More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_11190 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_11190  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  100 
 
 		 131 aa  255  2e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.170576 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0945  CBS domain-containing protein  49.18 
 
 		 144 aa  122  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.678646  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1401  signal-transduction protein  52.54 
 
 		 142 aa  121  4e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2776  putative signal transduction protein with CBS domains  48.06 
 
 		 141 aa  118  3e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000774578 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1577  putative signal transduction protein with CBS domains  44.26 
 
 		 139 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.011912  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2441  signal-transduction protein  43.75 
 
 		 144 aa  108  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.528968  normal  0.376991 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2667  hypothetical protein  44.53 
 
 		 140 aa  107  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.262704  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3278  putative CBS domain-containing signal transduction protein  47.46 
 
 		 145 aa  105  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.565248  normal  0.216437 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12645  hypothetical protein  46.61 
 
 		 143 aa  102  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  41.54 
 
 		 147 aa  99.8  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  42.48 
 
 		 148 aa  97.4  5e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3080  putative signal transduction protein with CBS domains  43.85 
 
 		 145 aa  95.5  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0313978 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5147  putative signal transduction protein with CBS domains  40.32 
 
 		 137 aa  95.1  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.48852  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1978  putative signal transduction protein with CBS domains  38.52 
 
 		 138 aa  89  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0602672  normal  0.871895 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1863  putative signal transduction protein with CBS domains  40.77 
 
 		 141 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1780  putative signal transduction protein with CBS domains  38.17 
 
 		 141 aa  83.2  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2035  CBS domain-containing protein  43.48 
 
 		 143 aa  82.4  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0797  CBS domain protein  39.67 
 
 		 139 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.65672e-35 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3605  hypothetical protein  40.35 
 
 		 139 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.103373  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0631  CBS domain-containing protein  39.5 
 
 		 139 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000812315  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0687  CBS domain-containing protein  39.5 
 
 		 139 aa  79.3  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.740174  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0720  CBS domain-containing protein  39.5 
 
 		 139 aa  79.3  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000162258  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0631  CBS domain-containing protein  39.5 
 
 		 139 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.480891  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3238  putative signal transduction protein with CBS domains  39.83 
 
 		 138 aa  77  0.00000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.365049  normal  0.128899 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0776  CBS domain protein  38.66 
 
 		 139 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00143526  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0636  signal-transduction protein  39.5 
 
 		 139 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00478917  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3316  CBS domain-containing protein  35.11 
 
 		 144 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5005  signal-transduction protein  39.23 
 
 		 144 aa  76.3  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3096  signal-transduction protein  35.04 
 
 		 139 aa  76.6  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0791  CBS domain-containing protein  38.66 
 
 		 139 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0244605  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4414  CBS domain-containing protein  43.1 
 
 		 146 aa  75.9  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.718009 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0872  CBS domain protein  38.66 
 
 		 139 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2352  signal-transduction protein  38.05 
 
 		 142 aa  75.9  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.103406  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06340  putative signal-transduction protein with CBS domains  36.92 
 
 		 141 aa  74.7  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4559  CBS domain protein  37.82 
 
 		 139 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000024778  normal  0.1618 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2185  signal transduction protein  40.91 
 
 		 170 aa  74.3  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.51071  normal  0.552255 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0656  CBS domain containing protein  38.93 
 
 		 142 aa  74.3  0.0000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02457  hypothetical protein  36.8 
 
 		 626 aa  73.9  0.0000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4395  CBS  36.64 
 
 		 164 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0203487  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0607  signal-transduction protein  39.5 
 
 		 144 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.150713  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2219  CBS domain containing protein  37.72 
 
 		 145 aa  72.8  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.338208  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1249  CBS domain-containing protein  42.11 
 
 		 141 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1740  signal transduction protein  38.95 
 
 		 138 aa  72.8  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247067 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6583  CBS domain-containing protein  42.11 
 
 		 141 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08210  CBS domain-containing protein  36.52 
 
 		 139 aa  71.6  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  33.04 
 
 		 145 aa  71.6  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1420  CBS domain containing protein  36.23 
 
 		 144 aa  71.6  0.000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.384654  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6186  CBS domain-containing protein  39.23 
 
 		 141 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1360  CBS domain-containing protein  36.3 
 
