More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1458 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1581  polyA polymerase family protein  44.2 
 
 		 880 aa  727    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.48144  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2246  CBS domain-containing protein  43.65 
 
 		 875 aa  730    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1297  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  42.3 
 
 		 888 aa  709    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.795106  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1578  PolyA polymerase family protein  44.47 
 
 		 880 aa  753    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.507141  normal  0.242793 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1972  CBS  54 
 
 		 898 aa  971    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.03578  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1458  Polynucleotide adenylyltransferase region  100 
 
 		 892 aa  1816    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.402567  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0878  CBS domain containing protein  42.53 
 
 		 880 aa  676    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1184  Polynucleotide adenylyltransferase region  46.08 
 
 		 905 aa  782    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2294  CBS domain containing protein  43 
 
 		 875 aa  698    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0358  CBS domain containing protein  56.74 
 
 		 1077 aa  660    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0457131 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1346  cyclic nucleotide-binding protein  55.49 
 
 		 902 aa  1006    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.761753 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2755  CBS domain-containing protein  43.58 
 
 		 896 aa  732    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.1635  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1929  CBS domain containing protein  43 
 
 		 875 aa  705    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0679  polynucleotide adenylyltransferase region  45.85 
 
 		 888 aa  799    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.197003  normal  0.0338911 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3306  polynucleotide adenylyltransferase region  42.17 
 
 		 881 aa  680    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102582  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1433  polynucleotide adenylyltransferase region  53.39 
 
 		 904 aa  964    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.743333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1131  polynucleotide adenylyltransferase region  38.33 
 
 		 907 aa  615  1e-175  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00727527  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1420  polyA polymerase family protein  37.34 
 
 		 880 aa  582  1e-164  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0185526  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1654  CBS domain containing protein  35.83 
 
 		 890 aa  548  1e-154  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.873652 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2087  Polynucleotide adenylyltransferase region  36.76 
 
 		 877 aa  542  9.999999999999999e-153  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.625204 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0684  polynucleotide adenylyltransferase region  35.23 
 
 		 877 aa  513  1e-144  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1203  CBS domain-containing protein  34.02 
 
 		 873 aa  499  1e-140  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.452152  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0750  CBS domain containing protein  33.26 
 
 		 867 aa  494  9.999999999999999e-139  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.596795  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0213  CBS domain-containing protein  33.75 
 
 		 863 aa  483  1e-135  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0215  CBS domain-containing protein  34.02 
 
 		 863 aa  482  1e-134  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0891  polynucleotide adenylyltransferase region  34.11 
 
 		 883 aa  478  1e-133  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1425  CBS domain-containing protein  32.99 
 
 		 859 aa  465  1e-129  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1695  CBS domain-containing protein  32.81 
 
 		 885 aa  449  1.0000000000000001e-124  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3428  Polynucleotide adenylyltransferase region  32.7 
 
 		 873 aa  439  1e-121  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000799776  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2388  Polynucleotide adenylyltransferase region  31.76 
 
 		 903 aa  436  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.991166 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2847  polynucleotide adenylyltransferase region  33.75 
 
 		 874 aa  413  1e-114  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3792  Polynucleotide adenylyltransferase region  31.51 
 
 		 903 aa  416  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3742  Polynucleotide adenylyltransferase region  31.06 
 
 		 903 aa  409  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0976  CBS  32.48 
 
 		 909 aa  401  9.999999999999999e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000281258  normal  0.107884 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  34.81 
 
 		 769 aa  399  1e-109  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  32.02 
 
 		 845 aa  398  1e-109  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2466  polynucleotide adenylyltransferase region  32.81 
 
 		 872 aa  393  1e-108  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.779181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07150  CBS domain containing protein  30.18 
 
 		 865 aa  394  1e-108  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0367477  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1708  phosphoesterase, RecJ-like  30.69 
 
 		 904 aa  386  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.833662  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4294  polynucleotide adenylyltransferase region  29.26 
 
 		 907 aa  377  1e-103  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00498072  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1421  polynucleotide adenylyltransferase region  30.64 
 
 		 909 aa  365  2e-99  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2030  Polynucleotide adenylyltransferase region  29.39 
 
 		 854 aa  325  3e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.609547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1481  Polynucleotide adenylyltransferase region  28.84 
 
 		 847 aa  317  6e-85  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000006237  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1441  Polynucleotide adenylyltransferase region  28.38 
 
 		 821 aa  283  1e-74  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000556215  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0635  CBS domain-containing protein  32.23 
 
 		 432 aa  216  1.9999999999999998e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00186716  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1774  polyA polymerase family protein  33.42 
 
 		 450 aa  199  2.0000000000000003e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.69358  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1450  Polynucleotide adenylyltransferase region  33.42 
 
 		 450 aa  199  2.0000000000000003e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1564  polynucleotide adenylyltransferase region  32.77 
 
