More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_6330 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_6330  CBS domain containing protein  100 
 
 		 139 aa  273  8e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.1107  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1198  CBS  58.27 
 
 		 139 aa  169  7.999999999999999e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2035  CBS domain-containing protein  55.47 
 
 		 143 aa  146  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2788  CBS domain-containing protein  52.94 
 
 		 151 aa  137  7e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.190959  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2439  CBS domain-containing protein  50 
 
 		 145 aa  134  6.0000000000000005e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3139  CBS domain-containing protein  43.57 
 
 		 143 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.533561  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1360  CBS domain-containing protein  43.57 
 
 		 143 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.565308  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3011  CBS domain-containing protein  43.57 
 
 		 143 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.162521  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1821  CBS domain containing protein  41.73 
 
 		 157 aa  118  3e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4395  CBS  39.71 
 
 		 164 aa  117  4.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0203487  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2292  CBS domain-containing protein  47.41 
 
 		 137 aa  117  7e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.173837  hitchhiker  0.00000858428 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1358  CBS domain-containing protein  40.71 
 
 		 143 aa  115  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6471  CBS domain-containing protein  40.71 
 
 		 143 aa  115  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0745469  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24850  CBS domain pair-containing protein  46.55 
 
 		 137 aa  116  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.310967  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5465  CBS domain-containing protein  43.07 
 
 		 143 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00381239 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6352  CBS domain-containing protein  42.98 
 
 		 143 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.88577 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5621  CBS domain-containing protein  42.98 
 
 		 143 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0984367 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6060  CBS domain-containing protein  40.71 
 
 		 143 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.613406  normal  0.175834 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7015  CBS domain-containing protein  40.71 
 
 		 143 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2012  CBS domain-containing protein  40.29 
 
 		 157 aa  114  3.9999999999999997e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.345115 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1863  putative signal transduction protein with CBS domains  45.99 
 
 		 141 aa  114  6e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  39.57 
 
 		 147 aa  113  6.9999999999999995e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06340  putative signal-transduction protein with CBS domains  45.59 
 
 		 141 aa  113  8.999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0872  CBS domain protein  40.15 
 
 		 139 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36650  hypothetical protein  49.14 
 
 		 138 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000287918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4414  CBS domain-containing protein  43.38 
 
 		 146 aa  112  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.718009 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  39.57 
 
 		 148 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0791  CBS domain-containing protein  40.15 
 
 		 139 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0244605  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3107  hypothetical protein  41.6 
 
 		 137 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0515224  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0631  CBS domain-containing protein  40.88 
 
 		 139 aa  111  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000812315  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3147  hypothetical protein  48.28 
 
 		 138 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.643619  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0687  CBS domain-containing protein  40.88 
 
 		 139 aa  110  5e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.740174  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0720  CBS domain-containing protein  40.88 
 
 		 139 aa  110  5e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000162258  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0631  CBS domain-containing protein  40.15 
 
 		 139 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.480891  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0797  CBS domain protein  40.15 
 
 		 139 aa  108  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.65672e-35 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4559  CBS domain protein  38.69 
 
 		 139 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000024778  normal  0.1618 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2001  putative signal transduction protein with CBS domains  40.29 
 
 		 157 aa  107  5e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0953206  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1249  CBS domain-containing protein  48.74 
 
 		 141 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6583  CBS domain-containing protein  48.74 
 
 		 141 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0607  signal-transduction protein  39.42 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.150713  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0776  CBS domain protein  37.96 
 
 		 139 aa  105  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00143526  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1420  CBS domain containing protein  37.69 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.384654  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0636  signal-transduction protein  37.96 
 
 		 139 aa  104  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00478917  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4760  CBS domain-containing protein  42.45 
 
 		 141 aa  105  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462026  normal  0.418108 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6186  CBS domain-containing protein  48.74 
 
 		 141 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  38.69 
 
 		 145 aa  105  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5536  CBS domain-containing protein  46.22 
 
 		 141 aa  104  5e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0354137 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4239  CBS domain-containing protein  42.15 
 
 		 143 aa  103  5e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.716364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3292  signal transduction protein  41.61 
 
 		 142 aa  104  5e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2352  signal-transduction protein  40.88 
 
 		 142 aa  103  9e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.103406  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0706  CBS domain containing protein  42.14 
 
 		 144 aa  102  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3605  hypothetical protein  42.74 
 
 		 139 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.103373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2185  signal transduction protein  39.72 
 
