More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0876 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0876  signal-transduction protein  100 
 
 		 141 aa  285  2e-76  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0633  signal-transduction protein  70.92 
 
 		 141 aa  214  2e-55  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.96504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0628  signal-transduction protein  68.09 
 
 		 141 aa  205  2e-52  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1597  signal-transduction protein  68.57 
 
 		 141 aa  202  9e-52  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0338  signal-transduction protein  53.17 
 
 		 145 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1229  signal-transduction protein  53.72 
 
 		 136 aa  134  4e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1885  signal-transduction protein  51.59 
 
 		 145 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0415  signal-transduction protein  51.54 
 
 		 145 aa  131  3e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.682078  normal  0.0782148 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1395  signal-transduction protein  49.28 
 
 		 141 aa  130  9e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0871644 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1488  signal-transduction protein  50.78 
 
 		 142 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.661715 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0255  signal-transduction protein  47.69 
 
 		 142 aa  118  3e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0155982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1339  signal-transduction protein  43.2 
 
 		 160 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.44426 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0201  signal-transduction protein  48.84 
 
 		 138 aa  102  1e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0254  signal-transduction protein  40.17 
 
 		 136 aa  101  3e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00659332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0979  signal transduction protein  41.35 
 
 		 139 aa  100  6e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000114145 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0416  signal-transduction protein  40.34 
 
 		 130 aa  98.2  3e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.498724  normal  0.0778746 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0597  signal transduction protein  43.2 
 
 		 145 aa  95.5  2e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0253  signal-transduction protein  41.48 
 
 		 140 aa  95.9  2e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00276555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2105  signal-transduction protein  42.06 
 
 		 138 aa  92.8  1e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.141062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0417  signal transduction protein  39.86 
 
 		 139 aa  92.4  2e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.694858  normal  0.0742839 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0362  signal-transduction protein  41.13 
 
 		 139 aa  92  2e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1479  signal-transduction protein  38.33 
 
 		 126 aa  88.2  3e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  39.17 
 
 		 688 aa  87.8  5e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0620  signal-transduction protein  38.35 
 
 		 144 aa  87  7e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1844  CBS domain-containing protein  40 
 
 		 688 aa  87  8e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1394  signal-transduction protein  33.91 
 
 		 135 aa  87  8e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.136388 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1326  signal-transduction protein  36.84 
 
 		 144 aa  86.3  1e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0914  putative signal transduction protein with CBS domains  37.93 
 
 		 131 aa  84  6e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0000312526  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0397  putative signal transduction protein with CBS domains  36.88 
 
 		 142 aa  82  0.000000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0148627  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0964  putative signal transduction protein with CBS domains  36.75 
 
 		 132 aa  81.3  0.000000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0239  signal transduction protein  36.44 
 
 		 128 aa  80.5  0.000000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.371768 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0381  CBS domain-containing protein  37.72 
 
 		 688 aa  79.7  0.00000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0243844 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1825  signal-transduction protein  37.59 
 
 		 139 aa  77.8  0.00000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1251  signal-transduction protein  37.93 
 
 		 131 aa  77  0.00000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.904359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4097  CBS domain-containing protein  37.61 
 
 		 643 aa  77  0.00000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1332  signal-transduction protein  36.44 
 
 		 139 aa  76.6  0.0000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.660277  normal  0.443449 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0939  signal-transduction protein  36.94 
 
 		 135 aa  74.7  0.0000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.120432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0624  signal-transduction protein  40 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1143  signal-transduction protein  40.68 
 
 		 138 aa  73.9  0.0000000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.430444 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0947  CBS domain-containing protein  35.58 
 
 		 689 aa  73.6  0.0000000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0532  signal-transduction protein  35.14 
 
 		 126 aa  73.2  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.392409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0663  signal-transduction protein  44.95 
 
 		 127 aa  72.8  0.000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1762  signal-transduction protein  38.98 
 
 		 139 aa  72.4  0.000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0280  signal-transduction protein  32.86 
 
 		 141 aa  72.4  0.000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.460001  normal  0.121609 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2707  signal-transduction protein  38.17 
 
 		 141 aa  72.8  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0295  signal-transduction protein  36.09 
 
 		 139 aa  72  0.000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0364  signal-transduction protein  38.39 
 
 		 139 aa  71.2  0.000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.612757 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1225  signal-transduction protein  42.86 
 
 		 127 aa  71.2  0.000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.276884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1100  signal-transduction protein  41.67 
 
