More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0397 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_0397  putative signal transduction protein with CBS domains  100 
 
 
142 aa  281  2.0000000000000002e-75  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0148627  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0253  signal-transduction protein  47.41 
 
 
140 aa  111  3e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00276555  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0280  signal-transduction protein  41.55 
 
 
141 aa  108  2.0000000000000002e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.460001  normal  0.121609 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0624  signal-transduction protein  41.67 
 
 
143 aa  104  3e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0417  signal transduction protein  43.1 
 
 
139 aa  104  4e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.694858  normal  0.0742839 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0914  putative signal transduction protein with CBS domains  46.43 
 
 
131 aa  99  2e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0000312526  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0362  signal-transduction protein  37.01 
 
 
139 aa  93.6  9e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0254  signal-transduction protein  39.37 
 
 
136 aa  92.8  1e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00659332  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0979  signal transduction protein  38.64 
 
 
139 aa  92.8  2e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000114145 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0201  signal-transduction protein  40.16 
 
 
138 aa  88.2  3e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0416  signal-transduction protein  39.66 
 
 
130 aa  87.4  5e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.498724  normal  0.0778746 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1393  signal transduction protein  38.98 
 
 
136 aa  87.8  5e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.137975 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1825  signal-transduction protein  37.1 
 
 
139 aa  86.7  1e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0620  signal-transduction protein  35.9 
 
 
144 aa  84.7  4e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1488  signal-transduction protein  40.32 
 
 
142 aa  83.6  9e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.661715 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0338  signal-transduction protein  37.4 
 
 
145 aa  82  0.000000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0876  signal-transduction protein  36.88 
 
 
141 aa  82  0.000000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0597  signal transduction protein  39.02 
 
 
145 aa  81.3  0.000000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1885  signal-transduction protein  38.89 
 
 
145 aa  80.1  0.000000000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0255  signal-transduction protein  37.98 
 
 
142 aa  79.7  0.00000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0155982  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1394  signal-transduction protein  34.17 
 
 
135 aa  79  0.00000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.136388 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1326  signal-transduction protein  32.48 
 
 
144 aa  79.3  0.00000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0239  signal transduction protein  39.13 
 
 
128 aa  78.2  0.00000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.371768 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0188  signal-transduction protein  39.83 
 
 
128 aa  77.8  0.00000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.885258  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1474  signal transduction protein  37.07 
 
 
128 aa  77  0.00000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0939  signal-transduction protein  32.5 
 
 
135 aa  76.6  0.0000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.120432  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1225  signal-transduction protein  44.9 
 
 
127 aa  76.3  0.0000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.276884  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0964  putative signal transduction protein with CBS domains  41.67 
 
 
132 aa  75.9  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0415  signal-transduction protein  37.98 
 
 
145 aa  75.5  0.0000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.682078  normal  0.0782148 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1762  signal-transduction protein  43.43 
 
 
139 aa  74.7  0.0000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0364  signal-transduction protein  42.55 
 
 
139 aa  74.3  0.0000000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.612757 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1143  signal-transduction protein  37.72 
 
 
138 aa  73.6  0.0000000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.430444 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1395  signal-transduction protein  34.71 
 
 
141 aa  73.6  0.0000000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0871644 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1229  signal-transduction protein  36.64 
 
 
136 aa  73.2  0.000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2051  putative signal transduction protein with CBS domains  37.27 
 
 
124 aa  72  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.787742  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1479  signal-transduction protein  31.58 
 
 
126 aa  72.8  0.000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1597  signal-transduction protein  38.32 
 
 
141 aa  71.2  0.000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4848  CBS domain-containing protein  36.67 
 
 
645 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.602391  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2231  signal-transduction protein  34.13 
 
 
188 aa  70.5  0.000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.943647  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1332  signal-transduction protein  36 
 
 
139 aa  70.1  0.000000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.660277  normal  0.443449 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2105  signal-transduction protein  35.16 
 
 
138 aa  70.1  0.000000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.141062  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4097  CBS domain-containing protein  34.45 
 
 
643 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1844  CBS domain-containing protein  33.88 
 
 
688 aa  68.6  0.00000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0345  signal-transduction protein  36.7 
 
 
150 aa  67  0.00000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2028  signal-transduction protein  35.25 
 
 
481 aa  67.4  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.240016 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0381  CBS domain-containing protein  38.78 
 
 
688 aa  67  0.00000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0243844 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0295  signal-transduction protein  35.43 
 
 
139 aa  67  0.00000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4152  signal-transduction protein  33.04 
 
 
486 aa  66.2  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.729428 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  33.06 
 
