More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1028 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1028  CBS domain containing membrane protein  100 
 
 		 226 aa  447  1e-125  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0495705 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  39.73 
 
 		 230 aa  180  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  44.59 
 
 		 230 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5821  signal-transduction protein  45.16 
 
 		 231 aa  176  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.12685 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3596  CBS domain-containing protein  41.74 
 
 		 241 aa  174  7e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.247468  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1094  signal-transduction protein  42.15 
 
 		 230 aa  174  8e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1933  CBS domain-containing protein  38.39 
 
 		 228 aa  170  1e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.316651  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1902  CBS domain-containing protein  38.57 
 
 		 231 aa  170  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5888  CBS domain-containing protein  43.3 
 
 		 242 aa  169  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1873  hypothetical protein  41.59 
 
 		 229 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6307  putative signal transduction protein with CBS domains  41.63 
 
 		 229 aa  164  8e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5760  hypothetical protein  37.67 
 
 		 242 aa  161  7e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.594459 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4051  signal-transduction protein  36.32 
 
 		 242 aa  155  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4725  putative signal transduction protein with CBS domains  36.32 
 
 		 243 aa  155  4e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1365  signal-transduction protein  36 
 
 		 243 aa  149  3e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.831809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0680  hypothetical protein  36.94 
 
 		 249 aa  146  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.480825 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  36.04 
 
 		 246 aa  145  6e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1344  putative signal-transduction protein with CBS domains  34.53 
 
 		 243 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1912  signal-transduction protein  34.08 
 
 		 242 aa  138  6e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0206039  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1947  signal-transduction protein  35.4 
 
 		 226 aa  137  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.489577  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1897  signal-transduction protein  33.33 
 
 		 231 aa  133  3e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2997  signal-transduction protein  34.51 
 
 		 223 aa  132  5e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1023  hypothetical protein  34.22 
 
 		 243 aa  131  7.999999999999999e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2338  CBS domain containing membrane protein  36.49 
 
 		 247 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1630  signal-transduction protein  34.08 
 
 		 233 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6177  transport-associated  37.97 
 
 		 198 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.896076  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3570  CBS domain-containing protein  36.12 
 
 		 246 aa  123  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2233  CBS domain-containing protein  36.44 
 
 		 232 aa  118  6e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0610  signal-transduction protein  40.38 
 
 		 348 aa  112  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4019  hypothetical protein  38.12 
 
 		 339 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.191976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2202  putative signal transduction protein with CBS domains  31.28 
 
 		 236 aa  107  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1228  signal-transduction protein  35 
 
 		 339 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  33.56 
 
 		 155 aa  103  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1413  putative signal-transduction protein with CBS domains  37.67 
 
 		 338 aa  102  4e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2522  CBS domain containing membrane protein  33.63 
 
 		 235 aa  101  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0807239 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  34.25 
 
 		 149 aa  97.8  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4751  CBS domain containing membrane protein  39.86 
 
 		 154 aa  97.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142923  hitchhiker  0.00000010565 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4814  CBS domain containing membrane protein  33.33 
 
 		 226 aa  97.4  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0264  CBS domain-containing protein  34.01 
 
 		 153 aa  94.7  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1883  CBS domain-containing protein  29.61 
 
 		 154 aa  94  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3002  signal-transduction protein  38.36 
 
 		 333 aa  94  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  34.03 
 
 		 155 aa  92.4  5e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0305  CBS domain containing membrane protein  29.45 
 
 		 147 aa  92  7e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1824  CBS  34.67 
 
 		 154 aa  91.7  8e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.539518 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2812  CBS domain containing membrane protein  31.86 
 
 		 201 aa  90.1  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718769  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1887  CBS domain containing membrane protein  33.11 
 
 		 153 aa  90.1  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278261  normal  0.114824 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  31.29 
 
 		 152 aa  89.7  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3889  signal-transduction protein  32.74 
 
 		 217 aa  88.2  9e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0646  CBS  37.93 
 
 		 332 aa  87.8  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  33.11 
 
 		 153 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  30.61 
 
 		 153 aa  87  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2041  CBS domain containing membrane protein  27.16 
 
