More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1488 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1488  signal-transduction protein  100 
 
 		 142 aa  281  2.0000000000000002e-75  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.661715 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1885  signal-transduction protein  80.28 
 
 		 145 aa  241  3.9999999999999997e-63  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0338  signal-transduction protein  73.79 
 
 		 145 aa  214  2.9999999999999998e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0415  signal-transduction protein  59.15 
 
 		 145 aa  177  4.999999999999999e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.682078  normal  0.0782148 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1229  signal-transduction protein  59.85 
 
 		 136 aa  169  7.999999999999999e-42  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0255  signal-transduction protein  54.93 
 
 		 142 aa  149  2e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0155982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0876  signal-transduction protein  50.78 
 
 		 141 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0633  signal-transduction protein  47.66 
 
 		 141 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.96504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1597  signal-transduction protein  49.21 
 
 		 141 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1395  signal-transduction protein  46.27 
 
 		 141 aa  122  1e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0871644 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0628  signal-transduction protein  47.5 
 
 		 141 aa  114  5e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0979  signal transduction protein  44.12 
 
 		 139 aa  110  4.0000000000000004e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000114145 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1394  signal-transduction protein  42.86 
 
 		 135 aa  106  1e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.136388 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0201  signal-transduction protein  43.85 
 
 		 138 aa  106  1e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1339  signal-transduction protein  37.5 
 
 		 160 aa  106  1e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.44426 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0362  signal-transduction protein  44.8 
 
 		 139 aa  106  1e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1825  signal-transduction protein  44.12 
 
 		 139 aa  105  2e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2105  signal-transduction protein  45.31 
 
 		 138 aa  103  5e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.141062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1844  CBS domain-containing protein  43.59 
 
 		 688 aa  99  2e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  42.74 
 
 		 688 aa  98.6  3e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1479  signal-transduction protein  42.15 
 
 		 126 aa  95.9  2e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0254  signal-transduction protein  41.67 
 
 		 136 aa  90.5  8e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00659332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0295  signal-transduction protein  41.73 
 
 		 139 aa  89.7  1e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0914  putative signal transduction protein with CBS domains  43.59 
 
 		 131 aa  86.3  1e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0000312526  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0597  signal transduction protein  42.86 
 
 		 145 aa  85.1  3e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0417  signal transduction protein  42.54 
 
 		 139 aa  84.7  3e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.694858  normal  0.0742839 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0381  CBS domain-containing protein  40.74 
 
 		 688 aa  85.1  3e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0243844 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0939  signal-transduction protein  39.67 
 
 		 135 aa  84.3  4e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.120432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0416  signal-transduction protein  36.72 
 
 		 130 aa  84.3  5e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.498724  normal  0.0778746 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0397  putative signal transduction protein with CBS domains  40.32 
 
 		 142 aa  83.6  9e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0148627  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0253  signal-transduction protein  38.81 
 
 		 140 aa  83.2  0.000000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00276555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0239  signal transduction protein  38.66 
 
 		 128 aa  81.6  0.000000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.371768 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0624  signal-transduction protein  37.88 
 
 		 143 aa  80.1  0.000000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0964  putative signal transduction protein with CBS domains  34.43 
 
 		 132 aa  78.6  0.00000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1393  signal transduction protein  38.35 
 
 		 136 aa  76.3  0.0000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.137975 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1425  signal-transduction protein  34.21 
 
 		 144 aa  73.6  0.0000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.316039 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1855  CBS domain-containing protein  47.5 
 
 		 88 aa  73.6  0.0000000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1332  signal-transduction protein  38.66 
 
 		 139 aa  73.2  0.000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.660277  normal  0.443449 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4338  CBS domain-containing protein  31.62 
 
 		 618 aa  72  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3204  putative signal transduction protein with CBS domains  39.6 
 
 		 139 aa  72  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.585184  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6173  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  36.44 
 
 		 837 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3004  signal-transduction protein  39.6 
 
 		 139 aa  71.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.159612  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0280  signal-transduction protein  32.35 
 
 		 141 aa  71.6  0.000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.460001  normal  0.121609 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0471  nucleotidyltransferase, putative  33.33 
 
 		 622 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0568  signal-transduction protein  33.61 
 
 		 133 aa  71.6  0.000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.706815 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3103  putative signal-transduction protein with CBS domains  39.6 
 
 		 139 aa  71.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1143  signal-transduction protein  38.52 
 
 		 138 aa  70.9  0.000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.430444 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1326  signal-transduction protein  36.29 
 
