More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1394 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_1394  signal-transduction protein  100 
 
 
135 aa  269  1e-71  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.136388 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0416  signal-transduction protein  55.91 
 
 
130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.498724  normal  0.0778746 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0254  signal-transduction protein  53.91 
 
 
136 aa  136  7.999999999999999e-32  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00659332  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0415  signal-transduction protein  48.74 
 
 
145 aa  117  7e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.682078  normal  0.0782148 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0362  signal-transduction protein  48.36 
 
 
139 aa  114  5e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0338  signal-transduction protein  46.22 
 
 
145 aa  114  6e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0939  signal-transduction protein  46.72 
 
 
135 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.120432  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1479  signal-transduction protein  47.54 
 
 
126 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1229  signal-transduction protein  44.54 
 
 
136 aa  107  5e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1488  signal-transduction protein  42.86 
 
 
142 aa  106  1e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.661715 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1825  signal-transduction protein  47.11 
 
 
139 aa  104  5e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1885  signal-transduction protein  41.18 
 
 
145 aa  104  5e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0255  signal-transduction protein  43.7 
 
 
142 aa  103  8e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0155982  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0979  signal transduction protein  41.32 
 
 
139 aa  98.2  3e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000114145 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1597  signal-transduction protein  40.35 
 
 
141 aa  95.1  3e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0633  signal-transduction protein  36.45 
 
 
141 aa  94  7e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.96504  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0253  signal-transduction protein  42.28 
 
 
140 aa  93.6  7e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00276555  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1339  signal-transduction protein  41.18 
 
 
160 aa  92.8  1e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.44426 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0914  putative signal transduction protein with CBS domains  38.98 
 
 
131 aa  92.4  2e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0000312526  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1844  CBS domain-containing protein  44.83 
 
 
688 aa  92.4  2e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1425  signal-transduction protein  44.07 
 
 
144 aa  91.7  3e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.316039 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2105  signal-transduction protein  40.34 
 
 
138 aa  91.3  4e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.141062  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  43.97 
 
 
688 aa  91.3  4e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0295  signal-transduction protein  44.63 
 
 
139 aa  90.1  8e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0239  signal transduction protein  39.32 
 
 
128 aa  89.7  1e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.371768 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0201  signal-transduction protein  37.82 
 
 
138 aa  90.1  1e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0417  signal transduction protein  42.15 
 
 
139 aa  89  2e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.694858  normal  0.0742839 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0964  putative signal transduction protein with CBS domains  39.32 
 
 
132 aa  87.4  6e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0876  signal-transduction protein  33.91 
 
 
141 aa  87  8e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0628  signal-transduction protein  33.9 
 
 
141 aa  84.3  5e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1225  signal-transduction protein  38.66 
 
 
127 aa  84  6e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.276884  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0568  signal-transduction protein  37.19 
 
 
133 aa  84  7e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.706815 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0280  signal-transduction protein  39.5 
 
 
141 aa  82.8  0.000000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.460001  normal  0.121609 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1393  signal transduction protein  36.97 
 
 
136 aa  82.8  0.000000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.137975 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1108  signal-transduction protein  41.74 
 
 
144 aa  80.1  0.000000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0397  putative signal transduction protein with CBS domains  34.17 
 
 
142 aa  79  0.00000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0148627  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1326  signal-transduction protein  34.96 
 
 
144 aa  78.6  0.00000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0620  signal-transduction protein  34.96 
 
 
144 aa  78.2  0.00000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1395  signal-transduction protein  34.45 
 
 
141 aa  77.8  0.00000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0871644 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0381  CBS domain-containing protein  41.67 
 
 
688 aa  77.8  0.00000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0243844 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0597  signal transduction protein  36.92 
 
 
145 aa  77.4  0.00000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1863  putative signal transduction protein with CBS domains  38.46 
 
 
141 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0188  signal-transduction protein  37.5 
 
 
128 aa  76.6  0.0000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.885258  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2962  putative signal transduction protein with CBS domains  39.45 
 
 
145 aa  75.1  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0267  cyclic nucleotide-binding protein  34.88 
 
 
625 aa  75.1  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0100  putative signal transduction protein with CBS domains  39.45 
 
 
143 aa  74.7  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4543  CBS domain-containing protein  33.8 
 
 
639 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.661781  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2231  signal-transduction protein  36.44 
 
 
188 aa  74.3  0.0000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.943647  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07150  CBS domain containing protein  34.75 
 
 
865 aa  73.9  0.0000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0367477  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2665  putative signal transduction protein with CBS domains  36.36 
 
