More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3788 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3788  putative signal transduction protein with CBS domains  100 
 
 
139 aa  269  1e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.534948  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08210  CBS domain-containing protein  50 
 
 
139 aa  130  6e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3944  signal-transduction protein  49.24 
 
 
138 aa  122  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.898238  normal  0.165624 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3565  CBS domain-containing protein  48.48 
 
 
138 aa  121  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2798  putative signal transduction protein with CBS domains  45 
 
 
140 aa  108  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0139355  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3238  putative signal transduction protein with CBS domains  44.85 
 
 
138 aa  103  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.365049  normal  0.128899 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3096  signal-transduction protein  44.12 
 
 
139 aa  100  9e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0022  signal-transduction protein  44.85 
 
 
141 aa  98.2  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  38.57 
 
 
145 aa  97.8  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2080  signal-transduction protein  49.12 
 
 
141 aa  97.4  5e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0026  CBS domain-containing protein  45.59 
 
 
141 aa  97.8  5e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3316  CBS domain-containing protein  37.76 
 
 
144 aa  96.7  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011902  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1568  putative signal transduction protein with CBS domains  50 
 
 
140 aa  95.1  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0256186 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  35 
 
 
147 aa  93.2  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1401  signal-transduction protein  46.15 
 
 
142 aa  90.5  6e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  32.62 
 
 
148 aa  90.1  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12645  hypothetical protein  38.17 
 
 
143 aa  89  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4395  CBS  44.17 
 
 
164 aa  87.4  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0203487  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1863  putative signal transduction protein with CBS domains  40.6 
 
 
141 aa  87.4  5e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3292  signal transduction protein  41.41 
 
 
142 aa  86.3  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2035  CBS domain-containing protein  43.48 
 
 
143 aa  86.7  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2352  signal-transduction protein  38.76 
 
 
142 aa  85.5  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.103406  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1740  signal transduction protein  44.23 
 
 
138 aa  85.1  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.247067 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0631  CBS domain-containing protein  36.07 
 
 
139 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.480891  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1198  CBS  39.67 
 
 
139 aa  84.3  4e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0776  CBS domain protein  34.43 
 
 
139 aa  84  7e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00143526  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4502  signal-transduction protein  44.04 
 
 
236 aa  83.6  8e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3278  putative CBS domain-containing signal transduction protein  39.84 
 
 
145 aa  83.6  9e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.565248  normal  0.216437 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1150  CBS  40 
 
 
154 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0872  CBS domain protein  34.33 
 
 
139 aa  83.6  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0791  CBS domain-containing protein  34.33 
 
 
139 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0244605  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1780  putative signal transduction protein with CBS domains  31.25 
 
 
141 aa  81.6  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0631  CBS domain-containing protein  35.25 
 
 
139 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000812315  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4559  CBS domain protein  35.14 
 
 
139 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000024778  normal  0.1618 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0636  signal-transduction protein  34.45 
 
 
139 aa  80.5  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00478917  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1420  CBS domain containing protein  38.98 
 
 
144 aa  80.9  0.000000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.384654  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6938  signal-transduction protein  41.03 
 
 
242 aa  80.9  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.335853 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4338  CBS domain-containing protein  34.92 
 
 
618 aa  80.9  0.000000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0945  CBS domain-containing protein  33.58 
 
 
144 aa  80.1  0.000000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.678646  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2667  hypothetical protein  39.32 
 
 
140 aa  80.1  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.262704  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4061  signal-transduction protein  40 
 
 
145 aa  80.1  0.000000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0687  CBS domain-containing protein  34.33 
 
 
139 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.740174  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0720  CBS domain-containing protein  34.33 
 
 
139 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000162258  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0637  signal-transduction protein  41.18 
 
 
140 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2776  putative signal transduction protein with CBS domains  42.61 
 
 
141 aa  79  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000774578 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0797  CBS domain protein  34.43 
 
 
139 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.65672e-35 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1577  putative signal transduction protein with CBS domains  38.98 
 
 
139 aa  77.8  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.011912  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0607  signal-transduction protein  34.21 
 
 
144 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.150713  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1821  CBS domain containing protein  38.35 
 
 
157 aa  75.1  0.0000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1548  cyclic nucleotide-binding protein  32.54 
 
 
615 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2441  signal-transduction protein  41.88 
 
 
144 aa  74.3  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.528968  normal  0.376991 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7033  signal-transduction protein  36.67 
 
