More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0340 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0340  signal-transduction protein  100 
 
 
186 aa  370  1e-102  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.189053  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1422  signal-transduction protein  94.62 
 
 
186 aa  352  1e-96  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.216584  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0497  signal-transduction protein  94.09 
 
 
186 aa  348  2e-95  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.835525  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0565  signal-transduction protein  84.18 
 
 
188 aa  309  1e-83  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0631  signal-transduction protein  52.41 
 
 
189 aa  185  3e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  37.63 
 
 
185 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0214  putative signal transduction protein with CBS domains  34.29 
 
 
207 aa  99.8  2e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0964  hypothetical protein  33.33 
 
 
217 aa  99.4  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0778  signal transduction protein  36.64 
 
 
140 aa  89  4e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0404956 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1794  signal-transduction protein  32.22 
 
 
187 aa  88.6  5e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.190963  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2907  signal-transduction protein  34.81 
 
 
188 aa  85.1  5e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.986231 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2665  putative signal transduction protein with CBS domains  35 
 
 
187 aa  83.6  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000148572  normal  0.84733 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1304  signal-transduction protein  38.21 
 
 
148 aa  82  0.000000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000185547 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0673  signal-transduction protein  38.33 
 
 
165 aa  80.1  0.00000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1763  CBS domain-containing protein  32.54 
 
 
200 aa  74.7  0.0000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0345  signal-transduction protein  33.09 
 
 
150 aa  73.9  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1676  signal-transduction protein  35 
 
 
147 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.780489  normal  0.354622 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2231  signal-transduction protein  29.52 
 
 
188 aa  72.8  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.943647  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2638  putative signal transduction protein with CBS domains  32.86 
 
 
144 aa  72.8  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3826  putative signal transduction protein with CBS domains  36 
 
 
120 aa  72  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.950929 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4974  putative signal-transduction protein with CBS domains  34.29 
 
 
147 aa  71.6  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0816417 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3216  CBS domain-containing protein  30.71 
 
 
149 aa  72  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1849  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  32.76 
 
 
633 aa  71.6  0.000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  35.34 
 
 
148 aa  71.6  0.000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2798  putative signal transduction protein with CBS domains  34.92 
 
 
140 aa  71.2  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0139355  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3328  putative signal transduction protein with CBS domains  26.89 
 
 
212 aa  71.2  0.000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0964  putative signal transduction protein with CBS domains  39.5 
 
 
132 aa  70.9  0.000000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2323  CBS domain-containing protein  30.71 
 
 
149 aa  70.9  0.000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.195763  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2033  CBS domain-containing protein  30.71 
 
 
149 aa  70.9  0.000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1057  CBS domain-containing protein  30.71 
 
 
149 aa  70.9  0.000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.486416  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1343  CBS domain-containing protein  30.71 
 
 
149 aa  70.9  0.000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2317  CBS domain-containing protein  28.35 
 
 
149 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.754062  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4587  signal-transduction protein  32.31 
 
 
153 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00378118  hitchhiker  0.00177049 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5408  putative signal transduction protein with CBS domains  34.23 
 
 
146 aa  70.5  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000447829  normal  0.196172 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1429  CBS domain-containing protein  30.71 
 
 
211 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1026  signal-transduction protein  32.31 
 
 
153 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0490462 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2360  signal-transduction protein  33.61 
 
 
142 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0426332  normal  0.516588 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3635  signal-transduction protein  31.54 
 
 
153 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.295786  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4732  signal-transduction protein  31.54 
 
 
153 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00820406  normal  0.0168857 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3091  CBS domain-containing protein  30.71 
 
 
291 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.105353  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5550  signal-transduction protein  31.54 
 
 
153 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3943  signal-transduction protein  34.17 
 
 
153 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.69222 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0184  putative signal transduction protein with CBS domains  36.97 
 
 
142 aa  68.9  0.00000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  32.76 
 
 
147 aa  68.2  0.00000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4123  signal-transduction protein  31.54 
 
 
153 aa  68.2  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00087962  normal  0.0202046 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0750  CBS domain containing protein  36.51 
 
 
867 aa  68.6  0.00000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.596795  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4954  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 
624 aa  68.2  0.00000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3056  putative signal-transduction protein with CBS domains  30.97 
 
 
143 aa  67.8  0.00000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.185367  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0262  MaoC domain protein dehydratase  35.77 
 
 
314 aa  67.8  0.00000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0779  putative signal transduction protein with CBS domains  38.39 
 
