More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0201 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0201  signal-transduction protein  100 
 
 		 138 aa  268  2e-71  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2105  signal-transduction protein  76.81 
 
 		 138 aa  214  2e-55  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.141062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0979  signal transduction protein  44.85 
 
 		 139 aa  121  3e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000114145 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1855  CBS domain-containing protein  67.47 
 
 		 88 aa  121  3e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0362  signal-transduction protein  46.32 
 
 		 139 aa  118  3e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1229  signal-transduction protein  51.91 
 
 		 136 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0415  signal-transduction protein  46.51 
 
 		 145 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.682078  normal  0.0782148 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0338  signal-transduction protein  47.58 
 
 		 145 aa  108  3e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1488  signal-transduction protein  43.85 
 
 		 142 aa  106  1e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.661715 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0876  signal-transduction protein  48.84 
 
 		 141 aa  102  1e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1825  signal-transduction protein  40.71 
 
 		 139 aa  102  2e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1597  signal-transduction protein  48.82 
 
 		 141 aa  102  2e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1885  signal-transduction protein  41.41 
 
 		 145 aa  102  2e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0255  signal-transduction protein  44.7 
 
 		 142 aa  100  6e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0155982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0628  signal-transduction protein  50.39 
 
 		 141 aa  100  8e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0633  signal-transduction protein  47.66 
 
 		 141 aa  95.9  2e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.96504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0254  signal-transduction protein  41.53 
 
 		 136 aa  95.5  2e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00659332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0253  signal-transduction protein  39.84 
 
 		 140 aa  94  6e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00276555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0417  signal transduction protein  40.48 
 
 		 139 aa  92.8  1e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.694858  normal  0.0742839 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0416  signal-transduction protein  40.68 
 
 		 130 aa  92.8  1e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.498724  normal  0.0778746 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1395  signal-transduction protein  44.78 
 
 		 141 aa  93.2  1e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0871644 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1394  signal-transduction protein  37.82 
 
 		 135 aa  90.1  9e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.136388 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0295  signal-transduction protein  42.75 
 
 		 139 aa  90.1  9e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0364  signal-transduction protein  41.41 
 
 		 139 aa  89  2e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.612757 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1479  signal-transduction protein  38.33 
 
 		 126 aa  89.4  2e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0397  putative signal transduction protein with CBS domains  40.16 
 
 		 142 aa  88.2  3e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0148627  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1393  signal transduction protein  41.41 
 
 		 136 aa  88.6  3e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.137975 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1332  signal-transduction protein  40.16 
 
 		 139 aa  86.7  1e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.660277  normal  0.443449 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0939  signal-transduction protein  37.93 
 
 		 135 aa  85.9  2e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.120432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1326  signal-transduction protein  38.41 
 
 		 144 aa  85.5  2e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1762  signal-transduction protein  41.41 
 
 		 139 aa  84.3  5e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0620  signal-transduction protein  38.41 
 
 		 144 aa  82.8  0.000000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0914  putative signal transduction protein with CBS domains  40.52 
 
 		 131 aa  82  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0000312526  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  39.5 
 
 		 688 aa  80.9  0.000000000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1143  signal-transduction protein  39.32 
 
 		 138 aa  80.1  0.000000000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.430444 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1844  CBS domain-containing protein  37.82 
 
 		 688 aa  77  0.00000000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0964  putative signal transduction protein with CBS domains  33.9 
 
 		 132 aa  73.6  0.0000000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0239  signal transduction protein  32.2 
 
 		 128 aa  73.2  0.000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.371768 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0597  signal transduction protein  35.61 
 
 		 145 aa  72  0.000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0280  signal-transduction protein  29.93 
 
 		 141 aa  72  0.000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.460001  normal  0.121609 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1339  signal-transduction protein  38.74 
 
 		 160 aa  71.2  0.000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.44426 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0381  CBS domain-containing protein  34.48 
 
 		 688 aa  70.9  0.000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0243844 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1251  signal-transduction protein  37.19 
 
 		 131 aa  70.1  0.000000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.904359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4338  CBS domain-containing protein  36.44 
 
 		 618 aa  67.4  0.00000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0624  signal-transduction protein  29.92 
 
 		 143 aa  67.4  0.00000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1225  signal-transduction protein  36.75 
 
 		 127 aa  65.9  0.0000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.276884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6173  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.23 
 
