More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2907 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_2907  signal-transduction protein  100 
 
 
188 aa  376  1e-103  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.986231 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1794  signal-transduction protein  54.79 
 
 
187 aa  218  5e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.190963  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2665  putative signal transduction protein with CBS domains  54.79 
 
 
187 aa  213  9.999999999999999e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000148572  normal  0.84733 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2231  signal-transduction protein  52.13 
 
 
188 aa  205  3e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.943647  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  39.23 
 
 
185 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0964  hypothetical protein  32.29 
 
 
217 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0214  putative signal transduction protein with CBS domains  34.62 
 
 
207 aa  103  1e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1763  CBS domain-containing protein  35.09 
 
 
200 aa  103  2e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0631  signal-transduction protein  33.16 
 
 
189 aa  89.7  2e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0565  signal-transduction protein  36.52 
 
 
188 aa  88.6  5e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0340  signal-transduction protein  34.81 
 
 
186 aa  85.1  5e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.189053  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1422  signal-transduction protein  35.33 
 
 
186 aa  85.5  5e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.216584  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0497  signal-transduction protein  35.36 
 
 
186 aa  84.7  6e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.835525  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0673  signal-transduction protein  37.4 
 
 
165 aa  78.2  0.00000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3328  putative signal transduction protein with CBS domains  27.36 
 
 
212 aa  74.7  0.0000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0340  signal-transduction protein  41.07 
 
 
120 aa  73.2  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0589746  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  36.51 
 
 
148 aa  73.2  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0695  putative signal-transduction protein with CBS domains  36.44 
 
 
140 aa  72.4  0.000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0173289  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1198  CBS  33.33 
 
 
139 aa  71.6  0.000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  33.09 
 
 
145 aa  71.2  0.000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0778  signal transduction protein  31.11 
 
 
140 aa  70.9  0.00000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0404956 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1599  CBS domain containing protein  28.02 
 
 
206 aa  70.1  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  33.88 
 
 
147 aa  69.3  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2035  CBS domain-containing protein  36.44 
 
 
143 aa  68.2  0.00000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0100  putative signal transduction protein with CBS domains  34.31 
 
 
143 aa  68.2  0.00000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3096  signal-transduction protein  37.82 
 
 
139 aa  67.8  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1304  signal-transduction protein  36.15 
 
 
148 aa  67.4  0.0000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000185547 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1697  CBS domain-containing protein  32.67 
 
 
615 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2962  putative signal transduction protein with CBS domains  35.04 
 
 
145 aa  67  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3605  hypothetical protein  31.06 
 
 
139 aa  67  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.103373  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2061  protein of unknown function CP12  34.84 
 
 
203 aa  66.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.419662 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3744  signal transduction protein  35.51 
 
 
148 aa  66.2  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2797  signal-transduction protein  35.77 
 
 
146 aa  65.9  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.182223  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  34.39 
 
 
155 aa  65.5  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1462  putative signal transduction protein with CBS domains  35.29 
 
 
145 aa  65.9  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0493403  normal  0.625814 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_13833  predicted protein  31.3 
 
 
443 aa  65.9  0.0000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0243831  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4660  CBS domain-containing protein  31.61 
 
 
199 aa  65.5  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0764  CBS domain-containing protein  37.11 
 
 
605 aa  65.5  0.0000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0514021 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2950  signal transduction protein  33.87 
 
 
141 aa  65.1  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.211508 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2502  cyclic nucleotide-binding protein  33.06 
 
 
607 aa  64.7  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2465  cyclic nucleotide-binding protein  33.06 
 
 
607 aa  64.7  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.151685  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2510  cyclic nucleotide-binding protein  33.06 
 
 
607 aa  64.7  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.514462 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1751  cyclic nucleotide-binding protein  34 
 
 
615 aa  64.7  0.0000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0246988 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0822  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  31.29 
 
 
603 aa  64.7  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4391  CBS domain-containing protein  35.71 
 
 
204 aa  64.7  0.0000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  32.33 
 
 
215 aa  64.7  0.0000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0818  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  31.29 
 
 
603 aa  64.7  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.410169  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3316  CBS domain-containing protein  36.36 
 
 
144 aa  64.3  0.0000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011902  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  32.33 
 
 
215 aa  64.3  0.0000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0239  signal transduction protein  33.33 
 
