More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3278 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_3278  putative CBS domain-containing signal transduction protein  100 
 
 
145 aa  296  8e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.565248  normal  0.216437 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2667  hypothetical protein  65.94 
 
 
140 aa  189  8e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.262704  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1577  putative signal transduction protein with CBS domains  66.92 
 
 
139 aa  189  1e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.011912  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0945  CBS domain-containing protein  58.52 
 
 
144 aa  166  8e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.678646  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5147  putative signal transduction protein with CBS domains  57.78 
 
 
137 aa  161  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.48852  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12645  hypothetical protein  53.85 
 
 
143 aa  158  2e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1401  signal-transduction protein  54.07 
 
 
142 aa  157  5e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2441  signal-transduction protein  54.07 
 
 
144 aa  148  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.528968  normal  0.376991 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1978  putative signal transduction protein with CBS domains  52.94 
 
 
138 aa  142  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0602672  normal  0.871895 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2776  putative signal transduction protein with CBS domains  45.04 
 
 
141 aa  125  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000774578 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11190  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  47.46 
 
 
131 aa  105  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.170576 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06340  putative signal-transduction protein with CBS domains  43.1 
 
 
141 aa  98.2  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  37.6 
 
 
147 aa  97.8  5e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3605  hypothetical protein  39.39 
 
 
139 aa  95.5  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.103373  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1863  putative signal transduction protein with CBS domains  48.74 
 
 
141 aa  95.5  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  33.33 
 
 
148 aa  92.8  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5536  CBS domain-containing protein  44.83 
 
 
141 aa  90.5  6e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0354137 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3080  putative signal transduction protein with CBS domains  37.98 
 
 
145 aa  90.5  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0313978 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0706  CBS domain containing protein  42.61 
 
 
144 aa  89.7  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3096  signal-transduction protein  38.06 
 
 
139 aa  89  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1249  CBS domain-containing protein  43.97 
 
 
141 aa  88.6  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6583  CBS domain-containing protein  43.97 
 
 
141 aa  88.6  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460187  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1740  signal transduction protein  36.64 
 
 
138 aa  88.2  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.247067 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6186  CBS domain-containing protein  43.59 
 
 
141 aa  87.4  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2185  signal transduction protein  38.71 
 
 
170 aa  87.4  6e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.51071  normal  0.552255 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4760  CBS domain-containing protein  43.7 
 
 
141 aa  87  8e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462026  normal  0.418108 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2035  CBS domain-containing protein  41.03 
 
 
143 aa  85.9  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4395  CBS  40.94 
 
 
164 aa  84.7  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0203487  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1198  CBS  39.37 
 
 
139 aa  84  6e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1821  CBS domain containing protein  38.66 
 
 
157 aa  83.6  7e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4061  signal-transduction protein  39.52 
 
 
145 aa  84  7e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6330  CBS domain containing protein  41.18 
 
 
139 aa  83.6  9e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.1107  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7015  CBS domain-containing protein  39.66 
 
 
143 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5465  CBS domain-containing protein  39.66 
 
 
143 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00381239 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2352  signal-transduction protein  40.52 
 
 
142 aa  83.2  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.103406  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6060  CBS domain-containing protein  38.79 
 
 
143 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.613406  normal  0.175834 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1358  CBS domain-containing protein  38.79 
 
 
143 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6471  CBS domain-containing protein  38.79 
 
 
143 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0745469  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3139  CBS domain-containing protein  39.66 
 
 
143 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.533561  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  31.71 
 
 
145 aa  82  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1360  CBS domain-containing protein  39.66 
 
 
143 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.565308  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3011  CBS domain-containing protein  39.66 
 
 
143 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.162521  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2080  signal-transduction protein  39.17 
 
 
141 aa  81.3  0.000000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2012  CBS domain-containing protein  37.82 
 
 
157 aa  81.3  0.000000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.345115 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2001  putative signal transduction protein with CBS domains  36.44 
 
 
157 aa  81.3  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0953206  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3788  putative signal transduction protein with CBS domains  39.84 
 
 
139 aa  79.7  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.534948  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6352  CBS domain-containing protein  37.07 
 
 
143 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.88577 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5621  CBS domain-containing protein  37.07 
 
 
143 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0984367 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0656  CBS domain containing protein  38.02 
 
 
142 aa  79  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3238  putative signal transduction protein with CBS domains  36.84 
 
