More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0768 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0768  putative signal-transduction protein with CBS domains  100 
 
 		 156 aa  310  3.9999999999999997e-84  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000458984  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0381  CBS domain-containing protein  37.72 
 
 		 688 aa  74.3  0.0000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0243844 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1171  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  31.78 
 
 		 916 aa  73.2  0.000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0254  signal-transduction protein  35.25 
 
 		 136 aa  72.8  0.000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00659332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0280  signal-transduction protein  38.71 
 
 		 141 aa  72.4  0.000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.460001  normal  0.121609 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0188  signal-transduction protein  37.14 
 
 		 128 aa  70.5  0.000000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.885258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0239  signal transduction protein  34.62 
 
 		 128 aa  68.9  0.00000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.371768 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1326  signal-transduction protein  30.84 
 
 		 144 aa  68.2  0.00000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0620  signal-transduction protein  29.91 
 
 		 144 aa  68.2  0.00000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0416  signal-transduction protein  35.09 
 
 		 130 aa  67.8  0.00000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.498724  normal  0.0778746 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1225  signal-transduction protein  34.91 
 
 		 127 aa  65.5  0.0000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.276884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0663  signal-transduction protein  33.63 
 
 		 127 aa  65.1  0.0000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  33.61 
 
 		 688 aa  65.1  0.0000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0964  putative signal transduction protein with CBS domains  36.7 
 
 		 132 aa  64.7  0.0000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1844  CBS domain-containing protein  34.45 
 
 		 688 aa  63.5  0.000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0628  signal-transduction protein  32.37 
 
 		 141 aa  61.6  0.000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1394  signal-transduction protein  35.29 
 
 		 135 aa  61.6  0.000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.136388 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1436  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.13 
 
 		 482 aa  61.6  0.000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1482  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.13 
 
 		 482 aa  61.6  0.000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0695  putative signal-transduction protein with CBS domains  31.25 
 
 		 140 aa  61.2  0.000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0173289  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0345  signal-transduction protein  33.33 
 
 		 150 aa  60.8  0.000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0876  signal-transduction protein  28.69 
 
 		 141 aa  60.1  0.00000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0253  signal-transduction protein  33.03 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00276555  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0397  putative signal transduction protein with CBS domains  38.1 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0148627  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0201  signal-transduction protein  27.5 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0914  putative signal transduction protein with CBS domains  28.32 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0000312526  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3508  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.17 
 
 		 498 aa  58.5  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488843  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0173  signal-transduction protein  38.46 
 
 		 130 aa  58.2  0.00000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0417  signal transduction protein  30.28 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.694858  normal  0.0742839 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1885  signal-transduction protein  28.46 
 
 		 145 aa  57.4  0.00000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0947  CBS domain-containing protein  32 
 
 		 689 aa  57  0.00000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  32.08 
 
 		 185 aa  57  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1395  signal-transduction protein  28.57 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0871644 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1143  signal-transduction protein  34.31 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.430444 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1474  signal transduction protein  30.91 
 
 		 128 aa  55.5  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0642  putative signal transduction protein with CBS domains  30.63 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.413978  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0597  signal transduction protein  28.04 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1393  signal transduction protein  31.36 
 
 		 136 aa  54.3  0.0000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.137975 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1304  signal-transduction protein  27.93 
 
 		 148 aa  53.9  0.0000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000185547 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1203  CBS domain-containing protein  31.62 
 
 		 873 aa  53.9  0.0000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.452152  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0673  signal-transduction protein  32.67 
 
 		 165 aa  53.1  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0633  signal-transduction protein  29.6 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.96504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1141  signal-transduction protein  31.71 
 
 		 150 aa  53.1  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.403559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1462  putative signal transduction protein with CBS domains  31.9 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0493403  normal  0.625814 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4731  CBS domain-containing protein  28.04 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.697087 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1488  signal-transduction protein  27.88 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.661715 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  31.82 
 
 		 845 aa  52.8  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1597  signal-transduction protein  25.41 
 
 		 141 aa  52.8  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0552  putative signal transduction protein with CBS domains  30.57 
 
 		 250 aa  52.4  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.168262  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2906  signal transduction protein  28.48 
 
 		 291 aa  52  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3340  signal-transduction protein  25.44 
 
 		 385 aa  52  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2362  signal-transduction protein  28.1 
 
