More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1304 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_1304  signal-transduction protein  100 
 
 
148 aa  295  1e-79  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000185547 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0568  signal-transduction protein  45.38 
 
 
133 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.706815 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0214  putative signal transduction protein with CBS domains  38.78 
 
 
207 aa  109  2.0000000000000002e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0673  signal-transduction protein  40.83 
 
 
165 aa  104  4e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0225  CBS domain-containing protein  43.88 
 
 
145 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.791993 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0272  CBS domain-containing protein  42.86 
 
 
145 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0202  CBS domain-containing protein  42.86 
 
 
145 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.025801  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2665  putative signal transduction protein with CBS domains  39.53 
 
 
187 aa  89  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000148572  normal  0.84733 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0228  CBS domain-containing protein  42.86 
 
 
145 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0335  hypothetical protein  42.86 
 
 
144 aa  89  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  40.17 
 
 
185 aa  88.6  3e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2620  CBS domain protein  34.68 
 
 
146 aa  87.4  7e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03090  CBS domain-containing protein  41.84 
 
 
144 aa  87  8e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.17742  hitchhiker  0.000000481482 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  35.65 
 
 
145 aa  87  8e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  36.36 
 
 
688 aa  84.7  4e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06340  putative signal-transduction protein with CBS domains  32.46 
 
 
141 aa  84  6e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1844  CBS domain-containing protein  35.45 
 
 
688 aa  83.6  9e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  31.4 
 
 
147 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0776  CBS domain protein  35.34 
 
 
139 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00143526  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0687  CBS domain-containing protein  33.62 
 
 
139 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.740174  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4559  CBS domain protein  35.34 
 
 
139 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000024778  normal  0.1618 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0964  hypothetical protein  31.58 
 
 
217 aa  82.4  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0340  signal-transduction protein  38.21 
 
 
186 aa  82  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.189053  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0720  CBS domain-containing protein  33.62 
 
 
139 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000162258  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0797  CBS domain protein  32.76 
 
 
139 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.65672e-35 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0656  CBS domain containing protein  33.33 
 
 
142 aa  82.8  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  32.2 
 
 
845 aa  81.6  0.000000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0631  CBS domain-containing protein  32.76 
 
 
139 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000812315  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4121  signal-transduction protein  37.82 
 
 
146 aa  81.3  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1422  signal-transduction protein  39.02 
 
 
186 aa  80.9  0.000000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.216584  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0636  signal-transduction protein  32.76 
 
 
139 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00478917  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4502  signal-transduction protein  39.62 
 
 
236 aa  80.5  0.000000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0565  signal-transduction protein  38.14 
 
 
188 aa  80.1  0.000000000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3241  signal-transduction protein  38.39 
 
 
144 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.484063 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0497  signal-transduction protein  38.21 
 
 
186 aa  79.7  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.835525  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0631  CBS domain-containing protein  31.9 
 
 
139 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.480891  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2638  putative signal transduction protein with CBS domains  32.52 
 
 
144 aa  79.3  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1584  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  30.17 
 
 
606 aa  79.3  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0450512 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1794  signal-transduction protein  36.07 
 
 
187 aa  78.6  0.00000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.190963  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0964  putative signal transduction protein with CBS domains  36.36 
 
 
132 aa  78.2  0.00000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  28.1 
 
 
148 aa  77.8  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1751  cyclic nucleotide-binding protein  31.9 
 
 
615 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0246988 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1780  putative signal transduction protein with CBS domains  33.91 
 
 
141 aa  77.8  0.00000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0239  signal transduction protein  35.25 
 
 
128 aa  77.4  0.00000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.371768 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1548  cyclic nucleotide-binding protein  29.45 
 
 
615 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0610  signal-transduction protein  26.39 
 
 
348 aa  77  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909822  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0013  signal-transduction protein  33.93 
 
 
147 aa  77  0.00000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.371187  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0791  CBS domain-containing protein  31.03 
 
 
139 aa  77  0.00000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0244605  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0872  CBS domain protein  31.03 
 
 
139 aa  77  0.00000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0607  signal-transduction protein  30.58 
 
 
144 aa  76.6  0.00000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.150713  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0267  cyclic nucleotide-binding protein  34.71 
 
