More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2439 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_2439  CBS domain-containing protein  100 
 
 
145 aa  296  7e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2788  CBS domain-containing protein  60.42 
 
 
151 aa  176  8e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.190959  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36650  hypothetical protein  59.32 
 
 
138 aa  146  7e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000287918  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2292  CBS domain-containing protein  55.08 
 
 
137 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.173837  hitchhiker  0.00000858428 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3147  hypothetical protein  57.63 
 
 
138 aa  141  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.643619  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24850  CBS domain pair-containing protein  47.48 
 
 
137 aa  139  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.310967  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4414  CBS domain-containing protein  47.22 
 
 
146 aa  135  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.718009 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6330  CBS domain containing protein  50 
 
 
139 aa  134  6.0000000000000005e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.1107  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2035  CBS domain-containing protein  52.5 
 
 
143 aa  130  5e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1198  CBS  53.85 
 
 
139 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3107  hypothetical protein  47.62 
 
 
137 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0515224  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4239  CBS domain-containing protein  45.99 
 
 
143 aa  126  8.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.716364  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3139  CBS domain-containing protein  48 
 
 
143 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.533561  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1360  CBS domain-containing protein  48 
 
 
143 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.565308  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3011  CBS domain-containing protein  48 
 
 
143 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.162521  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1420  CBS domain containing protein  45.8 
 
 
144 aa  124  3e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.384654  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7015  CBS domain-containing protein  46.15 
 
 
143 aa  121  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5465  CBS domain-containing protein  47.86 
 
 
143 aa  121  4e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00381239 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3985  CBS domain-containing protein  42.34 
 
 
143 aa  120  5e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.134213  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3796  CBS domain-containing protein  42.34 
 
 
143 aa  120  5e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.586823  normal  0.399094 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4382  CBS domain-containing protein  42.34 
 
 
143 aa  120  5e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0262346  normal  0.971701 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4261  CBS domain-containing protein  42.34 
 
 
143 aa  120  6e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.808384  normal  0.229571 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5973  CBS domain-containing protein  42.34 
 
 
143 aa  119  9e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.643427  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1821  CBS domain containing protein  42.22 
 
 
157 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1358  CBS domain-containing protein  45.3 
 
 
143 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6471  CBS domain-containing protein  45.3 
 
 
143 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0745469  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6060  CBS domain-containing protein  45.3 
 
 
143 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.613406  normal  0.175834 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1483  CBS domain protein  50 
 
 
125 aa  117  4.9999999999999996e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0666376  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1740  signal transduction protein  41.73 
 
 
138 aa  117  4.9999999999999996e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.247067 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5536  CBS domain-containing protein  41.04 
 
 
141 aa  116  7.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0354137 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1249  CBS domain-containing protein  43.51 
 
 
141 aa  116  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6583  CBS domain-containing protein  43.51 
 
 
141 aa  116  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460187  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4760  CBS domain-containing protein  43.51 
 
 
141 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462026  normal  0.418108 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1637  CBS domain-containing protein  40.88 
 
 
143 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.817023  normal  0.200106 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5621  CBS domain-containing protein  43.59 
 
 
143 aa  115  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0984367 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6352  CBS domain-containing protein  43.59 
 
 
143 aa  115  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.88577 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6186  CBS domain-containing protein  43.51 
 
 
141 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2012  CBS domain-containing protein  40.74 
 
 
157 aa  114  6e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.345115 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2001  putative signal transduction protein with CBS domains  42.4 
 
 
157 aa  113  8.999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0953206  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0706  CBS domain containing protein  47.41 
 
 
144 aa  113  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4395  CBS  42.34 
 
 
164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0203487  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3292  signal transduction protein  47.29 
 
 
142 aa  110  8.000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3605  hypothetical protein  42.28 
 
 
139 aa  105  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.103373  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  40.44 
 
 
147 aa  104  4e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2185  signal transduction protein  40.44 
 
 
170 aa  104  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.51071  normal  0.552255 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5005  signal-transduction protein  38.69 
 
 
144 aa  102  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06340  putative signal-transduction protein with CBS domains  40 
 
 
141 aa  100  7e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1780  putative signal transduction protein with CBS domains  42.02 
 
 
141 aa  98.6  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1449  signal transduction protein  39.5 
 
 
153 aa  97.4  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  37.5 
 
 
148 aa  97.1  8e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1863  putative signal transduction protein with CBS domains  39.13 
 
