More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0417 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_0417  signal transduction protein  100 
 
 
139 aa  273  7e-73  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.694858  normal  0.0742839 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0253  signal-transduction protein  75.36 
 
 
140 aa  225  1e-58  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00276555  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1393  signal transduction protein  52.94 
 
 
136 aa  147  4e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.137975 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0362  signal-transduction protein  45.99 
 
 
139 aa  120  9e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0620  signal-transduction protein  46.27 
 
 
144 aa  116  7.999999999999999e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1326  signal-transduction protein  45.52 
 
 
144 aa  117  7.999999999999999e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0979  signal transduction protein  40.88 
 
 
139 aa  105  2e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000114145 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0624  signal-transduction protein  45.19 
 
 
143 aa  104  3e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0397  putative signal transduction protein with CBS domains  43.1 
 
 
142 aa  104  4e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0148627  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0280  signal-transduction protein  39.68 
 
 
141 aa  102  1e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.460001  normal  0.121609 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0939  signal-transduction protein  42.98 
 
 
135 aa  102  2e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.120432  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0239  signal transduction protein  42.24 
 
 
128 aa  100  7e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.371768 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1825  signal-transduction protein  39.42 
 
 
139 aa  99.4  2e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1479  signal-transduction protein  40.8 
 
 
126 aa  97.1  7e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0914  putative signal transduction protein with CBS domains  38.46 
 
 
131 aa  94.4  4e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0000312526  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0201  signal-transduction protein  40.48 
 
 
138 aa  92.8  1e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1597  signal-transduction protein  41.04 
 
 
141 aa  93.2  1e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0876  signal-transduction protein  39.86 
 
 
141 aa  92.4  2e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0964  putative signal transduction protein with CBS domains  37.93 
 
 
132 aa  90.5  7e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0415  signal-transduction protein  45.74 
 
 
145 aa  90.5  8e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.682078  normal  0.0782148 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0338  signal-transduction protein  45.53 
 
 
145 aa  89.7  1e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1394  signal-transduction protein  42.15 
 
 
135 aa  89  2e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.136388 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1229  signal-transduction protein  45.8 
 
 
136 aa  87.4  6e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2105  signal-transduction protein  38.58 
 
 
138 aa  85.9  2e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.141062  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1488  signal-transduction protein  42.54 
 
 
142 aa  84.7  3e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.661715 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0628  signal-transduction protein  39.55 
 
 
141 aa  84.3  4e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0295  signal-transduction protein  41.67 
 
 
139 aa  84  6e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1885  signal-transduction protein  40.34 
 
 
145 aa  82.4  0.000000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1844  CBS domain-containing protein  40.83 
 
 
688 aa  81.6  0.000000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  41.67 
 
 
688 aa  81.6  0.000000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1395  signal-transduction protein  42.15 
 
 
141 aa  81.3  0.000000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0871644 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0416  signal-transduction protein  34.4 
 
 
130 aa  79.3  0.00000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.498724  normal  0.0778746 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0597  signal transduction protein  34.78 
 
 
145 aa  79.7  0.00000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0633  signal-transduction protein  35.82 
 
 
141 aa  80.1  0.00000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.96504  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0255  signal-transduction protein  39.69 
 
 
142 aa  78.6  0.00000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0155982  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47178  predicted protein  35.25 
 
 
182 aa  76.3  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0254  signal-transduction protein  38.17 
 
 
136 aa  76.6  0.0000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00659332  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2051  putative signal transduction protein with CBS domains  31.09 
 
 
124 aa  74.7  0.0000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.787742  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1474  signal transduction protein  31.93 
 
 
128 aa  72.8  0.000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1635  cyclic nucleotide-binding/CBS/putative nucleotidyltransferase  36.94 
 
 
646 aa  72.8  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.5663  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0381  CBS domain-containing protein  38.39 
 
 
688 aa  71.6  0.000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0243844 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2583  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  35.04 
 
 
648 aa  72  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1339  signal-transduction protein  38.52 
 
 
160 aa  69.3  0.00000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.44426 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4152  signal-transduction protein  35.4 
 
 
486 aa  68.6  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.729428 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1394  putative signal-transduction protein with CBS domains  34.75 
 
 
485 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.332611  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1108  signal-transduction protein  35.4 
 
 
144 aa  68.2  0.00000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1025  cyclic nucleotide-binding protein  37.61 
 
 
645 aa  67.8  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4097  CBS domain-containing protein  34.19 
 
 
643 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7035  CBS domain-containing protein  36.09 
 
 
150 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.819335  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3630  signal-transduction protein  34.26 
 
