More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0673 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0673  signal-transduction protein  100 
 
 
165 aa  328  3e-89  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1304  signal-transduction protein  40.83 
 
 
148 aa  104  5e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000185547 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0214  putative signal transduction protein with CBS domains  44.54 
 
 
207 aa  100  9e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  43.09 
 
 
185 aa  99  2e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0964  hypothetical protein  37.88 
 
 
217 aa  93.6  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2835  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 
615 aa  91.7  4e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00609535 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0568  signal-transduction protein  45.22 
 
 
133 aa  91.7  4e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.706815 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1751  cyclic nucleotide-binding protein  34.81 
 
 
615 aa  90.5  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0246988 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1198  CBS  36.59 
 
 
139 aa  86.3  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1863  putative signal transduction protein with CBS domains  36.52 
 
 
141 aa  86.3  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1763  CBS domain-containing protein  36.92 
 
 
200 aa  85.9  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0817  CBS domain-containing protein  34.75 
 
 
603 aa  84.3  7e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.175091 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1697  CBS domain-containing protein  30.2 
 
 
615 aa  84  8e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  32.5 
 
 
148 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  33.33 
 
 
147 aa  83.6  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0575  signal transduction protein  36.22 
 
 
606 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.513215  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1794  signal-transduction protein  35.83 
 
 
187 aa  82.8  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.190963  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2228  cyclic nucleotide-binding protein  36.22 
 
 
606 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.480608  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0642  putative signal transduction protein with CBS domains  35.34 
 
 
140 aa  82.4  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.413978  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3824  CBS domain-containing protein  31.01 
 
 
605 aa  82  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00664828 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2321  nucleotidyltransferase  31.82 
 
 
627 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.477711  hitchhiker  0.00895935 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0565  signal-transduction protein  38.33 
 
 
188 aa  81.3  0.000000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  33.33 
 
 
145 aa  81.3  0.000000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0506  CBS domain-containing protein  36.22 
 
 
606 aa  80.9  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.413474  normal  0.25412 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3209  putative signal transduction protein with CBS domains  37.7 
 
 
136 aa  80.5  0.000000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0964  putative signal transduction protein with CBS domains  42.37 
 
 
132 aa  80.1  0.00000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0797  CBS domain protein  33.62 
 
 
139 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.65672e-35 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2520  putative signal transduction protein with CBS domains  35.94 
 
 
143 aa  80.1  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1650  signal-transduction protein  35.83 
 
 
141 aa  80.5  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0340  signal-transduction protein  38.33 
 
 
186 aa  80.1  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.189053  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003141  Signal transduction protein  29.37 
 
 
629 aa  79.7  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0631  CBS domain-containing protein  33.62 
 
 
139 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000812315  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0607  signal-transduction protein  31.75 
 
 
144 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.150713  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2620  putative signal transduction protein with CBS domains  31.25 
 
 
480 aa  79.3  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0774627  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  35.77 
 
 
688 aa  79.7  0.00000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2665  putative signal transduction protein with CBS domains  34.45 
 
 
187 aa  79.3  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000148572  normal  0.84733 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0631  signal-transduction protein  38.21 
 
 
189 aa  79.3  0.00000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1584  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  31.9 
 
 
606 aa  79  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0450512 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2234  putative signal transduction protein with CBS domains  31.36 
 
 
139 aa  79  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0687  CBS domain-containing protein  32.76 
 
 
139 aa  78.6  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.740174  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0631  CBS domain-containing protein  33.62 
 
 
139 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.480891  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0720  CBS domain-containing protein  32.76 
 
 
139 aa  78.6  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000162258  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2907  signal-transduction protein  37.4 
 
 
188 aa  78.2  0.00000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.986231 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3096  signal-transduction protein  36.97 
 
 
139 aa  78.6  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2369  cyclic nucleotide-binding protein  28.15 
 
 
615 aa  77.8  0.00000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0100  putative cyclic nucleotide binding protein  31.61 
 
 
626 aa  77.8  0.00000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01888  hypothetical protein  29.55 
 
 
629 aa  77.4  0.00000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0818  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  29.23 
 
 
603 aa  77.4  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.410169  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0822  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  29.23 
 
 
603 aa  77.4  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1844  CBS domain-containing protein  35.04 
 
 
688 aa  77.4  0.00000000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1548  cyclic nucleotide-binding protein  31.5 
 
