More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3565 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_3565  CBS domain-containing protein  100 
 
 
138 aa  270  5.000000000000001e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3944  signal-transduction protein  95.65 
 
 
138 aa  262  1e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.898238  normal  0.165624 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3788  putative signal transduction protein with CBS domains  48.48 
 
 
139 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.534948  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08210  CBS domain-containing protein  42.11 
 
 
139 aa  104  4e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0026  CBS domain-containing protein  45.59 
 
 
141 aa  103  6e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0872  CBS domain protein  42.15 
 
 
139 aa  103  6e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0791  CBS domain-containing protein  42.15 
 
 
139 aa  102  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0244605  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0656  CBS domain containing protein  46.67 
 
 
142 aa  102  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0636  signal-transduction protein  40.98 
 
 
139 aa  102  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00478917  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4559  CBS domain protein  42.5 
 
 
139 aa  101  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000024778  normal  0.1618 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3238  putative signal transduction protein with CBS domains  45.59 
 
 
138 aa  100  8e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.365049  normal  0.128899 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0631  CBS domain-containing protein  42.5 
 
 
139 aa  100  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.480891  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0776  CBS domain protein  41.67 
 
 
139 aa  99.4  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00143526  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0022  signal-transduction protein  41.48 
 
 
141 aa  98.6  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1863  putative signal transduction protein with CBS domains  43.44 
 
 
141 aa  98.2  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  43.97 
 
 
145 aa  97.8  5e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0631  CBS domain-containing protein  41.67 
 
 
139 aa  96.7  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000812315  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0797  CBS domain protein  41.67 
 
 
139 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.65672e-35 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0687  CBS domain-containing protein  40.83 
 
 
139 aa  95.1  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.740174  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0720  CBS domain-containing protein  40.83 
 
 
139 aa  95.1  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000162258  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1568  putative signal transduction protein with CBS domains  44.12 
 
 
140 aa  93.2  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0256186 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1821  CBS domain containing protein  42.86 
 
 
157 aa  92.4  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1198  CBS  44.26 
 
 
139 aa  91.7  3e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2798  putative signal transduction protein with CBS domains  40 
 
 
140 aa  91.3  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0139355  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0607  signal-transduction protein  39.5 
 
 
144 aa  90.5  7e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.150713  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2001  putative signal transduction protein with CBS domains  42.62 
 
 
157 aa  89.4  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0953206  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2012  CBS domain-containing protein  41.43 
 
 
157 aa  88.6  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.345115 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06340  putative signal-transduction protein with CBS domains  41.38 
 
 
141 aa  88.2  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3096  signal-transduction protein  40.3 
 
 
139 aa  85.9  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  39.66 
 
 
147 aa  84.3  5e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2185  signal transduction protein  39.34 
 
 
170 aa  84  6e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.51071  normal  0.552255 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2352  signal-transduction protein  38.76 
 
 
142 aa  82.8  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.103406  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  37.07 
 
 
148 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2219  CBS domain containing protein  42.74 
 
 
145 aa  80.5  0.000000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.338208  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2557  hypothetical protein  35.83 
 
 
149 aa  79.3  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2011  CBS domain-containing protein  35.71 
 
 
286 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2035  CBS domain-containing protein  39.66 
 
 
143 aa  79  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2776  putative signal transduction protein with CBS domains  35.16 
 
 
141 aa  78.6  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000774578 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0568  signal-transduction protein  37.39 
 
 
133 aa  78.2  0.00000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.706815 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3943  signal-transduction protein  38.69 
 
 
153 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.69222 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6938  signal-transduction protein  41.18 
 
 
242 aa  77.4  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.335853 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3316  CBS domain-containing protein  37.31 
 
 
144 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011902  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0706  CBS domain containing protein  38.66 
 
 
144 aa  77.4  0.00000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4061  signal-transduction protein  39.34 
 
 
145 aa  77  0.00000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1780  putative signal transduction protein with CBS domains  34.65 
 
 
141 aa  76.6  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0642  putative signal transduction protein with CBS domains  36.11 
 
 
140 aa  76.3  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.413978  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2950  signal transduction protein  39.32 
 
 
141 aa  75.5  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.211508 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2080  signal-transduction protein  42.02 
 
