229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_2105 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_2105  signal-transduction protein  100 
 
 
138 aa  271  2.0000000000000002e-72  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.141062  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0201  signal-transduction protein  76.81 
 
 
138 aa  214  2e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1855  CBS domain-containing protein  67.47 
 
 
88 aa  123  1e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0362  signal-transduction protein  45.11 
 
 
139 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0979  signal transduction protein  43.61 
 
 
139 aa  117  6e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000114145 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1229  signal-transduction protein  49.21 
 
 
136 aa  107  5e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0338  signal-transduction protein  45.74 
 
 
145 aa  107  5e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0415  signal-transduction protein  42.96 
 
 
145 aa  107  7.000000000000001e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.682078  normal  0.0782148 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1488  signal-transduction protein  45.31 
 
 
142 aa  103  5e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.661715 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0416  signal-transduction protein  45.83 
 
 
130 aa  102  2e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.498724  normal  0.0778746 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1395  signal-transduction protein  45.59 
 
 
141 aa  102  2e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0871644 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1825  signal-transduction protein  41.61 
 
 
139 aa  102  2e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1885  signal-transduction protein  40 
 
 
145 aa  95.9  2e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0628  signal-transduction protein  45.74 
 
 
141 aa  94.4  5e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0254  signal-transduction protein  45.83 
 
 
136 aa  94.4  5e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00659332  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0876  signal-transduction protein  42.06 
 
 
141 aa  92.8  1e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0633  signal-transduction protein  48.7 
 
 
141 aa  92.8  2e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.96504  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1394  signal-transduction protein  40.34 
 
 
135 aa  91.3  4e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.136388 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0255  signal-transduction protein  41.48 
 
 
142 aa  90.1  9e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0155982  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1597  signal-transduction protein  45.76 
 
 
141 aa  89.7  1e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0295  signal-transduction protein  45.8 
 
 
139 aa  88.2  3e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1479  signal-transduction protein  36.67 
 
 
126 aa  87  7e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0417  signal transduction protein  38.58 
 
 
139 aa  85.9  2e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.694858  normal  0.0742839 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0253  signal-transduction protein  35.2 
 
 
140 aa  84.3  5e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00276555  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0939  signal-transduction protein  33.88 
 
 
135 aa  84.3  5e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.120432  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1762  signal-transduction protein  38.76 
 
 
139 aa  83.6  8e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1332  signal-transduction protein  37.21 
 
 
139 aa  82.8  0.000000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.660277  normal  0.443449 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0364  signal-transduction protein  35.88 
 
 
139 aa  81.3  0.000000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.612757 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0914  putative signal transduction protein with CBS domains  42.02 
 
 
131 aa  78.2  0.00000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0000312526  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1143  signal-transduction protein  35.43 
 
 
138 aa  77.8  0.00000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.430444 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0239  signal transduction protein  33.05 
 
 
128 aa  76.3  0.0000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.371768 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1251  signal-transduction protein  41.32 
 
 
131 aa  76.6  0.0000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.904359  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0381  CBS domain-containing protein  38.79 
 
 
688 aa  76.3  0.0000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0243844 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1339  signal-transduction protein  34.88 
 
 
160 aa  75.1  0.0000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.44426 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1326  signal-transduction protein  39.34 
 
 
144 aa  73.9  0.0000000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0597  signal transduction protein  37.31 
 
 
145 aa  71.2  0.000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0397  putative signal transduction protein with CBS domains  35.16 
 
 
142 aa  70.1  0.000000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0148627  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1393  signal transduction protein  34.4 
 
 
136 aa  69.7  0.00000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.137975 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0620  signal-transduction protein  36.07 
 
 
144 aa  67.8  0.00000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0964  putative signal transduction protein with CBS domains  33.33 
 
 
132 aa  67.4  0.00000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1225  signal-transduction protein  36.51 
 
 
127 aa  67.4  0.00000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.276884  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1844  CBS domain-containing protein  33.61 
 
 
688 aa  66.6  0.0000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  33.61 
 
 
688 aa  66.2  0.0000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0947  CBS domain-containing protein  36.89 
 
 
689 aa  65.9  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0280  signal-transduction protein  30.09 
 
 
141 aa  65.5  0.0000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.460001  normal  0.121609 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4338  CBS domain-containing protein  35.59 
 
 
618 aa  60.5  0.000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0624  signal-transduction protein  32.08 
 
 
143 aa  60.1  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7035  CBS domain-containing protein  31.45 
 
 
150 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.819335  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0663  signal-transduction protein  33.33 
 