 
128 aa  63.9  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.371768 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2219  CBS domain containing protein  32.59 
 
 
145 aa  63.9  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.338208  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0770  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.29 
 
 
603 aa  64.3  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.461269  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3850  signal-transduction protein  32.48 
 
 
153 aa  63.9  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2798  putative signal transduction protein with CBS domains  32.48 
 
 
140 aa  63.9  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0139355  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0568  signal-transduction protein  32.82 
 
 
133 aa  63.2  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.706815 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1809  putative signal-transduction protein with CBS domains  34.96 
 
 
478 aa  63.2  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0345  signal-transduction protein  35.35 
 
 
150 aa  63.5  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3565  CBS domain-containing protein  36.36 
 
 
138 aa  63.2  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2620  putative signal transduction protein with CBS domains  35.87 
 
 
480 aa  63.2  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0774627  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0597  signal transduction protein  29.63 
 
 
145 aa  62.8  0.000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2675  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  27.34 
 
 
840 aa  62.8  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0500157  hitchhiker  7.41843e-16 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3238  putative signal transduction protein with CBS domains  31.09 
 
 
138 aa  62.4  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.365049  normal  0.128899 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2856  CBS domain-containing protein  32.03 
 
 
620 aa  62.4  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0446  putative signal transduction protein with CBS domains  34.33 
 
 
136 aa  62  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0212406  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3667  cyclic nucleotide-binding protein  33.8 
 
 
606 aa  62.4  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.773951  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000925  Signal transduction protein  30.84 
 
 
622 aa  62.4  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.334534  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0804  CBS domain containing protein  39.83 
 
 
208 aa  62  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1863  putative signal transduction protein with CBS domains  32.48 
 
 
141 aa  62  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3706  CBS domain containing protein  39.84 
 
 
208 aa  62  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.312715  normal  0.158217 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3652  CBS domain containing protein  39.84 
 
 
208 aa  62  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2776  putative signal transduction protein with CBS domains  34.85 
 
 
141 aa  62  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000774578 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  30.61 
 
 
149 aa  62  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0552  putative signal transduction protein with CBS domains  34.75 
 
 
250 aa  61.6  0.000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.168262  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4121  signal-transduction protein  33.33 
 
 
146 aa  62  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3539  signal-transduction protein  37.96 
 
 
146 aa  61.6  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.278615 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  28.67 
 
 
153 aa  61.6  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  36.84 
 
 
1560 aa  61.6  0.000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0338  signal-transduction protein  34.31 
 
 
147 aa  61.2  0.000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6852  putative signal transduction protein with CBS domains  31.36 
 
 
141 aa  61.2  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0925593 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2095  hypothetical protein  41.38 
 
 
164 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.040556  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1630  signal-transduction protein  30.94 
 
 
233 aa  61.2  0.000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1650  signal-transduction protein  34.23 
 
 
141 aa  60.5  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11190  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  32.14 
 
 
131 aa  60.5  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.170576 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1528  signal-transduction protein  31.09 
 
 
153 aa  60.8  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0248  putative signal transduction protein with CBS domains  36.08 
 
 
149 aa  60.5  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0016  signal-transduction protein  33.98 
 
 
146 aa  60.8  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  33.33 
 
 
688 aa  60.8  0.00000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3944  signal-transduction protein  34.09 
 
 
138 aa  60.8  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.898238  normal  0.165624 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1844  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 
688 aa  60.8  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0964  putative signal transduction protein with CBS domains  34.19 
 
 
132 aa  60.1  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2620  CBS domain protein  32.5 
 
 
146 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2632  putative signal transduction protein with CBS domains  25.26 
 
 
197 aa  59.7  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02457  hypothetical protein  31.43 
 
 
626 aa  60.1  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0677  signal transduction protein  33.09 
 
 
399 aa  60.1  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2357  cyclic nucleotide-binding protein  32.89 
 
 
615 aa  59.7  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3131  cyclic nucleotide-binding domain (cNMP-BD) protein  31.88 
 
 
633 aa  59.7  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1543  putative signal-transduction protein with CBS domains  27.86 
 
 
600 aa  59.7  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00292919  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2352  signal-transduction protein  37.17 
 
 
142 aa  59.7  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.103406  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2788  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 
151 aa  59.3  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.190959  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003141  Signal transduction protein  28.29 
 
 
629 aa  59.7  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>