 		 144 aa  71.2  0.000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0228  CBS domain-containing protein  36.94 
 
 		 145 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0272  CBS domain-containing protein  36.04 
 
 		 145 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2231  signal-transduction protein  32.85 
 
 		 188 aa  70.5  0.000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.943647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0620  signal-transduction protein  36.29 
 
 		 144 aa  70.1  0.000000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1762  signal-transduction protein  39.5 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0364  signal-transduction protein  41.18 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.612757 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0202  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.025801  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2620  CBS domain protein  35.71 
 
 		 146 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2052  cyclic nucleotide-binding protein  33.09 
 
 		 663 aa  68.2  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.19282 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03090  CBS domain-containing protein  33.94 
 
 		 144 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.17742  hitchhiker  0.000000481482 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1851  CBS domain-containing protein  37.96 
 
 		 120 aa  67.8  0.00000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4702  cyclic nucleotide-binding/CBS:putative nucleotidyltransferase  30.83 
 
 		 644 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0705  putative signal transduction protein with CBS domains  33.87 
 
 		 124 aa  67  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.108789  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0410  putative CBS domain-containing signal transduction protein  35.19 
 
 		 124 aa  67  0.00000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.269207  normal  0.258379 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0335  hypothetical protein  33.03 
 
 		 144 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0225  CBS domain-containing protein  32.54 
 
 		 145 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.791993 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0090  CBS signal-transduction protein  30.43 
 
 		 629 aa  67  0.00000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.382061 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2880  signal-transduction protein  34.06 
 
 		 145 aa  67  0.00000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.982708  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0420  signal-transduction protein  35.25 
 
 		 158 aa  66.2  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1266  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  35.59 
 
 		 649 aa  66.2  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2661  signal-transduction protein  37.61 
 
 		 177 aa  66.2  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.63207  normal  0.665873 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1811  cyclic nucleotide-binding protein  25.98 
 
 		 625 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2970  signal-transduction protein  35.64 
 
 		 187 aa  65.5  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2707  signal-transduction protein  37.27 
 
 		 141 aa  65.9  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1043  cyclic nucleotide-binding protein  35.04 
 
 		 624 aa  65.5  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1225  signal-transduction protein  34.62 
 
 		 127 aa  65.5  0.0000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.276884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0774  putative signal transduction protein with CBS domains  37.7 
 
 		 143 aa  65.1  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1863  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  30.43 
 
 		 625 aa  65.1  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0994673  normal  0.46863 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0198  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.43 
 
 		 1344 aa  64.7  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.592297 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2342  CBS domain-containing protein  34.27 
 
 		 150 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.72552 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3268  CBS domain-containing protein  35.29 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06340  putative signal-transduction protein with CBS domains  32.77 
 
 		 141 aa  64.3  0.0000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0663  signal-transduction protein  34.11 
 
 		 127 aa  64.3  0.0000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0770  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.82 
 
 		 603 aa  63.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.461269  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4587  signal-transduction protein  36.29 
 
 		 153 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00378118  hitchhiker  0.00177049 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2480  CBS domain-containing protein  31.15 
 
 		 639 aa  63.5  0.0000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.218166  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0822  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  31.82 
 
 		 603 aa  63.5  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3238  putative signal transduction protein with CBS domains  33.04 
 
 		 138 aa  63.9  0.0000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.365049  normal  0.128899 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0100  putative signal transduction protein with CBS domains  31.71 
 
 		 143 aa  63.5  0.0000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1251  signal-transduction protein  30.58 
 
 		 131 aa  63.2  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.904359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3932  CBS domain-containing protein  28.93 
 
 		 623 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.177243  normal  0.11098 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0695  putative signal-transduction protein with CBS domains  33.33 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0173289  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0818  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  31.82 
 
 		 603 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.410169  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0947  CBS domain-containing protein  34.74 
 
 		 689 aa  63.2  0.000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0233  putative signal transduction protein with CBS domains  32.73 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193926  normal  0.17761 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3056  putative signal-transduction protein with CBS domains  35.34 
 
 		 143 aa  63.5  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.185367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  33.05 
 
 		 845 aa  63.2  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1304  signal-transduction protein  27.5 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000185547 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1108  signal-transduction protein  36.04 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0188  signal-transduction protein  33.33 
 
 		 128 aa  63.5  0.000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.885258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1905  putative signal transduction protein with CBS domains  32.41 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2096  signal-transduction protein  33.06 
 
 		 137 aa  62  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>