More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2292 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2292  CBS domain-containing protein  100 
 
 		 137 aa  273  7e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.173837  hitchhiker  0.00000858428 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36650  hypothetical protein  70.07 
 
 		 138 aa  199  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000287918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3147  hypothetical protein  70.07 
 
 		 138 aa  197  3e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.643619  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24850  CBS domain pair-containing protein  66.42 
 
 		 137 aa  186  7e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.310967  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3107  hypothetical protein  56.93 
 
 		 137 aa  165  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0515224  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2788  CBS domain-containing protein  53.73 
 
 		 151 aa  155  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.190959  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2439  CBS domain-containing protein  55.08 
 
 		 145 aa  144  4.0000000000000006e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3139  CBS domain-containing protein  50 
 
 		 143 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.533561  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1360  CBS domain-containing protein  50 
 
 		 143 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.565308  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3011  CBS domain-containing protein  50 
 
 		 143 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.162521  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2035  CBS domain-containing protein  52.94 
 
 		 143 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5465  CBS domain-containing protein  48.18 
 
 		 143 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00381239 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6186  CBS domain-containing protein  47.86 
 
 		 141 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1249  CBS domain-containing protein  47.01 
 
 		 141 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6583  CBS domain-containing protein  47.01 
 
 		 141 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4760  CBS domain-containing protein  47.01 
 
 		 141 aa  120  7e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462026  normal  0.418108 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1821  CBS domain containing protein  43.61 
 
 		 157 aa  120  9e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7015  CBS domain-containing protein  44.53 
 
 		 143 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1358  CBS domain-containing protein  44.53 
 
 		 143 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6471  CBS domain-containing protein  44.53 
 
 		 143 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0745469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6060  CBS domain-containing protein  44.53 
 
 		 143 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.613406  normal  0.175834 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5536  CBS domain-containing protein  45.3 
 
 		 141 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0354137 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1198  CBS  48.72 
 
 		 139 aa  118  3e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0706  CBS domain containing protein  44.44 
 
 		 144 aa  117  6e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6330  CBS domain containing protein  47.41 
 
 		 139 aa  117  7e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.1107  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4414  CBS domain-containing protein  50.37 
 
 		 146 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.718009 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2001  putative signal transduction protein with CBS domains  44.96 
 
 		 157 aa  112  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0953206  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5621  CBS domain-containing protein  41.3 
 
 		 143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0984367 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6352  CBS domain-containing protein  41.3 
 
 		 143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.88577 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2012  CBS domain-containing protein  41.35 
 
 		 157 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.345115 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4239  CBS domain-containing protein  44.19 
 
 		 143 aa  111  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.716364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2185  signal transduction protein  47.46 
 
 		 170 aa  111  4.0000000000000004e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.51071  normal  0.552255 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1420  CBS domain containing protein  44.54 
 
 		 144 aa  110  5e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.384654  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1637  CBS domain-containing protein  45.76 
 
 		 143 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.817023  normal  0.200106 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3985  CBS domain-containing protein  44.44 
 
 		 143 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.134213  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3796  CBS domain-containing protein  44.07 
 
 		 143 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.586823  normal  0.399094 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4382  CBS domain-containing protein  44.44 
 
 		 143 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0262346  normal  0.971701 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4261  CBS domain-containing protein  44.07 
 
 		 143 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.808384  normal  0.229571 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5973  CBS domain-containing protein  44.44 
 
 		 143 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.643427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4395  CBS  41.98 
 
 		 164 aa  105  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0203487  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06340  putative signal-transduction protein with CBS domains  43.22 
 
 		 141 aa  100  6e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1740  signal transduction protein  37.68 
 
 		 138 aa  98.6  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247067 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1483  CBS domain protein  48 
 
 		 125 aa  98.6  3e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0666376  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3292  signal transduction protein  42.96 
 
 		 142 aa  95.1  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4061  signal-transduction protein  44.92 
 
 		 145 aa  94  6e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5005  signal-transduction protein  37.5 
 
 		 144 aa  92  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0446  putative signal transduction protein with CBS domains  44 
 
 		 136 aa  92.4  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0212406  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  37.78 
 
 		 147 aa  90.5  6e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  44.17 
 
 		 145 aa  90.1  8e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1780  putative signal transduction protein with CBS domains  40 
 
