More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0345 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0345  signal-transduction protein  100 
 
 		 150 aa  298  2e-80  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0695  putative signal-transduction protein with CBS domains  46.1 
 
 		 140 aa  131  3e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0173289  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0642  putative signal transduction protein with CBS domains  39.57 
 
 		 140 aa  110  5e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.413978  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2234  putative signal transduction protein with CBS domains  41.01 
 
 		 139 aa  110  6e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3773  putative signal transduction protein with CBS domains  35.97 
 
 		 144 aa  107  6e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0583  CBS domain-containing protein  36.73 
 
 		 150 aa  105  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00772647  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5919  signal-transduction protein  39.31 
 
 		 162 aa  99.8  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.512609  normal  0.346148 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5203  CBS domain containing protein  40.14 
 
 		 141 aa  95.9  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0920  CBS domain-containing protein  42.98 
 
 		 149 aa  95.9  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0389  signal-transduction protein  39.83 
 
 		 150 aa  91.7  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1388  hypothetical protein  38.24 
 
 		 149 aa  91.3  4e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3669  putative signal transduction protein with CBS domains  39.53 
 
 		 141 aa  90.9  5e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2557  hypothetical protein  33.33 
 
 		 149 aa  89.4  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1141  signal-transduction protein  36.22 
 
 		 150 aa  89.4  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.403559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2620  putative signal transduction protein with CBS domains  37.21 
 
 		 480 aa  84  6e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0774627  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7035  CBS domain-containing protein  33.9 
 
 		 150 aa  84.3  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.819335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0067  putative inosine monophosphate dehydrogenase  39.53 
 
 		 149 aa  84  7e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1809  putative signal-transduction protein with CBS domains  35.38 
 
 		 478 aa  83.6  8e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4568  putative signal transduction protein with CBS domains  28.47 
 
 		 155 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0446023  normal  0.17585 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4435  putative signal-transduction protein with CBS domains  28.47 
 
 		 155 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3605  hypothetical protein  36.21 
 
 		 139 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.103373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3679  signal-transduction protein  34.4 
 
 		 150 aa  81.6  0.000000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1169  signal-transduction protein  37.76 
 
 		 149 aa  80.1  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0248  putative signal transduction protein with CBS domains  31.62 
 
 		 149 aa  79.7  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  36.97 
 
 		 148 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0183  hypothetical protein  33.85 
 
 		 165 aa  78.2  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0517579 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  38.02 
 
 		 147 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06340  putative signal-transduction protein with CBS domains  37.82 
 
 		 141 aa  78.2  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5408  putative signal transduction protein with CBS domains  32 
 
 		 146 aa  77.8  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000447829  normal  0.196172 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2665  putative signal transduction protein with CBS domains  32.61 
 
 		 187 aa  77.8  0.00000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000148572  normal  0.84733 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3216  CBS domain-containing protein  31.16 
 
 		 149 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3850  signal-transduction protein  29.1 
 
 		 153 aa  77  0.00000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1057  CBS domain-containing protein  30.43 
 
 		 149 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.486416  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1343  CBS domain-containing protein  30.43 
 
 		 149 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2033  CBS domain-containing protein  30.43 
 
 		 149 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2323  CBS domain-containing protein  30.43 
 
 		 149 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.195763  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1740  signal transduction protein  31.36 
 
 		 138 aa  75.5  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247067 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0565  signal-transduction protein  32.61 
 
 		 188 aa  75.9  0.0000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3488  CBS domain-containing protein  36.44 
 
 		 142 aa  75.1  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2317  CBS domain-containing protein  32.33 
 
 		 149 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.754062  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0770  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.01 
 
 		 603 aa  75.1  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.461269  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2342  CBS domain-containing protein  30.51 
 
 		 150 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.72552 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  34.55 
 
 		 185 aa  75.1  0.0000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0822  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  31.01 
 
 		 603 aa  75.1  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2704  CBS domain containing protein  33.57 
 
 		 158 aa  74.7  0.0000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0801095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0818  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  31.01 
 
 		 603 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.410169  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2352  signal-transduction protein  36.97 
 
 		 142 aa  74.7  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.103406  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3091  CBS domain-containing protein  32.09 
 
 		 291 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.105353  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1528  signal-transduction protein  30.88 
 
 		 153 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2797  signal-transduction protein  33.33 
 
 		 146 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.182223  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  34.23 
 
 		 145 aa  73.9  0.0000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0340  signal-transduction protein  33.09 
 
