
 
450 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0158  metal dependent phosphohydrolase  41.76 
 
 
472 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14390  poly(A) polymerase/tRNA nucleotidyl transferase  39.27 
 
 
478 aa  130  3e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101542  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0065  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  25.28 
 
 
467 aa  127  5e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000449224  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0264  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  46.63 
 
 
517 aa  123  5e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2285  polynucleotide adenylyltransferase region  41.12 
 
 
431 aa  122  9e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0369543  normal  0.29262 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2046  poly(A) polymerase  34.36 
 
 
461 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1521  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  30.85 
 
 
469 aa  108  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0632  multifunctional tRNA nucleotidyl transferase/2'3'-cyclic phosphodiesterase/2'nucleotidase/phosphatase  43.94 
 
 
416 aa  109  1e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1045  Polynucleotide adenylyltransferase region  27.27 
 
 
474 aa  108  2e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5092  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  38.21 
 
 
485 aa  107  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000588683 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1238  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  31.42 
 
 
500 aa  107  3e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3571  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  37.8 
 
 
483 aa  107  4e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.564653 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4574  HDIG domain-containing protein  27.39 
 
 
485 aa  107  4e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.119435 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0715  multifunctional tRNA nucleotidyl transferase/2'3'-cyclic phosphodiesterase/2'nucleotidase/phosphatase  43.43 
 
 
416 aa  107  4e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3362  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  39.45 
 
 
500 aa  107  5e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0461  tRNA CCA-pyrophosphorylase  28.07 
 
 
402 aa  107  5e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6436  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  28.37 
 
 
473 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2216  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  39.71 
 
 
426 aa  104  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0973  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  38.65 
 
 
474 aa  105  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3067  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  41.11 
 
 
489 aa  105  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.263831  hitchhiker  0.000000430788 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9036  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  35.44 
 
 
491 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192829  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2087  Polynucleotide adenylyltransferase region  26.35 
 
 
877 aa  104  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.625204 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2857  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  34.91 
 
 
484 aa  104  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.858546  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0608  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  37.2 
 
 
584 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4968  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  27.03 
 
 
490 aa  102  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1528  poly(A) polymerase  32.76 
 
 
484 aa  102  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000410456  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0060  tRNA adenylyltransferase  37.79 
 
 
475 aa  102  2e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.451798 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1564  polynucleotide adenylyltransferase region  28.77 
 
 
388 aa  101  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9369  hypothetical protein  27.51 
 
 
479 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.494361 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0314  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  32.41 
 
 
498 aa  100  3e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000179563  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1695  CBS domain-containing protein  23.65 
 
 
885 aa  100  4e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3827  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  32.28 
 
 
459 aa  100  4e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4207  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  37.18 
 
 
483 aa  100  4e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2415  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 
471 aa  100  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2057  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  28.21 
 
 
465 aa  100  6e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000115369  normal  0.734292 
 
 
-
 
NC_002936  DET0334  polyA polymerase family protein  33.33 
 
 
493 aa  100  7e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000707313  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0854  Polynucleotide adenylyltransferase region  24.94 
 
 
468 aa  99.4  9e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00520307 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0726  multifunctional tRNA nucleotidyl transferase/2'3'-cyclic phosphodiesterase/2'nucleotidase/phosphatase  42.33 
 
 
410 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0218  poly(A) polymerase I  34.07 
 
 
454 aa  99  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000474344  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2615  polynucleotide adenylyltransferase region  30.27 
 
 
404 aa  99.4  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0405883  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0200  poly(A) polymerase I  34.07 
 
 
437 aa  99  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000820079  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4531  metal dependent phosphohydrolase  28.73 
 
 
502 aa  99  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0201  poly(A) polymerase I  34.07 
 
 
437 aa  99  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000171206  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0216  poly(A) polymerase I  34.07 
 
 
437 aa  99.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000405641  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3130  poly(A) polymerase  33.33 
 
 
494 aa  98.2  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000172182  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0389  polynucleotide adenylyltransferase  37.67 
 
 
406 aa  98.6  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3712  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  36.77 
 
 
507 aa  98.2  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.353872  normal  0.0967324 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07620  multifunctional tRNA nucleotidyl transferase/2'3'-cyclic phosphodiesterase/2'nucleotidase/phosphatase  41.59 
 
 
410 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0918866 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3116  poly(A) polymerase I  32.92 
 
 
482 aa  97.8  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000129404  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0212  poly(A) polymerase I  34.07 
 
 
437 aa  97.8  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00291988  normal  0.692878 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1645  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  36.71 
 
 
438 aa  97.8  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000115731  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0882  poly(A) polymerase  33.33 
 
 
513 aa  98.2  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000307041  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0669  poly(A) polymerase  33.92 
 
 
455 aa  97.8  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.598779  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00142  poly(A) polymerase I  34.51 
 
 
454 aa  97.4  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00002208  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3459  poly(A) polymerase  34.51 
 
 
454 aa  97.4  4e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000537308  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0152  poly(A) polymerase I  34.51 
 
 
454 aa  97.4  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000005693  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3516  poly(A) polymerase I  34.51 
 
 
465 aa  97.4  4e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000476175  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1889  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  42.13 
 
 
479 aa  97.4  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.4086 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0154  poly(A) polymerase I  34.51 
 
 
454 aa  97.4  4e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000110744  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0134  poly(A) polymerase I  34.51 
 
 
454 aa  97.4  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000109672  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3406  poly(A) polymerase  33.33 
 
 
435 aa  97.4  4e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000031653  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13942  poly(A) polymerase pcnA  29.23 
 
 
480 aa  97.4  4e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00346461  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1654  CBS domain containing protein  30.66 
 
 
890 aa  97.4  4e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.873652 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00141  hypothetical protein  34.51 
 
 
465 aa  97.4  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000170376  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3415  multifunctional tRNA nucleotidyl transferase/2'3'-cyclic phosphodiesterase/2'nucleotidase/phosphatase  38.91 
 
 
406 aa  97.1  5e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.372421  normal  0.617389 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2535  tRNA adenylyltransferase (tRNA nucleotidyl transferase)  32.74 
 
 
479 aa  97.1  5e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0147  poly(A) polymerase I  34.51 
 
 
454 aa  97.1  5e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000759631  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0146  poly(A) polymerase I  34.51 
 
 
454 aa  97.1  5e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  4.2681200000000003e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3492  poly(A) polymerase  32.88 
 
 
450 aa  96.7  6e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000092007  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0870  poly(A) polymerase  32.88 
 
 
513 aa  96.7  6e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000796933  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0077  poly(A) polymerase family protein  29.26 
 
 
410 aa  96.7  7e-19  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.991708  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1390  poly(A) polymerase  31.96 
 
 
424 aa  96.7  7e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0847  poly(A) polymerase  32.88 
 
 
513 aa  96.7  7e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000196187  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1131  polynucleotide adenylyltransferase region  32.59 
 
 
907 aa  96.7  7e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00727527  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0499  tRNA CCA-pyrophosphorylase  36.08 
 
 
404 aa  96.3  8e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1162  poly(A) polymerase I  31.67 
 
 
482 aa  96.3  9e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000172758  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3294  poly(A) polymerase  32.88 
 
 
435 aa  95.9  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000608896  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1012  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  27.82 
 
 
399 aa  95.9  1e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.200696  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3987  poly(A) polymerase I  33.63 
 
 
505 aa  95.1  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000599452  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3800  poly(A) polymerase  32.13 
 
 
421 aa  95.5  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000630801  hitchhiker  0.000152208 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>