More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2665 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_2665  putative signal transduction protein with CBS domains  100 
 
 
187 aa  377  1e-104  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000148572  normal  0.84733 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1794  signal-transduction protein  63.64 
 
 
187 aa  244  6e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.190963  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2231  signal-transduction protein  59.36 
 
 
188 aa  226  1e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.943647  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2907  signal-transduction protein  54.79 
 
 
188 aa  213  9.999999999999999e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.986231 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  41.76 
 
 
185 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0964  hypothetical protein  38.34 
 
 
217 aa  137  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1763  CBS domain-containing protein  35.88 
 
 
200 aa  102  2e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0631  signal-transduction protein  30.57 
 
 
189 aa  92.4  3e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1304  signal-transduction protein  39.53 
 
 
148 aa  89  4e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000185547 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0214  putative signal transduction protein with CBS domains  28 
 
 
207 aa  89  4e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0565  signal-transduction protein  34.27 
 
 
188 aa  87.8  7e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  33.1 
 
 
147 aa  85.9  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  33.1 
 
 
148 aa  85.9  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0642  putative signal transduction protein with CBS domains  30.66 
 
 
140 aa  84  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.413978  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0340  signal-transduction protein  35 
 
 
186 aa  83.6  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.189053  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  35.77 
 
 
145 aa  83.2  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0497  signal-transduction protein  33.89 
 
 
186 aa  82.4  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.835525  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1425  signal-transduction protein  41.54 
 
 
144 aa  82.4  0.000000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.316039 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1198  CBS  34.31 
 
 
139 aa  81.6  0.000000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2035  CBS domain-containing protein  38.66 
 
 
143 aa  81.6  0.000000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3328  putative signal transduction protein with CBS domains  25 
 
 
212 aa  81.6  0.000000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1697  CBS domain-containing protein  36.59 
 
 
615 aa  81.6  0.000000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2080  signal-transduction protein  37.07 
 
 
141 aa  81.3  0.000000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2856  CBS domain-containing protein  34.65 
 
 
620 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0695  putative signal-transduction protein with CBS domains  35.04 
 
 
140 aa  80.5  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0173289  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1422  signal-transduction protein  33.89 
 
 
186 aa  79.7  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.216584  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0239  signal transduction protein  32 
 
 
128 aa  79.3  0.00000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.371768 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0673  signal-transduction protein  34.45 
 
 
165 aa  79.3  0.00000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1809  putative signal-transduction protein with CBS domains  38.79 
 
 
478 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0345  signal-transduction protein  32.61 
 
 
150 aa  77.8  0.00000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0568  signal-transduction protein  35.25 
 
 
133 aa  76.6  0.0000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.706815 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  34.68 
 
 
688 aa  75.9  0.0000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1576  cyclic nucleotide-binding protein  33.07 
 
 
620 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00132625 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2219  CBS domain containing protein  32.85 
 
 
145 aa  75.1  0.0000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.338208  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1751  cyclic nucleotide-binding protein  30.54 
 
 
615 aa  74.7  0.0000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0246988 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1515  cyclic nucleotide-binding protein  32.28 
 
 
620 aa  74.3  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0149843 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1582  cyclic nucleotide-binding protein  32.28 
 
 
620 aa  74.3  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0380043 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1780  putative signal transduction protein with CBS domains  30.22 
 
 
141 aa  73.9  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1844  CBS domain-containing protein  34.15 
 
 
688 aa  74.3  0.000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2637  signal-transduction protein  31.71 
 
 
615 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1394  signal-transduction protein  36.36 
 
 
135 aa  73.6  0.000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.136388 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3316  CBS domain-containing protein  35.34 
 
 
144 aa  73.6  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011902  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2357  cyclic nucleotide-binding protein  33.33 
 
 
615 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0340  signal-transduction protein  44.14 
 
 
120 aa  72.8  0.000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0589746  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3292  signal transduction protein  33.33 
 
 
142 aa  72.4  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1712  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  31.71 
 
 
615 aa  72  0.000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  hitchhiker  0.00000133647 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1863  putative signal transduction protein with CBS domains  37.11 
 
 
141 aa  72  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2672  signal-transduction protein  31.71 
 
 
615 aa  72  0.000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4395  CBS  27.78 
 
 
164 aa  71.6  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0203487  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06340  putative signal-transduction protein with CBS domains  36.97 
 
 
141 aa  72  0.000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2751  CBS domain-containing protein  31.71 
 
