More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2080 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_2080  signal-transduction protein  100 
 
 
141 aa  275  2e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06340  putative signal-transduction protein with CBS domains  45.19 
 
 
141 aa  112  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  42.96 
 
 
145 aa  108  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  38.97 
 
 
148 aa  99.4  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1863  putative signal transduction protein with CBS domains  43.7 
 
 
141 aa  98.6  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  40.58 
 
 
147 aa  99  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0631  CBS domain-containing protein  38.33 
 
 
139 aa  94.4  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.480891  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1360  CBS domain-containing protein  40 
 
 
143 aa  94.4  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.565308  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3011  CBS domain-containing protein  40 
 
 
143 aa  94.4  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.162521  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3139  CBS domain-containing protein  40 
 
 
143 aa  94.4  5e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.533561  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2352  signal-transduction protein  41.43 
 
 
142 aa  94.4  5e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.103406  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3788  putative signal transduction protein with CBS domains  49.12 
 
 
139 aa  91.7  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.534948  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5621  CBS domain-containing protein  37.06 
 
 
143 aa  91.7  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0984367 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0872  CBS domain protein  38.14 
 
 
139 aa  92  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6352  CBS domain-containing protein  37.06 
 
 
143 aa  91.7  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.88577 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0656  CBS domain containing protein  39.57 
 
 
142 aa  91.3  4e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0791  CBS domain-containing protein  38.14 
 
 
139 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0244605  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0631  CBS domain-containing protein  37.5 
 
 
139 aa  91.3  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000812315  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4395  CBS  38.3 
 
 
164 aa  90.9  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0203487  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0636  signal-transduction protein  36.67 
 
 
139 aa  90.9  6e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00478917  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0776  CBS domain protein  35.83 
 
 
139 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00143526  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4559  CBS domain protein  35.83 
 
 
139 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000024778  normal  0.1618 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0687  CBS domain-containing protein  37.5 
 
 
139 aa  89.4  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.740174  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2798  putative signal transduction protein with CBS domains  40.29 
 
 
140 aa  89.4  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0139355  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0720  CBS domain-containing protein  37.5 
 
 
139 aa  89.4  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000162258  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0607  signal-transduction protein  37.98 
 
 
144 aa  89.7  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.150713  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5465  CBS domain-containing protein  39.29 
 
 
143 aa  89.7  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00381239 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7015  CBS domain-containing protein  34.97 
 
 
143 aa  88.6  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6186  CBS domain-containing protein  36.62 
 
 
141 aa  88.2  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1358  CBS domain-containing protein  35.66 
 
 
143 aa  87.4  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6471  CBS domain-containing protein  35.66 
 
 
143 aa  87.4  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0745469  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0797  CBS domain protein  36.67 
 
 
139 aa  87.8  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.65672e-35 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6060  CBS domain-containing protein  35.66 
 
 
143 aa  87.4  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.613406  normal  0.175834 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36650  hypothetical protein  44.44 
 
 
138 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000287918  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1249  CBS domain-containing protein  36.62 
 
 
141 aa  87.4  7e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6583  CBS domain-containing protein  36.62 
 
 
141 aa  87.4  7e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460187  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1577  putative signal transduction protein with CBS domains  36.23 
 
 
139 aa  86.7  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.011912  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5536  CBS domain-containing protein  35.92 
 
 
141 aa  85.5  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0354137 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3147  hypothetical protein  44.44 
 
 
138 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.643619  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2292  CBS domain-containing protein  41.09 
 
 
137 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.173837  hitchhiker  0.00000858428 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3238  putative signal transduction protein with CBS domains  42.24 
 
 
138 aa  85.9  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.365049  normal  0.128899 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1198  CBS  40.34 
 
 
139 aa  84  6e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1978  putative signal transduction protein with CBS domains  43.33 
 
 
138 aa  84  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0602672  normal  0.871895 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2788  CBS domain-containing protein  40.91 
 
 
151 aa  84.3  6e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.190959  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3316  CBS domain-containing protein  37.59 
 
 
144 aa  84  7e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011902  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6938  signal-transduction protein  43.44 
 
 
242 aa  83.6  8e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.335853 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4239  CBS domain-containing protein  40 
 
 
143 aa  83.6  9e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.716364  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1780  putative signal transduction protein with CBS domains  36.21 
 
 
141 aa  83.2  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2035  CBS domain-containing protein  42.14 
 
 
143 aa  83.2  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3107  hypothetical protein  37.12 
 
 
137 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0515224  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1474  signal transduction protein  40 
 
 
128 aa  82  0.000000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3773  putative signal transduction protein with CBS domains  38.33 
 
