More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1780 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1780  putative signal transduction protein with CBS domains  100 
 
 
141 aa  281  2.0000000000000002e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2352  signal-transduction protein  60 
 
 
142 aa  179  1e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.103406  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  48.2 
 
 
145 aa  148  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  48.57 
 
 
147 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  44.29 
 
 
148 aa  134  4e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06340  putative signal-transduction protein with CBS domains  47.52 
 
 
141 aa  132  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4395  CBS  46.1 
 
 
164 aa  124  5e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0203487  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3316  CBS domain-containing protein  43.28 
 
 
144 aa  122  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011902  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1198  CBS  44.2 
 
 
139 aa  118  3e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0656  CBS domain containing protein  40.71 
 
 
142 aa  117  3.9999999999999996e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1863  putative signal transduction protein with CBS domains  44.36 
 
 
141 aa  117  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0776  CBS domain protein  41.3 
 
 
139 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00143526  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0631  CBS domain-containing protein  42.03 
 
 
139 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.480891  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2185  signal transduction protein  46.43 
 
 
170 aa  115  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.51071  normal  0.552255 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4559  CBS domain protein  41.3 
 
 
139 aa  114  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000024778  normal  0.1618 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5536  CBS domain-containing protein  44.29 
 
 
141 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0354137 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0631  CBS domain-containing protein  41.3 
 
 
139 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000812315  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0687  CBS domain-containing protein  40.58 
 
 
139 aa  114  6e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.740174  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3292  signal transduction protein  39.44 
 
 
142 aa  114  6e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0720  CBS domain-containing protein  40.58 
 
 
139 aa  114  6e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000162258  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0636  signal-transduction protein  42.22 
 
 
139 aa  113  6.9999999999999995e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00478917  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0791  CBS domain-containing protein  41.3 
 
 
139 aa  113  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0244605  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2219  CBS domain containing protein  43.66 
 
 
145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.338208  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0607  signal-transduction protein  41.01 
 
 
144 aa  111  3e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.150713  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0872  CBS domain protein  40.58 
 
 
139 aa  111  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5621  CBS domain-containing protein  39.01 
 
 
143 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0984367 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6352  CBS domain-containing protein  39.01 
 
 
143 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.88577 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0797  CBS domain protein  40.58 
 
 
139 aa  110  5e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.65672e-35 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1249  CBS domain-containing protein  44.6 
 
 
141 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6583  CBS domain-containing protein  44.6 
 
 
141 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460187  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6186  CBS domain-containing protein  44.6 
 
 
141 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3011  CBS domain-containing protein  39.72 
 
 
143 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.162521  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1360  CBS domain-containing protein  39.72 
 
 
143 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.565308  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3139  CBS domain-containing protein  39.72 
 
 
143 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.533561  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2788  CBS domain-containing protein  44.29 
 
 
151 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.190959  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7015  CBS domain-containing protein  39.01 
 
 
143 aa  107  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4061  signal-transduction protein  41.43 
 
 
145 aa  106  9.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1358  CBS domain-containing protein  38.3 
 
 
143 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6060  CBS domain-containing protein  38.3 
 
 
143 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.613406  normal  0.175834 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6471  CBS domain-containing protein  38.3 
 
 
143 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0745469  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4239  CBS domain-containing protein  41.13 
 
 
143 aa  103  6e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.716364  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4760  CBS domain-containing protein  43.06 
 
 
141 aa  103  7e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462026  normal  0.418108 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5465  CBS domain-containing protein  37.59 
 
 
143 aa  102  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00381239 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5973  CBS domain-containing protein  39.72 
 
 
143 aa  99  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.643427  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2439  CBS domain-containing protein  42.02 
 
 
145 aa  98.6  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4261  CBS domain-containing protein  39.72 
 
 
143 aa  98.2  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.808384  normal  0.229571 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3796  CBS domain-containing protein  39.72 
 
 
143 aa  97.8  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.586823  normal  0.399094 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3985  CBS domain-containing protein  39.72 
 
 
143 aa  97.4  6e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.134213  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4382  CBS domain-containing protein  39.72 
 
 
143 aa  97.4  6e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0262346  normal  0.971701 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2035  CBS domain-containing protein  37.41 
 
 
143 aa  96.7  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3605  hypothetical protein  36.8 
 
 
139 aa  96.3  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.103373  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1401  signal-transduction protein  40.52 
 
