More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0695 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0695  putative signal-transduction protein with CBS domains  100 
 
 
140 aa  273  7e-73  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0173289  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0345  signal-transduction protein  46.1 
 
 
150 aa  131  3e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3773  putative signal transduction protein with CBS domains  41.18 
 
 
144 aa  115  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0642  putative signal transduction protein with CBS domains  33.33 
 
 
140 aa  108  3e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.413978  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5203  CBS domain containing protein  35.25 
 
 
141 aa  103  6e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2234  putative signal transduction protein with CBS domains  34.78 
 
 
139 aa  100  6e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3669  putative signal transduction protein with CBS domains  36.62 
 
 
141 aa  100  9e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0583  CBS domain-containing protein  36.69 
 
 
150 aa  99.8  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00772647  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1388  hypothetical protein  39.57 
 
 
149 aa  97.4  5e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2798  putative signal transduction protein with CBS domains  37.86 
 
 
140 aa  96.3  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0139355  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2557  hypothetical protein  32.85 
 
 
149 aa  93.2  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3292  signal transduction protein  40 
 
 
142 aa  92.4  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0248  putative signal transduction protein with CBS domains  32.37 
 
 
149 aa  91.3  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  37.29 
 
 
148 aa  90.9  5e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  39.32 
 
 
145 aa  90.9  6e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0239  signal transduction protein  39.66 
 
 
128 aa  88.6  3e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.371768 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0964  putative signal transduction protein with CBS domains  40 
 
 
132 aa  87  7e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2033  CBS domain-containing protein  32.35 
 
 
149 aa  85.5  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1429  CBS domain-containing protein  33.59 
 
 
211 aa  85.9  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2323  CBS domain-containing protein  32.35 
 
 
149 aa  85.5  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.195763  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3216  CBS domain-containing protein  32.35 
 
 
149 aa  85.5  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1343  CBS domain-containing protein  32.35 
 
 
149 aa  85.5  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1057  CBS domain-containing protein  32.35 
 
 
149 aa  85.5  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.486416  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1143  signal-transduction protein  40 
 
 
138 aa  85.1  3e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.430444 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0920  CBS domain-containing protein  37.5 
 
 
149 aa  84.3  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  31.34 
 
 
147 aa  84  6e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06340  putative signal-transduction protein with CBS domains  39.53 
 
 
141 aa  84  7e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5919  signal-transduction protein  37.5 
 
 
162 aa  83.6  9e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.512609  normal  0.346148 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  33.61 
 
 
185 aa  82.8  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1762  signal-transduction protein  40 
 
 
139 aa  82.4  0.000000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0446  putative signal transduction protein with CBS domains  35.71 
 
 
136 aa  82.4  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0212406  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3091  CBS domain-containing protein  32.82 
 
 
291 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.105353  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1332  signal-transduction protein  36.67 
 
 
139 aa  80.9  0.000000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.660277  normal  0.443449 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1740  signal transduction protein  31.5 
 
 
138 aa  80.9  0.000000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.247067 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1809  putative signal-transduction protein with CBS domains  36.84 
 
 
478 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2665  putative signal transduction protein with CBS domains  35.04 
 
 
187 aa  80.5  0.000000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000148572  normal  0.84733 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1169  signal-transduction protein  36.21 
 
 
149 aa  80.5  0.000000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2231  signal-transduction protein  33.33 
 
 
188 aa  79.7  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.943647  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0637  signal-transduction protein  38.94 
 
 
140 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0364  signal-transduction protein  40.18 
 
 
139 aa  79.3  0.00000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.612757 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5476  putative signal transduction protein with CBS domains  36.44 
 
 
145 aa  79  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2620  putative signal transduction protein with CBS domains  32.77 
 
 
480 aa  79.3  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0774627  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0264  signal protein  35.9 
 
 
614 aa  79.3  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2797  signal-transduction protein  32.76 
 
 
146 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.182223  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3316  CBS domain-containing protein  37.04 
 
 
144 aa  77.8  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011902  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0026  CBS domain-containing protein  33.62 
 
 
141 aa  77.4  0.00000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4395  CBS  37.27 
 
 
164 aa  77.4  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0203487  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00940  CBS domain containing protein  35 
 
 
262 aa  77  0.00000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000126291  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2051  putative signal transduction protein with CBS domains  37.5 
 
 
124 aa  77  0.00000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.787742  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0381  CBS domain-containing protein  37.39 
 