 
625 aa  76.6  0.00000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0100  putative cyclic nucleotide binding protein  34.4 
 
 
626 aa  76.3  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1383  signal transduction protein  31.97 
 
 
282 aa  76.3  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.56563 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2637  signal-transduction protein  29.58 
 
 
615 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1425  signal-transduction protein  30 
 
 
144 aa  76.3  0.0000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.316039 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2369  cyclic nucleotide-binding protein  29.31 
 
 
615 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0833  CBS domain-containing protein  31.75 
 
 
211 aa  76.6  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1863  putative signal transduction protein with CBS domains  32.46 
 
 
141 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0420  signal-transduction protein  39.81 
 
 
158 aa  75.9  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3824  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 
605 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00664828 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3944  signal-transduction protein  35.9 
 
 
138 aa  75.9  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.898238  normal  0.165624 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3565  CBS domain-containing protein  35.9 
 
 
138 aa  75.5  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3316  CBS domain-containing protein  32.17 
 
 
144 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011902  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2352  signal-transduction protein  31.3 
 
 
142 aa  75.9  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.103406  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1697  CBS domain-containing protein  31.03 
 
 
615 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1401  signal-transduction protein  32.79 
 
 
142 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1462  putative signal transduction protein with CBS domains  37.27 
 
 
145 aa  75.1  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0493403  normal  0.625814 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3539  signal-transduction protein  35.29 
 
 
146 aa  75.1  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.278615 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2066  CBS domain containing protein  37.5 
 
 
163 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00480753 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1712  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  29.58 
 
 
615 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  hitchhiker  0.00000133647 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2835  CBS domain-containing protein  31.03 
 
 
615 aa  74.7  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00609535 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2672  signal-transduction protein  29.58 
 
 
615 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3735  signal transduction protein  33.06 
 
 
146 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2751  CBS domain-containing protein  29.58 
 
 
615 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0342062 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2035  CBS domain-containing protein  36.44 
 
 
143 aa  74.3  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0100  putative signal transduction protein with CBS domains  32.17 
 
 
143 aa  74.3  0.0000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1676  signal-transduction protein  37.5 
 
 
147 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.780489  normal  0.354622 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3713  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  28.57 
 
 
613 aa  73.9  0.0000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000235103  unclonable  0.0000000288509 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0962  putative signal transduction protein with CBS domains  34.92 
 
 
208 aa  73.9  0.0000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.55358  normal  0.0758366 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0004  signal-transduction protein  32.77 
 
 
142 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4974  putative signal-transduction protein with CBS domains  36.61 
 
 
147 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0816417 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0631  signal-transduction protein  35.04 
 
 
189 aa  73.2  0.000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1409  signal-transduction protein  38.78 
 
 
146 aa  72.8  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0575  signal transduction protein  30.88 
 
 
606 aa  72  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.513215  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2228  cyclic nucleotide-binding protein  30.88 
 
 
606 aa  72  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.480608  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2234  putative signal transduction protein with CBS domains  31.67 
 
 
139 aa  71.6  0.000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1358  CBS domain-containing protein  33.88 
 
 
143 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3697  putative signal transduction protein with CBS domains  31.15 
 
 
146 aa  71.6  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6471  CBS domain-containing protein  33.88 
 
 
143 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0745469  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0506  CBS domain-containing protein  31.62 
 
 
606 aa  72  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.413474  normal  0.25412 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7015  CBS domain-containing protein  33.88 
 
 
143 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2231  signal-transduction protein  35.71 
 
 
188 aa  71.6  0.000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.943647  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6060  CBS domain-containing protein  33.88 
 
 
143 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.613406  normal  0.175834 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0040  CBS  33.93 
 
 
146 aa  70.9  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.847902  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0778  signal transduction protein  26.45 
 
 
140 aa  71.2  0.000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0404956 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0750  CBS domain containing protein  32.76 
 
 
867 aa  70.9  0.000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.596795  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07150  CBS domain containing protein  28.97 
 
 
865 aa  70.9  0.000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0367477  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2856  CBS domain-containing protein  29.25 
 
 
620 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0026  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 
141 aa  70.9  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3557  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  31.93 
 
 
605 aa  70.9  0.000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>