More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2185 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2185  signal transduction protein  100 
 
 		 170 aa  331  3e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.51071  normal  0.552255 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4061  signal-transduction protein  74.48 
 
 		 145 aa  201  3e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2001  putative signal transduction protein with CBS domains  59.51 
 
 		 157 aa  167  7e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0953206  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2012  CBS domain-containing protein  51.59 
 
 		 157 aa  154  7e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.345115 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1821  CBS domain containing protein  53.79 
 
 		 157 aa  149  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0706  CBS domain containing protein  54.55 
 
 		 144 aa  142  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4760  CBS domain-containing protein  47.59 
 
 		 141 aa  125  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462026  normal  0.418108 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5536  CBS domain-containing protein  44.83 
 
 		 141 aa  122  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0354137 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1249  CBS domain-containing protein  44.83 
 
 		 141 aa  121  6e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6583  CBS domain-containing protein  44.83 
 
 		 141 aa  121  6e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6186  CBS domain-containing protein  44.83 
 
 		 141 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2788  CBS domain-containing protein  47.1 
 
 		 151 aa  118  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.190959  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4395  CBS  47.89 
 
 		 164 aa  117  7.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0203487  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1780  putative signal transduction protein with CBS domains  46.43 
 
 		 141 aa  115  3e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2292  CBS domain-containing protein  47.46 
 
 		 137 aa  111  5e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.173837  hitchhiker  0.00000858428 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2352  signal-transduction protein  47.18 
 
 		 142 aa  110  7.000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.103406  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  41.84 
 
 		 147 aa  110  9e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  39.72 
 
 		 148 aa  107  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6060  CBS domain-containing protein  38.89 
 
 		 143 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.613406  normal  0.175834 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7015  CBS domain-containing protein  40.85 
 
 		 143 aa  105  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1358  CBS domain-containing protein  38.89 
 
 		 143 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6471  CBS domain-containing protein  38.89 
 
 		 143 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0745469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1420  CBS domain containing protein  44.35 
 
 		 144 aa  105  4e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.384654  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1637  CBS domain-containing protein  42.25 
 
 		 143 aa  105  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.817023  normal  0.200106 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2439  CBS domain-containing protein  40.44 
 
 		 145 aa  104  6e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4559  CBS domain protein  42.52 
 
 		 139 aa  104  7e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000024778  normal  0.1618 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0776  CBS domain protein  42.52 
 
 		 139 aa  103  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00143526  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6352  CBS domain-containing protein  39.44 
 
 		 143 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.88577 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5621  CBS domain-containing protein  39.44 
 
 		 143 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0984367 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2219  CBS domain containing protein  42.86 
 
 		 145 aa  103  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.338208  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1198  CBS  42.55 
 
 		 139 aa  102  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2035  CBS domain-containing protein  44.17 
 
 		 143 aa  102  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6330  CBS domain containing protein  39.72 
 
 		 139 aa  102  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.1107  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3107  hypothetical protein  46.34 
 
 		 137 aa  102  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0515224  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4261  CBS domain-containing protein  40.14 
 
 		 143 aa  101  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.808384  normal  0.229571 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3796  CBS domain-containing protein  40.14 
 
 		 143 aa  101  6e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.586823  normal  0.399094 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5465  CBS domain-containing protein  38.89 
 
 		 143 aa  100  7e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00381239 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0791  CBS domain-containing protein  42.28 
 
 		 139 aa  100  9e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0244605  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0631  CBS domain-containing protein  41.46 
 
 		 139 aa  100  9e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000812315  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1360  CBS domain-containing protein  37.59 
 
 		 143 aa  100  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.565308  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3139  CBS domain-containing protein  37.59 
 
 		 143 aa  100  9e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.533561  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3011  CBS domain-containing protein  37.59 
 
 		 143 aa  100  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.162521  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4414  CBS domain-containing protein  46.28 
 
 		 146 aa  100  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.718009 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5973  CBS domain-containing protein  40.85 
 
 		 143 aa  99.8  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.643427  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0687  CBS domain-containing protein  40.94 
 
 		 139 aa  99.8  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.740174  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3147  hypothetical protein  44.07 
 
 		 138 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.643619  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0720  CBS domain-containing protein  40.94 
 
 		 139 aa  99.8  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000162258  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3985  CBS domain-containing protein  40.85 
 
 		 143 aa  99.4  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.134213  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4382  CBS domain-containing protein  40.85 
 
 		 143 aa  99.4  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0262346  normal  0.971701 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36650  hypothetical protein  44.07 
 
 		 138 aa  99  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000287918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0872  CBS domain protein  41.46 
 