 
142 aa  95.5  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1821  CBS domain containing protein  38.13 
 
 
157 aa  95.5  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1637  CBS domain-containing protein  39.01 
 
 
143 aa  94.7  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.817023  normal  0.200106 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0706  CBS domain containing protein  40.43 
 
 
144 aa  94.4  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2798  putative signal transduction protein with CBS domains  37.21 
 
 
140 aa  94  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0139355  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2001  putative signal transduction protein with CBS domains  40.43 
 
 
157 aa  94  7e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0953206  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1420  CBS domain containing protein  36.3 
 
 
144 aa  92.4  2e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.384654  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2620  CBS domain protein  34.71 
 
 
146 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5005  signal-transduction protein  41.61 
 
 
144 aa  91.7  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2776  putative signal transduction protein with CBS domains  35.9 
 
 
141 aa  91.3  4e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000774578 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6330  CBS domain containing protein  35.77 
 
 
139 aa  91.3  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.1107  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4414  CBS domain-containing protein  43.8 
 
 
146 aa  90.9  6e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.718009 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3147  hypothetical protein  40 
 
 
138 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.643619  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2292  CBS domain-containing protein  40 
 
 
137 aa  89  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.173837  hitchhiker  0.00000858428 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2012  CBS domain-containing protein  35.97 
 
 
157 aa  88.2  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.345115 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0202  CBS domain-containing protein  34.55 
 
 
145 aa  87  7e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.025801  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12645  hypothetical protein  33.62 
 
 
143 aa  87  8e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0225  CBS domain-containing protein  34.55 
 
 
145 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.791993 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3107  hypothetical protein  40 
 
 
137 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0515224  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36650  hypothetical protein  39.17 
 
 
138 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000287918  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0026  CBS domain-containing protein  35.56 
 
 
141 aa  84.3  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3539  signal-transduction protein  35.14 
 
 
146 aa  84.3  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.278615 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0100  putative signal transduction protein with CBS domains  32.69 
 
 
143 aa  84.7  4e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0591  signal-transduction protein  41.53 
 
 
155 aa  84.3  5e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0331315  normal  0.426072 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3096  signal-transduction protein  38.14 
 
 
139 aa  84  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1740  signal transduction protein  31.15 
 
 
138 aa  84  6e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.247067 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0446  putative signal transduction protein with CBS domains  40.74 
 
 
136 aa  84  6e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0212406  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0228  CBS domain-containing protein  33.64 
 
 
145 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3238  putative signal transduction protein with CBS domains  36.22 
 
 
138 aa  83.2  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.365049  normal  0.128899 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11190  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  38.17 
 
 
131 aa  83.2  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.170576 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2080  signal-transduction protein  36.21 
 
 
141 aa  83.2  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2950  signal transduction protein  32.77 
 
 
141 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.211508 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3788  putative signal transduction protein with CBS domains  31.25 
 
 
139 aa  82.4  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.534948  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2247  putative signal transduction protein with CBS domains  34.85 
 
 
142 aa  81.6  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000297093  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  31.13 
 
 
230 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1141  signal-transduction protein  35 
 
 
150 aa  80.9  0.000000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.403559  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0272  CBS domain-containing protein  31.82 
 
 
145 aa  80.1  0.000000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24850  CBS domain pair-containing protein  35 
 
 
137 aa  80.1  0.000000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.310967  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1449  signal transduction protein  32.41 
 
 
153 aa  80.1  0.000000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  35.59 
 
 
155 aa  79.7  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2667  hypothetical protein  33.9 
 
 
140 aa  79  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.262704  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3033  signal-transduction protein  36.64 
 
 
142 aa  79.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0966775  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1462  putative signal transduction protein with CBS domains  32.43 
 
 
145 aa  79  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0493403  normal  0.625814 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0420  signal-transduction protein  32.38 
 
 
158 aa  78.6  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1577  putative signal transduction protein with CBS domains  30.51 
 
 
139 aa  78.6  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.011912  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0022  signal-transduction protein  32.77 
 
 
141 aa  78.6  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4391  CBS domain-containing protein  33.6 
 
 
204 aa  78.6  0.00000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2234  putative signal transduction protein with CBS domains  32.48 
 
 
139 aa  78.2  0.00000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1304  signal-transduction protein  33.91 
 
 
148 aa  77.8  0.00000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000185547 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>