 
688 aa  76.6  0.00000000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0243844 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7033  signal-transduction protein  30.88 
 
 
154 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.365249  normal  0.472984 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2219  CBS domain containing protein  33.88 
 
 
145 aa  76.3  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.338208  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1780  putative signal transduction protein with CBS domains  36.44 
 
 
141 aa  76.6  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1141  signal-transduction protein  25.74 
 
 
150 aa  76.3  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.403559  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4502  signal-transduction protein  33.05 
 
 
236 aa  75.5  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0338  signal-transduction protein  37.7 
 
 
145 aa  75.1  0.0000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0233  putative signal transduction protein with CBS domains  32.74 
 
 
140 aa  75.1  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193926  normal  0.17761 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2788  CBS domain-containing protein  36 
 
 
151 aa  75.1  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.190959  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2011  CBS domain-containing protein  29.32 
 
 
286 aa  74.3  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2352  signal-transduction protein  35.29 
 
 
142 aa  74.3  0.0000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.103406  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0964  hypothetical protein  32.19 
 
 
217 aa  74.3  0.0000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3744  signal transduction protein  36.28 
 
 
148 aa  73.9  0.0000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2317  CBS domain-containing protein  30.15 
 
 
149 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.754062  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1198  CBS  41.12 
 
 
139 aa  73.9  0.0000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0389  signal-transduction protein  31.13 
 
 
150 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3679  signal-transduction protein  31.53 
 
 
150 aa  72.8  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1393  signal transduction protein  36.36 
 
 
136 aa  72.8  0.000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.137975 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4435  putative signal-transduction protein with CBS domains  29.2 
 
 
155 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3850  signal-transduction protein  36.45 
 
 
153 aa  73.2  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3605  hypothetical protein  26.77 
 
 
139 aa  73.2  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.103373  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4568  putative signal transduction protein with CBS domains  29.2 
 
 
155 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0446023  normal  0.17585 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1150  CBS  31.39 
 
 
154 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2907  signal-transduction protein  36.44 
 
 
188 aa  72.4  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.986231 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0022  signal-transduction protein  31.9 
 
 
141 aa  72.8  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4543  CBS domain-containing protein  34.59 
 
 
639 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.661781  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05716  CBS and PB1 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G06780)  30.91 
 
 
666 aa  72  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2870  CBS  28.1 
 
 
146 aa  72  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1528  signal-transduction protein  35.51 
 
 
153 aa  72  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0013  signal-transduction protein  29.91 
 
 
147 aa  71.6  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.371187  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7035  CBS domain-containing protein  32 
 
 
150 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.819335  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3746  putative signal transduction protein with CBS domains  29.32 
 
 
144 aa  70.9  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2558  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  37.04 
 
 
484 aa  70.9  0.000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0597  signal transduction protein  35.04 
 
 
145 aa  70.9  0.000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2950  signal transduction protein  30.25 
 
 
141 aa  70.9  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.211508 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2080  signal-transduction protein  33.33 
 
 
141 aa  70.9  0.000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2290  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  30.83 
 
 
589 aa  70.9  0.000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4551  putative signal transduction protein with CBS domains  29.2 
 
 
154 aa  70.5  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.610614  normal  0.0178706 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0067  putative inosine monophosphate dehydrogenase  34.48 
 
 
149 aa  70.5  0.000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4418  putative signal-transduction protein with CBS domains  29.2 
 
 
154 aa  70.5  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.577015  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4954  CBS domain-containing protein  30.88 
 
 
624 aa  70.5  0.000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0631  signal-transduction protein  30.19 
 
 
142 aa  70.5  0.000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0667586  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2261  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.11 
 
 
484 aa  70.5  0.000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2632  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.21 
 
 
486 aa  70.1  0.000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0280  signal-transduction protein  33.9 
 
 
141 aa  69.7  0.00000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.460001  normal  0.121609 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1568  putative signal transduction protein with CBS domains  41.57 
 
 
140 aa  69.7  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0256186 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003608  Signal transduction protein  33.6 
 
 
626 aa  69.3  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0328  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  38.74 
 
 
482 aa  69.7  0.00000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2342  CBS domain-containing protein  31.45 
 
 
150 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.72552 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1229  signal-transduction protein  31.97 
 
 
136 aa  69.3  0.00000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  32.43 
 
 
688 aa  69.3  0.00000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>