 		 139 aa  98.6  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0631  CBS domain-containing protein  40.16 
 
 		 139 aa  98.2  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.480891  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  36.96 
 
 		 145 aa  98.2  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06340  putative signal-transduction protein with CBS domains  40.14 
 
 		 141 aa  98.6  4e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0636  signal-transduction protein  41.04 
 
 		 139 aa  98.6  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00478917  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4239  CBS domain-containing protein  40.85 
 
 		 143 aa  98.6  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.716364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0607  signal-transduction protein  40.58 
 
 		 144 aa  97.8  6e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.150713  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12645  hypothetical protein  40.16 
 
 		 143 aa  97.4  7e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1863  putative signal transduction protein with CBS domains  46.67 
 
 		 141 aa  97.4  8e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1483  CBS domain protein  46.73 
 
 		 125 aa  96.7  1e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0666376  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3316  CBS domain-containing protein  40.44 
 
 		 144 aa  96.7  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0797  CBS domain protein  40.16 
 
 		 139 aa  97.1  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.65672e-35 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0656  CBS domain containing protein  38.46 
 
 		 142 aa  95.9  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1401  signal-transduction protein  41.73 
 
 		 142 aa  95.9  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3292  signal transduction protein  40.43 
 
 		 142 aa  96.3  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24850  CBS domain pair-containing protein  41.53 
 
 		 137 aa  93.6  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.310967  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3605  hypothetical protein  45.19 
 
 		 139 aa  92  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.103373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1978  putative signal transduction protein with CBS domains  44.72 
 
 		 138 aa  92  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0602672  normal  0.871895 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1740  signal transduction protein  35.77 
 
 		 138 aa  89.7  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247067 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3278  putative CBS domain-containing signal transduction protein  38.71 
 
 		 145 aa  87.4  9e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.565248  normal  0.216437 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08210  CBS domain-containing protein  43.38 
 
 		 139 aa  86.7  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1577  putative signal transduction protein with CBS domains  38.1 
 
 		 139 aa  85.9  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.011912  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0945  CBS domain-containing protein  34.38 
 
 		 144 aa  85.9  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.678646  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2441  signal-transduction protein  40.5 
 
 		 144 aa  85.5  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.528968  normal  0.376991 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2667  hypothetical protein  40.32 
 
 		 140 aa  84.7  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.262704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3565  CBS domain-containing protein  39.34 
 
 		 138 aa  84  9e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3944  signal-transduction protein  39.34 
 
 		 138 aa  82.4  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.898238  normal  0.165624 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1449  signal transduction protein  34.27 
 
 		 153 aa  82  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5005  signal-transduction protein  40.56 
 
 		 144 aa  81.6  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0026  CBS domain-containing protein  40.44 
 
 		 141 aa  81.6  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0022  signal-transduction protein  38.97 
 
 		 141 aa  81.3  0.000000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2776  putative signal transduction protein with CBS domains  39.67 
 
 		 141 aa  80.1  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000774578 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1938  CBS domain-containing protein  32.59 
 
 		 143 aa  79.3  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.704039  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1528  signal-transduction protein  39.67 
 
 		 153 aa  78.6  0.00000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1026  signal-transduction protein  35.48 
 
 		 153 aa  77.4  0.00000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0490462 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4587  signal-transduction protein  36.36 
 
 		 153 aa  77.4  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00378118  hitchhiker  0.00177049 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0623  CBS  35.25 
 
 		 143 aa  77  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2950  signal transduction protein  35.51 
 
 		 141 aa  77  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.211508 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3635  signal-transduction protein  36.36 
 
 		 153 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.295786  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4732  signal-transduction protein  36.36 
 
 		 153 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00820406  normal  0.0168857 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5550  signal-transduction protein  36.36 
 
 		 153 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3850  signal-transduction protein  38.84 
 
 		 153 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0446  putative signal transduction protein with CBS domains  42.37 
 
 		 136 aa  75.9  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0212406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1132  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  32.91 
 
 		 500 aa  75.1  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.41509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3943  signal-transduction protein  34.55 
 
 		 153 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.69222 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4974  putative signal-transduction protein with CBS domains  35.48 
 
 		 147 aa  74.7  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0816417 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3241  signal-transduction protein  34.15 
 
 		 144 aa  74.7  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.484063 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0420  signal-transduction protein  34.96 
 
 		 158 aa  74.7  0.0000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4123  signal-transduction protein  34.55 
 
 		 153 aa  74.7  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00087962  normal  0.0202046 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2080  signal-transduction protein  36.49 
 
 		 141 aa  74.3  0.0000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>