More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5821 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_5821  signal-transduction protein  100 
 
 
231 aa  462  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.12685 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1094  signal-transduction protein  56.47 
 
 
230 aa  259  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5888  CBS domain-containing protein  54.08 
 
 
242 aa  236  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361711  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  52.59 
 
 
230 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  46.52 
 
 
230 aa  194  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1873  hypothetical protein  45.65 
 
 
229 aa  192  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6307  putative signal transduction protein with CBS domains  44.78 
 
 
229 aa  187  8e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1933  CBS domain-containing protein  44.64 
 
 
228 aa  177  8e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.316651  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1028  CBS domain containing membrane protein  45.16 
 
 
226 aa  176  2e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0495705 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1344  putative signal-transduction protein with CBS domains  42.54 
 
 
243 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3596  CBS domain-containing protein  43.04 
 
 
241 aa  172  5e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.247468  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4051  signal-transduction protein  41.67 
 
 
242 aa  171  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5760  hypothetical protein  41.13 
 
 
242 aa  171  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.594459 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1365  signal-transduction protein  40.79 
 
 
243 aa  168  7e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.831809  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4725  putative signal transduction protein with CBS domains  39.47 
 
 
243 aa  165  5e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0680  hypothetical protein  41.59 
 
 
249 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.480825 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1912  signal-transduction protein  39.91 
 
 
242 aa  161  8.000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0206039  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1023  hypothetical protein  41.74 
 
 
243 aa  161  1e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1947  signal-transduction protein  41.07 
 
 
226 aa  154  1e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.489577  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1902  CBS domain-containing protein  40.44 
 
 
231 aa  149  5e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6177  transport-associated  43.41 
 
 
198 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.896076  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  39.11 
 
 
246 aa  138  6e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2338  CBS domain containing membrane protein  38.16 
 
 
247 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3570  CBS domain-containing protein  38.43 
 
 
246 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2997  signal-transduction protein  35.96 
 
 
223 aa  124  9e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1228  signal-transduction protein  41.5 
 
 
339 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4019  hypothetical protein  39.33 
 
 
339 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.191976  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1897  signal-transduction protein  32.91 
 
 
231 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1413  putative signal-transduction protein with CBS domains  41.1 
 
 
338 aa  112  5e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1630  signal-transduction protein  32.58 
 
 
233 aa  106  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2233  CBS domain-containing protein  34.26 
 
 
232 aa  103  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2202  putative signal transduction protein with CBS domains  32.02 
 
 
236 aa  101  9e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0610  signal-transduction protein  39.16 
 
 
348 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909822  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0646  CBS  40 
 
 
332 aa  98.6  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  35.66 
 
 
149 aa  95.9  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0305  CBS domain containing membrane protein  36.3 
 
 
147 aa  95.5  7e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  39.33 
 
 
153 aa  94.4  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0264  CBS domain-containing protein  38.93 
 
 
153 aa  94  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2008  CBS  35.48 
 
 
330 aa  92.8  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1812  CBS domain containing membrane protein  37.5 
 
 
132 aa  92  7e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2522  CBS domain containing membrane protein  35.59 
 
 
235 aa  91.7  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0807239 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  35.42 
 
 
155 aa  90.5  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1883  CBS domain-containing protein  31.82 
 
 
154 aa  90.9  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  36.91 
 
 
152 aa  88.6  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3889  signal-transduction protein  30.3 
 
 
217 aa  88.6  8e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4751  CBS domain containing membrane protein  38.62 
 
 
154 aa  88.2  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142923  hitchhiker  0.00000010565 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0393  CBS domain-containing membrane protein  36.08 
 
 
193 aa  87.8  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.464074  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1801  CBS domain-containing protein  32.39 
 
 
149 aa  87  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0256126  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2529  CBS domain containing membrane protein  33.8 
 
 
149 aa  87.4  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00130386  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3002  signal-transduction protein  37.22 
 
 
333 aa  87.4  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1824  CBS  37.58 
 
 
154 aa  85.9  5e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.539518 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  34.67 
 
