More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0415 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_0415  signal-transduction protein  100 
 
 
145 aa  280  7.000000000000001e-75  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.682078  normal  0.0782148 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1488  signal-transduction protein  59.15 
 
 
142 aa  177  4.999999999999999e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.661715 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0255  signal-transduction protein  61.27 
 
 
142 aa  176  7e-44  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0155982  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1885  signal-transduction protein  51.72 
 
 
145 aa  169  1e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0338  signal-transduction protein  60 
 
 
145 aa  159  9e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1229  signal-transduction protein  60.74 
 
 
136 aa  158  2e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1597  signal-transduction protein  51.97 
 
 
141 aa  134  5e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0876  signal-transduction protein  51.54 
 
 
141 aa  131  3e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0628  signal-transduction protein  52.8 
 
 
141 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1395  signal-transduction protein  44.44 
 
 
141 aa  128  3e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0871644 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0633  signal-transduction protein  48.46 
 
 
141 aa  125  3e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.96504  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1339  signal-transduction protein  52.34 
 
 
160 aa  121  4e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.44426 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0362  signal-transduction protein  50 
 
 
139 aa  121  4e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0979  signal transduction protein  48.92 
 
 
139 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000114145 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1394  signal-transduction protein  48.74 
 
 
135 aa  117  6e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.136388 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1825  signal-transduction protein  50.74 
 
 
139 aa  111  3e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0201  signal-transduction protein  46.51 
 
 
138 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2105  signal-transduction protein  42.96 
 
 
138 aa  107  7.000000000000001e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.141062  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1479  signal-transduction protein  45.45 
 
 
126 aa  106  1e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0295  signal-transduction protein  47.48 
 
 
139 aa  99  2e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0624  signal-transduction protein  43.94 
 
 
143 aa  95.9  1e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0939  signal-transduction protein  42.98 
 
 
135 aa  90.9  5e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.120432  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0416  signal-transduction protein  36.97 
 
 
130 aa  90.5  7e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.498724  normal  0.0778746 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0417  signal transduction protein  45.74 
 
 
139 aa  90.5  8e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.694858  normal  0.0742839 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0381  CBS domain-containing protein  40 
 
 
688 aa  90.1  8e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0243844 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1844  CBS domain-containing protein  36.97 
 
 
688 aa  90.1  1e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1326  signal-transduction protein  44.12 
 
 
144 aa  89.4  1e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0620  signal-transduction protein  44.12 
 
 
144 aa  89.4  2e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0254  signal-transduction protein  38.79 
 
 
136 aa  87.8  4e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00659332  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0597  signal transduction protein  36.49 
 
 
145 aa  87  7e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  38.46 
 
 
688 aa  86.7  1e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0239  signal transduction protein  35.65 
 
 
128 aa  85.5  2e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.371768 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1425  signal-transduction protein  40.34 
 
 
144 aa  84  6e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.316039 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0964  putative signal transduction protein with CBS domains  35.19 
 
 
132 aa  83.2  0.000000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0280  signal-transduction protein  36.76 
 
 
141 aa  82.4  0.000000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.460001  normal  0.121609 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0914  putative signal transduction protein with CBS domains  38.98 
 
 
131 aa  80.1  0.000000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0000312526  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0253  signal-transduction protein  39.84 
 
 
140 aa  80.1  0.000000000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00276555  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4338  CBS domain-containing protein  33.05 
 
 
618 aa  79.7  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1762  signal-transduction protein  39.1 
 
 
139 aa  79  0.00000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3004  signal-transduction protein  42.98 
 
 
139 aa  78.2  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.159612  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3204  putative signal transduction protein with CBS domains  41.07 
 
 
139 aa  77.8  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.585184  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1393  signal transduction protein  40.16 
 
 
136 aa  77.8  0.00000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.137975 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4097  CBS domain-containing protein  36.17 
 
 
643 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003608  Signal transduction protein  37.6 
 
 
626 aa  77  0.00000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3103  putative signal-transduction protein with CBS domains  41.07 
 
 
139 aa  77  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0090  CBS signal-transduction protein  36.96 
 
 
629 aa  76.6  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.382061 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0397  putative signal transduction protein with CBS domains  37.98 
 
 
142 aa  75.5  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0148627  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1332  signal-transduction protein  33.59 
 
 
139 aa  75.5  0.0000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.660277  normal  0.443449 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1251  signal-transduction protein  36.44 
 
 
131 aa  75.5  0.0000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.904359  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4702  cyclic nucleotide-binding/CBS:putative nucleotidyltransferase  36.69 
 
