More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0945 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0945  CBS domain-containing protein  100 
 
 
144 aa  295  1e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.678646  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2441  signal-transduction protein  60.84 
 
 
144 aa  189  8e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.528968  normal  0.376991 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1577  putative signal transduction protein with CBS domains  62.22 
 
 
139 aa  183  7e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.011912  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3278  putative CBS domain-containing signal transduction protein  58.52 
 
 
145 aa  166  8e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.565248  normal  0.216437 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1401  signal-transduction protein  54.07 
 
 
142 aa  160  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2667  hypothetical protein  55.56 
 
 
140 aa  157  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.262704  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12645  hypothetical protein  54.74 
 
 
143 aa  156  1e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1978  putative signal transduction protein with CBS domains  55.56 
 
 
138 aa  152  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0602672  normal  0.871895 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5147  putative signal transduction protein with CBS domains  51.82 
 
 
137 aa  147  4e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.48852  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2776  putative signal transduction protein with CBS domains  46.67 
 
 
141 aa  143  8.000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000774578 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11190  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  49.18 
 
 
131 aa  122  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.170576 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3080  putative signal transduction protein with CBS domains  38.89 
 
 
145 aa  103  9e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0313978 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1863  putative signal transduction protein with CBS domains  39.42 
 
 
141 aa  91.3  5e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3605  hypothetical protein  34.85 
 
 
139 aa  88.6  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.103373  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4395  CBS  40.17 
 
 
164 aa  87.8  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0203487  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  36.72 
 
 
148 aa  87.4  6e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2185  signal transduction protein  34.38 
 
 
170 aa  85.9  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.51071  normal  0.552255 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1740  signal transduction protein  37.88 
 
 
138 aa  85.9  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.247067 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1821  CBS domain containing protein  35.42 
 
 
157 aa  85.1  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2035  CBS domain-containing protein  41.53 
 
 
143 aa  85.1  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2012  CBS domain-containing protein  35.86 
 
 
157 aa  84.7  4e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.345115 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4760  CBS domain-containing protein  40.98 
 
 
141 aa  84.3  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462026  normal  0.418108 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  34.71 
 
 
147 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1198  CBS  37.19 
 
 
139 aa  79.3  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1249  CBS domain-containing protein  39.34 
 
 
141 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6583  CBS domain-containing protein  39.34 
 
 
141 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460187  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06340  putative signal-transduction protein with CBS domains  36.84 
 
 
141 aa  79.3  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1449  signal transduction protein  39.32 
 
 
153 aa  79  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6186  CBS domain-containing protein  39.02 
 
 
141 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6330  CBS domain containing protein  35.16 
 
 
139 aa  77.8  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.1107  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5536  CBS domain-containing protein  38.71 
 
 
141 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0354137 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2001  putative signal transduction protein with CBS domains  33.88 
 
 
157 aa  77  0.00000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0953206  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0706  CBS domain containing protein  32.5 
 
 
144 aa  76.3  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2080  signal-transduction protein  36.89 
 
 
141 aa  75.9  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2352  signal-transduction protein  34.48 
 
 
142 aa  75.1  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.103406  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7015  CBS domain-containing protein  35.54 
 
 
143 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4061  signal-transduction protein  34.88 
 
 
145 aa  73.9  0.0000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0797  CBS domain protein  36.36 
 
 
139 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.65672e-35 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6060  CBS domain-containing protein  34.71 
 
 
143 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.613406  normal  0.175834 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1360  CBS domain-containing protein  34.71 
 
 
143 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.565308  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5465  CBS domain-containing protein  34.71 
 
 
143 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00381239 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1358  CBS domain-containing protein  34.71 
 
 
143 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3011  CBS domain-containing protein  34.71 
 
 
143 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.162521  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6471  CBS domain-containing protein  34.71 
 
 
143 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0745469  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3139  CBS domain-containing protein  34.71 
 
 
143 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.533561  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0631  CBS domain-containing protein  35.54 
 
 
139 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000812315  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0631  CBS domain-containing protein  35.54 
 
 
139 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.480891  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2439  CBS domain-containing protein  34.19 
 
 
145 aa  72.8  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3565  CBS domain-containing protein  35 
 
 
138 aa  72.8  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1780  putative signal transduction protein with CBS domains  31.9 
 
 
141 aa  71.6  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6352  CBS domain-containing protein  34.71 
 