 
688 aa  66.6  0.0000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0354  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 
645 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.466174 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1339  signal-transduction protein  39.42 
 
 
160 aa  65.9  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.44426 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0380  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 
645 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.488205  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0771  signal-transduction protein  35.59 
 
 
164 aa  65.9  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.411579  normal  0.0544722 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1425  signal-transduction protein  36.52 
 
 
144 aa  65.9  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.316039 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1251  signal-transduction protein  34.91 
 
 
131 aa  65.1  0.0000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.904359  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2355  signal-transduction protein  33.33 
 
 
145 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.302795  normal  0.112681 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1855  CBS domain-containing protein  40 
 
 
88 aa  65.1  0.0000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4702  cyclic nucleotide-binding/CBS:putative nucleotidyltransferase  34.17 
 
 
644 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1905  putative signal transduction protein with CBS domains  30.77 
 
 
139 aa  64.7  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0903  cyclic nucleotide-binding protein  32.48 
 
 
638 aa  64.7  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2219  putative signal-transduction protein with CBS domains  35.9 
 
 
143 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0827472 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2262  CBS domain-containing protein  35.29 
 
 
143 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.175418 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2080  signal-transduction protein  32.5 
 
 
141 aa  64.3  0.0000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2537  putative signal transduction protein with CBS domains  35.29 
 
 
143 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.482232 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0471  nucleotidyltransferase, putative  35 
 
 
622 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4731  CBS domain-containing protein  28.81 
 
 
145 aa  64.3  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.697087 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0663  signal-transduction protein  37.23 
 
 
127 aa  63.9  0.0000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2203  hypothetical protein  33.33 
 
 
144 aa  63.5  0.0000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05910  cyclic nucleotide-binding protein  31.67 
 
 
645 aa  63.9  0.0000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0914238  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0628  signal-transduction protein  36.75 
 
 
141 aa  63.5  0.0000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0382  CBS domain-containing protein  32.5 
 
 
645 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.263171 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0633  signal-transduction protein  35.58 
 
 
141 aa  62.8  0.000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.96504  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4477  signal-transduction protein  32.43 
 
 
145 aa  63.2  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.458256  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  28.57 
 
 
185 aa  61.6  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1395  putative signal transduction protein with CBS domains  31.63 
 
 
138 aa  62  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.319409  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1141  signal-transduction protein  30.43 
 
 
150 aa  62  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.403559  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1108  signal-transduction protein  35.24 
 
 
144 aa  61.2  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5185  cyclic nucleotide-binding (cNMP-bd) protein  33.33 
 
 
646 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.255954  normal  0.285696 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1548  cyclic nucleotide-binding protein  27.59 
 
 
615 aa  60.8  0.000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0019  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.64 
 
 
835 aa  60.5  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2019  putative signal transduction protein with CBS domains  29.37 
 
 
144 aa  60.5  0.000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.80054  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1863  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  36.22 
 
 
625 aa  60.1  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0994673  normal  0.46863 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1915  signal-transduction protein  28.68 
 
 
144 aa  59.7  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.414103  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0173  signal-transduction protein  40.4 
 
 
130 aa  59.7  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1635  cyclic nucleotide-binding/CBS/putative nucleotidyltransferase  33.33 
 
 
646 aa  58.9  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.5663  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5000  signal-transduction protein  34 
 
 
130 aa  58.9  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000125843 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4338  CBS domain-containing protein  33.07 
 
 
618 aa  59.3  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3231  signal-transduction protein  32.17 
 
 
143 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00933533  normal  0.19525 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0768  putative signal-transduction protein with CBS domains  38.1 
 
 
156 aa  59.3  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000458984  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0578  signal transduction protein  36.36 
 
 
413 aa  58.5  0.00000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1852  putative signal transduction protein with CBS domains  33.02 
 
 
144 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260866  normal  0.0125119 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4486  CBS domain-containing protein  34 
 
 
129 aa  58.5  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0214678 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6938  signal-transduction protein  31.25 
 
 
242 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.335853 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1046  signal-transduction protein  34.34 
 
 
142 aa  58.5  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.460697  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0583  CBS domain-containing protein  30.77 
 
 
150 aa  58.2  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00772647  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1938  CBS domain-containing protein  30.71 
 
 
143 aa  58.2  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.704039  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1314  hypothetical protein  33.04 
 
 
513 aa  57.8  0.00000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2583  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  30.83 
 
 
648 aa  57.8  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2150  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.78 
 
 
1643 aa  57.8  0.00000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.133009  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1607  signal-transduction protein  30.77 
 
 
144 aa  57.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0484541 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>