 		 227 aa  87  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000255814  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1201  CBS domain-containing protein  28.57 
 
 		 152 aa  86.7  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000963836  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17480  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  29.86 
 
 		 191 aa  85.9  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0591  signal-transduction protein  36.11 
 
 		 155 aa  85.5  6e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0331315  normal  0.426072 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1851  CBS domain containing membrane protein  30.14 
 
 		 151 aa  85.1  8e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.309684  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3042  CBS  31 
 
 		 241 aa  84.3  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2529  CBS domain containing membrane protein  33.1 
 
 		 149 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00130386  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1649  CBS domain-containing membrane protein  31 
 
 		 234 aa  83.6  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0176167  normal  0.734042 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1435  CBS domain containing protein  36.24 
 
 		 427 aa  84  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1851  CBS domain-containing protein  34.03 
 
 		 120 aa  83.2  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4005  CBS domain containing protein  31.29 
 
 		 153 aa  83.2  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3960  CBS domain containing protein  31.29 
 
 		 153 aa  83.2  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  27.15 
 
 		 152 aa  82.8  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1253  CBS domain-containing protein  29.53 
 
 		 150 aa  82.8  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.515572 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0393  CBS domain-containing membrane protein  30.59 
 
 		 193 aa  82.4  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.464074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1134  signal transduction protein  32.88 
 
 		 151 aa  81.6  0.000000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1879  CBS  32.89 
 
 		 157 aa  80.9  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  29.05 
 
 		 152 aa  81.6  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2021  CBS domain containing membrane protein  33.95 
 
 		 164 aa  80.1  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1341  CBS domain-containing protein  28.76 
 
 		 154 aa  80.1  0.00000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2844  CBS domain-containing protein  31.41 
 
 		 428 aa  79.7  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1812  CBS domain containing membrane protein  33.77 
 
 		 132 aa  79.3  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1105  CBS domain containing membrane protein  30.36 
 
 		 228 aa  79  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2232  CBS domain containing membrane protein  32.52 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2008  CBS  36.3 
 
 		 330 aa  79  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2521  signal transduction protein  30.92 
 
 		 161 aa  79  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 427 aa  78.6  0.00000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4839  CBS domain containing membrane protein  27.95 
 
 		 232 aa  78.6  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0490  signal transduction protein  34.39 
 
 		 158 aa  78.6  0.00000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0243  signal transduction protein  28.76 
 
 		 155 aa  77.8  0.0000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2451  CBS domain containing membrane protein  37.06 
 
 		 141 aa  77.4  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000150568  normal  0.0113314 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_8994  predicted protein  35.77 
 
 		 133 aa  77.8  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2046  CBS  28.77 
 
 		 150 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.455097  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2015  CBS domain containing membrane protein  33.78 
 
 		 368 aa  76.6  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00292892  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  32.05 
 
 		 161 aa  75.5  0.0000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1490  signal transduction protein  31.37 
 
 		 150 aa  74.7  0.0000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0133707  normal  0.421198 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0803  signal transduction protein  31.13 
 
 		 160 aa  75.1  0.0000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.708068  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1262  CBS domain containing membrane protein  27.4 
 
 		 149 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00178252  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1004  CBS domain-containing protein  28.77 
 
 		 149 aa  73.6  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024412  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3021  CBS domain containing membrane protein  27.4 
 
 		 149 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0991  CBS domain-containing protein  29.49 
 
 		 196 aa  73.9  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27290  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.72 
 
 		 628 aa  74.3  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0152  signal transduction protein  32.5 
 
 		 160 aa  73.9  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2138  putative signal transduction protein with CBS domains  29.41 
 
 		 151 aa  73.2  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0381  CBS domain-containing protein  31.47 
 
 		 688 aa  73.6  0.000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0243844 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1799  putative signal transduction protein with CBS domains  32.43 
 
 		 202 aa  72.8  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0446245  normal  0.0519326 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17501  IMP dehydrogenase-like protein  33.1 
 
 		 156 aa  72.8  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2260  CBS domain-containing protein  30.41 
 
 		 150 aa  72.4  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000586041  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0550  CBS domain-containing protein  31.51 
 
 		 146 aa  72.8  0.000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>