More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3107 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3107  hypothetical protein  100 
 
 		 137 aa  273  8e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0515224  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2292  CBS domain-containing protein  56.93 
 
 		 137 aa  165  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.173837  hitchhiker  0.00000858428 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36650  hypothetical protein  54.01 
 
 		 138 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000287918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3147  hypothetical protein  54.01 
 
 		 138 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.643619  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24850  CBS domain pair-containing protein  55.47 
 
 		 137 aa  160  8.000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.310967  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2788  CBS domain-containing protein  47.41 
 
 		 151 aa  135  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.190959  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2439  CBS domain-containing protein  47.62 
 
 		 145 aa  129  1.0000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1821  CBS domain containing protein  47.37 
 
 		 157 aa  122  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1360  CBS domain-containing protein  47.1 
 
 		 143 aa  121  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.565308  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3139  CBS domain-containing protein  47.1 
 
 		 143 aa  121  4e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.533561  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3011  CBS domain-containing protein  47.1 
 
 		 143 aa  121  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.162521  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1637  CBS domain-containing protein  52.54 
 
 		 143 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.817023  normal  0.200106 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2012  CBS domain-containing protein  45.86 
 
 		 157 aa  117  6e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.345115 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5465  CBS domain-containing protein  46.38 
 
 		 143 aa  114  6e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00381239 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6352  CBS domain-containing protein  43.48 
 
 		 143 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.88577 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5621  CBS domain-containing protein  43.48 
 
 		 143 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0984367 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7015  CBS domain-containing protein  43.8 
 
 		 143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1249  CBS domain-containing protein  44.09 
 
 		 141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3796  CBS domain-containing protein  49.15 
 
 		 143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.586823  normal  0.399094 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6583  CBS domain-containing protein  44.09 
 
 		 141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460187  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6330  CBS domain containing protein  41.6 
 
 		 139 aa  112  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.1107  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4261  CBS domain-containing protein  49.15 
 
 		 143 aa  111  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.808384  normal  0.229571 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6060  CBS domain-containing protein  43.8 
 
 		 143 aa  111  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.613406  normal  0.175834 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1358  CBS domain-containing protein  43.8 
 
 		 143 aa  111  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6471  CBS domain-containing protein  43.8 
 
 		 143 aa  111  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0745469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6186  CBS domain-containing protein  43.31 
 
 		 141 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2035  CBS domain-containing protein  49.15 
 
 		 143 aa  111  4.0000000000000004e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3985  CBS domain-containing protein  49.15 
 
 		 143 aa  110  6e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.134213  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4382  CBS domain-containing protein  49.15 
 
 		 143 aa  110  6e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0262346  normal  0.971701 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5973  CBS domain-containing protein  49.15 
 
 		 143 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.643427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4239  CBS domain-containing protein  49.15 
 
 		 143 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.716364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5536  CBS domain-containing protein  42.52 
 
 		 141 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0354137 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0706  CBS domain containing protein  45.3 
 
 		 144 aa  108  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4414  CBS domain-containing protein  43.61 
 
 		 146 aa  107  5e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.718009 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1198  CBS  42.62 
 
 		 139 aa  107  5e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4760  CBS domain-containing protein  41.73 
 
 		 141 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462026  normal  0.418108 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2001  putative signal transduction protein with CBS domains  45.3 
 
 		 157 aa  103  6e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0953206  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2185  signal transduction protein  46.34 
 
 		 170 aa  102  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.51071  normal  0.552255 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3292  signal transduction protein  43.48 
 
 		 142 aa  98.6  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1740  signal transduction protein  37.68 
 
 		 138 aa  98.6  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247067 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06340  putative signal-transduction protein with CBS domains  38.98 
 
 		 141 aa  95.9  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1420  CBS domain containing protein  36.3 
 
 		 144 aa  92  2e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.384654  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0656  CBS domain containing protein  38.71 
 
 		 142 aa  90.9  6e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3605  hypothetical protein  39.13 
 
 		 139 aa  90.1  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.103373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1863  putative signal transduction protein with CBS domains  43.59 
 
 		 141 aa  89.7  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4395  CBS  39.02 
 
 		 164 aa  89  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0203487  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  41.18 
 
 		 147 aa  87.4  5e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1449  signal transduction protein  40 
 
 		 153 aa  87  8e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2352  signal-transduction protein  41.18 
 
 		 142 aa  86.3  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.103406  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1780  putative signal transduction protein with CBS domains  40 
 