 
615 aa  77.4  0.00000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0022  signal-transduction protein  33.62 
 
 
141 aa  77.4  0.00000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0770  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.9 
 
 
603 aa  76.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.461269  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1296  hypothetical protein  31.9 
 
 
601 aa  77  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.922257  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0636  signal-transduction protein  31.9 
 
 
139 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00478917  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0051  cyclic nucleotide-binding protein  30.46 
 
 
629 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1524  CBS domain-containing protein  30.15 
 
 
618 aa  77  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3825  CBS domain-containing protein  31.78 
 
 
598 aa  77  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00138236 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0791  CBS domain-containing protein  32.76 
 
 
139 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0244605  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0776  CBS domain protein  32.48 
 
 
139 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00143526  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3944  signal-transduction protein  29.91 
 
 
138 aa  75.9  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.898238  normal  0.165624 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2035  CBS domain-containing protein  31.58 
 
 
143 aa  76.3  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3713  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  28.57 
 
 
613 aa  76.3  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000235103  unclonable  0.0000000288509 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0267  cyclic nucleotide-binding protein  33.33 
 
 
625 aa  76.3  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02457  hypothetical protein  31.78 
 
 
626 aa  75.5  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1768  signal-transduction protein  34.19 
 
 
131 aa  75.5  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00805181  normal  0.187228 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1821  CBS domain containing protein  32.76 
 
 
157 aa  75.5  0.0000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3142  CBS domain-containing protein  28.91 
 
 
608 aa  75.9  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0872  CBS domain protein  32.76 
 
 
139 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4559  CBS domain protein  32.48 
 
 
139 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000024778  normal  0.1618 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2637  signal-transduction protein  27.78 
 
 
615 aa  75.1  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  34.03 
 
 
845 aa  75.1  0.0000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1462  putative signal transduction protein with CBS domains  36.11 
 
 
145 aa  75.1  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0493403  normal  0.625814 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1712  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  27.78 
 
 
615 aa  75.1  0.0000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  hitchhiker  0.00000133647 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3565  CBS domain-containing protein  30.77 
 
 
138 aa  74.7  0.0000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2672  signal-transduction protein  27.78 
 
 
615 aa  75.1  0.0000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0100  putative signal transduction protein with CBS domains  31.36 
 
 
143 aa  74.3  0.0000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1809  putative signal-transduction protein with CBS domains  32.06 
 
 
478 aa  74.7  0.0000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03090  CBS domain-containing protein  27.5 
 
 
144 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.17742  hitchhiker  0.000000481482 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3932  CBS domain-containing protein  28.57 
 
 
623 aa  74.3  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.177243  normal  0.11098 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1762  signal-transduction protein  40.16 
 
 
139 aa  74.3  0.0000000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2231  signal-transduction protein  31.62 
 
 
188 aa  74.3  0.0000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.943647  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2751  CBS domain-containing protein  27.78 
 
 
615 aa  73.9  0.0000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0342062 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0910  hypothetical protein  28.17 
 
 
637 aa  73.9  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.529281  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06340  putative signal-transduction protein with CBS domains  31.53 
 
 
141 aa  73.2  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3316  CBS domain-containing protein  33.61 
 
 
144 aa  73.2  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011902  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0497  signal-transduction protein  35.83 
 
 
186 aa  73.2  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.835525  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6060  CBS domain-containing protein  29.31 
 
 
143 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.613406  normal  0.175834 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0026  CBS domain-containing protein  31.9 
 
 
141 aa  73.6  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1422  signal-transduction protein  35.83 
 
 
186 aa  73.6  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.216584  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1332  signal-transduction protein  35.54 
 
 
139 aa  73.6  0.000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.660277  normal  0.443449 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5465  CBS domain-containing protein  29.31 
 
 
143 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00381239 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0680  hypothetical protein  30.94 
 
 
249 aa  72.8  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.480825 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7015  CBS domain-containing protein  30 
 
 
143 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003608  Signal transduction protein  30.23 
 
 
626 aa  72.8  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2352  signal-transduction protein  36.04 
 
 
142 aa  73.2  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.103406  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1528  signal-transduction protein  30 
 
 
153 aa  72  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1358  CBS domain-containing protein  29.31 
 
 
143 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2219  CBS domain containing protein  29.66 
 
 
145 aa  72  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.338208  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6471  CBS domain-containing protein  29.31 
 
 
143 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0745469  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>