138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2340 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_2340  signal transduction protein  100 
 
 
163 aa  330  4e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03841  CBS domain pair, putative  28.19 
 
 
172 aa  73.9  0.0000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5821  signal-transduction protein  30.38 
 
 
231 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.12685 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5888  CBS domain-containing protein  30.67 
 
 
242 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361711  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2569  metal dependent phosphohydrolase  24.5 
 
 
171 aa  64.7  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1094  signal-transduction protein  28.57 
 
 
230 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1812  CBS domain containing membrane protein  27.7 
 
 
132 aa  61.6  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4725  putative signal transduction protein with CBS domains  28.93 
 
 
243 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1873  hypothetical protein  26.53 
 
 
229 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1883  CBS domain-containing protein  30.23 
 
 
154 aa  59.3  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0305  CBS domain containing membrane protein  29.14 
 
 
147 aa  59.7  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  32.91 
 
 
155 aa  58.2  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0394  CBS domain-containing membrane protein  26.49 
 
 
201 aa  57.4  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.474769  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1886  hypothetical protein  27.78 
 
 
291 aa  57  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2233  CBS domain-containing protein  27.7 
 
 
232 aa  57  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  28.08 
 
 
246 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  25.48 
 
 
155 aa  55.8  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  26.71 
 
 
230 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  25 
 
 
230 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6307  putative signal transduction protein with CBS domains  26.49 
 
 
229 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1882  CBS domain-containing protein  24.52 
 
 
149 aa  54.7  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000211918  hitchhiker  0.00000438045 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2997  signal-transduction protein  23.81 
 
 
223 aa  53.9  0.0000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2008  CBS  23.84 
 
 
330 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1228  signal-transduction protein  28.3 
 
 
339 aa  53.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0646  CBS  23.84 
 
 
332 aa  53.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2680  Chloride channel core  24.16 
 
 
879 aa  53.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1912  signal-transduction protein  29.11 
 
 
242 aa  52.4  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0206039  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1420  polyA polymerase family protein  25 
 
 
880 aa  52.8  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0185526  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5760  hypothetical protein  24.68 
 
 
242 aa  52.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.594459 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1201  CBS domain-containing protein  25.47 
 
 
152 aa  52.8  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000963836  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3436  Chloride channel core  24.16 
 
 
879 aa  53.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0610  signal-transduction protein  27.27 
 
 
348 aa  52.4  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909822  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0264  CBS domain-containing protein  24.34 
 
 
153 aa  52.4  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1023  hypothetical protein  22.94 
 
 
243 aa  52  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1344  putative signal-transduction protein with CBS domains  25.79 
 
 
243 aa  52  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  24.84 
 
 
149 aa  52  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2229  CBS domain-containing protein  23.68 
 
 
313 aa  52  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0130  hypothetical protein  25.16 
 
 
378 aa  50.8  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3889  signal-transduction protein  27.78 
 
 
217 aa  50.8  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4051  signal-transduction protein  26.42 
 
 
242 aa  50.8  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1253  CBS domain-containing protein  26.45 
 
 
150 aa  50.4  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.515572 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1947  signal-transduction protein  28.48 
 
 
226 aa  49.7  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.489577  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0304  signal transduction protein  27.05 
 
 
261 aa  49.3  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.123702  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0680  hypothetical protein  25.95 
 
 
249 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.480825 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1421  CBS domain-containing protein  25.17 
 
 
279 aa  49.3  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.351959  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3570  CBS domain-containing protein  27.03 
 
 
246 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1028  CBS domain containing membrane protein  24.81 
 
 
226 aa  49.7  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0495705 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1004  CBS domain-containing protein  22.93 
 
 
149 aa  48.9  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024412  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3021  CBS domain containing membrane protein  24.84 
 
 
149 aa  48.9  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1262  CBS domain containing membrane protein  24.84 
 
 
149 aa  48.9  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00178252  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1365  signal-transduction protein  25.16 
 
 
243 aa  48.5  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.831809  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0152  signal transduction protein  30.41 
 
 
160 aa  48.5  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2320  CBS domain-containing protein  26.11 
 