 
143 aa  72  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.88577 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5621  CBS domain-containing protein  34.71 
 
 
143 aa  72  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0984367 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3788  putative signal transduction protein with CBS domains  33.58 
 
 
139 aa  71.6  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.534948  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3944  signal-transduction protein  34.17 
 
 
138 aa  71.6  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.898238  normal  0.165624 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0687  CBS domain-containing protein  34.71 
 
 
139 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.740174  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0720  CBS domain-containing protein  34.71 
 
 
139 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000162258  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4261  CBS domain-containing protein  33.88 
 
 
143 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.808384  normal  0.229571 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3796  CBS domain-containing protein  33.88 
 
 
143 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.586823  normal  0.399094 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6054  signal transduction protein  31.45 
 
 
193 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000453933 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0791  CBS domain-containing protein  34.71 
 
 
139 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0244605  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0776  CBS domain protein  32.5 
 
 
139 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00143526  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08210  CBS domain-containing protein  31.62 
 
 
139 aa  69.3  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0872  CBS domain protein  34.71 
 
 
139 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0345  signal-transduction protein  31.58 
 
 
150 aa  68.2  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5005  signal-transduction protein  31.36 
 
 
144 aa  68.2  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3096  signal-transduction protein  29.63 
 
 
139 aa  68.2  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1304  signal-transduction protein  31.71 
 
 
148 aa  68.2  0.00000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000185547 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3292  signal transduction protein  29.91 
 
 
142 aa  67.8  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2011  CBS domain-containing protein  31.71 
 
 
286 aa  67.8  0.00000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4559  CBS domain protein  31.67 
 
 
139 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000024778  normal  0.1618 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6938  signal-transduction protein  35.51 
 
 
242 aa  67.4  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.335853 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0636  signal-transduction protein  32.5 
 
 
139 aa  67  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00478917  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3826  putative signal transduction protein with CBS domains  32 
 
 
120 aa  67  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.950929 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0214  putative signal transduction protein with CBS domains  31.45 
 
 
207 aa  67  0.00000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0607  signal-transduction protein  33.88 
 
 
144 aa  67  0.00000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.150713  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2798  putative signal transduction protein with CBS domains  31.82 
 
 
140 aa  66.2  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0139355  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2788  CBS domain-containing protein  32.48 
 
 
151 aa  66.2  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.190959  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2620  CBS domain protein  29.27 
 
 
146 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3154  putative signal transduction protein with CBS domains  29.92 
 
 
139 aa  64.7  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.12439 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3107  hypothetical protein  35.9 
 
 
137 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0515224  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1420  CBS domain containing protein  32.09 
 
 
144 aa  64.7  0.0000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.384654  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4414  CBS domain-containing protein  36.07 
 
 
146 aa  64.3  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.718009 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  29.17 
 
 
155 aa  63.9  0.0000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  25.56 
 
 
145 aa  63.9  0.0000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1483  CBS domain protein  35.65 
 
 
125 aa  63.5  0.0000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0666376  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4239  CBS domain-containing protein  31.15 
 
 
143 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.716364  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0026  CBS domain-containing protein  36.84 
 
 
141 aa  63.5  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2219  CBS domain containing protein  34.17 
 
 
145 aa  63.2  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.338208  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2292  CBS domain-containing protein  34.48 
 
 
137 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.173837  hitchhiker  0.00000858428 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4502  signal-transduction protein  35.85 
 
 
236 aa  62.8  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1245  signal-transduction protein  32.65 
 
 
155 aa  62  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.117901 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0389  signal-transduction protein  34.62 
 
 
150 aa  62.8  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7033  signal-transduction protein  35.77 
 
 
154 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.365249  normal  0.472984 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1568  putative signal transduction protein with CBS domains  34.4 
 
 
140 aa  62.4  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0256186 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1141  signal-transduction protein  34.59 
 
 
150 aa  62.4  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.403559  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1637  CBS domain-containing protein  31.97 
 
 
143 aa  62  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.817023  normal  0.200106 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0631  signal-transduction protein  27.03 
 
 
142 aa  61.6  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0667586  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2834  signal-transduction protein  29.01 
 
 
145 aa  61.6  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.316088  normal  0.231791 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5973  CBS domain-containing protein  31.15 
 
 
143 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.643427  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3985  CBS domain-containing protein  31.15 
 
 
143 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.134213  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>