 
141 aa  75.9  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1304  signal-transduction protein  35.9 
 
 
148 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000185547 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1515  CBS domain-containing protein  39.13 
 
 
153 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4502  signal-transduction protein  39.64 
 
 
236 aa  75.1  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0673  signal-transduction protein  30.77 
 
 
165 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1401  signal-transduction protein  37.5 
 
 
142 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4587  signal-transduction protein  37.23 
 
 
153 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00378118  hitchhiker  0.00177049 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1218  CBS domain-containing protein  38.26 
 
 
154 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1350  CBS domain-containing protein  38.26 
 
 
154 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0725634  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2480  CBS domain-containing protein  38.26 
 
 
154 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4121  signal-transduction protein  33.61 
 
 
146 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0612  CBS domain-containing protein  38.26 
 
 
154 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.735232  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0957  CBS domain-containing protein  38.26 
 
 
154 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1290  CBS domain-containing protein  38.26 
 
 
154 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427954  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0334  CBS domain-containing protein  38.26 
 
 
154 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0964  putative signal transduction protein with CBS domains  38.46 
 
 
132 aa  72.8  0.000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2033  CBS domain-containing protein  37.82 
 
 
149 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3216  CBS domain-containing protein  37.82 
 
 
149 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1343  CBS domain-containing protein  37.82 
 
 
149 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2323  CBS domain-containing protein  37.82 
 
 
149 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.195763  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3488  CBS domain-containing protein  36.44 
 
 
142 aa  73.2  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4760  CBS domain-containing protein  38.33 
 
 
141 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462026  normal  0.418108 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2834  signal-transduction protein  36.89 
 
 
145 aa  72.8  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.316088  normal  0.231791 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1057  CBS domain-containing protein  37.82 
 
 
149 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.486416  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0345  signal-transduction protein  43.43 
 
 
150 aa  72.8  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0945  CBS domain-containing protein  35 
 
 
144 aa  72.8  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.678646  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2323  putative signal transduction protein with CBS domains  36.89 
 
 
145 aa  72.4  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.170904  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1429  CBS domain-containing protein  37.82 
 
 
211 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3091  CBS domain-containing protein  38.14 
 
 
291 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.105353  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1026  signal-transduction protein  35.77 
 
 
153 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0490462 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4414  CBS domain-containing protein  43.09 
 
 
146 aa  72  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.718009 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6330  CBS domain containing protein  37.68 
 
 
139 aa  71.6  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.1107  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3011  putative signal transduction protein with CBS domains  42.45 
 
 
148 aa  71.2  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2317  CBS domain-containing protein  37.82 
 
 
149 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.754062  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4338  CBS domain-containing protein  35.83 
 
 
618 aa  71.2  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2439  CBS domain-containing protein  33.9 
 
 
145 aa  71.2  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3635  signal-transduction protein  35.77 
 
 
153 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.295786  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4732  signal-transduction protein  35.77 
 
 
153 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00820406  normal  0.0168857 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5550  signal-transduction protein  35.77 
 
 
153 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0239  signal transduction protein  35.04 
 
 
128 aa  70.9  0.000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.371768 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0583  CBS domain-containing protein  34.17 
 
 
150 aa  70.9  0.000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00772647  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1150  CBS  35.04 
 
 
154 aa  70.9  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4123  signal-transduction protein  35.77 
 
 
153 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00087962  normal  0.0202046 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0202  CBS domain-containing protein  34.13 
 
 
145 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.025801  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0228  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 
145 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3292  signal transduction protein  37.61 
 
 
142 aa  70.1  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1794  signal-transduction protein  37.21 
 
 
187 aa  70.1  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.190963  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2620  CBS domain protein  34.65 
 
 
146 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0964  hypothetical protein  32.2 
 
 
217 aa  69.3  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2665  putative signal transduction protein with CBS domains  33.85 
 
 
187 aa  69.3  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000148572  normal  0.84733 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0214  putative signal transduction protein with CBS domains  31.62 
 
 
207 aa  68.9  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0225  CBS domain-containing protein  34.13 
 
 
145 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.791993 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2115  putative signal transduction protein with CBS domains  32.5 
 
 
148 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>