 		 143 aa  51.6  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.67854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0338  signal-transduction protein  26.92 
 
 		 145 aa  51.6  0.000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2638  putative signal transduction protein with CBS domains  28.83 
 
 		 144 aa  51.6  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0184  putative signal transduction protein with CBS domains  30.36 
 
 		 142 aa  51.2  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  31.96 
 
 		 215 aa  51.2  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1947  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  30.58 
 
 		 500 aa  51.2  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2051  putative signal transduction protein with CBS domains  27.36 
 
 		 124 aa  50.8  0.000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.787742  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1339  signal-transduction protein  31.68 
 
 		 160 aa  50.8  0.000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.44426 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1332  signal-transduction protein  32.35 
 
 		 139 aa  51.2  0.000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.660277  normal  0.443449 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0364  signal-transduction protein  30.3 
 
 		 139 aa  50.8  0.000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.612757 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  27.36 
 
 		 145 aa  50.8  0.000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0013  signal-transduction protein  31.2 
 
 		 147 aa  50.4  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.371187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47178  predicted protein  29.57 
 
 		 182 aa  50.4  0.000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0770  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  31.58 
 
 		 481 aa  50.4  0.000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0061566  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0116  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  30.43 
 
 		 508 aa  50.4  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000189991  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  29.52 
 
 		 147 aa  50.4  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0328  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.02 
 
 		 482 aa  50.1  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1425  signal-transduction protein  29.2 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.316039 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3238  putative signal transduction protein with CBS domains  28.18 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.365049  normal  0.128899 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1328  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.21 
 
 		 496 aa  49.7  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3679  signal-transduction protein  28.69 
 
 		 150 aa  49.7  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0189  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  29.81 
 
 		 489 aa  49.7  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000133225  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3159  putative signal transduction protein with CBS domains  29.2 
 
 		 155 aa  49.7  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.408163  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3089  sensory box protein  24.81 
 
 		 858 aa  49.3  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.168178  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1688  hypothetical protein  30.09 
 
 		 490 aa  49.3  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0446  putative signal transduction protein with CBS domains  26.36 
 
 		 136 aa  49.3  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0212406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0699  CBS domain-containing protein  25.49 
 
 		 625 aa  48.5  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0116377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0778  signal transduction protein  29.7 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0404956 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2087  Polynucleotide adenylyltransferase region  29.25 
 
 		 877 aa  48.9  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.625204 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1687  hypothetical protein  30.09 
 
 		 490 aa  48.5  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4214  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  31.19 
 
 		 488 aa  48.5  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1321  hypothetical protein  25.19 
 
 		 142 aa  48.9  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2620  putative signal transduction protein with CBS domains  31.19 
 
 		 480 aa  48.5  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0774627  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0389  signal-transduction protein  29.63 
 
 		 150 aa  48.5  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4362  D-arabinose 5-phosphate isomerase  29.36 
 
 		 328 aa  48.5  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.315495  normal  0.179965 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1863  putative signal transduction protein with CBS domains  28.7 
 
 		 141 aa  48.1  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2231  signal-transduction protein  24 
 
 		 188 aa  48.1  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.943647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2338  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  30.91 
 
 		 487 aa  48.1  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.879992  normal  0.100057 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3096  signal-transduction protein  26.77 
 
 		 139 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0776  CBS domain protein  32.38 
 
 		 139 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00143526  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07150  CBS domain containing protein  29.81 
 
 		 865 aa  48.1  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0367477  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0019  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  27.88 
 
 		 835 aa  48.1  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1271  signal transduction protein  31.06 
 
 		 285 aa  48.1  0.00005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.906703 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2798  putative signal transduction protein with CBS domains  27.27 
 
 		 140 aa  47.8  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0139355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0304  signal transduction protein  25.66 
 
 		 261 aa  47.8  0.00005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.123702  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0286  D-arabinose 5-phosphate isomerase  28.44 
 
 		 345 aa  48.1  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0195424  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2150  multi-sensor hybrid histidine kinase  26 
 
 		 1643 aa  47.8  0.00006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.133009  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0653  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  31.53 
 
 		 500 aa  47.8  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0771  signal-transduction protein  27.55 
 
 		 164 aa  47.8  0.00006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.411579  normal  0.0544722 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>