 		 141 aa  86.3  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2080  signal-transduction protein  37.12 
 
 		 141 aa  82  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  40.34 
 
 		 148 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2950  signal transduction protein  40.91 
 
 		 141 aa  80.5  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.211508 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4061  signal-transduction protein  40.98 
 
 		 145 aa  80.1  0.000000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0568  signal-transduction protein  38.05 
 
 		 133 aa  79.3  0.00000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.706815 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0446  putative signal transduction protein with CBS domains  39.23 
 
 		 136 aa  79.3  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0212406  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0791  CBS domain-containing protein  36.75 
 
 		 139 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0244605  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0631  CBS domain-containing protein  36.75 
 
 		 139 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000812315  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0631  CBS domain-containing protein  36.75 
 
 		 139 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.480891  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0872  CBS domain protein  36.75 
 
 		 139 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5005  signal-transduction protein  36.97 
 
 		 144 aa  78.6  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08210  CBS domain-containing protein  44.92 
 
 		 139 aa  79  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0687  CBS domain-containing protein  36.75 
 
 		 139 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.740174  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0636  signal-transduction protein  35.9 
 
 		 139 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00478917  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0720  CBS domain-containing protein  36.75 
 
 		 139 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000162258  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1483  CBS domain protein  37.93 
 
 		 125 aa  78.6  0.00000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0666376  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4559  CBS domain protein  35.04 
 
 		 139 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000024778  normal  0.1618 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  35.54 
 
 		 145 aa  77.8  0.00000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0776  CBS domain protein  35.04 
 
 		 139 aa  77  0.00000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00143526  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0797  CBS domain protein  35.9 
 
 		 139 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.65672e-35 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3316  CBS domain-containing protein  40.68 
 
 		 144 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0026  CBS domain-containing protein  38.66 
 
 		 141 aa  74.7  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0607  signal-transduction protein  33.33 
 
 		 144 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.150713  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4379  signal-transduction protein  35.04 
 
 		 158 aa  74.3  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.817612 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3278  putative CBS domain-containing signal transduction protein  36.36 
 
 		 145 aa  73.6  0.0000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.565248  normal  0.216437 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2219  CBS domain containing protein  34.45 
 
 		 145 aa  72.8  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.338208  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0214  putative signal transduction protein with CBS domains  33.88 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2798  putative signal transduction protein with CBS domains  35.59 
 
 		 140 aa  72.4  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0139355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1577  putative signal transduction protein with CBS domains  31.88 
 
 		 139 aa  70.5  0.000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.011912  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4435  putative signal-transduction protein with CBS domains  41.18 
 
 		 155 aa  70.5  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4568  putative signal transduction protein with CBS domains  41.18 
 
 		 155 aa  70.5  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0446023  normal  0.17585 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3669  putative signal transduction protein with CBS domains  36.44 
 
 		 141 aa  69.7  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3238  putative signal transduction protein with CBS domains  37.61 
 
 		 138 aa  69.7  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.365049  normal  0.128899 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0420  signal-transduction protein  37.96 
 
 		 158 aa  69.7  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7035  CBS domain-containing protein  39.84 
 
 		 150 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.819335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1046  signal-transduction protein  36.07 
 
 		 142 aa  68.6  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.460697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00940  CBS domain containing protein  36.75 
 
 		 262 aa  68.6  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000126291  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2661  signal-transduction protein  37.84 
 
 		 177 aa  68.6  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.63207  normal  0.665873 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3271  putative signal-transduction protein with CBS domains  36.89 
 
 		 143 aa  68.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311988 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0824  CBS domain containing membrane protein  33.59 
 
 		 143 aa  67.8  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.117875 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6054  signal transduction protein  39.5 
 
 		 193 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000453933 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12645  hypothetical protein  38.46 
 
 		 143 aa  67  0.00000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1304  signal-transduction protein  33.04 
 
 		 148 aa  66.6  0.0000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000185547 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2247  putative signal transduction protein with CBS domains  33.85 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000297093  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0978  CBS domain-containing protein  35.71 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3897  CBS domain containing protein  38.52 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1938  CBS domain-containing protein  35.77 
 
 		 143 aa  65.9  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.704039  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02457  hypothetical protein  32.8 
 
 		 626 aa  65.5  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0022  signal-transduction protein  34.45 
 
 		 141 aa  65.1  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1852  putative signal transduction protein with CBS domains  35.04 
 
 		 144 aa  65.1  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260866  normal  0.0125119 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>