 
122 aa  65.9  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.30892 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0446  putative signal transduction protein with CBS domains  35.11 
 
 
136 aa  65.9  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0212406  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2219  putative signal-transduction protein with CBS domains  36.28 
 
 
143 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0827472 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2052  cyclic nucleotide-binding protein  35.59 
 
 
663 aa  65.9  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.19282 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0471  nucleotidyltransferase, putative  32.79 
 
 
622 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0352  putative signal transduction protein with CBS domains  37.07 
 
 
143 aa  65.1  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.014797 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5005  signal-transduction protein  30.47 
 
 
144 aa  65.5  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1425  signal-transduction protein  36.67 
 
 
144 aa  65.5  0.0000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.316039 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1100  signal-transduction protein  37.96 
 
 
152 aa  64.7  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1022  cyclic nucleotide-binding protein  33.06 
 
 
613 aa  64.7  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0695  putative signal-transduction protein with CBS domains  35.96 
 
 
140 aa  64.7  0.0000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0173289  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2439  CBS domain-containing protein  32.2 
 
 
145 aa  64.3  0.0000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1360  CBS domain-containing protein  31.67 
 
 
143 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.565308  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3011  CBS domain-containing protein  31.67 
 
 
143 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.162521  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3139  CBS domain-containing protein  31.67 
 
 
143 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.533561  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0771  signal-transduction protein  36.73 
 
 
164 aa  63.9  0.0000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.411579  normal  0.0544722 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2080  signal-transduction protein  34.17 
 
 
141 aa  63.5  0.0000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4477  signal-transduction protein  34.17 
 
 
145 aa  63.5  0.0000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.458256  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3439  putative signal transduction protein with CBS domains  31.25 
 
 
141 aa  63.5  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.72224  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3375  putative signal-transduction protein with CBS domains  31.25 
 
 
141 aa  63.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0583  CBS domain-containing protein  29.77 
 
 
150 aa  62.4  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00772647  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3231  signal-transduction protein  37.93 
 
 
143 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00933533  normal  0.19525 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1938  CBS domain-containing protein  34.48 
 
 
143 aa  62.8  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.704039  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1905  putative signal transduction protein with CBS domains  37.27 
 
 
139 aa  62.4  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1169  signal-transduction protein  37.39 
 
 
149 aa  62.4  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3268  CBS domain-containing protein  37.07 
 
 
142 aa  62.4  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2355  signal-transduction protein  27.12 
 
 
145 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.302795  normal  0.112681 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2113  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  33.6 
 
 
644 aa  62.4  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0903  cyclic nucleotide-binding protein  34.21 
 
 
638 aa  62.8  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3788  putative signal transduction protein with CBS domains  38.93 
 
 
139 aa  61.6  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.534948  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4702  cyclic nucleotide-binding/CBS:putative nucleotidyltransferase  32.2 
 
 
644 aa  62  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5185  cyclic nucleotide-binding (cNMP-bd) protein  32.48 
 
 
646 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.255954  normal  0.285696 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1863  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  35.77 
 
 
625 aa  61.6  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0994673  normal  0.46863 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3298  signal-transduction protein  30.36 
 
 
141 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1251  signal-transduction protein  26.56 
 
 
131 aa  62  0.000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.904359  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4486  CBS domain-containing protein  34.71 
 
 
129 aa  61.6  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0214678 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0364  signal-transduction protein  32.77 
 
 
139 aa  61.6  0.000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.612757 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  31.62 
 
 
1560 aa  61.2  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2537  putative signal transduction protein with CBS domains  34.51 
 
 
143 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.482232 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1855  CBS domain-containing protein  45.45 
 
 
88 aa  61.6  0.000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2262  CBS domain-containing protein  34.51 
 
 
143 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.175418 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05910  cyclic nucleotide-binding protein  33.05 
 
 
645 aa  61.2  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0914238  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3238  putative signal transduction protein with CBS domains  37.29 
 
 
138 aa  61.2  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.365049  normal  0.128899 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1143  signal-transduction protein  28.8 
 
 
138 aa  60.8  0.000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.430444 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0532  signal-transduction protein  36.11 
 
 
126 aa  60.8  0.000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.392409  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2226  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.56 
 
 
498 aa  60.5  0.000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4848  CBS domain-containing protein  33.88 
 
 
645 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.602391  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5000  signal-transduction protein  33.88 
 
 
130 aa  60.5  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000125843 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1607  signal-transduction protein  33.63 
 
 
144 aa  60.5  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0484541 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1696  CBS domain-containing protein  30.95 
 
 
143 aa  60.5  0.000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.28583  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0380  CBS domain-containing protein  33.06 
 
 
645 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.488205  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>