 
272 aa  67.8  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0978373  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2667  CBS domain containing protein  39.17 
 
 
313 aa  66.6  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.13324  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3744  signal transduction protein  33.33 
 
 
148 aa  66.6  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0016  signal-transduction protein  32.23 
 
 
146 aa  66.6  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1650  signal-transduction protein  29.41 
 
 
141 aa  66.2  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0784  signal-transduction protein  31.4 
 
 
213 aa  66.2  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.26594 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2234  putative signal transduction protein with CBS domains  32.23 
 
 
139 aa  66.6  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  34.17 
 
 
769 aa  66.6  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3850  signal-transduction protein  31.53 
 
 
153 aa  66.2  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0267  cyclic nucleotide-binding protein  37.4 
 
 
625 aa  66.2  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3316  CBS domain-containing protein  32.23 
 
 
144 aa  65.5  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011902  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3241  signal-transduction protein  30.77 
 
 
144 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.484063 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1863  putative signal transduction protein with CBS domains  33.33 
 
 
141 aa  65.1  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0486  signal transduction protein  34.43 
 
 
258 aa  64.7  0.0000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0100  putative signal transduction protein with CBS domains  28.85 
 
 
143 aa  64.7  0.0000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0113  CBS domain containing protein  33.9 
 
 
216 aa  64.7  0.0000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1812  CBS domain containing membrane protein  35.09 
 
 
132 aa  64.7  0.0000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2115  putative signal transduction protein with CBS domains  33.9 
 
 
148 aa  64.3  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1242  signal-transduction protein  28.93 
 
 
213 aa  64.3  0.0000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1393  signal transduction protein  30.97 
 
 
136 aa  63.9  0.000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.137975 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0420  signal-transduction protein  32.73 
 
 
158 aa  63.9  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2768  putative signal transduction protein with CBS domains  32.77 
 
 
148 aa  63.9  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0620195  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0264  signal protein  31.36 
 
 
614 aa  63.9  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1141  signal-transduction protein  31.11 
 
 
150 aa  63.5  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.403559  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0310  hypothetical protein  34.9 
 
 
284 aa  63.9  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  32.76 
 
 
845 aa  63.5  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0695  putative signal-transduction protein with CBS domains  34.55 
 
 
140 aa  63.2  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0173289  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2002  cyclic nucleotide-binding protein  30.77 
 
 
641 aa  63.2  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0631  signal-transduction protein  29.63 
 
 
142 aa  63.5  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0667586  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2260  CBS domain-containing protein  34.27 
 
 
150 aa  63.2  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000586041  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1524  signal transduction protein  34.07 
 
 
212 aa  63.2  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0592801 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0202  CBS domain-containing protein  31.62 
 
 
145 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.025801  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0040  CBS  28.93 
 
 
146 aa  62.4  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.847902  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1462  putative signal transduction protein with CBS domains  28.69 
 
 
145 aa  62.8  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0493403  normal  0.625814 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5727  putative signal transduction protein with CBS domains  30.23 
 
 
156 aa  62.8  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0233  putative signal transduction protein with CBS domains  27.78 
 
 
140 aa  62.4  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193926  normal  0.17761 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1528  signal-transduction protein  29.71 
 
 
153 aa  62  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3686  CBS domain containing protein  29.82 
 
 
142 aa  62  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.364538  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1332  signal-transduction protein  30.77 
 
 
139 aa  62  0.000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.660277  normal  0.443449 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4379  signal-transduction protein  29.11 
 
 
158 aa  62  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.817612 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0225  CBS domain-containing protein  31.62 
 
 
145 aa  62  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.791993 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0591  signal-transduction protein  31.4 
 
 
155 aa  62  0.000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0331315  normal  0.426072 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3824  CBS domain-containing protein  31.4 
 
 
605 aa  61.6  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00664828 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0920  CBS domain-containing protein  30.66 
 
 
149 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1383  signal transduction protein  31.68 
 
 
282 aa  61.6  0.000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.56563 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0364  signal-transduction protein  32.82 
 
 
139 aa  61.6  0.000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.612757 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0272  CBS domain-containing protein  30.77 
 
 
145 aa  61.6  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3742  Polynucleotide adenylyltransferase region  34.17 
 
 
903 aa  61.2  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5919  signal-transduction protein  28.68 
 
 
162 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.512609  normal  0.346148 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1421  polynucleotide adenylyltransferase region  30.25 
 
 
909 aa  61.6  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1395  putative signal transduction protein with CBS domains  32.2 
 
 
138 aa  61.2  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.319409  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>