More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2962 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2962  putative signal transduction protein with CBS domains  100 
 
 
145 aa  294  3e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0100  putative signal transduction protein with CBS domains  72.54 
 
 
143 aa  217  5e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2360  signal-transduction protein  57.97 
 
 
142 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0426332  normal  0.516588 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0233  putative signal transduction protein with CBS domains  56.49 
 
 
140 aa  160  7e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193926  normal  0.17761 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2323  putative signal transduction protein with CBS domains  52.08 
 
 
145 aa  157  3e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.170904  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2834  signal-transduction protein  52.08 
 
 
145 aa  158  3e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.316088  normal  0.231791 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0623  CBS  54.61 
 
 
143 aa  155  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2768  putative signal transduction protein with CBS domains  50.35 
 
 
148 aa  154  3e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0620195  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0420  signal-transduction protein  54.62 
 
 
158 aa  154  4e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5408  putative signal transduction protein with CBS domains  53.79 
 
 
146 aa  152  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000447829  normal  0.196172 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1409  signal-transduction protein  53.47 
 
 
146 aa  152  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0338  signal-transduction protein  48.95 
 
 
147 aa  150  8e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3056  putative signal-transduction protein with CBS domains  51.08 
 
 
143 aa  148  3e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.185367  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0016  signal-transduction protein  51.77 
 
 
146 aa  147  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3943  signal-transduction protein  48.3 
 
 
153 aa  147  4e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.69222 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0957  CBS domain-containing protein  50 
 
 
154 aa  147  6e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1350  CBS domain-containing protein  50 
 
 
154 aa  147  6e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0725634  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0334  CBS domain-containing protein  50 
 
 
154 aa  147  6e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2480  CBS domain-containing protein  50 
 
 
154 aa  147  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1218  CBS domain-containing protein  50 
 
 
154 aa  147  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1290  CBS domain-containing protein  50 
 
 
154 aa  147  6e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427954  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0612  CBS domain-containing protein  50 
 
 
154 aa  147  6e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.735232  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1462  putative signal transduction protein with CBS domains  49.3 
 
 
145 aa  146  8e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0493403  normal  0.625814 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1515  CBS domain-containing protein  49.32 
 
 
153 aa  146  9e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1026  signal-transduction protein  48.98 
 
 
153 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0490462 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5550  signal-transduction protein  48.98 
 
 
153 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3635  signal-transduction protein  48.98 
 
 
153 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.295786  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4732  signal-transduction protein  48.98 
 
 
153 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00820406  normal  0.0168857 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4123  signal-transduction protein  47.62 
 
 
153 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00087962  normal  0.0202046 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03090  CBS domain-containing protein  50.35 
 
 
144 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.17742  hitchhiker  0.000000481482 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4587  signal-transduction protein  47.62 
 
 
153 aa  144  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00378118  hitchhiker  0.00177049 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0335  hypothetical protein  49.65 
 
 
144 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3686  CBS domain containing protein  50 
 
 
142 aa  144  6e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.364538  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0228  CBS domain-containing protein  49.3 
 
 
145 aa  144  6e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3735  signal transduction protein  50.34 
 
 
146 aa  143  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2620  CBS domain protein  51.05 
 
 
146 aa  142  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0040  CBS  49.65 
 
 
146 aa  142  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.847902  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0272  CBS domain-containing protein  47.89 
 
 
145 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0202  CBS domain-containing protein  47.89 
 
 
145 aa  140  8e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.025801  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0225  CBS domain-containing protein  47.89 
 
 
145 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.791993 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0004  signal-transduction protein  50.72 
 
 
142 aa  138  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2374  signal-transduction protein  48.61 
 
 
146 aa  135  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.425597  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4974  putative signal-transduction protein with CBS domains  47.59 
 
 
147 aa  136  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0816417 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1650  signal-transduction protein  50.36 
 
 
141 aa  136  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2114  CBS domain-containing protein  49.24 
 
 
149 aa  136  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3539  signal-transduction protein  46.48 
 
 
146 aa  135  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.278615 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1676  signal-transduction protein  46.21 
 
 
147 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.780489  normal  0.354622 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3241  signal-transduction protein  45.83 
 
 
144 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.484063 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3631  putative signal transduction protein with CBS domains  47.45 
 
 
142 aa  129  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2360  CBS  48.95 
 
 
146 aa  127  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00610469  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3826  putative signal transduction protein with CBS domains  48.74 
 