 
144 aa  82.4  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3278  putative CBS domain-containing signal transduction protein  39.17 
 
 
145 aa  81.3  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.565248  normal  0.216437 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2665  putative signal transduction protein with CBS domains  37.07 
 
 
187 aa  81.3  0.000000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000148572  normal  0.84733 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3796  CBS domain-containing protein  37.14 
 
 
143 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.586823  normal  0.399094 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1420  CBS domain containing protein  36.09 
 
 
144 aa  80.9  0.000000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.384654  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5147  putative signal transduction protein with CBS domains  40.83 
 
 
137 aa  80.9  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.48852  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4261  CBS domain-containing protein  37.14 
 
 
143 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.808384  normal  0.229571 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3292  signal transduction protein  39.26 
 
 
142 aa  80.5  0.000000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2001  putative signal transduction protein with CBS domains  39.44 
 
 
157 aa  80.1  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0953206  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2439  CBS domain-containing protein  38.46 
 
 
145 aa  79.7  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0026  CBS domain-containing protein  43.17 
 
 
141 aa  79.3  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4760  CBS domain-containing protein  35.21 
 
 
141 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462026  normal  0.418108 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24850  CBS domain pair-containing protein  39.39 
 
 
137 aa  79.7  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.310967  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3985  CBS domain-containing protein  37.86 
 
 
143 aa  78.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.134213  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4382  CBS domain-containing protein  37.86 
 
 
143 aa  78.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0262346  normal  0.971701 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5973  CBS domain-containing protein  37.86 
 
 
143 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.643427  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4954  CBS domain-containing protein  38 
 
 
624 aa  77.8  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1401  signal-transduction protein  40.98 
 
 
142 aa  78.2  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4502  signal-transduction protein  39.67 
 
 
236 aa  77  0.00000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1449  signal transduction protein  42.74 
 
 
153 aa  76.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4414  CBS domain-containing protein  43.18 
 
 
146 aa  76.3  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.718009 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2667  hypothetical protein  36.44 
 
 
140 aa  75.5  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.262704  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0945  CBS domain-containing protein  36.89 
 
 
144 aa  75.9  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.678646  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3565  CBS domain-containing protein  42.02 
 
 
138 aa  75.9  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0446  putative signal transduction protein with CBS domains  45.3 
 
 
136 aa  75.9  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0212406  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1425  signal-transduction protein  40 
 
 
144 aa  75.9  0.0000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.316039 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08210  CBS domain-containing protein  38.79 
 
 
139 aa  75.5  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12645  hypothetical protein  39.17 
 
 
143 aa  76.3  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3944  signal-transduction protein  42.02 
 
 
138 aa  75.1  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.898238  normal  0.165624 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2219  CBS domain containing protein  36.76 
 
 
145 aa  74.3  0.0000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.338208  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2185  signal transduction protein  36.49 
 
 
170 aa  74.3  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.51071  normal  0.552255 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6330  CBS domain containing protein  38.85 
 
 
139 aa  74.3  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.1107  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2441  signal-transduction protein  38.46 
 
 
144 aa  74.3  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.528968  normal  0.376991 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2011  CBS domain-containing protein  39.45 
 
 
286 aa  73.9  0.0000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2776  putative signal transduction protein with CBS domains  35.29 
 
 
141 aa  73.9  0.0000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000774578 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1740  signal transduction protein  38.71 
 
 
138 aa  73.9  0.0000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.247067 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3605  hypothetical protein  35.34 
 
 
139 aa  73.9  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.103373  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4338  CBS domain-containing protein  30.97 
 
 
618 aa  73.6  0.0000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0214  putative signal transduction protein with CBS domains  31.03 
 
 
207 aa  73.2  0.000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0415  signal-transduction protein  40.87 
 
 
145 aa  73.2  0.000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.682078  normal  0.0782148 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0022  signal-transduction protein  40.71 
 
 
141 aa  71.6  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0673  signal-transduction protein  29.6 
 
 
165 aa  71.6  0.000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3096  signal-transduction protein  39.5 
 
 
139 aa  71.2  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1637  CBS domain-containing protein  36.43 
 
 
143 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.817023  normal  0.200106 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0695  putative signal-transduction protein with CBS domains  33.33 
 
 
140 aa  70.9  0.000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0173289  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2231  signal-transduction protein  31.9 
 
 
188 aa  70.9  0.000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.943647  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1483  CBS domain protein  38.79 
 
 
125 aa  70.5  0.000000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0666376  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2661  signal-transduction protein  38.4 
 
 
177 aa  70.5  0.000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.63207  normal  0.665873 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1794  signal-transduction protein  33.04 
 
 
187 aa  70.1  0.000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.190963  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>