 
155 aa  85.5  7e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  35.33 
 
 
152 aa  85.1  7e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1882  CBS domain-containing protein  30.28 
 
 
149 aa  84  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000211918  hitchhiker  0.00000438045 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0490  signal transduction protein  37.58 
 
 
158 aa  84  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3021  CBS domain containing membrane protein  32.64 
 
 
149 aa  84  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4814  CBS domain containing membrane protein  35.23 
 
 
226 aa  83.6  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107222  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1262  CBS domain containing membrane protein  31.94 
 
 
149 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00178252  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  37.24 
 
 
153 aa  82.8  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1851  CBS domain-containing protein  34.03 
 
 
120 aa  82.4  0.000000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3960  CBS domain containing protein  35.81 
 
 
153 aa  82  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4005  CBS domain containing protein  35.81 
 
 
153 aa  82  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2138  putative signal transduction protein with CBS domains  34.42 
 
 
151 aa  80.9  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0591  signal-transduction protein  36.43 
 
 
155 aa  80.1  0.00000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0331315  normal  0.426072 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2521  signal transduction protein  34.46 
 
 
161 aa  80.1  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2320  CBS domain-containing protein  32.88 
 
 
150 aa  78.6  0.00000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000465345  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1201  CBS domain-containing protein  30.28 
 
 
152 aa  78.6  0.00000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000963836  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2812  CBS domain containing membrane protein  37.09 
 
 
201 aa  77.8  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718769  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1105  CBS domain containing membrane protein  31.46 
 
 
228 aa  78.2  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2002  hypothetical protein  33.33 
 
 
154 aa  77.4  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.584772  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1134  signal transduction protein  30.67 
 
 
151 aa  77.4  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1851  CBS domain containing membrane protein  31.94 
 
 
151 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.309684  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1490  signal transduction protein  33.76 
 
 
150 aa  75.9  0.0000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0133707  normal  0.421198 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  31.43 
 
 
427 aa  75.9  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1341  CBS domain-containing protein  33.11 
 
 
154 aa  75.5  0.0000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1253  CBS domain-containing protein  31.72 
 
 
150 aa  75.5  0.0000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.515572 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2966  signal-transduction protein  32.85 
 
 
132 aa  75.1  0.0000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0278  CBS domain containing membrane protein  29.53 
 
 
150 aa  75.1  0.0000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10697 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_8994  predicted protein  39.42 
 
 
133 aa  75.1  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2260  CBS domain-containing protein  30.99 
 
 
150 aa  74.7  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000586041  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  29.49 
 
 
161 aa  73.9  0.000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3300  CBS domain containing protein  35.66 
 
 
216 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0947  CBS domain containing protein  35.66 
 
 
216 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0017149 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2041  CBS domain containing membrane protein  30.36 
 
 
227 aa  73.6  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000255814  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  31.76 
 
 
152 aa  73.6  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2340  signal transduction protein  30.38 
 
 
163 aa  73.2  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0394  CBS domain-containing membrane protein  35.53 
 
 
201 aa  72.8  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.474769  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0675  signal transduction protein  33.56 
 
 
153 aa  72.8  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.302021  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1395  signal transduction protein  33.56 
 
 
153 aa  72.4  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1108  CBS domain containing membrane protein  29.39 
 
 
221 aa  72  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1879  CBS  33.56 
 
 
157 aa  71.2  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2046  CBS  29.86 
 
 
150 aa  70.9  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.455097  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2651  putative signal transduction protein with CBS domains  31.82 
 
 
161 aa  70.5  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.440356 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17501  IMP dehydrogenase-like protein  33.11 
 
 
156 aa  70.1  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0803  signal transduction protein  34.97 
 
 
160 aa  70.1  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.708068  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1281  signal transduction protein  32.03 
 
 
153 aa  70.1  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.366949  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2844  CBS domain-containing protein  32.05 
 
 
428 aa  69.7  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27290  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.28 
 
 
628 aa  69.7  0.00000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3042  CBS  29.87 
 
 
241 aa  68.9  0.00000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1895  CBS domain-containing protein  31.39 
 
 
133 aa  68.9  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.272783 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>