More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6583 on replicon NC_008544
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008060  Bcen_1249  CBS domain-containing protein  100 
 
 
141 aa  279  9e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6583  CBS domain-containing protein  100 
 
 
141 aa  279  9e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460187  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6186  CBS domain-containing protein  97.87 
 
 
141 aa  273  4e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5536  CBS domain-containing protein  87.94 
 
 
141 aa  253  5e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0354137 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4760  CBS domain-containing protein  80.85 
 
 
141 aa  231  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462026  normal  0.418108 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3139  CBS domain-containing protein  51.41 
 
 
143 aa  156  7e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.533561  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1360  CBS domain-containing protein  51.41 
 
 
143 aa  156  7e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.565308  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3011  CBS domain-containing protein  51.41 
 
 
143 aa  156  7e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.162521  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5465  CBS domain-containing protein  51.41 
 
 
143 aa  152  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00381239 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7015  CBS domain-containing protein  50.7 
 
 
143 aa  152  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6352  CBS domain-containing protein  49.3 
 
 
143 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.88577 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5621  CBS domain-containing protein  49.3 
 
 
143 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0984367 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1358  CBS domain-containing protein  47.89 
 
 
143 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6060  CBS domain-containing protein  47.89 
 
 
143 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.613406  normal  0.175834 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6471  CBS domain-containing protein  47.89 
 
 
143 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0745469  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3985  CBS domain-containing protein  47.89 
 
 
143 aa  140  7e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.134213  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4382  CBS domain-containing protein  47.89 
 
 
143 aa  140  7e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0262346  normal  0.971701 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4261  CBS domain-containing protein  47.18 
 
 
143 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.808384  normal  0.229571 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3796  CBS domain-containing protein  47.18 
 
 
143 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.586823  normal  0.399094 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5973  CBS domain-containing protein  47.18 
 
 
143 aa  138  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.643427  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2001  putative signal transduction protein with CBS domains  48.59 
 
 
157 aa  137  7e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0953206  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1637  CBS domain-containing protein  46.48 
 
 
143 aa  135  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.817023  normal  0.200106 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4239  CBS domain-containing protein  45.77 
 
 
143 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.716364  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1821  CBS domain containing protein  49.3 
 
 
157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3147  hypothetical protein  45.67 
 
 
138 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.643619  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36650  hypothetical protein  45.67 
 
 
138 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000287918  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0706  CBS domain containing protein  46.53 
 
 
144 aa  124  5e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2292  CBS domain-containing protein  47.01 
 
 
137 aa  122  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.173837  hitchhiker  0.00000858428 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2185  signal transduction protein  44.83 
 
 
170 aa  121  4e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.51071  normal  0.552255 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2788  CBS domain-containing protein  50 
 
 
151 aa  120  5e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.190959  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2012  CBS domain-containing protein  47.18 
 
 
157 aa  120  9e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.345115 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4395  CBS  47.86 
 
 
164 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0203487  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2439  CBS domain-containing protein  43.51 
 
 
145 aa  116  7.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2035  CBS domain-containing protein  48.15 
 
 
143 aa  114  3.9999999999999997e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1198  CBS  44.6 
 
 
139 aa  113  7.999999999999999e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24850  CBS domain pair-containing protein  42.52 
 
 
137 aa  113  8.999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.310967  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3107  hypothetical protein  44.09 
 
 
137 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0515224  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4061  signal-transduction protein  47.59 
 
 
145 aa  110  6e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1780  putative signal transduction protein with CBS domains  44.6 
 
 
141 aa  110  8.000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6330  CBS domain containing protein  48.74 
 
 
139 aa  106  9.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.1107  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1420  CBS domain containing protein  43.59 
 
 
144 aa  103  1e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.384654  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06340  putative signal-transduction protein with CBS domains  40 
 
 
141 aa  100  8e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  39.31 
 
 
148 aa  100  9e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4414  CBS domain-containing protein  42.11 
 
 
146 aa  99  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.718009 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2352  signal-transduction protein  42.55 
 
 
142 aa  97.8  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.103406  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  39.58 
 
 
147 aa  97.4  6e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  38.89 
 
 
145 aa  93.6  8e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2776  putative signal transduction protein with CBS domains  42.98 
 
 
141 aa  92  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000774578 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1863  putative signal transduction protein with CBS domains  45 
 
