More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1169 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1169  signal-transduction protein  100 
 
 
149 aa  293  7e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0583  CBS domain-containing protein  54.05 
 
 
150 aa  153  9e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00772647  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1388  hypothetical protein  54.86 
 
 
149 aa  147  4e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0248  putative signal transduction protein with CBS domains  50.68 
 
 
149 aa  145  3e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2557  hypothetical protein  45.27 
 
 
149 aa  136  8.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0067  putative inosine monophosphate dehydrogenase  48.97 
 
 
149 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2342  CBS domain-containing protein  41.61 
 
 
150 aa  115  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.72552 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3850  signal-transduction protein  40.94 
 
 
153 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1528  signal-transduction protein  39.6 
 
 
153 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0920  CBS domain-containing protein  42.57 
 
 
149 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1429  CBS domain-containing protein  41.18 
 
 
211 aa  110  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1141  signal-transduction protein  44.6 
 
 
150 aa  109  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.403559  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0642  putative signal transduction protein with CBS domains  40.43 
 
 
140 aa  107  4.0000000000000004e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.413978  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2033  CBS domain-containing protein  40.58 
 
 
149 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2323  CBS domain-containing protein  40.58 
 
 
149 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.195763  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1343  CBS domain-containing protein  40.58 
 
 
149 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1057  CBS domain-containing protein  40.58 
 
 
149 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.486416  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7035  CBS domain-containing protein  38.93 
 
 
150 aa  107  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.819335  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3216  CBS domain-containing protein  40.58 
 
 
149 aa  107  6e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3091  CBS domain-containing protein  40.44 
 
 
291 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.105353  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2317  CBS domain-containing protein  40.58 
 
 
149 aa  106  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.754062  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3679  signal-transduction protein  45.59 
 
 
150 aa  106  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0389  signal-transduction protein  44.8 
 
 
150 aa  105  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5919  signal-transduction protein  41.89 
 
 
162 aa  105  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.512609  normal  0.346148 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0345  signal-transduction protein  37.76 
 
 
150 aa  102  1e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0695  putative signal-transduction protein with CBS domains  36.03 
 
 
140 aa  96.3  1e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0173289  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5931  CBS domain-containing protein  38.14 
 
 
149 aa  90.9  6e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4418  putative signal-transduction protein with CBS domains  37.5 
 
 
154 aa  89.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.577015  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4551  putative signal transduction protein with CBS domains  37.5 
 
 
154 aa  89.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.610614  normal  0.0178706 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3773  putative signal transduction protein with CBS domains  37.78 
 
 
144 aa  89  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1150  CBS  36.11 
 
 
154 aa  87.4  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6177  CBS domain-containing protein  38.98 
 
 
149 aa  87  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7033  signal-transduction protein  33.1 
 
 
154 aa  85.9  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.365249  normal  0.472984 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2234  putative signal transduction protein with CBS domains  34.75 
 
 
139 aa  84  7e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1809  putative signal-transduction protein with CBS domains  37.1 
 
 
478 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2231  signal-transduction protein  34.38 
 
 
188 aa  80.5  0.000000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.943647  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  38.98 
 
 
145 aa  79  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4435  putative signal-transduction protein with CBS domains  34.01 
 
 
155 aa  78.2  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4568  putative signal transduction protein with CBS domains  34.01 
 
 
155 aa  78.2  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0446023  normal  0.17585 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3669  putative signal transduction protein with CBS domains  36.92 
 
 
141 aa  77.8  0.00000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1584  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  33.33 
 
 
606 aa  75.9  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0450512 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3316  CBS domain-containing protein  36.44 
 
 
144 aa  72.8  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011902  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2798  putative signal transduction protein with CBS domains  33.86 
 
 
140 aa  72.4  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0139355  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3235  hypothetical protein  36.19 
 
 
130 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3278  putative CBS domain-containing signal transduction protein  35.94 
 
 
145 aa  72.4  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.565248  normal  0.216437 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06340  putative signal-transduction protein with CBS domains  40.16 
 
 
141 aa  72.4  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1978  putative signal transduction protein with CBS domains  39.5 
 
 
138 aa  71.6  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0602672  normal  0.871895 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3605  hypothetical protein  32.58 
 
 
139 aa  71.6  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.103373  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1568  putative signal transduction protein with CBS domains  43.48 
 
 
140 aa  71.2  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0256186 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0914  putative signal transduction protein with CBS domains  35.25 
 
 
131 aa  70.9  0.000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0000312526  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0417  signal transduction protein  38.21 
 