 
127 aa  56.6  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3669  putative signal transduction protein with CBS domains  32.23 
 
 
141 aa  55.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5919  signal-transduction protein  31.15 
 
 
162 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.512609  normal  0.346148 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6173  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.73 
 
 
837 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0188  signal-transduction protein  32.5 
 
 
128 aa  55.1  0.0000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.885258  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1474  signal transduction protein  28.23 
 
 
128 aa  54.7  0.0000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2096  signal-transduction protein  36.59 
 
 
137 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2142  signal-transduction protein  36.59 
 
 
137 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0386104 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2079  signal-transduction protein  36.59 
 
 
137 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.266751  normal  0.1743 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0532  signal-transduction protein  30.95 
 
 
126 aa  53.9  0.0000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.392409  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0554  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  32.48 
 
 
637 aa  53.9  0.0000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1863  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  34.51 
 
 
625 aa  53.5  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0994673  normal  0.46863 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2051  putative signal transduction protein with CBS domains  30.83 
 
 
124 aa  53.1  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.787742  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1395  putative signal transduction protein with CBS domains  34.95 
 
 
138 aa  52.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.319409  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2231  signal-transduction protein  28.69 
 
 
188 aa  52  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.943647  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2693  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.5 
 
 
873 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5005  signal-transduction protein  31.15 
 
 
144 aa  51.6  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0352  putative signal transduction protein with CBS domains  35.4 
 
 
143 aa  51.2  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.014797 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0695  putative signal-transduction protein with CBS domains  28.45 
 
 
140 aa  50.8  0.000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0173289  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2661  signal-transduction protein  36.94 
 
 
177 aa  50.8  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.63207  normal  0.665873 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1580  signal-transduction protein  31.15 
 
 
143 aa  50.4  0.000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0967784 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0642  putative signal transduction protein with CBS domains  29.27 
 
 
140 aa  50.4  0.000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.413978  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0774  putative signal transduction protein with CBS domains  32.03 
 
 
143 aa  50.4  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6177  CBS domain-containing protein  31.03 
 
 
149 aa  50.4  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2052  cyclic nucleotide-binding protein  35 
 
 
663 aa  50.4  0.000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.19282 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1905  putative signal transduction protein with CBS domains  32.08 
 
 
139 aa  50.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0410  putative CBS domain-containing signal transduction protein  31.4 
 
 
124 aa  49.7  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.269207  normal  0.258379 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2680  signal-transduction protein  28.33 
 
 
128 aa  50.1  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0686487 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0767  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  29.67 
 
 
675 aa  49.7  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000798179  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2478  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  27.12 
 
 
642 aa  49.3  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00776763 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1310  CBS  32.81 
 
 
213 aa  48.9  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3004  signal-transduction protein  31.58 
 
 
139 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.159612  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2342  CBS domain-containing protein  32.23 
 
 
150 aa  48.9  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.72552 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0782  CBS domain-containing protein  28.78 
 
 
185 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163079  normal  0.38781 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0631  signal-transduction protein  33.88 
 
 
189 aa  48.9  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0903  cyclic nucleotide-binding protein  30.71 
 
 
638 aa  48.9  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0568  signal-transduction protein  28 
 
 
133 aa  48.9  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.706815 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3204  putative signal transduction protein with CBS domains  30.83 
 
 
139 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.585184  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2247  putative signal transduction protein with CBS domains  29.23 
 
 
142 aa  48.9  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000297093  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7033  signal-transduction protein  24.24 
 
 
154 aa  48.1  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.365249  normal  0.472984 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3103  putative signal-transduction protein with CBS domains  30.83 
 
 
139 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1198  CBS  28.35 
 
 
139 aa  48.1  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4477  signal-transduction protein  31.9 
 
 
145 aa  48.1  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.458256  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1166  putative signal transduction protein with CBS domains  31.25 
 
 
134 aa  48.1  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.973852  normal  0.21805 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3630  signal-transduction protein  31.19 
 
 
122 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.30892 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0022  signal-transduction protein  30.95 
 
 
141 aa  47.8  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1968  nucleotidyltransferase family protein  30.56 
 
 
476 aa  47.8  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142573  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2226  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.79 
 
 
498 aa  47.4  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0173  signal-transduction protein  30.69 
 
 
130 aa  47.4  0.00007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1290  protein of unknown function DUF39  32.48 
 
 
502 aa  47.4  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0616948  normal  0.376218 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3959  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  26.92 
 
 
855 aa  47.4  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  26.02 
 
 
185 aa  47  0.00008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>