 		 837 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0782  CBS domain-containing protein  35.29 
 
 		 185 aa  64.3  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163079  normal  0.38781 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2052  cyclic nucleotide-binding protein  36.64 
 
 		 663 aa  63.5  0.0000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.19282 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0947  CBS domain-containing protein  34.62 
 
 		 689 aa  62.4  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1635  cyclic nucleotide-binding/CBS/putative nucleotidyltransferase  34.75 
 
 		 646 aa  61.2  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.5663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1863  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  36.84 
 
 		 625 aa  60.5  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0994673  normal  0.46863 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7035  CBS domain-containing protein  31.78 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.819335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0768  putative signal-transduction protein with CBS domains  27.5 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000458984  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2231  signal-transduction protein  29.41 
 
 		 188 aa  58.2  0.00000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.943647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2096  signal-transduction protein  39.85 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2142  signal-transduction protein  39.85 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0386104 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2079  signal-transduction protein  39.85 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.266751  normal  0.1743 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0663  signal-transduction protein  40.21 
 
 		 127 aa  57  0.00000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1968  nucleotidyltransferase family protein  36.94 
 
 		 476 aa  57  0.00000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142573  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5005  signal-transduction protein  32.81 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2262  CBS domain-containing protein  36.8 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.175418 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0389  signal-transduction protein  33.86 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2537  putative signal transduction protein with CBS domains  36.8 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.482232 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2226  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.83 
 
 		 498 aa  55.5  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0188  signal-transduction protein  39.18 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.885258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4477  signal-transduction protein  32.33 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.458256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1025  cyclic nucleotide-binding protein  34.33 
 
 		 645 aa  55.1  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5944  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.73 
 
 		 745 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.120992 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2080  signal-transduction protein  30 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0778  signal transduction protein  29.85 
 
 		 140 aa  53.5  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0404956 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0352  putative signal transduction protein with CBS domains  33.33 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.014797 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47178  predicted protein  30.47 
 
 		 182 aa  52.4  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0903  cyclic nucleotide-binding protein  29.77 
 
 		 638 aa  52  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1425  signal-transduction protein  34.15 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.316039 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0793  hypothetical protein  28.45 
 
 		 511 aa  52  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.455242  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2028  signal-transduction protein  34.31 
 
 		 481 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.240016 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1046  signal-transduction protein  28.45 
 
 		 142 aa  51.6  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.460697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3990  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.98 
 
 		 1665 aa  50.8  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0022  signal-transduction protein  33.87 
 
 		 141 aa  50.8  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0554  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  28.21 
 
 		 637 aa  50.8  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5919  signal-transduction protein  29.77 
 
 		 162 aa  50.8  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.512609  normal  0.346148 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2369  cyclic nucleotide-binding protein  30 
 
 		 615 aa  50.8  0.000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2330  signal-transduction protein  42.86 
 
 		 162 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0179397 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3231  signal-transduction protein  34.01 
 
 		 143 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00933533  normal  0.19525 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2693  multi-sensor hybrid histidine kinase  25 
 
 		 873 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2342  CBS domain-containing protein  30.65 
 
 		 150 aa  50.4  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.72552 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2880  signal-transduction protein  33.33 
 
 		 145 aa  50.4  0.000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.982708  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2185  signal transduction protein  33.33 
 
 		 170 aa  50.1  0.000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.51071  normal  0.552255 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_28539  predicted protein  31.45 
 
 		 158 aa  50.1  0.000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.0000000139364 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1049  signal transduction protein  31.67 
 
 		 303 aa  49.7  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0090  CBS signal-transduction protein  32.84 
 
 		 629 aa  50.1  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.382061 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1161  homoserine O-acetyltransferase  33.04 
 
 		 496 aa  49.7  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.985258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0345  signal-transduction protein  31.67 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4502  signal-transduction protein  35.77 
 
 		 236 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5536  CBS domain-containing protein  29.58 
 
 		 141 aa  50.1  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0354137 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1249  CBS domain-containing protein  29.58 
 
 		 141 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2219  putative signal-transduction protein with CBS domains  33.33 
 
 		 143 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0827472 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6583  CBS domain-containing protein  29.58 
 
 		 141 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0695  putative signal-transduction protein with CBS domains  24.39 
 
 		 140 aa  50.1  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0173289  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>