 
187 aa  73.6  0.0000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000148572  normal  0.84733 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0791  CBS domain-containing protein  33.9 
 
 
139 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0244605  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1391  CBS domain-containing protein  38.74 
 
 
144 aa  72  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.769563 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1395  putative signal transduction protein with CBS domains  36.59 
 
 
138 aa  72.8  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.319409  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0967  nucleotidyltransferase  28.24 
 
 
641 aa  72.8  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.151654 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2961  CBS domain-containing proteins  39.64 
 
 
144 aa  71.6  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.195076  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1607  signal-transduction protein  39.64 
 
 
144 aa  71.6  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0484541 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0532  signal-transduction protein  37.5 
 
 
126 aa  71.6  0.000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.392409  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1905  putative signal transduction protein with CBS domains  36.67 
 
 
139 aa  71.2  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5000  signal-transduction protein  35 
 
 
130 aa  71.2  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000125843 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2661  signal-transduction protein  40 
 
 
177 aa  71.2  0.000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.63207  normal  0.665873 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0872  CBS domain protein  33.05 
 
 
139 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2321  nucleotidyltransferase  29.77 
 
 
627 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.477711  hitchhiker  0.00895935 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06340  putative signal-transduction protein with CBS domains  31.93 
 
 
141 aa  70.1  0.000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2504  cyclic nucleotide-binding protein  32.59 
 
 
628 aa  70.1  0.000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  35.34 
 
 
845 aa  70.1  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0663  signal-transduction protein  36.13 
 
 
127 aa  70.1  0.00000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2080  signal-transduction protein  36.75 
 
 
141 aa  69.7  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2052  cyclic nucleotide-binding protein  33.9 
 
 
663 aa  69.7  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.19282 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  35.25 
 
 
185 aa  69.7  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0656  CBS domain containing protein  29.37 
 
 
142 aa  68.9  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4486  CBS domain-containing protein  34.17 
 
 
129 aa  68.9  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0214678 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3944  signal-transduction protein  40.37 
 
 
138 aa  69.3  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.898238  normal  0.165624 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1938  CBS domain-containing protein  33.6 
 
 
143 aa  68.6  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.704039  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1584  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  33.91 
 
 
606 aa  68.2  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0450512 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4502  signal-transduction protein  35.59 
 
 
236 aa  68.2  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1394  putative signal-transduction protein with CBS domains  35.43 
 
 
485 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.332611  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1915  signal-transduction protein  34.15 
 
 
144 aa  67.8  0.00000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.414103  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0624  signal-transduction protein  33.06 
 
 
143 aa  67.8  0.00000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0506  putative signal transduction protein with CBS domains  30.58 
 
 
133 aa  67.4  0.00000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4559  CBS domain protein  31.36 
 
 
139 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000024778  normal  0.1618 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0636  signal-transduction protein  32.2 
 
 
139 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00478917  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0607  signal-transduction protein  33.33 
 
 
144 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.150713  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0446  putative signal transduction protein with CBS domains  36.97 
 
 
136 aa  67.4  0.00000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0212406  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4338  CBS domain-containing protein  26.89 
 
 
618 aa  67.4  0.00000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0583  CBS domain-containing protein  37.1 
 
 
150 aa  67  0.00000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00772647  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0778  signal transduction protein  33.59 
 
 
140 aa  67  0.00000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0404956 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1304  signal-transduction protein  30.25 
 
 
148 aa  67  0.00000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000185547 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2262  CBS domain-containing protein  36.94 
 
 
143 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.175418 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2537  putative signal transduction protein with CBS domains  36.94 
 
 
143 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.482232 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0090  CBS signal-transduction protein  33.61 
 
 
629 aa  66.2  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.382061 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1762  signal-transduction protein  34.71 
 
 
139 aa  66.2  0.0000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2079  signal-transduction protein  33.87 
 
 
137 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.266751  normal  0.1743 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2096  signal-transduction protein  33.87 
 
 
137 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2142  signal-transduction protein  33.87 
 
 
137 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0386104 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2219  putative signal-transduction protein with CBS domains  36.94 
 
 
143 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0827472 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2620  CBS domain protein  28.69 
 
 
146 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0631  CBS domain-containing protein  30.51 
 
 
139 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.480891  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1143  signal-transduction protein  35.54 
 
 
138 aa  66.2  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.430444 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1474  signal transduction protein  36.97 
 
 
128 aa  65.9  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4294  polynucleotide adenylyltransferase region  34.48 
 
 
907 aa  65.9  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00498072  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>