 		 388 aa  185  3e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0388  polynucleotide adenylyltransferase region  29.15 
 
 		 416 aa  182  2.9999999999999997e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_352  polyA polymerase, tRNA nucleotidyltransferase  28.94 
 
 		 418 aa  175  2.9999999999999996e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2615  polynucleotide adenylyltransferase region  33.5 
 
 		 404 aa  175  3.9999999999999995e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0405883  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1363  polynucleotide adenylyltransferase region  36.33 
 
 		 383 aa  173  1e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0409  polyA polymerase family protein  29.88 
 
 		 418 aa  167  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2260  Polynucleotide adenylyltransferase region  31.78 
 
 		 422 aa  142  3.9999999999999997e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.029615  unclonable  0.0000000423985 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0642  polynucleotide adenylyltransferase region  28.02 
 
 		 374 aa  142  3.9999999999999997e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000899541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1937  polynucleotide adenylyltransferase  26.72 
 
 		 567 aa  138  4e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.916376 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0854  Polynucleotide adenylyltransferase region  39.17 
 
 		 468 aa  129  3e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00520307 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2535  tRNA adenylyltransferase (tRNA nucleotidyl transferase)  35.5 
 
 		 479 aa  128  4.0000000000000003e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1668  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  27 
 
 		 418 aa  128  6e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03821  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  26.62 
 
 		 418 aa  127  7e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.150415  normal  0.362341 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0184  polyA polymerase  35.51 
 
 		 403 aa  125  3e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.648939  normal  0.0507556 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0872  hypothetical protein  36.21 
 
 		 474 aa  125  3e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1306  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  33.74 
 
 		 489 aa  125  4e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0665  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  35.32 
 
 		 484 aa  125  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0990908 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5957  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  34.82 
 
 		 483 aa  121  6e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122928  normal  0.0117202 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2058  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  37.71 
 
 		 469 aa  120  9.999999999999999e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0801  polyA polymerase family protein  34.84 
 
 		 483 aa  115  3e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4906  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  35.34 
 
 		 495 aa  115  3e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2415  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  35.5 
 
 		 471 aa  113  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06110  tRNA nucleotidyltransferase  34.07 
 
 		 477 aa  111  6e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1525  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  33.47 
 
 		 475 aa  110  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1109  metal dependent phosphohydrolase  34.18 
 
 		 470 aa  109  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.875974  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2544  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  35.83 
 
 		 561 aa  107  9e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0334  polyA polymerase family protein  30.82 
 
 		 493 aa  102  2e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000707313  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0314  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  27.27 
 
 		 498 aa  103  2e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000179563  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0722  HDIG  31.12 
 
 		 476 aa  102  3e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.314731  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0551  polynucleotide adenylyltransferase region  34.41 
 
 		 377 aa  102  4e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1213  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  33.19 
 
 		 479 aa  101  7e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0212  polyA polymerase  37.99 
 
 		 404 aa  101  8e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.809405  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03261  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  32.97 
 
 		 415 aa  100  1e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03361  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  31.43 
 
 		 415 aa  99.8  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0600629  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1151  polyA polymerase family protein  32.31 
 
 		 475 aa  98.6  5e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.71029 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03271  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  32.42 
 
 		 415 aa  98.6  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.163609  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0992  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  34.44 
 
 		 471 aa  97.8  7e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2857  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  35.43 
 
 		 484 aa  97.8  9e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.858546  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_276  polymerase  26.63 
 
 		 501 aa  97.4  9e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000457601  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25491  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  36.22 
 
 		 415 aa  97.1  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3525  Polynucleotide adenylyltransferase region  39.9 
 
 		 448 aa  97.1  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.224253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0305  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  31.87 
 
 		 415 aa  97.1  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.535708  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23340  tRNA adenylyltransferase  34.94 
 
 		 483 aa  95.9  3e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2184  polyA polymerase family protein  27.32 
 
 		 430 aa  94.7  7e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.459849  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03291  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  32.35 
 
 		 421 aa  94.4  9e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.418266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0389  polynucleotide adenylyltransferase  35.19 
 
 		 406 aa  92.8  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31221  predicted protein  34.91 
 
 		 559 aa  92.8  3e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.443393 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0497  metal dependent phosphohydrolase  27.11 
 
 		 492 aa  91.3  7e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0756  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  25.54 
 
 		 401 aa  90.5  1e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.525982  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0767  tRNA CCA-pyrophosphorylase  27.25 
 
 		 403 aa  89.7  2e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.746315  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3120  polynucleotide adenylyltransferase region  31.25 
 
 		 450 aa  89  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3102  metal-dependent phosphohydrolase  31.4 
 
 		 552 aa  89  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0908  tRNA CCA-pyrophosphorylase  27.21 
 
 		 398 aa  89.4  3e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000445275 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>