 
139 aa  70.9  0.000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.694858  normal  0.0742839 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3292  signal transduction protein  39.34 
 
 
142 aa  70.9  0.000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1143  signal-transduction protein  38.52 
 
 
138 aa  70.5  0.000000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.430444 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2352  signal-transduction protein  36.05 
 
 
142 aa  70.5  0.000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.103406  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  30.56 
 
 
148 aa  70.5  0.000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  34.68 
 
 
185 aa  70.5  0.000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1394  putative signal-transduction protein with CBS domains  35.11 
 
 
485 aa  70.1  0.000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.332611  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  31.62 
 
 
147 aa  69.7  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0183  hypothetical protein  33.59 
 
 
165 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0517579 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2665  putative signal transduction protein with CBS domains  33.33 
 
 
187 aa  70.1  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000148572  normal  0.84733 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5203  CBS domain containing protein  33.08 
 
 
141 aa  69.7  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2219  CBS domain containing protein  34.75 
 
 
145 aa  69.7  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.338208  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3788  putative signal transduction protein with CBS domains  36.97 
 
 
139 aa  69.3  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.534948  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0764  CBS domain-containing protein  28.7 
 
 
605 aa  68.6  0.00000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0514021 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0673  signal-transduction protein  33.6 
 
 
165 aa  68.6  0.00000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0100  putative cyclic nucleotide binding protein  34.01 
 
 
626 aa  68.6  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12645  hypothetical protein  33.07 
 
 
143 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3565  CBS domain-containing protein  38.33 
 
 
138 aa  68.6  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1326  signal-transduction protein  33.1 
 
 
144 aa  68.2  0.00000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1296  hypothetical protein  33.05 
 
 
601 aa  67.8  0.00000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.922257  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1393  signal transduction protein  36.75 
 
 
136 aa  67.8  0.00000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.137975 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0771  signal-transduction protein  34.13 
 
 
164 aa  67  0.00000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.411579  normal  0.0544722 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3944  signal-transduction protein  38.33 
 
 
138 aa  66.2  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.898238  normal  0.165624 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0979  signal transduction protein  35.48 
 
 
139 aa  66.6  0.0000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000114145 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1740  signal transduction protein  32.28 
 
 
138 aa  66.6  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.247067 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1382  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  39.66 
 
 
489 aa  66.2  0.0000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.614319 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1577  putative signal transduction protein with CBS domains  34.78 
 
 
139 aa  66.6  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.011912  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0364  signal-transduction protein  33.06 
 
 
139 aa  66.2  0.0000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.612757 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2620  putative signal transduction protein with CBS domains  33.11 
 
 
480 aa  66.6  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0774627  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3096  signal-transduction protein  34.4 
 
 
139 aa  65.9  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05140  conserved hypothetical protein  30.71 
 
 
704 aa  65.5  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0568  signal-transduction protein  36.51 
 
 
133 aa  65.9  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.706815 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0620  signal-transduction protein  32.39 
 
 
144 aa  65.5  0.0000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1762  signal-transduction protein  36 
 
 
139 aa  65.5  0.0000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1794  signal-transduction protein  35.07 
 
 
187 aa  65.5  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.190963  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1780  putative signal transduction protein with CBS domains  32.88 
 
 
141 aa  65.5  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2096  diguanylate cyclase with GAF sensor  32.54 
 
 
664 aa  65.1  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.76184 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0026  CBS domain-containing protein  35.83 
 
 
141 aa  65.1  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0778  signal transduction protein  26.24 
 
 
140 aa  65.1  0.0000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0404956 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0264  signal protein  31.47 
 
 
614 aa  65.1  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2360  signal-transduction protein  35.43 
 
 
142 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0426332  normal  0.516588 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4030  CBS domain-containing protein  35.54 
 
 
641 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.210383  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2950  signal transduction protein  36.89 
 
 
141 aa  63.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.211508 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0362  signal-transduction protein  32.8 
 
 
139 aa  63.5  0.0000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0631  signal-transduction protein  29.32 
 
 
189 aa  63.5  0.0000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01888  hypothetical protein  32.65 
 
 
629 aa  63.5  0.0000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2788  CBS domain-containing protein  34.01 
 
 
151 aa  63.5  0.0000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.190959  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1548  cyclic nucleotide-binding protein  35.07 
 
 
615 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4152  signal-transduction protein  31.47 
 
 
486 aa  62.8  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.729428 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3107  hypothetical protein  39.85 
 
 
137 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0515224  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>