 
138 aa  78.6  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.365049  normal  0.128899 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2798  putative signal transduction protein with CBS domains  37.01 
 
 
140 aa  78.2  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0139355  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1449  signal transduction protein  39.32 
 
 
153 aa  78.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0631  CBS domain-containing protein  38.71 
 
 
139 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000812315  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0797  CBS domain protein  38.71 
 
 
139 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.65672e-35 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0631  CBS domain-containing protein  38.71 
 
 
139 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.480891  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1637  CBS domain-containing protein  37.07 
 
 
143 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.817023  normal  0.200106 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3796  CBS domain-containing protein  35.34 
 
 
143 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.586823  normal  0.399094 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4261  CBS domain-containing protein  35.34 
 
 
143 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.808384  normal  0.229571 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3316  CBS domain-containing protein  32.52 
 
 
144 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011902  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0026  CBS domain-containing protein  35.29 
 
 
141 aa  73.6  0.0000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3107  hypothetical protein  36.36 
 
 
137 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0515224  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1568  putative signal transduction protein with CBS domains  38.4 
 
 
140 aa  73.2  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0256186 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0687  CBS domain-containing protein  38.71 
 
 
139 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.740174  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0720  CBS domain-containing protein  38.71 
 
 
139 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000162258  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5005  signal-transduction protein  35.59 
 
 
144 aa  72.8  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2219  CBS domain containing protein  39.13 
 
 
145 aa  72.4  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.338208  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4502  signal-transduction protein  39.47 
 
 
236 aa  72  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6054  signal transduction protein  35.66 
 
 
193 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000453933 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0776  CBS domain protein  34.96 
 
 
139 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00143526  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3292  signal transduction protein  35.04 
 
 
142 aa  71.6  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36650  hypothetical protein  38.46 
 
 
138 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000287918  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2439  CBS domain-containing protein  37.61 
 
 
145 aa  71.6  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6938  signal-transduction protein  37.39 
 
 
242 aa  72  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.335853 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1197  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  31.67 
 
 
491 aa  71.6  0.000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4239  CBS domain-containing protein  35.34 
 
 
143 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.716364  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3985  CBS domain-containing protein  36.21 
 
 
143 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.134213  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4382  CBS domain-containing protein  36.21 
 
 
143 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0262346  normal  0.971701 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0214  putative signal transduction protein with CBS domains  32.52 
 
 
207 aa  71.6  0.000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3147  hypothetical protein  37.61 
 
 
138 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.643619  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4559  CBS domain protein  34.15 
 
 
139 aa  70.5  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000024778  normal  0.1618 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5973  CBS domain-containing protein  36.21 
 
 
143 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.643427  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08210  CBS domain-containing protein  36.89 
 
 
139 aa  70.5  0.000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0791  CBS domain-containing protein  36.29 
 
 
139 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0244605  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0872  CBS domain protein  36.29 
 
 
139 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2950  signal transduction protein  38.46 
 
 
141 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.211508 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1780  putative signal transduction protein with CBS domains  30.51 
 
 
141 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0272  CBS domain-containing protein  31.58 
 
 
145 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0607  signal-transduction protein  35.48 
 
 
144 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.150713  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2620  CBS domain protein  31.36 
 
 
146 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1420  CBS domain containing protein  33.6 
 
 
144 aa  68.6  0.00000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.384654  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0381  CBS domain-containing protein  32 
 
 
688 aa  68.6  0.00000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0243844 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2292  CBS domain-containing protein  36.21 
 
 
137 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.173837  hitchhiker  0.00000858428 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0778  signal transduction protein  29.84 
 
 
140 aa  68.6  0.00000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0404956 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1304  signal-transduction protein  30.25 
 
 
148 aa  68.6  0.00000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000185547 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4414  CBS domain-containing protein  35.83 
 
 
146 aa  68.2  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.718009 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2788  CBS domain-containing protein  35.34 
 
 
151 aa  68.2  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.190959  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0636  signal-transduction protein  36.27 
 
 
139 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00478917  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3154  putative signal transduction protein with CBS domains  33.06 
 
 
139 aa  67.8  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.12439 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3944  signal-transduction protein  34.78 
 
 
138 aa  67.4  0.00000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.898238  normal  0.165624 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0631  signal-transduction protein  33.33 
 
 
142 aa  67  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0667586  normal  0.341746 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>