More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0389 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0389  signal-transduction protein  100 
 
 		 150 aa  292  1e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1141  signal-transduction protein  75.17 
 
 		 150 aa  226  1e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.403559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3679  signal-transduction protein  69.13 
 
 		 150 aa  203  7e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0583  CBS domain-containing protein  39.73 
 
 		 150 aa  107  6e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00772647  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0345  signal-transduction protein  38.89 
 
 		 150 aa  96.3  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3850  signal-transduction protein  37.24 
 
 		 153 aa  91.3  4e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5919  signal-transduction protein  41.09 
 
 		 162 aa  88.2  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.512609  normal  0.346148 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1169  signal-transduction protein  47.31 
 
 		 149 aa  88.2  4e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0642  putative signal transduction protein with CBS domains  36.96 
 
 		 140 aa  87.8  5e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.413978  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0248  putative signal transduction protein with CBS domains  37.41 
 
 		 149 aa  87.4  6e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1528  signal-transduction protein  37.24 
 
 		 153 aa  87  7e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2557  hypothetical protein  36.57 
 
 		 149 aa  86.7  9e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0920  CBS domain-containing protein  38.76 
 
 		 149 aa  85.9  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  35.25 
 
 		 145 aa  84.7  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1740  signal transduction protein  36.43 
 
 		 138 aa  84.3  5e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247067 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1388  hypothetical protein  41.6 
 
 		 149 aa  84  6e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06340  putative signal-transduction protein with CBS domains  36.36 
 
 		 141 aa  82.4  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3773  putative signal transduction protein with CBS domains  36.36 
 
 		 144 aa  81.6  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3292  signal transduction protein  34.48 
 
 		 142 aa  80.9  0.000000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  33.61 
 
 		 148 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4418  putative signal-transduction protein with CBS domains  40.5 
 
 		 154 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.577015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3605  hypothetical protein  40.68 
 
 		 139 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.103373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7033  signal-transduction protein  35.66 
 
 		 154 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.365249  normal  0.472984 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  35.38 
 
 		 147 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4551  putative signal transduction protein with CBS domains  40.5 
 
 		 154 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.610614  normal  0.0178706 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1150  CBS  36.92 
 
 		 154 aa  78.6  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7035  CBS domain-containing protein  34.71 
 
 		 150 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.819335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0695  putative signal-transduction protein with CBS domains  29.73 
 
 		 140 aa  77  0.00000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0173289  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2234  putative signal transduction protein with CBS domains  36.23 
 
 		 139 aa  77  0.00000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0067  putative inosine monophosphate dehydrogenase  36.05 
 
 		 149 aa  75.5  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2352  signal-transduction protein  33.33 
 
 		 142 aa  75.9  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.103406  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3669  putative signal transduction protein with CBS domains  36.44 
 
 		 141 aa  75.1  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1780  putative signal transduction protein with CBS domains  35 
 
 		 141 aa  74.7  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2231  signal-transduction protein  35.35 
 
 		 188 aa  73.9  0.0000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.943647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2798  putative signal transduction protein with CBS domains  33.33 
 
 		 140 aa  73.2  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0139355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2219  CBS domain containing protein  36.13 
 
 		 145 aa  72.4  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.338208  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1382  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  38.84 
 
 		 489 aa  71.2  0.000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.614319 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1429  CBS domain-containing protein  39.05 
 
 		 211 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3316  CBS domain-containing protein  34.15 
 
 		 144 aa  70.1  0.000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  32.59 
 
 		 185 aa  69.7  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2317  CBS domain-containing protein  40.71 
 
 		 149 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.754062  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2342  CBS domain-containing protein  31.03 
 
 		 150 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.72552 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3091  CBS domain-containing protein  37.5 
 
 		 291 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.105353  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3216  CBS domain-containing protein  37.84 
 
 		 149 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2033  CBS domain-containing protein  37.84 
 
 		 149 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1449  signal transduction protein  34.88 
 
 		 153 aa  67.4  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2323  CBS domain-containing protein  37.84 
 
 		 149 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.195763  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1057  CBS domain-containing protein  37.84 
 
 		 149 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.486416  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1343  CBS domain-containing protein  37.84 
 