 
615 aa  71.6  0.000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0342062 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0100  putative signal transduction protein with CBS domains  35.14 
 
 
143 aa  71.2  0.000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2835  CBS domain-containing protein  28.74 
 
 
615 aa  71.2  0.000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00609535 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1022  cyclic nucleotide-binding protein  39.13 
 
 
613 aa  71.6  0.000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0583  CBS domain-containing protein  32.8 
 
 
150 aa  71.2  0.000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00772647  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0964  putative signal transduction protein with CBS domains  32.8 
 
 
132 aa  70.9  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2620  CBS domain protein  33.61 
 
 
146 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4502  signal-transduction protein  36.57 
 
 
236 aa  70.5  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3944  signal-transduction protein  33.08 
 
 
138 aa  70.9  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.898238  normal  0.165624 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2234  putative signal transduction protein with CBS domains  33.04 
 
 
139 aa  70.9  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0552  putative signal transduction protein with CBS domains  32.26 
 
 
250 aa  70.1  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.168262  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3096  signal-transduction protein  35.11 
 
 
139 aa  69.7  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3565  CBS domain-containing protein  33.85 
 
 
138 aa  69.3  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0302  signal-transduction protein  35.71 
 
 
648 aa  68.9  0.00000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2962  putative signal transduction protein with CBS domains  30.17 
 
 
145 aa  68.9  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1393  signal transduction protein  39.5 
 
 
136 aa  68.6  0.00000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.137975 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3773  putative signal transduction protein with CBS domains  26.28 
 
 
144 aa  68.6  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00722  Signaling protein with a cAMP-binding, CBS domains and predicted nucleotidyltransferase domain  30.3 
 
 
613 aa  68.2  0.00000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0016  signal-transduction protein  32.69 
 
 
146 aa  68.2  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3605  hypothetical protein  26.27 
 
 
139 aa  67.8  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.103373  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6330  CBS domain containing protein  31.62 
 
 
139 aa  67.8  0.00000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.1107  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0446  putative signal transduction protein with CBS domains  29.1 
 
 
136 aa  67.4  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0212406  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0776  CBS domain protein  34.34 
 
 
139 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00143526  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2620  putative signal transduction protein with CBS domains  39.56 
 
 
480 aa  67.4  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0774627  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0920  CBS domain-containing protein  37 
 
 
149 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1543  putative signal-transduction protein with CBS domains  34.15 
 
 
600 aa  67.8  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00292919  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0528  signal-transduction protein  30.07 
 
 
611 aa  67  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.766846  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1799  putative signal transduction protein with CBS domains  35.66 
 
 
202 aa  67.4  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0446245  normal  0.0519326 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4954  CBS domain-containing protein  35.78 
 
 
624 aa  66.2  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0631  CBS domain-containing protein  32.32 
 
 
139 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000812315  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0636  signal-transduction protein  29.91 
 
 
139 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00478917  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4559  CBS domain protein  30.77 
 
 
139 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000024778  normal  0.1618 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0797  CBS domain protein  32.32 
 
 
139 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.65672e-35 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2369  cyclic nucleotide-binding protein  31.36 
 
 
615 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0631  CBS domain-containing protein  32.32 
 
 
139 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.480891  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1577  putative signal transduction protein with CBS domains  35.71 
 
 
139 aa  65.9  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.011912  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0597  signal transduction protein  31.67 
 
 
145 aa  65.9  0.0000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2352  signal-transduction protein  28.78 
 
 
142 aa  66.2  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.103406  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0623  CBS  30.89 
 
 
143 aa  65.9  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4660  CBS domain-containing protein  29.03 
 
 
199 aa  65.5  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3679  signal-transduction protein  32 
 
 
150 aa  65.9  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5919  signal-transduction protein  37.11 
 
 
162 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.512609  normal  0.346148 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5931  CBS domain-containing protein  39.09 
 
 
149 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0687  CBS domain-containing protein  32.32 
 
 
139 aa  65.1  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.740174  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0720  CBS domain-containing protein  32.32 
 
 
139 aa  65.1  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000162258  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11190  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  35.71 
 
 
131 aa  65.1  0.0000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.170576 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  28.03 
 
 
215 aa  65.1  0.0000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2798  putative signal transduction protein with CBS domains  30.77 
 
 
140 aa  65.1  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0139355  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6471  CBS domain-containing protein  27.34 
 
 
143 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0745469  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0677  signal transduction protein  32.56 
 
 
399 aa  65.1  0.0000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>