 
150 aa  48.5  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000465345  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1899  putative signal transduction protein with CBS domains  24.5 
 
 
149 aa  48.5  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1801  CBS domain-containing protein  26.45 
 
 
149 aa  48.1  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0256126  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1824  CBS  25.19 
 
 
154 aa  48.1  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.539518 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3596  CBS domain-containing protein  25.55 
 
 
241 aa  48.1  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.247468  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1851  CBS domain-containing protein  26.35 
 
 
120 aa  47.8  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2338  CBS domain containing membrane protein  24.31 
 
 
247 aa  48.1  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4814  CBS domain containing membrane protein  25.31 
 
 
226 aa  47.4  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107222  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3002  signal-transduction protein  25.64 
 
 
333 aa  47.4  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2812  CBS domain containing membrane protein  25 
 
 
201 aa  47.4  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718769  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1310  CBS  27.5 
 
 
213 aa  47.4  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  25.48 
 
 
152 aa  47  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  26 
 
 
256 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1108  CBS domain containing membrane protein  24.68 
 
 
221 aa  46.6  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1068  CBS domain-containing protein  29.58 
 
 
139 aa  47  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1796  CBS domain-containing protein  23.45 
 
 
315 aa  46.2  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.507937  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3080  putative signal transduction protein with CBS domains  24.66 
 
 
145 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0313978 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0393  CBS domain-containing membrane protein  23.72 
 
 
193 aa  46.6  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.464074  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2980  signal transduction protein  22.07 
 
 
423 aa  46.2  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1203  CBS domain-containing protein  25.34 
 
 
873 aa  45.8  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.452152  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0498  CBS domain-containing protein  23.81 
 
 
279 aa  45.4  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.235797  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0171  signal transduction protein  27.03 
 
 
132 aa  45.4  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.900499  normal  0.567274 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2844  CBS domain-containing protein  27.39 
 
 
428 aa  45.1  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4005  CBS domain containing protein  22.73 
 
 
153 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3960  CBS domain containing protein  22.73 
 
 
153 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2489  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  21.88 
 
 
657 aa  45.1  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0302  signal transduction protein  23.87 
 
 
282 aa  44.7  0.0005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.983478  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0591  signal-transduction protein  24.14 
 
 
155 aa  45.1  0.0005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0331315  normal  0.426072 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0675  signal transduction protein  27.08 
 
 
147 aa  44.7  0.0005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  21.66 
 
 
153 aa  44.7  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0339  CBS domain-containing protein  22.45 
 
 
279 aa  44.7  0.0006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.436853  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1895  CBS domain-containing protein  24.66 
 
 
133 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.272783 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0348  CBS domain-containing protein  27.12 
 
 
420 aa  44.3  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1413  putative signal-transduction protein with CBS domains  25.83 
 
 
338 aa  44.3  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2260  CBS domain-containing protein  23.75 
 
 
150 aa  44.3  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000586041  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2165  hypothetical protein  25.58 
 
 
291 aa  43.9  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.758559  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2351  CBS domain-containing protein  27.22 
 
 
283 aa  43.5  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000984272  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0383  putative signal transduction protein with CBS domains  28.7 
 
 
149 aa  43.9  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0412615  normal  0.799719 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0566  CBS domain-containing protein  23.13 
 
 
279 aa  43.5  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.565144  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2620  CBS domain protein  24.24 
 
 
146 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  24.18 
 
 
153 aa  43.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1851  CBS domain containing membrane protein  22.37 
 
 
151 aa  43.1  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.309684  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1126  putative signal transduction protein with CBS domains  24.66 
 
 
143 aa  42.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0684  polynucleotide adenylyltransferase region  23.97 
 
 
877 aa  42.4  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1197  signal-transduction protein  26.24 
 
 
280 aa  43.1  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.749795  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1703  CBS domain containing membrane protein  25.33 
 
 
148 aa  42.7  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311156  normal  0.0624027 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3591  Chloride channel core  22.92 
 
 
875 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0274826 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0415  signal-transduction protein  31.82 
 
 
145 aa  42.7  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.682078  normal  0.0782148 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>