 
644 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1043  cyclic nucleotide-binding protein  33.1 
 
 
624 aa  75.1  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0471  nucleotidyltransferase, putative  36.69 
 
 
622 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0554  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  34.4 
 
 
637 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2970  signal-transduction protein  44.55 
 
 
187 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2052  cyclic nucleotide-binding protein  41.8 
 
 
663 aa  74.3  0.0000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.19282 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5185  cyclic nucleotide-binding (cNMP-bd) protein  34.51 
 
 
646 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.255954  normal  0.285696 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1143  signal-transduction protein  35.11 
 
 
138 aa  72.8  0.000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.430444 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2080  signal-transduction protein  40.87 
 
 
141 aa  73.2  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3932  CBS domain-containing protein  36.15 
 
 
623 aa  73.2  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.177243  normal  0.11098 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1225  signal-transduction protein  35.83 
 
 
127 aa  73.6  0.000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.276884  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0663  signal-transduction protein  37.82 
 
 
127 aa  72.8  0.000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1855  CBS domain-containing protein  46.25 
 
 
88 aa  72.4  0.000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2231  signal-transduction protein  31.34 
 
 
188 aa  70.9  0.000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.943647  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1696  CBS domain-containing protein  34.48 
 
 
143 aa  70.9  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.28583  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1915  signal-transduction protein  34.56 
 
 
144 aa  70.5  0.000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.414103  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0225  CBS domain-containing protein  37.9 
 
 
145 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.791993 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0233  putative signal transduction protein with CBS domains  34.55 
 
 
140 aa  70.1  0.000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193926  normal  0.17761 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0947  CBS domain-containing protein  33.98 
 
 
689 aa  69.7  0.00000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7035  CBS domain-containing protein  37.9 
 
 
150 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.819335  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2342  CBS domain-containing protein  36.99 
 
 
150 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.72552 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1046  signal-transduction protein  38.39 
 
 
142 aa  69.7  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.460697  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3348  putative nucleotidyltransferase  33.33 
 
 
646 aa  69.7  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.351645  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1851  CBS domain-containing protein  38.33 
 
 
120 aa  68.6  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1474  signal transduction protein  36.13 
 
 
128 aa  68.9  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0202  CBS domain-containing protein  37.1 
 
 
145 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.025801  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0335  hypothetical protein  34.38 
 
 
144 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02457  hypothetical protein  32.67 
 
 
626 aa  68.6  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03090  CBS domain-containing protein  34.38 
 
 
144 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.17742  hitchhiker  0.000000481482 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0382  CBS domain-containing protein  34.29 
 
 
645 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.263171 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2620  CBS domain protein  33.33 
 
 
146 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2537  putative signal transduction protein with CBS domains  39.09 
 
 
143 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.482232 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2262  CBS domain-containing protein  39.09 
 
 
143 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.175418 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2203  hypothetical protein  37.17 
 
 
144 aa  67.4  0.00000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0629  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.48 
 
 
667 aa  67  0.00000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2007  CBS domain-containing protein  33.08 
 
 
623 aa  67.4  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232416  decreased coverage  0.00139706 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0354  CBS domain-containing protein  33.57 
 
 
645 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.466174 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0040  CBS  35.83 
 
 
146 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.847902  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5476  putative signal transduction protein with CBS domains  37.04 
 
 
145 aa  66.6  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3539  signal-transduction protein  35.48 
 
 
146 aa  66.2  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.278615 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0272  CBS domain-containing protein  36.94 
 
 
145 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2292  CBS domain-containing protein  42.74 
 
 
137 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.173837  hitchhiker  0.00000858428 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0364  signal-transduction protein  32.06 
 
 
139 aa  66.2  0.0000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.612757 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1025  cyclic nucleotide-binding protein  36.69 
 
 
645 aa  66.2  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0774  putative signal transduction protein with CBS domains  43.64 
 
 
143 aa  66.6  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2219  putative signal-transduction protein with CBS domains  38.18 
 
 
143 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0827472 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1009  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  34.53 
 
 
649 aa  66.2  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.959275  normal  0.0476299 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2247  putative signal transduction protein with CBS domains  39.68 
 
 
142 aa  65.9  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000297093  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0631  signal-transduction protein  39.32 
 
 
142 aa  65.5  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0667586  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0100  putative cyclic nucleotide binding protein  29.84 
 
 
626 aa  65.9  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0568  signal-transduction protein  29.51 
 
 
133 aa  66.2  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.706815 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>