 
120 aa  126  9.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.950929 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2095  hypothetical protein  42.66 
 
 
164 aa  124  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.040556  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2066  CBS domain containing protein  41.96 
 
 
163 aa  120  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00480753 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4121  signal-transduction protein  46.09 
 
 
146 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1756  CBS  41.48 
 
 
155 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.966462  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01671  CBS domain protein  52.94 
 
 
104 aa  112  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147887  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0013  signal-transduction protein  38.46 
 
 
147 aa  109  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.371187  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3907  signal-transduction protein  40.58 
 
 
142 aa  102  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.184794  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0859  XRE family transcriptional regulator  38.73 
 
 
170 aa  102  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2771  hypothetical protein  46.15 
 
 
125 aa  101  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.372067 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2247  putative signal transduction protein with CBS domains  40 
 
 
142 aa  101  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000297093  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3033  signal-transduction protein  42.96 
 
 
142 aa  101  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0966775  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1616  putative CBS domain-containing signal transduction protein  39.86 
 
 
142 aa  100  6e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1107  signal-transduction protein  42.14 
 
 
143 aa  100  7e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1852  putative signal transduction protein with CBS domains  39.58 
 
 
144 aa  99.8  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260866  normal  0.0125119 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3897  CBS domain containing protein  39.01 
 
 
142 aa  99.8  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2052  putative signal transduction protein with CBS domains  38.89 
 
 
144 aa  98.2  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2219  putative signal-transduction protein with CBS domains  40.71 
 
 
143 aa  97.4  5e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0827472 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2670  signal-transduction protein  39.86 
 
 
142 aa  97.4  6e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0199897  normal  0.983064 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2153  signal-transduction protein  38.3 
 
 
142 aa  97.1  7e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.268313  normal  0.0990163 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1571  CBS domain-containing protein  37.96 
 
 
165 aa  96.7  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.249229  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2362  signal-transduction protein  43.17 
 
 
143 aa  95.5  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.67854  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2537  putative signal transduction protein with CBS domains  40 
 
 
143 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.482232 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2769  CBS domain containing protein  37.23 
 
 
153 aa  95.5  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3128  signal-transduction protein  38.41 
 
 
142 aa  95.9  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.192632  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1358  hypothetical protein  37.23 
 
 
153 aa  95.5  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.512036  normal  0.639451 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2262  CBS domain-containing protein  40 
 
 
143 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.175418 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2707  signal-transduction protein  39.57 
 
 
141 aa  94.4  4e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4635  signal-transduction protein  40.71 
 
 
143 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.574258  normal  0.318433 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2661  signal-transduction protein  39.01 
 
 
177 aa  94.4  5e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.63207  normal  0.665873 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0631  signal-transduction protein  35.77 
 
 
142 aa  94.4  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0667586  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1108  signal-transduction protein  37.59 
 
 
144 aa  94  6e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5213  hypothetical protein  39.13 
 
 
142 aa  94  6e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal  0.0487848 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1696  CBS domain-containing protein  44.12 
 
 
143 aa  93.6  7e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.28583  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3250  signal-transduction protein  39.86 
 
 
174 aa  93.6  8e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0271263  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47178  predicted protein  40.62 
 
 
182 aa  92.8  1e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1563  hypothetical protein  36.62 
 
 
151 aa  92.8  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1990  CBS domain containing protein  36.23 
 
 
151 aa  92.8  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1321  hypothetical protein  38.13 
 
 
142 aa  92.8  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3268  CBS domain-containing protein  37.23 
 
 
142 aa  92.8  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3271  putative signal-transduction protein with CBS domains  35.92 
 
 
143 aa  92.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00311988 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1660  CBS domain containing protein  36.23 
 
 
151 aa  92.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0113728 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2203  hypothetical protein  36.11 
 
 
144 aa  92  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3316  CBS domain-containing protein  37.61 
 
 
144 aa  91.3  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011902  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0774  putative signal transduction protein with CBS domains  42.75 
 
 
143 aa  91.3  4e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1220  signal-transduction protein  35.86 
 
 
145 aa  91.3  4e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.348501 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  35.04 
 
 
145 aa  91.3  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2880  signal-transduction protein  38.46 
 
 
145 aa  90.5  7e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.982708  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2019  putative signal transduction protein with CBS domains  39.84 
 
 
144 aa  90.5  7e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.80054  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3725  signal-transduction protein  38.85 
 
 
143 aa  90.5  8e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>