More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0771 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_0771  signal-transduction protein  100 
 
 
164 aa  336  7e-92  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.411579  normal  0.0544722 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0914  putative signal transduction protein with CBS domains  41.18 
 
 
131 aa  95.9  2e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0000312526  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0239  signal transduction protein  48.45 
 
 
128 aa  89.7  2e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.371768 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1108  signal-transduction protein  38.21 
 
 
144 aa  85.9  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2219  CBS domain containing protein  37.96 
 
 
145 aa  83.2  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.338208  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0964  putative signal transduction protein with CBS domains  45.36 
 
 
132 aa  81.6  0.000000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1198  CBS  35.29 
 
 
139 aa  77  0.00000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0416  signal-transduction protein  35.48 
 
 
130 aa  76.6  0.0000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.498724  normal  0.0778746 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6330  CBS domain containing protein  35.9 
 
 
139 aa  76.6  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.1107  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2797  signal-transduction protein  42.71 
 
 
146 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.182223  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2323  putative signal transduction protein with CBS domains  34.59 
 
 
145 aa  75.9  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.170904  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0505  conserved hypothetical protein  58.82 
 
 
122 aa  75.5  0.0000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2035  CBS domain-containing protein  34.35 
 
 
143 aa  75.5  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2834  signal-transduction protein  34.59 
 
 
145 aa  75.5  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.316088  normal  0.231791 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1762  signal-transduction protein  37.01 
 
 
139 aa  75.1  0.0000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2012  CBS domain-containing protein  34.75 
 
 
157 aa  75.1  0.0000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.345115 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1332  signal-transduction protein  37.61 
 
 
139 aa  74.7  0.0000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.660277  normal  0.443449 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1821  CBS domain containing protein  34.48 
 
 
157 aa  74.7  0.0000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0623  CBS  35.59 
 
 
143 aa  74.3  0.0000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3238  putative signal transduction protein with CBS domains  39.23 
 
 
138 aa  73.9  0.0000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.365049  normal  0.128899 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1143  signal-transduction protein  38.66 
 
 
138 aa  73.9  0.0000000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.430444 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0942  CBS domain containing membrane protein  34.64 
 
 
277 aa  73.2  0.000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0100206  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2520  putative signal transduction protein with CBS domains  33.88 
 
 
143 aa  73.6  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4731  CBS domain-containing protein  38.38 
 
 
145 aa  73.2  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.697087 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1290  CBS domain-containing protein  36.36 
 
 
154 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427954  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1350  CBS domain-containing protein  36.36 
 
 
154 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0725634  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2480  CBS domain-containing protein  36.36 
 
 
154 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1515  CBS domain-containing protein  36.36 
 
 
153 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0957  CBS domain-containing protein  36.36 
 
 
154 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0013  signal-transduction protein  35.04 
 
 
147 aa  72.8  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.371187  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0420  signal-transduction protein  38.39 
 
 
158 aa  72.8  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0334  CBS domain-containing protein  36.36 
 
 
154 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0612  CBS domain-containing protein  36.36 
 
 
154 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.735232  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1218  CBS domain-containing protein  36.36 
 
 
154 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0838  signal transduction protein  37.37 
 
 
279 aa  71.6  0.000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.545659  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1409  signal-transduction protein  37.84 
 
 
146 aa  71.6  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0254  signal-transduction protein  32.35 
 
 
136 aa  71.2  0.000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00659332  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0364  signal-transduction protein  34.43 
 
 
139 aa  71.2  0.000000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.612757 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1119  signal transduction protein  32.5 
 
 
295 aa  70.9  0.000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.700202 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1217  CBS domain-containing protein  33.06 
 
 
143 aa  70.9  0.000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5476  putative signal transduction protein with CBS domains  35.71 
 
 
145 aa  70.9  0.000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  34.75 
 
 
185 aa  70.9  0.000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2352  signal-transduction protein  37.01 
 
 
142 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.103406  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0360  hypothetical protein  64.58 
 
 
90 aa  70.5  0.00000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.889115  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3943  signal-transduction protein  34.71 
 
 
153 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.69222 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1938  CBS domain-containing protein  32.23 
 
 
143 aa  69.3  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.704039  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2962  putative signal transduction protein with CBS domains  33.63 
 
 
145 aa  69.7  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2374  signal-transduction protein  34.78 
 
 
146 aa  69.7  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.425597  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0153  signal-transduction protein  38.32 
 
 
142 aa  68.9  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2219  putative signal-transduction protein with CBS domains  33.33 
 
 
143 aa  68.9  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0827472 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2114  CBS domain-containing protein  32.26 
 