 		 143 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.565308  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3139  CBS domain-containing protein  36.3 
 
 		 143 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.533561  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3011  CBS domain-containing protein  36.3 
 
 		 143 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.162521  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6060  CBS domain-containing protein  34.81 
 
 		 143 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.613406  normal  0.175834 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7015  CBS domain-containing protein  36.57 
 
 		 143 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1198  CBS  36.97 
 
 		 139 aa  69.3  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1358  CBS domain-containing protein  34.33 
 
 		 143 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2788  CBS domain-containing protein  36.64 
 
 		 151 aa  69.3  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.190959  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6471  CBS domain-containing protein  34.33 
 
 		 143 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0745469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2439  CBS domain-containing protein  34.78 
 
 		 145 aa  68.9  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5536  CBS domain-containing protein  39.23 
 
 		 141 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0354137 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2001  putative signal transduction protein with CBS domains  34.35 
 
 		 157 aa  68.6  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0953206  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5621  CBS domain-containing protein  34.07 
 
 		 143 aa  67  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0984367 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6352  CBS domain-containing protein  34.07 
 
 		 143 aa  67  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.88577 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5465  CBS domain-containing protein  35.29 
 
 		 143 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00381239 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2080  signal-transduction protein  36.28 
 
 		 141 aa  66.6  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0214  putative signal transduction protein with CBS domains  33.33 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003608  Signal transduction protein  32.79 
 
 		 626 aa  66.2  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3147  hypothetical protein  38.6 
 
 		 138 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.643619  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2798  putative signal transduction protein with CBS domains  34.59 
 
 		 140 aa  66.2  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0139355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3292  signal transduction protein  33.85 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4760  CBS domain-containing protein  42.02 
 
 		 141 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462026  normal  0.418108 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2665  putative signal transduction protein with CBS domains  35.71 
 
 		 187 aa  65.1  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000148572  normal  0.84733 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0673  signal-transduction protein  30.7 
 
 		 165 aa  65.1  0.0000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1821  CBS domain containing protein  36.15 
 
 		 157 aa  64.7  0.0000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6938  signal-transduction protein  36.04 
 
 		 242 aa  63.9  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.335853 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2835  CBS domain-containing protein  34.78 
 
 		 615 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00609535 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1794  signal-transduction protein  33.33 
 
 		 187 aa  63.9  0.0000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.190963  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0051  cyclic nucleotide-binding protein  31.71 
 
 		 629 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4061  signal-transduction protein  38.64 
 
 		 145 aa  63.9  0.0000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36650  hypothetical protein  37.61 
 
 		 138 aa  63.9  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000287918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1150  CBS  33.63 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3944  signal-transduction protein  32.17 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.898238  normal  0.165624 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2012  CBS domain-containing protein  36.64 
 
 		 157 aa  62.8  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.345115 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4660  CBS domain-containing protein  33.04 
 
 		 199 aa  62  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3565  CBS domain-containing protein  31.3 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2962  putative signal transduction protein with CBS domains  31.73 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3788  putative signal transduction protein with CBS domains  35.65 
 
 		 139 aa  62.8  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.534948  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1483  CBS domain protein  36.8 
 
 		 125 aa  62.8  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0666376  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0389  signal-transduction protein  34.78 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0345  signal-transduction protein  33.33 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1809  putative signal-transduction protein with CBS domains  30.09 
 
 		 478 aa  60.8  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3154  putative signal transduction protein with CBS domains  35.04 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.12439 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01888  hypothetical protein  31.71 
 
 		 629 aa  61.2  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1751  cyclic nucleotide-binding protein  33.61 
 
 		 615 aa  60.8  0.000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0246988 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0583  CBS domain-containing protein  31.82 
 
 		 150 aa  60.5  0.000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00772647  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2907  signal-transduction protein  32.14 
 
 		 188 aa  60.5  0.000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.986231 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3542  putative signal transduction protein with CBS domains  33.03 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.329551  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1169  signal-transduction protein  37.61 
 
 		 149 aa  60.5  0.000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1304  signal-transduction protein  28.18 
 
 		 148 aa  60.5  0.000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000185547 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4502  signal-transduction protein  39.64 
 
 		 236 aa  60.5  0.000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4391  CBS domain-containing protein  35.71 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>