 		 152 aa  71.2  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5000  signal-transduction protein  33.06 
 
 		 130 aa  69.3  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000125843 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0705  putative signal transduction protein with CBS domains  35.29 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.108789  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3004  signal-transduction protein  35.29 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.159612  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4502  signal-transduction protein  37.98 
 
 		 236 aa  69.3  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6173  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.33 
 
 		 837 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4486  CBS domain-containing protein  31.4 
 
 		 129 aa  68.2  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0214678 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1905  putative signal transduction protein with CBS domains  35.34 
 
 		 139 aa  68.6  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0188  signal-transduction protein  41.28 
 
 		 128 aa  68.2  0.00000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.885258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3204  putative signal transduction protein with CBS domains  34.45 
 
 		 139 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.585184  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1046  signal-transduction protein  33.63 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.460697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3630  signal-transduction protein  36.94 
 
 		 122 aa  66.2  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.30892 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1393  signal transduction protein  35.51 
 
 		 136 aa  66.6  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.137975 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0100  putative cyclic nucleotide binding protein  28.26 
 
 		 626 aa  66.6  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3103  putative signal-transduction protein with CBS domains  34.45 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1863  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  37.5 
 
 		 625 aa  65.5  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0994673  normal  0.46863 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1855  CBS domain-containing protein  44.32 
 
 		 88 aa  66.2  0.0000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0410  putative CBS domain-containing signal transduction protein  36.44 
 
 		 124 aa  65.5  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.269207  normal  0.258379 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5005  signal-transduction protein  33.82 
 
 		 144 aa  65.1  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3669  putative signal transduction protein with CBS domains  31.93 
 
 		 141 aa  65.1  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3238  putative signal transduction protein with CBS domains  38.46 
 
 		 138 aa  64.7  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.365049  normal  0.128899 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6938  signal-transduction protein  34.82 
 
 		 242 aa  64.3  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.335853 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1395  putative signal transduction protein with CBS domains  29.82 
 
 		 138 aa  63.5  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.319409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0695  putative signal-transduction protein with CBS domains  35.77 
 
 		 140 aa  63.5  0.0000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0173289  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1425  signal-transduction protein  31.62 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.316039 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2661  signal-transduction protein  33.33 
 
 		 177 aa  63.2  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.63207  normal  0.665873 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1108  signal-transduction protein  37.31 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4702  cyclic nucleotide-binding/CBS:putative nucleotidyltransferase  34.75 
 
 		 644 aa  62  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06340  putative signal-transduction protein with CBS domains  29.46 
 
 		 141 aa  62  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1811  cyclic nucleotide-binding protein  29.17 
 
 		 625 aa  62  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1025  cyclic nucleotide-binding protein  34.19 
 
 		 645 aa  62.4  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2219  putative signal-transduction protein with CBS domains  35 
 
 		 143 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0827472 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2480  CBS domain-containing protein  29.31 
 
 		 639 aa  61.6  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.218166  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0420  signal-transduction protein  33.64 
 
 		 158 aa  61.6  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2537  putative signal transduction protein with CBS domains  35 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.482232 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0656  CBS domain containing protein  33.02 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2262  CBS domain-containing protein  35 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.175418 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0090  CBS signal-transduction protein  34.51 
 
 		 629 aa  60.8  0.000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.382061 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003608  Signal transduction protein  25.9 
 
 		 626 aa  60.8  0.000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4338  CBS domain-containing protein  31.48 
 
 		 618 aa  60.8  0.000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2583  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  33.61 
 
 		 648 aa  60.5  0.000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0631  CBS domain-containing protein  32.28 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.480891  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3231  signal-transduction protein  33.08 
 
 		 143 aa  60.5  0.000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00933533  normal  0.19525 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0471  nucleotidyltransferase, putative  34.19 
 
 		 622 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2439  CBS domain-containing protein  34.17 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5185  cyclic nucleotide-binding (cNMP-bd) protein  33.33 
 
 		 646 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.255954  normal  0.285696 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0637  signal-transduction protein  30.83 
 
 		 140 aa  60.1  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2247  putative signal transduction protein with CBS domains  36.45 
 
 		 142 aa  60.1  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000297093  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0768  putative signal-transduction protein with CBS domains  28.69 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000458984  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1043  cyclic nucleotide-binding protein  32.46 
 
 		 624 aa  60.1  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0272  CBS domain-containing protein  32.77 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2321  nucleotidyltransferase  25.58 
 
 		 627 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.477711  hitchhiker  0.00895935 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>