 
154 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.365249  normal  0.472984 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2962  putative signal transduction protein with CBS domains  34.95 
 
 
145 aa  73.2  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1360  CBS domain-containing protein  38.89 
 
 
143 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.565308  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3139  CBS domain-containing protein  38.89 
 
 
143 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.533561  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3011  CBS domain-containing protein  38.89 
 
 
143 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.162521  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2185  signal transduction protein  39.66 
 
 
170 aa  72.4  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.51071  normal  0.552255 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6330  CBS domain containing protein  40.17 
 
 
139 aa  72.4  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.1107  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06340  putative signal-transduction protein with CBS domains  33.58 
 
 
141 aa  72  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2834  signal-transduction protein  38.46 
 
 
145 aa  72.4  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.316088  normal  0.231791 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3605  hypothetical protein  36.15 
 
 
139 aa  71.6  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.103373  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4551  putative signal transduction protein with CBS domains  39.17 
 
 
154 aa  71.6  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.610614  normal  0.0178706 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4418  putative signal-transduction protein with CBS domains  39.17 
 
 
154 aa  71.6  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.577015  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2012  CBS domain-containing protein  37.59 
 
 
157 aa  71.2  0.000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.345115 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2292  CBS domain-containing protein  41.53 
 
 
137 aa  70.9  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.173837  hitchhiker  0.00000858428 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2323  putative signal transduction protein with CBS domains  37.5 
 
 
145 aa  70.9  0.000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.170904  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36650  hypothetical protein  39.2 
 
 
138 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000287918  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4760  CBS domain-containing protein  41.67 
 
 
141 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462026  normal  0.418108 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2439  CBS domain-containing protein  38.98 
 
 
145 aa  69.3  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1449  signal transduction protein  38.66 
 
 
153 aa  69.3  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2001  putative signal transduction protein with CBS domains  40.16 
 
 
157 aa  70.1  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0953206  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7035  CBS domain-containing protein  35.29 
 
 
150 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.819335  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1358  CBS domain-containing protein  37.29 
 
 
143 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6060  CBS domain-containing protein  37.29 
 
 
143 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.613406  normal  0.175834 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6471  CBS domain-containing protein  37.29 
 
 
143 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0745469  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3147  hypothetical protein  39.2 
 
 
138 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.643619  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5465  CBS domain-containing protein  38.98 
 
 
143 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00381239 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7015  CBS domain-containing protein  36.44 
 
 
143 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2360  signal-transduction protein  29.84 
 
 
142 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0426332  normal  0.516588 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0013  signal-transduction protein  31.78 
 
 
147 aa  68.2  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.371187  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0656  CBS domain containing protein  33.58 
 
 
142 aa  67.8  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0642  putative signal transduction protein with CBS domains  37.01 
 
 
140 aa  68.2  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.413978  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0568  signal-transduction protein  31.9 
 
 
133 aa  68.2  0.00000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.706815 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0100  putative signal transduction protein with CBS domains  34.95 
 
 
143 aa  67.8  0.00000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5147  putative signal transduction protein with CBS domains  35.9 
 
 
137 aa  67.4  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.48852  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2011  CBS domain-containing protein  31.3 
 
 
286 aa  67.4  0.00000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11190  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  35.65 
 
 
131 aa  67.4  0.00000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.170576 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2672  signal-transduction protein  31.4 
 
 
615 aa  67  0.00000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6352  CBS domain-containing protein  36.44 
 
 
143 aa  67  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.88577 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1712  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  31.4 
 
 
615 aa  67  0.00000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  hitchhiker  0.00000133647 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1249  CBS domain-containing protein  40.91 
 
 
141 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5621  CBS domain-containing protein  36.44 
 
 
143 aa  67  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0984367 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6583  CBS domain-containing protein  40.91 
 
 
141 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460187  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0253  signal-transduction protein  34.97 
 
 
140 aa  67.4  0.00000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00276555  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0417  signal transduction protein  38.93 
 
 
139 aa  66.6  0.0000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.694858  normal  0.0742839 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2219  CBS domain containing protein  33.09 
 
 
145 aa  66.6  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.338208  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2751  CBS domain-containing protein  30.58 
 
 
615 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0342062 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0202  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 
145 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.025801  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1483  CBS domain protein  39 
 
 
125 aa  65.5  0.0000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0666376  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02457  hypothetical protein  29.63 
 
 
626 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>