 		 149 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2080  signal-transduction protein  37.4 
 
 		 141 aa  67  0.00000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1809  putative signal-transduction protein with CBS domains  36.73 
 
 		 478 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0914  putative signal transduction protein with CBS domains  33.85 
 
 		 131 aa  65.9  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0000312526  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1393  signal transduction protein  36 
 
 		 136 aa  65.5  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.137975 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2583  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  33.33 
 
 		 648 aa  65.5  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3944  signal-transduction protein  35 
 
 		 138 aa  65.9  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.898238  normal  0.165624 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6177  CBS domain-containing protein  35.4 
 
 		 149 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3565  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 138 aa  65.5  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2665  putative signal transduction protein with CBS domains  30.4 
 
 		 187 aa  64.7  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000148572  normal  0.84733 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2667  hypothetical protein  32.79 
 
 		 140 aa  64.7  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.262704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2355  signal-transduction protein  29.92 
 
 		 145 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.302795  normal  0.112681 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5931  CBS domain-containing protein  33.63 
 
 		 149 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1863  putative signal transduction protein with CBS domains  33.56 
 
 		 141 aa  64.3  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5005  signal-transduction protein  37.8 
 
 		 144 aa  64.3  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11190  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  35.48 
 
 		 131 aa  63.9  0.0000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.170576 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0214  putative signal transduction protein with CBS domains  35.34 
 
 		 207 aa  63.5  0.0000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3375  putative signal-transduction protein with CBS domains  35.29 
 
 		 141 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4486  CBS domain-containing protein  33.07 
 
 		 129 aa  63.2  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0214678 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3439  putative signal transduction protein with CBS domains  35.29 
 
 		 141 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.72224  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2360  signal-transduction protein  32.79 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0426332  normal  0.516588 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0568  signal-transduction protein  32.54 
 
 		 133 aa  62.4  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.706815 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0945  CBS domain-containing protein  34.62 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.678646  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.08 
 
 		 1274 aa  62.4  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0778  signal transduction protein  28.67 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0404956 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1568  putative signal transduction protein with CBS domains  38.14 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0256186 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1108  signal-transduction protein  32.61 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2620  putative signal transduction protein with CBS domains  40 
 
 		 480 aa  62.4  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0774627  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1394  signal-transduction protein  36.7 
 
 		 135 aa  62.4  0.000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.136388 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3096  signal-transduction protein  34.38 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12645  hypothetical protein  33.05 
 
 		 143 aa  62  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3298  signal-transduction protein  35.29 
 
 		 141 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2035  CBS domain-containing protein  32.23 
 
 		 143 aa  62  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3278  putative CBS domain-containing signal transduction protein  36.11 
 
 		 145 aa  62  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.565248  normal  0.216437 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5000  signal-transduction protein  32.8 
 
 		 130 aa  61.2  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000125843 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1401  signal-transduction protein  38.89 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1394  putative signal-transduction protein with CBS domains  30.66 
 
 		 485 aa  60.8  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.332611  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2041  CBS domain containing membrane protein  29.86 
 
 		 227 aa  60.8  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000255814  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0013  signal-transduction protein  29.45 
 
 		 147 aa  60.5  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.371187  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1649  CBS domain-containing membrane protein  28.85 
 
 		 234 aa  60.5  0.000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0176167  normal  0.734042 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0979  signal transduction protein  27.07 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000114145 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0565  signal-transduction protein  33.6 
 
 		 188 aa  60.1  0.000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1339  signal-transduction protein  36.21 
 
 		 160 aa  60.1  0.00000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.44426 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1310  CBS  31.11 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2962  putative signal transduction protein with CBS domains  28.36 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1978  putative signal transduction protein with CBS domains  37.39 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0602672  normal  0.871895 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0446  putative signal transduction protein with CBS domains  36.51 
 
 		 136 aa  60.1  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0212406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1568  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.85 
 
 		 488 aa  59.7  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1577  putative signal transduction protein with CBS domains  34.31 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.011912  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0239  signal transduction protein  30.47 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.371768 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0198  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.53 
 
 		 1344 aa  58.9  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.592297 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2797  signal-transduction protein  29.92 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.182223  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>