More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0362 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_0362  signal-transduction protein  100 
 
 
139 aa  280  3.0000000000000004e-75  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1825  signal-transduction protein  72.66 
 
 
139 aa  208  2e-53  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0979  signal transduction protein  72.66 
 
 
139 aa  206  1e-52  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000114145 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0295  signal-transduction protein  73.38 
 
 
139 aa  189  1e-47  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1479  signal-transduction protein  59.02 
 
 
126 aa  160  8.000000000000001e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0939  signal-transduction protein  56.56 
 
 
135 aa  147  4e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.120432  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0415  signal-transduction protein  50 
 
 
145 aa  121  4e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.682078  normal  0.0782148 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0417  signal transduction protein  45.99 
 
 
139 aa  120  9e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.694858  normal  0.0742839 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0201  signal-transduction protein  46.32 
 
 
138 aa  118  3e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2105  signal-transduction protein  45.11 
 
 
138 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.141062  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0253  signal-transduction protein  45.04 
 
 
140 aa  117  7e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00276555  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1394  signal-transduction protein  48.36 
 
 
135 aa  114  5e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.136388 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0624  signal-transduction protein  48.25 
 
 
143 aa  113  1.0000000000000001e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0338  signal-transduction protein  46.15 
 
 
145 aa  110  6e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1229  signal-transduction protein  46.56 
 
 
136 aa  110  8.000000000000001e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0255  signal-transduction protein  46.38 
 
 
142 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0155982  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1488  signal-transduction protein  44.8 
 
 
142 aa  106  1e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.661715 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0416  signal-transduction protein  42.5 
 
 
130 aa  105  1e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.498724  normal  0.0778746 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1885  signal-transduction protein  43.51 
 
 
145 aa  106  1e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0280  signal-transduction protein  40.94 
 
 
141 aa  103  6e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.460001  normal  0.121609 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1393  signal transduction protein  44.07 
 
 
136 aa  99.8  1e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.137975 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0254  signal-transduction protein  39.06 
 
 
136 aa  96.7  1e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00659332  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1395  signal-transduction protein  42.65 
 
 
141 aa  95.5  2e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0871644 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1326  signal-transduction protein  42.28 
 
 
144 aa  95.9  2e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0397  putative signal transduction protein with CBS domains  37.01 
 
 
142 aa  93.6  9e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0148627  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0914  putative signal transduction protein with CBS domains  40.16 
 
 
131 aa  93.2  9e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0000312526  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0620  signal-transduction protein  40.65 
 
 
144 aa  92.8  1e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0876  signal-transduction protein  41.13 
 
 
141 aa  92  2e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1597  signal-transduction protein  40.62 
 
 
141 aa  91.7  3e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1339  signal-transduction protein  47.27 
 
 
160 aa  90.5  6e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.44426 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0633  signal-transduction protein  43.36 
 
 
141 aa  86.3  1e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.96504  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0628  signal-transduction protein  37.5 
 
 
141 aa  82.8  0.000000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0964  putative signal transduction protein with CBS domains  39.5 
 
 
132 aa  82  0.000000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0239  signal transduction protein  38.74 
 
 
128 aa  78.6  0.00000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.371768 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1474  signal transduction protein  36.13 
 
 
128 aa  77.8  0.00000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1855  CBS domain-containing protein  45.24 
 
 
88 aa  74.7  0.0000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  33.61 
 
 
688 aa  73.6  0.0000000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1332  signal-transduction protein  35.61 
 
 
139 aa  72.8  0.000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.660277  normal  0.443449 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1844  CBS domain-containing protein  33.61 
 
 
688 aa  72.8  0.000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0364  signal-transduction protein  34.09 
 
 
139 aa  73.2  0.000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.612757 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1225  signal-transduction protein  36.07 
 
 
127 aa  72.4  0.000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.276884  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1425  signal-transduction protein  36.22 
 
 
144 aa  70.5  0.000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.316039 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0597  signal transduction protein  35 
 
 
145 aa  69.3  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1762  signal-transduction protein  33.33 
 
 
139 aa  69.3  0.00000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1143  signal-transduction protein  33.88 
 
 
138 aa  68.2  0.00000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.430444 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4338  CBS domain-containing protein  33.06 
 
 
618 aa  68.6  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0188  signal-transduction protein  35.51 
 
 
128 aa  68.2  0.00000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.885258  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0381  CBS domain-containing protein  34.75 
 