 
141 aa  95.5  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2352  signal-transduction protein  41.61 
 
 
142 aa  95.9  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.103406  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  37.5 
 
 
145 aa  95.1  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2219  CBS domain containing protein  41.91 
 
 
145 aa  93.2  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.338208  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3316  CBS domain-containing protein  40.74 
 
 
144 aa  91.7  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011902  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2950  signal transduction protein  40.65 
 
 
141 aa  91.7  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.211508 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0656  CBS domain containing protein  36.03 
 
 
142 aa  91.3  4e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0631  CBS domain-containing protein  36.23 
 
 
139 aa  90.9  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000812315  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0687  CBS domain-containing protein  35.51 
 
 
139 aa  90.1  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.740174  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0720  CBS domain-containing protein  35.51 
 
 
139 aa  90.1  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000162258  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0872  CBS domain protein  35.77 
 
 
139 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2776  putative signal transduction protein with CBS domains  42.62 
 
 
141 aa  89.7  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000774578 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0446  putative signal transduction protein with CBS domains  42.28 
 
 
136 aa  88.2  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0212406  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0791  CBS domain-containing protein  35.04 
 
 
139 aa  87.8  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0244605  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0631  CBS domain-containing protein  35.51 
 
 
139 aa  87.8  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.480891  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4559  CBS domain protein  34.06 
 
 
139 aa  87.4  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000024778  normal  0.1618 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0797  CBS domain protein  35.51 
 
 
139 aa  87.8  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.65672e-35 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0636  signal-transduction protein  36.57 
 
 
139 aa  87  7e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00478917  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4061  signal-transduction protein  41.03 
 
 
145 aa  86.3  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0776  CBS domain protein  33.82 
 
 
139 aa  84.7  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00143526  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0026  CBS domain-containing protein  40.68 
 
 
141 aa  81.6  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0607  signal-transduction protein  32.09 
 
 
144 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.150713  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2080  signal-transduction protein  38.46 
 
 
141 aa  79.7  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0214  putative signal transduction protein with CBS domains  38.94 
 
 
207 aa  79.3  0.00000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0022  signal-transduction protein  37.82 
 
 
141 aa  77  0.00000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4379  signal-transduction protein  34.4 
 
 
158 aa  77  0.00000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.817612 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12645  hypothetical protein  36.75 
 
 
143 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2441  signal-transduction protein  37.61 
 
 
144 aa  75.9  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.528968  normal  0.376991 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1577  putative signal transduction protein with CBS domains  35.71 
 
 
139 aa  74.3  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.011912  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3096  signal-transduction protein  42.45 
 
 
139 aa  74.3  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0420  signal-transduction protein  36.36 
 
 
158 aa  74.3  0.0000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2620  CBS domain protein  32.5 
 
 
146 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1401  signal-transduction protein  38.46 
 
 
142 aa  73.6  0.0000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0233  putative signal transduction protein with CBS domains  36.13 
 
 
140 aa  73.2  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193926  normal  0.17761 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0272  CBS domain-containing protein  36.19 
 
 
145 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2667  hypothetical protein  36.21 
 
 
140 aa  73.2  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.262704  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0945  CBS domain-containing protein  34.19 
 
 
144 aa  72.8  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.678646  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1978  putative signal transduction protein with CBS domains  39.32 
 
 
138 aa  72.8  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0602672  normal  0.871895 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6054  signal transduction protein  38.83 
 
 
193 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000453933 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3298  signal-transduction protein  40.19 
 
 
141 aa  71.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3944  signal-transduction protein  34.75 
 
 
138 aa  71.6  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.898238  normal  0.165624 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3439  putative signal transduction protein with CBS domains  39.25 
 
 
141 aa  71.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.72224  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3278  putative CBS domain-containing signal transduction protein  37.61 
 
 
145 aa  71.6  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.565248  normal  0.216437 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2355  signal-transduction protein  35.48 
 
 
145 aa  72  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.302795  normal  0.112681 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0228  CBS domain-containing protein  34.82 
 
 
145 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3375  putative signal-transduction protein with CBS domains  39.25 
 
 
141 aa  71.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3565  CBS domain-containing protein  33.9 
 
 
138 aa  71.2  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4974  putative signal-transduction protein with CBS domains  40.2 
 
 
147 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0816417 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0964  putative signal transduction protein with CBS domains  35.65 
 
 
132 aa  70.5  0.000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0673  signal-transduction protein  31.97 
 
 
165 aa  70.5  0.000000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>