 		 186 aa  73.9  0.0000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.189053  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2231  signal-transduction protein  32.26 
 
 		 188 aa  73.9  0.0000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.943647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1650  signal-transduction protein  30.77 
 
 		 141 aa  73.2  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0022  signal-transduction protein  36.04 
 
 		 141 aa  72.8  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3565  CBS domain-containing protein  43.43 
 
 		 138 aa  72.8  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2798  putative signal transduction protein with CBS domains  34.19 
 
 		 140 aa  72.4  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0139355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1462  putative signal transduction protein with CBS domains  36.04 
 
 		 145 aa  72  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0493403  normal  0.625814 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0233  putative signal transduction protein with CBS domains  34.48 
 
 		 140 aa  72.8  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193926  normal  0.17761 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3209  putative signal transduction protein with CBS domains  37.72 
 
 		 136 aa  72.8  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1429  CBS domain-containing protein  31.34 
 
 		 211 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0264  signal protein  32.31 
 
 		 614 aa  71.6  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3080  putative signal transduction protein with CBS domains  35.2 
 
 		 145 aa  70.9  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0313978 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1762  signal-transduction protein  41.12 
 
 		 139 aa  70.9  0.000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1821  CBS domain containing protein  33.59 
 
 		 157 aa  70.9  0.000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3292  signal transduction protein  35.51 
 
 		 142 aa  70.5  0.000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1143  signal-transduction protein  37.5 
 
 		 138 aa  70.5  0.000000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.430444 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0497  signal-transduction protein  35.71 
 
 		 186 aa  70.5  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.835525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1304  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  33.85 
 
 		 650 aa  70.5  0.000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333083  normal  0.600467 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1422  signal-transduction protein  34.82 
 
 		 186 aa  70.5  0.000000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.216584  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4152  signal-transduction protein  32.21 
 
 		 486 aa  70.5  0.000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.729428 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1863  putative signal transduction protein with CBS domains  39.05 
 
 		 141 aa  69.7  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0202  CBS domain-containing protein  28.03 
 
 		 145 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.025801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2355  signal-transduction protein  30.89 
 
 		 145 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.302795  normal  0.112681 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0945  CBS domain-containing protein  31.58 
 
 		 144 aa  68.2  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.678646  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0228  CBS domain-containing protein  28.03 
 
 		 145 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00940  CBS domain containing protein  37.27 
 
 		 262 aa  68.6  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000126291  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0225  CBS domain-containing protein  28.03 
 
 		 145 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.791993 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0364  signal-transduction protein  36.94 
 
 		 139 aa  68.6  0.00000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.612757 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2185  signal transduction protein  31.82 
 
 		 170 aa  68.2  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.51071  normal  0.552255 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1794  signal-transduction protein  37.5 
 
 		 187 aa  68.2  0.00000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.190963  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2080  signal-transduction protein  36.11 
 
 		 141 aa  67.8  0.00000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3944  signal-transduction protein  39.39 
 
 		 138 aa  67.8  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.898238  normal  0.165624 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0964  putative signal transduction protein with CBS domains  38.14 
 
 		 132 aa  67.4  0.00000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2480  CBS domain-containing protein  30.53 
 
 		 639 aa  67.4  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.218166  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0673  signal-transduction protein  38.24 
 
 		 165 aa  67.4  0.00000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4587  signal-transduction protein  33.33 
 
 		 153 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00378118  hitchhiker  0.00177049 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2980  signal transduction protein  28.68 
 
 		 423 aa  67.4  0.00000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0397  putative signal transduction protein with CBS domains  36.7 
 
 		 142 aa  67  0.00000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0148627  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2374  signal-transduction protein  26.19 
 
 		 146 aa  67  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.425597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2012  CBS domain-containing protein  32.81 
 
 		 157 aa  67.4  0.00000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.345115 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0026  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 141 aa  67  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2290  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  36.28 
 
 		 589 aa  67  0.00000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5465  CBS domain-containing protein  31.85 
 
 		 143 aa  66.6  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00381239 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4395  CBS  36.28 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0203487  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3539  signal-transduction protein  28.91 
 
 		 146 aa  66.6  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.278615 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7033  signal-transduction protein  26.87 
 
 		 154 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.365249  normal  0.472984 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1266  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  33.59 
 
 		 649 aa  66.2  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1649  signal-transduction protein  34.15 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1108  signal-transduction protein  35.48 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>