 
688 aa  66.2  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0243844 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0382  CBS domain-containing protein  37.12 
 
 
645 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.263171 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1635  cyclic nucleotide-binding/CBS/putative nucleotidyltransferase  33.61 
 
 
646 aa  64.3  0.0000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.5663  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0532  signal-transduction protein  35.14 
 
 
126 aa  64.3  0.0000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.392409  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5919  signal-transduction protein  28.46 
 
 
162 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.512609  normal  0.346148 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0791  CBS domain-containing protein  38.21 
 
 
139 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0244605  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2231  signal-transduction protein  30.83 
 
 
188 aa  63.2  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.943647  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  32.2 
 
 
1560 aa  62.8  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0872  CBS domain protein  38.21 
 
 
139 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47178  predicted protein  34.51 
 
 
182 aa  62.8  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  31.67 
 
 
185 aa  63.5  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2051  putative signal transduction protein with CBS domains  30.51 
 
 
124 aa  62.8  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.787742  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0583  CBS domain-containing protein  35.07 
 
 
150 aa  62.4  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00772647  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0623  CBS  34.75 
 
 
143 aa  62.8  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0488  hypothetical protein  37.82 
 
 
302 aa  62  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0568  signal-transduction protein  31.15 
 
 
133 aa  62.8  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.706815 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0354  CBS domain-containing protein  36.36 
 
 
645 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.466174 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0380  CBS domain-containing protein  36.36 
 
 
645 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.488205  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5000  signal-transduction protein  38.68 
 
 
130 aa  62  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000125843 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0778  signal transduction protein  30.83 
 
 
140 aa  60.5  0.000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0404956 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5203  CBS domain containing protein  31.25 
 
 
141 aa  60.5  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0100  putative signal transduction protein with CBS domains  37.84 
 
 
143 aa  60.5  0.000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0446  putative signal transduction protein with CBS domains  31.71 
 
 
136 aa  60.5  0.000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0212406  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1087  signal-transduction protein  37.82 
 
 
142 aa  60.5  0.000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0884607  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0920  CBS domain-containing protein  29.23 
 
 
149 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0607  signal-transduction protein  35.54 
 
 
144 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.150713  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4848  CBS domain-containing protein  34.35 
 
 
645 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.602391  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4097  CBS domain-containing protein  36.15 
 
 
643 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1141  signal-transduction protein  31.48 
 
 
150 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.403559  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5185  cyclic nucleotide-binding (cNMP-bd) protein  35.11 
 
 
646 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.255954  normal  0.285696 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  29.14 
 
 
215 aa  59.3  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1108  signal-transduction protein  33.91 
 
 
144 aa  58.9  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0776  CBS domain protein  36.59 
 
 
139 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00143526  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4486  CBS domain-containing protein  33.06 
 
 
129 aa  59.3  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0214678 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2962  putative signal transduction protein with CBS domains  36.04 
 
 
145 aa  58.5  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2557  hypothetical protein  29.6 
 
 
149 aa  58.5  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1395  putative signal transduction protein with CBS domains  33.33 
 
 
138 aa  58.2  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.319409  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3679  signal-transduction protein  31.09 
 
 
150 aa  58.2  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1905  putative signal transduction protein with CBS domains  34.62 
 
 
139 aa  58.9  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1198  CBS  33.03 
 
 
139 aa  58.5  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4559  CBS domain protein  36.59 
 
 
139 aa  58.2  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000024778  normal  0.1618 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1217  CBS domain-containing protein  35.59 
 
 
143 aa  58.5  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0766  signal transduction protein  32.77 
 
 
269 aa  57.8  0.00000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.024671 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0631  signal-transduction protein  29.17 
 
 
189 aa  58.2  0.00000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0847  signal transduction protein  33.93 
 
 
287 aa  58.2  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.766257  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2079  signal-transduction protein  33.61 
 
 
137 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.266751  normal  0.1743 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2096  signal-transduction protein  33.61 
 
 
137 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2142  signal-transduction protein  33.61 
 
 
137 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0386104 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2052  putative signal transduction protein with CBS domains  35.25 
 
 
144 aa  57.8  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2950  signal transduction protein  34.85 
 
 
141 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.211508 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0389  signal-transduction protein  33.93 
 
 
150 aa  57.8  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  28.48 
 
 
215 aa  57.8  0.00000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1249  CBS domain-containing protein  32.79 
 
 
141 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>