More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0939 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_0939  signal-transduction protein  100 
 
 
135 aa  272  9e-73  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.120432  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1479  signal-transduction protein  70.63 
 
 
126 aa  193  7e-49  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0362  signal-transduction protein  56.56 
 
 
139 aa  147  4e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0979  signal transduction protein  50.41 
 
 
139 aa  141  3e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000114145 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1825  signal-transduction protein  52.07 
 
 
139 aa  134  5e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0295  signal-transduction protein  52.07 
 
 
139 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1394  signal-transduction protein  46.72 
 
 
135 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.136388 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0253  signal-transduction protein  47.41 
 
 
140 aa  108  3e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00276555  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0416  signal-transduction protein  43.8 
 
 
130 aa  103  6e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.498724  normal  0.0778746 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0417  signal transduction protein  42.98 
 
 
139 aa  102  2e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.694858  normal  0.0742839 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0415  signal-transduction protein  42.98 
 
 
145 aa  90.9  5e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.682078  normal  0.0782148 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0254  signal-transduction protein  38.14 
 
 
136 aa  90.5  7e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00659332  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0338  signal-transduction protein  42.15 
 
 
145 aa  89.7  1e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1229  signal-transduction protein  40.5 
 
 
136 aa  89  2e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1393  signal transduction protein  40.32 
 
 
136 aa  88.6  3e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.137975 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1885  signal-transduction protein  37.4 
 
 
145 aa  86.7  1e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0201  signal-transduction protein  37.93 
 
 
138 aa  85.9  2e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1488  signal-transduction protein  39.67 
 
 
142 aa  84.3  4e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.661715 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2105  signal-transduction protein  33.88 
 
 
138 aa  84.3  5e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.141062  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0914  putative signal transduction protein with CBS domains  34.92 
 
 
131 aa  81.6  0.000000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0000312526  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0620  signal-transduction protein  42.86 
 
 
144 aa  81.6  0.000000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1326  signal-transduction protein  42.86 
 
 
144 aa  80.9  0.000000000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1597  signal-transduction protein  38.74 
 
 
141 aa  80.5  0.000000000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0397  putative signal transduction protein with CBS domains  32.5 
 
 
142 aa  76.6  0.0000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0148627  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0964  putative signal transduction protein with CBS domains  36.67 
 
 
132 aa  76.6  0.0000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0280  signal-transduction protein  35 
 
 
141 aa  76.6  0.0000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.460001  normal  0.121609 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1339  signal-transduction protein  38.76 
 
 
160 aa  76.3  0.0000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.44426 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0239  signal transduction protein  35.83 
 
 
128 aa  75.5  0.0000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.371768 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0381  CBS domain-containing protein  40.54 
 
 
688 aa  75.1  0.0000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0243844 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0876  signal-transduction protein  36.94 
 
 
141 aa  74.7  0.0000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1425  signal-transduction protein  35.56 
 
 
144 aa  73.2  0.000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.316039 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1108  signal-transduction protein  35.94 
 
 
144 aa  71.6  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0628  signal-transduction protein  37.84 
 
 
141 aa  71.6  0.000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1395  signal-transduction protein  36.89 
 
 
141 aa  71.2  0.000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0871644 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1905  putative signal transduction protein with CBS domains  36.89 
 
 
139 aa  69.7  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0624  signal-transduction protein  33.06 
 
 
143 aa  69.7  0.00000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2051  putative signal transduction protein with CBS domains  31.45 
 
 
124 aa  68.9  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.787742  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1844  CBS domain-containing protein  36.44 
 
 
688 aa  68.9  0.00000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  36.44 
 
 
688 aa  68.9  0.00000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1474  signal transduction protein  30.65 
 
 
128 aa  68.2  0.00000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0778  signal transduction protein  31.45 
 
 
140 aa  68.6  0.00000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0404956 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0633  signal-transduction protein  36.45 
 
 
141 aa  68.6  0.00000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.96504  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2057  putative signal transduction protein with CBS domains  30.83 
 
 
134 aa  68.2  0.00000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  31.78 
 
 
185 aa  67.4  0.00000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5000  signal-transduction protein  34.68 
 
 
130 aa  65.5  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000125843 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0255  signal-transduction protein  31.71 
 
 
142 aa  66.2  0.0000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0155982  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1635  cyclic nucleotide-binding/CBS/putative nucleotidyltransferase  33.33 
 
 
646 aa  65.5  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.5663  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24850  CBS domain pair-containing protein  34.71 
 