 
141 aa  91.3  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1740  signal transduction protein  37.5 
 
 
138 aa  91.3  4e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.247067 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0656  CBS domain containing protein  42.76 
 
 
142 aa  91.3  4e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2950  signal transduction protein  40.88 
 
 
141 aa  90.5  7e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.211508 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1483  CBS domain protein  43 
 
 
125 aa  90.1  9e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0666376  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3278  putative CBS domain-containing signal transduction protein  43.97 
 
 
145 aa  88.6  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.565248  normal  0.216437 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3605  hypothetical protein  43.2 
 
 
139 aa  88.6  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.103373  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5147  putative signal transduction protein with CBS domains  40.32 
 
 
137 aa  88.6  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.48852  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2080  signal-transduction protein  36.62 
 
 
141 aa  87.4  7e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2219  CBS domain containing protein  37.5 
 
 
145 aa  85.5  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.338208  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1449  signal transduction protein  35.29 
 
 
153 aa  85.1  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1401  signal-transduction protein  42.15 
 
 
142 aa  84.7  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5005  signal-transduction protein  38.46 
 
 
144 aa  84  7e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3292  signal transduction protein  36.23 
 
 
142 aa  83.2  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3316  CBS domain-containing protein  41.03 
 
 
144 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011902  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1577  putative signal transduction protein with CBS domains  39.67 
 
 
139 aa  82  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.011912  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12645  hypothetical protein  36.43 
 
 
143 aa  81.6  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2441  signal-transduction protein  40 
 
 
144 aa  81.3  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.528968  normal  0.376991 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4379  signal-transduction protein  39.34 
 
 
158 aa  80.9  0.000000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.817612 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0945  CBS domain-containing protein  39.34 
 
 
144 aa  79.7  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.678646  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0446  putative signal transduction protein with CBS domains  39.39 
 
 
136 aa  79  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0212406  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3096  signal-transduction protein  43.26 
 
 
139 aa  78.6  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1978  putative signal transduction protein with CBS domains  39.67 
 
 
138 aa  77  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0602672  normal  0.871895 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0607  signal-transduction protein  32.86 
 
 
144 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.150713  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0636  signal-transduction protein  35.29 
 
 
139 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00478917  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0631  CBS domain-containing protein  33.57 
 
 
139 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.480891  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2667  hypothetical protein  38.79 
 
 
140 aa  75.9  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.262704  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2798  putative signal transduction protein with CBS domains  36.36 
 
 
140 aa  75.5  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0139355  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0631  CBS domain-containing protein  33.57 
 
 
139 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000812315  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6054  signal transduction protein  39.66 
 
 
193 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000453933 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0026  CBS domain-containing protein  37.12 
 
 
141 aa  74.3  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0687  CBS domain-containing protein  32.86 
 
 
139 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.740174  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0720  CBS domain-containing protein  32.86 
 
 
139 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000162258  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4559  CBS domain protein  32.86 
 
 
139 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000024778  normal  0.1618 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0776  CBS domain protein  33.82 
 
 
139 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00143526  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0872  CBS domain protein  33.82 
 
 
139 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0964  putative signal transduction protein with CBS domains  35.54 
 
 
132 aa  72.8  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0791  CBS domain-containing protein  33.82 
 
 
139 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0244605  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11190  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  42.11 
 
 
131 aa  72.4  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.170576 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0022  signal-transduction protein  37.12 
 
 
141 aa  72  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0797  CBS domain protein  32.86 
 
 
139 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.65672e-35 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1138  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.34 
 
 
500 aa  71.6  0.000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2355  signal-transduction protein  31.39 
 
 
145 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.302795  normal  0.112681 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4502  signal-transduction protein  31.69 
 
 
236 aa  68.2  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1429  CBS domain-containing protein  34.81 
 
 
211 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2317  CBS domain-containing protein  34.81 
 
 
149 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.754062  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2033  CBS domain-containing protein  34.07 
 
 
149 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1913  putative sigma54 specific transcriptional regulator  33.9 
 
 
710 aa  66.6  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0899132  normal  0.0546689 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2323  CBS domain-containing protein  34.07 
 
 
149 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.195763  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1057  CBS domain-containing protein  34.07 
 
 
149 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.486416  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3216  CBS domain-containing protein  34.07 
 
 
149 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1343  CBS domain-containing protein  34.07 
 
 
149 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>