 		 170 aa  102  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.51071  normal  0.552255 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1637  CBS domain-containing protein  37.86 
 
 		 143 aa  101  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.817023  normal  0.200106 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1740  signal transduction protein  41.59 
 
 		 138 aa  100  5e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247067 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4061  signal-transduction protein  41.13 
 
 		 145 aa  99  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4261  CBS domain-containing protein  37.19 
 
 		 143 aa  96.3  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.808384  normal  0.229571 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3985  CBS domain-containing protein  38.84 
 
 		 143 aa  96.3  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.134213  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3796  CBS domain-containing protein  37.19 
 
 		 143 aa  96.3  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.586823  normal  0.399094 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4382  CBS domain-containing protein  38.84 
 
 		 143 aa  96.3  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0262346  normal  0.971701 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5973  CBS domain-containing protein  38.84 
 
 		 143 aa  95.5  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.643427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1483  CBS domain protein  38.94 
 
 		 125 aa  94.7  3e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0666376  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2219  CBS domain containing protein  37.04 
 
 		 145 aa  92  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.338208  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1780  putative signal transduction protein with CBS domains  35.77 
 
 		 141 aa  91.3  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0656  CBS domain containing protein  33.82 
 
 		 142 aa  89.7  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3316  CBS domain-containing protein  37.23 
 
 		 144 aa  89.7  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2776  putative signal transduction protein with CBS domains  36.69 
 
 		 141 aa  87  7e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000774578 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6054  signal transduction protein  37.6 
 
 		 193 aa  84.7  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000453933 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1449  signal transduction protein  36.5 
 
 		 153 aa  84.7  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3278  putative CBS domain-containing signal transduction protein  41.18 
 
 		 145 aa  83.6  9e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.565248  normal  0.216437 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0446  putative signal transduction protein with CBS domains  37.4 
 
 		 136 aa  81.6  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0212406  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2620  CBS domain protein  34.65 
 
 		 146 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5005  signal-transduction protein  34.78 
 
 		 144 aa  78.6  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2441  signal-transduction protein  38.02 
 
 		 144 aa  78.2  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.528968  normal  0.376991 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0945  CBS domain-containing protein  35.16 
 
 		 144 aa  77.8  0.00000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.678646  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0771  signal-transduction protein  35.9 
 
 		 164 aa  76.6  0.0000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.411579  normal  0.0544722 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12645  hypothetical protein  33.88 
 
 		 143 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0026  CBS domain-containing protein  36.5 
 
 		 141 aa  75.5  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2080  signal-transduction protein  38.85 
 
 		 141 aa  74.3  0.0000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0272  CBS domain-containing protein  34.68 
 
 		 145 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0214  putative signal transduction protein with CBS domains  31.62 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1577  putative signal transduction protein with CBS domains  35.38 
 
 		 139 aa  72.8  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.011912  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3488  CBS domain-containing protein  35.56 
 
 		 142 aa  72.8  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1401  signal-transduction protein  35.54 
 
 		 142 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2950  signal transduction protein  35.29 
 
 		 141 aa  72  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.211508 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1197  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.59 
 
 		 491 aa  72.4  0.000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08210  CBS domain-containing protein  37.31 
 
 		 139 aa  72.4  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0019  hypothetical protein  36.75 
 
 		 503 aa  72  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0964  putative signal transduction protein with CBS domains  33.62 
 
 		 132 aa  72  0.000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3096  signal-transduction protein  41.67 
 
 		 139 aa  71.6  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0778  signal transduction protein  32.5 
 
 		 140 aa  71.6  0.000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0404956 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3565  CBS domain-containing protein  37.68 
 
 		 138 aa  71.6  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3944  signal-transduction protein  36.96 
 
 		 138 aa  70.9  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.898238  normal  0.165624 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0623  CBS  30 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0239  signal transduction protein  31.03 
 
 		 128 aa  70.5  0.000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.371768 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3788  putative signal transduction protein with CBS domains  40.17 
 
 		 139 aa  70.5  0.000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.534948  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0328  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.51 
 
 		 482 aa  69.7  0.00000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2667  hypothetical protein  34.75 
 
 		 140 aa  70.1  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.262704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1409  signal-transduction protein  35.34 
 
 		 146 aa  69.7  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0233  putative signal transduction protein with CBS domains  35.24 
 
 		 140 aa  69.3  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193926  normal  0.17761 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>