 
137 aa  64.7  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.310967  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4486  CBS domain-containing protein  32.79 
 
 
129 aa  64.3  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0214678 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1449  signal transduction protein  35.43 
 
 
153 aa  63.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0791  CBS domain-containing protein  35.83 
 
 
139 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0244605  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0532  signal-transduction protein  31.97 
 
 
126 aa  63.5  0.0000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.392409  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  31.4 
 
 
145 aa  63.5  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0872  CBS domain protein  35.83 
 
 
139 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3268  CBS domain-containing protein  34.92 
 
 
142 aa  63.2  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6330  CBS domain containing protein  31.93 
 
 
139 aa  62.8  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.1107  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0597  signal transduction protein  31.4 
 
 
145 aa  62.8  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1938  CBS domain-containing protein  36.07 
 
 
143 aa  61.2  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.704039  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1087  signal-transduction protein  41.8 
 
 
142 aa  60.8  0.000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0884607  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2219  putative signal-transduction protein with CBS domains  38.94 
 
 
143 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0827472 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0771  signal-transduction protein  36.46 
 
 
164 aa  60.8  0.000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.411579  normal  0.0544722 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2520  putative signal transduction protein with CBS domains  30.51 
 
 
143 aa  60.8  0.000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3107  hypothetical protein  35.54 
 
 
137 aa  60.8  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0515224  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1198  CBS  30.89 
 
 
139 aa  60.5  0.000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2035  CBS domain-containing protein  30.23 
 
 
143 aa  60.5  0.000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1225  signal-transduction protein  30.16 
 
 
127 aa  60.5  0.000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.276884  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1391  CBS domain-containing protein  36.28 
 
 
144 aa  60.1  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.769563 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0631  CBS domain-containing protein  35 
 
 
139 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.480891  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1580  signal-transduction protein  36.28 
 
 
143 aa  60.1  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0967784 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3209  putative signal transduction protein with CBS domains  31.36 
 
 
136 aa  59.7  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06340  putative signal-transduction protein with CBS domains  27.27 
 
 
141 aa  59.7  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2583  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  34.75 
 
 
648 aa  59.7  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2360  signal-transduction protein  36.94 
 
 
142 aa  59.7  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0426332  normal  0.516588 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3292  signal transduction protein  32.79 
 
 
142 aa  59.7  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0656  CBS domain containing protein  32.23 
 
 
142 aa  60.1  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2052  putative signal transduction protein with CBS domains  36.59 
 
 
144 aa  60.1  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0607  signal-transduction protein  35.59 
 
 
144 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.150713  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2962  putative signal transduction protein with CBS domains  35.45 
 
 
145 aa  58.9  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2080  signal-transduction protein  34.17 
 
 
141 aa  59.3  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2231  signal-transduction protein  28.57 
 
 
188 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.943647  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0806  hypothetical protein  32.43 
 
 
144 aa  58.5  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1852  putative signal transduction protein with CBS domains  36.59 
 
 
144 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260866  normal  0.0125119 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2226  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.33 
 
 
498 aa  58.5  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2661  signal-transduction protein  34.51 
 
 
177 aa  58.2  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.63207  normal  0.665873 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1100  signal-transduction protein  35.34 
 
 
152 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0777  hypothetical protein  32.43 
 
 
144 aa  57.8  0.00000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2537  putative signal transduction protein with CBS domains  38.94 
 
 
143 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.482232 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1217  CBS domain-containing protein  34.43 
 
 
143 aa  57.8  0.00000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0636  signal-transduction protein  32.5 
 
 
139 aa  57.8  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00478917  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2262  CBS domain-containing protein  38.94 
 
 
143 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.175418 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00940  CBS domain containing protein  30.33 
 
 
262 aa  57.4  0.00000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000126291  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0631  CBS domain-containing protein  34.17 
 
 
139 aa  57.4  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000812315  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02457  hypothetical protein  30.23 
 
 
626 aa  57.4  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3630  signal-transduction protein  35.59 
 
 
122 aa  57.8  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.30892 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1482  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  31.5 
 
 
482 aa  57.4  0.00000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2961  CBS domain-containing proteins  33.93 
 
 
144 aa  57.4  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.195076  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0446  putative signal transduction protein with CBS domains  30.77 
 
 
136 aa  57.4  0.00000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0212406  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1696  CBS domain-containing protein  33.07 
 
 
143 aa  57.4  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.28583  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1436  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  31.5 
 
 
482 aa  57.4  0.00000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1568  cyclic nucleotide-binding protein  29.13 
 
 
634 aa  56.2  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>