More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1395 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1395  putative signal transduction protein with CBS domains  100 
 
 		 138 aa  274  3e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.319409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5000  signal-transduction protein  61.34 
 
 		 130 aa  163  5.9999999999999996e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000125843 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4486  CBS domain-containing protein  61.34 
 
 		 129 aa  162  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0214678 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1905  putative signal transduction protein with CBS domains  59.17 
 
 		 139 aa  147  4e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0532  signal-transduction protein  56.67 
 
 		 126 aa  143  6e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.392409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6392  putative signal transduction protein with CBS domains  63.64 
 
 		 133 aa  141  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3630  signal-transduction protein  56.9 
 
 		 122 aa  139  9.999999999999999e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.30892 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1100  signal-transduction protein  53.72 
 
 		 152 aa  132  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1915  signal-transduction protein  35.83 
 
 		 144 aa  77.8  0.00000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.414103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2362  signal-transduction protein  41.07 
 
 		 143 aa  77  0.00000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.67854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1108  signal-transduction protein  38.05 
 
 		 144 aa  76.6  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3231  signal-transduction protein  37.27 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00933533  normal  0.19525 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2262  CBS domain-containing protein  36.36 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.175418 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2537  putative signal transduction protein with CBS domains  36.36 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.482232 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2219  putative signal-transduction protein with CBS domains  34.82 
 
 		 143 aa  73.9  0.0000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0827472 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1394  signal-transduction protein  36.59 
 
 		 135 aa  72.8  0.000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.136388 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3250  signal-transduction protein  33.58 
 
 		 174 aa  71.2  0.000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0271263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1745  hypothetical protein  34.45 
 
 		 144 aa  70.1  0.000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.87888 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2203  hypothetical protein  32 
 
 		 144 aa  68.2  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0416  signal-transduction protein  33.61 
 
 		 130 aa  68.2  0.00000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.498724  normal  0.0778746 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  33.33 
 
 		 148 aa  68.2  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  31.62 
 
 		 147 aa  67  0.00000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0896  putative signal transduction protein with CBS domains  39.13 
 
 		 124 aa  66.2  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.711423 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5476  putative signal transduction protein with CBS domains  35.51 
 
 		 145 aa  66.6  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1762  signal-transduction protein  36.67 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1143  signal-transduction protein  35.83 
 
 		 138 aa  66.2  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.430444 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5213  hypothetical protein  41.12 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal  0.0487848 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1332  signal-transduction protein  36.67 
 
 		 139 aa  65.5  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.660277  normal  0.443449 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0254  signal-transduction protein  36.7 
 
 		 136 aa  65.5  0.0000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00659332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0771  signal-transduction protein  39 
 
 		 164 aa  64.7  0.0000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.411579  normal  0.0544722 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  32.48 
 
 		 145 aa  64.7  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2400  CBS domain containing protein  33.85 
 
 		 143 aa  63.9  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000190312  decreased coverage  0.0000946646 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1580  signal-transduction protein  35.51 
 
 		 143 aa  64.3  0.0000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0967784 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2661  signal-transduction protein  33.33 
 
 		 177 aa  63.9  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.63207  normal  0.665873 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1597  signal-transduction protein  29.82 
 
 		 141 aa  64.3  0.0000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2880  signal-transduction protein  32.5 
 
 		 145 aa  63.9  0.0000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.982708  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1479  signal-transduction protein  34.75 
 
 		 238 aa  63.5  0.0000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.543565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0876  signal-transduction protein  29.82 
 
 		 141 aa  63.5  0.0000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0964  putative signal transduction protein with CBS domains  36.13 
 
 		 132 aa  63.2  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3725  signal-transduction protein  37.14 
 
 		 143 aa  63.5  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4635  signal-transduction protein  31.58 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.574258  normal  0.318433 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0188  signal-transduction protein  38.38 
 
 		 128 aa  62.4  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.885258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0628  signal-transduction protein  32.48 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0397  putative signal transduction protein with CBS domains  31.63 
 
 		 142 aa  62  0.000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0148627  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0381  CBS domain-containing protein  31.67 
 