 
149 aa  68.9  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3209  putative signal transduction protein with CBS domains  28.93 
 
 
136 aa  68.6  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0552  putative signal transduction protein with CBS domains  30 
 
 
250 aa  68.2  0.00000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.168262  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3735  signal transduction protein  35.83 
 
 
146 aa  67.8  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1568  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.67 
 
 
488 aa  67.4  0.00000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0280  signal-transduction protein  37.17 
 
 
141 aa  67.8  0.00000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.460001  normal  0.121609 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0410  putative CBS domain-containing signal transduction protein  40 
 
 
124 aa  67.4  0.00000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.269207  normal  0.258379 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0233  putative signal transduction protein with CBS domains  37.27 
 
 
140 aa  67.4  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193926  normal  0.17761 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2768  putative signal transduction protein with CBS domains  30.71 
 
 
148 aa  67.4  0.00000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0620195  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4635  signal-transduction protein  37.37 
 
 
143 aa  67.4  0.00000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.574258  normal  0.318433 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1225  signal-transduction protein  39.09 
 
 
127 aa  67.4  0.00000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.276884  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0631  CBS domain-containing protein  34.88 
 
 
139 aa  67  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.480891  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4414  CBS domain-containing protein  34.75 
 
 
146 aa  66.6  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.718009 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2185  signal transduction protein  34.45 
 
 
170 aa  67  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.51071  normal  0.552255 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0776  CBS domain protein  33.57 
 
 
139 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00143526  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3271  putative signal-transduction protein with CBS domains  29.75 
 
 
143 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00311988 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  36.07 
 
 
145 aa  66.6  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17480  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  34.96 
 
 
191 aa  67  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3348  putative nucleotidyltransferase  30.83 
 
 
646 aa  66.6  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.351645  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0397  putative signal transduction protein with CBS domains  35.59 
 
 
142 aa  65.9  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0148627  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1695  signal transduction protein  29.51 
 
 
281 aa  66.2  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000133254 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1567  CBS domain-containing protein  29.51 
 
 
280 aa  66.6  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  unclonable  0.0000000000000154873 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0847  signal transduction protein  31.43 
 
 
287 aa  65.9  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.766257  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  28.1 
 
 
155 aa  66.2  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0620  signal-transduction protein  34.58 
 
 
144 aa  66.2  0.0000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0631  CBS domain-containing protein  34.88 
 
 
139 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000812315  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0352  putative signal transduction protein with CBS domains  41.3 
 
 
143 aa  65.5  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.014797 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0188  signal-transduction protein  39.09 
 
 
128 aa  65.5  0.0000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.885258  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0966  hypothetical protein  31.11 
 
 
331 aa  65.5  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1393  signal transduction protein  38.46 
 
 
136 aa  65.5  0.0000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.137975 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0765  CBS  35.45 
 
 
224 aa  65.9  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1505  CBS domain-containing protein  30.58 
 
 
282 aa  65.5  0.0000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.206773  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1916  CBS domain containing membrane protein  33.11 
 
 
219 aa  65.5  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.683041  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0797  CBS domain protein  35.54 
 
 
139 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.65672e-35 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1100  signal-transduction protein  35.29 
 
 
152 aa  65.5  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2439  CBS domain-containing protein  35 
 
 
145 aa  65.5  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0872  CBS domain protein  35.45 
 
 
139 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0636  signal-transduction protein  33.08 
 
 
139 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00478917  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  35.29 
 
 
148 aa  65.1  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4486  CBS domain-containing protein  34.68 
 
 
129 aa  65.1  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0214678 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4123  signal-transduction protein  33.06 
 
 
153 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00087962  normal  0.0202046 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0791  CBS domain-containing protein  35.45 
 
 
139 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0244605  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1395  putative signal transduction protein with CBS domains  39 
 
 
138 aa  64.7  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.319409  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2262  CBS domain-containing protein  33.68 
 
 
143 aa  64.7  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.175418 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2537  putative signal transduction protein with CBS domains  33.68 
 
 
143 aa  64.7  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.482232 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0695  putative signal-transduction protein with CBS domains  35.9 
 
 
140 aa  64.7  0.0000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0173289  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0338  signal-transduction protein  37.07 
 
 
147 aa  64.7  0.0000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1425  signal-transduction protein  38.79 
 
 
144 aa  64.7  0.0000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.316039 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0303  signal transduction protein  27.5 
 
 
320 aa  64.7  0.0000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.123815  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3231  signal-transduction protein  31.86 
 
 
143 aa  64.7  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00933533  normal  0.19525 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>