 		 141 aa  89  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  38.52 
 
 		 148 aa  88.2  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2080  signal-transduction protein  41.09 
 
 		 141 aa  85.9  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0656  CBS domain containing protein  38.66 
 
 		 142 aa  85.9  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3605  hypothetical protein  34.06 
 
 		 139 aa  84.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.103373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1449  signal transduction protein  36.97 
 
 		 153 aa  81.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2776  putative signal transduction protein with CBS domains  37.96 
 
 		 141 aa  81.3  0.000000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000774578 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2352  signal-transduction protein  41.32 
 
 		 142 aa  79.7  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.103406  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1863  putative signal transduction protein with CBS domains  38.46 
 
 		 141 aa  78.2  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2950  signal transduction protein  36.09 
 
 		 141 aa  78.2  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.211508 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3316  CBS domain-containing protein  37.29 
 
 		 144 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2219  CBS domain containing protein  36.13 
 
 		 145 aa  73.6  0.0000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.338208  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3241  signal-transduction protein  38.74 
 
 		 144 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.484063 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0214  putative signal transduction protein with CBS domains  31.03 
 
 		 207 aa  72  0.000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4379  signal-transduction protein  33.33 
 
 		 158 aa  71.2  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.817612 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0026  CBS domain-containing protein  36 
 
 		 141 aa  71.2  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4974  putative signal-transduction protein with CBS domains  39.45 
 
 		 147 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0816417 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003608  Signal transduction protein  34.59 
 
 		 626 aa  71.2  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0420  signal-transduction protein  35.19 
 
 		 158 aa  69.3  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1409  signal-transduction protein  37.96 
 
 		 146 aa  69.7  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2323  putative signal transduction protein with CBS domains  37.61 
 
 		 145 aa  68.9  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.170904  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4338  CBS domain-containing protein  38.46 
 
 		 618 aa  68.9  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1676  signal-transduction protein  38.53 
 
 		 147 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.780489  normal  0.354622 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0791  CBS domain-containing protein  29.75 
 
 		 139 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0244605  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0631  CBS domain-containing protein  29.91 
 
 		 139 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000812315  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3278  putative CBS domain-containing signal transduction protein  36.21 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.565248  normal  0.216437 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0636  signal-transduction protein  29.91 
 
 		 139 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00478917  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1401  signal-transduction protein  39.66 
 
 		 142 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0687  CBS domain-containing protein  29.91 
 
 		 139 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.740174  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0631  CBS domain-containing protein  29.91 
 
 		 139 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.480891  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0872  CBS domain protein  29.75 
 
 		 139 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0720  CBS domain-containing protein  29.91 
 
 		 139 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000162258  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2834  signal-transduction protein  37.61 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.316088  normal  0.231791 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0022  signal-transduction protein  36.97 
 
 		 141 aa  67.8  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2757  CBS domain-containing protein  33.87 
 
 		 151 aa  67.8  0.00000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.212289  normal  0.140067 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3539  signal-transduction protein  35.14 
 
 		 146 aa  67.4  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.278615 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12645  hypothetical protein  36.36 
 
 		 143 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0623  CBS  31.82 
 
 		 143 aa  67  0.00000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1837  CBS domain-containing protein  32.23 
 
 		 155 aa  67  0.00000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0592619 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3238  putative signal transduction protein with CBS domains  33.9 
 
 		 138 aa  67.4  0.00000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.365049  normal  0.128899 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0914  putative signal transduction protein with CBS domains  35.94 
 
 		 131 aa  67  0.00000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0000312526  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08210  CBS domain-containing protein  39.32 
 
 		 139 aa  67  0.00000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2066  CBS domain containing protein  31.71 
 
 		 163 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00480753 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4559  CBS domain protein  28.21 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000024778  normal  0.1618 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0415  signal-transduction protein  42.74 
 
 		 145 aa  66.6  0.0000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.682078  normal  0.0782148 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2114  CBS domain-containing protein  36.36 
 
 		 149 aa  66.6  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4603  XRE family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.545277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1436  CBS domain-containing protein  35.59 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0976  XRE family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1046  signal-transduction protein  34.45 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.460697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1458  XRE family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.867241  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>