 		 688 aa  61.6  0.000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0243844 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1844  hypothetical protein  32.48 
 
 		 144 aa  62  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0498  CBS domain-containing protein  30.71 
 
 		 279 aa  61.6  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.235797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5124  putative signal transduction protein with CBS domains  35.45 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.922703  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0415  signal-transduction protein  34.31 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.682078  normal  0.0782148 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1422  signal-transduction protein  32.2 
 
 		 186 aa  61.2  0.000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.216584  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0340  signal-transduction protein  32.2 
 
 		 186 aa  61.2  0.000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.189053  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0705  putative signal transduction protein with CBS domains  37.86 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.108789  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1339  signal-transduction protein  34.51 
 
 		 160 aa  61.2  0.000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.44426 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0914  putative signal transduction protein with CBS domains  32.77 
 
 		 131 aa  60.8  0.000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0000312526  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1395  signal-transduction protein  36.54 
 
 		 141 aa  60.8  0.000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0871644 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0565  signal-transduction protein  28.81 
 
 		 188 aa  60.5  0.000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0239  signal transduction protein  32.5 
 
 		 128 aa  60.5  0.000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.371768 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0633  signal-transduction protein  28.07 
 
 		 141 aa  60.1  0.000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.96504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1849  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  26.5 
 
 		 633 aa  59.7  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0656  CBS domain containing protein  30.51 
 
 		 142 aa  60.1  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3316  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1229  signal-transduction protein  34.17 
 
 		 136 aa  59.7  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1391  CBS domain-containing protein  34.23 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.769563 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0497  signal-transduction protein  32.5 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.835525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06340  putative signal-transduction protein with CBS domains  31.93 
 
 		 141 aa  60.1  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1474  signal transduction protein  35.04 
 
 		 128 aa  59.7  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2352  signal-transduction protein  31.03 
 
 		 142 aa  60.1  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.103406  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0339  CBS domain-containing protein  29.92 
 
 		 279 aa  58.9  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.436853  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0468  signal-transduction protein  33.33 
 
 		 326 aa  58.9  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.125396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2321  nucleotidyltransferase  28.15 
 
 		 627 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.477711  hitchhiker  0.00895935 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3268  CBS domain-containing protein  32.41 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0410  putative CBS domain-containing signal transduction protein  38 
 
 		 124 aa  58.9  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.269207  normal  0.258379 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0013  signal-transduction protein  32.54 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.371187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0352  putative signal transduction protein with CBS domains  32.71 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.014797 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0362  signal-transduction protein  33.33 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0597  signal transduction protein  34.26 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3271  putative signal-transduction protein with CBS domains  36.97 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311988 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0417  signal transduction protein  30.77 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.694858  normal  0.0742839 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1242  signal-transduction protein  32.17 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0687  CBS domain-containing protein  30.17 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.740174  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2961  CBS domain-containing proteins  32.43 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.195076  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0720  CBS domain-containing protein  30.17 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000162258  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3328  putative signal transduction protein with CBS domains  32.77 
 
 		 212 aa  58.2  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0253  signal-transduction protein  29.91 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00276555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0364  signal-transduction protein  32.5 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.612757 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1225  signal-transduction protein  30.25 
 
 		 127 aa  58.2  0.00000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.276884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1425  signal-transduction protein  34.45 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.316039 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2051  putative signal transduction protein with CBS domains  29.51 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.787742  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0631  CBS domain-containing protein  29.31 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000812315  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0620  signal-transduction protein  34.31 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1217  CBS domain-containing protein  32.43 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0663  signal-transduction protein  32.77 
 
 		 127 aa  57.8  0.00000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1607  signal-transduction protein  32.43 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0484541 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0380  CBS domain-containing protein  35.92 
 
 		 645 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.488205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4559  CBS domain protein  29.31 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000024778  normal  0.1618 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3744  signal transduction protein  36.36 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1421  CBS domain-containing protein  29.92 
 
 		 279 aa  56.6  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.351959  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3128  signal-transduction protein  32.77 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.192632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0255  signal-transduction protein  29.52 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0155982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4848  CBS domain-containing protein  34.62 
 
 		 645 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.602391  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>