More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2352 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2352  signal-transduction protein  100 
 
 		 142 aa  288  2e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.103406  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1780  putative signal transduction protein with CBS domains  60 
 
 		 141 aa  179  1e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  56.12 
 
 		 145 aa  161  3e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  50.36 
 
 		 147 aa  145  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  50.36 
 
 		 148 aa  144  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3316  CBS domain-containing protein  53.57 
 
 		 144 aa  142  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06340  putative signal-transduction protein with CBS domains  50 
 
 		 141 aa  134  5e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0631  CBS domain-containing protein  47.1 
 
 		 139 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.480891  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2219  CBS domain containing protein  50.72 
 
 		 145 aa  118  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.338208  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0631  CBS domain-containing protein  47.41 
 
 		 139 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000812315  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0791  CBS domain-containing protein  47.41 
 
 		 139 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0244605  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0687  CBS domain-containing protein  47.41 
 
 		 139 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.740174  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0720  CBS domain-containing protein  47.41 
 
 		 139 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000162258  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1863  putative signal transduction protein with CBS domains  46.27 
 
 		 141 aa  117  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0776  CBS domain protein  45.93 
 
 		 139 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00143526  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0872  CBS domain protein  47.41 
 
 		 139 aa  117  6e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0656  CBS domain containing protein  42.14 
 
 		 142 aa  117  7e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0636  signal-transduction protein  46.67 
 
 		 139 aa  116  9e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00478917  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4559  CBS domain protein  45.93 
 
 		 139 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000024778  normal  0.1618 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0607  signal-transduction protein  46.04 
 
 		 144 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.150713  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3292  signal transduction protein  43.97 
 
 		 142 aa  115  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0797  CBS domain protein  46.67 
 
 		 139 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.65672e-35 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2185  signal transduction protein  47.18 
 
 		 170 aa  110  5e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.51071  normal  0.552255 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4395  CBS  40.56 
 
 		 164 aa  105  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0203487  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4061  signal-transduction protein  47.89 
 
 		 145 aa  105  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2788  CBS domain-containing protein  45.32 
 
 		 151 aa  105  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.190959  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6330  CBS domain containing protein  40.88 
 
 		 139 aa  103  9e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.1107  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1198  CBS  40.58 
 
 		 139 aa  101  3e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2001  putative signal transduction protein with CBS domains  45.07 
 
 		 157 aa  101  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0953206  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5621  CBS domain-containing protein  38.3 
 
 		 143 aa  99.4  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0984367 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6352  CBS domain-containing protein  38.3 
 
 		 143 aa  99.4  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.88577 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3011  CBS domain-containing protein  38.3 
 
 		 143 aa  99  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.162521  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1360  CBS domain-containing protein  38.3 
 
 		 143 aa  99  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.565308  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7015  CBS domain-containing protein  42.37 
 
 		 143 aa  98.6  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3139  CBS domain-containing protein  38.3 
 
 		 143 aa  99  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.533561  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1358  CBS domain-containing protein  41.32 
 
 		 143 aa  98.6  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6471  CBS domain-containing protein  41.32 
 
 		 143 aa  98.6  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0745469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1249  CBS domain-containing protein  42.55 
 
 		 141 aa  97.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6583  CBS domain-containing protein  42.55 
 
 		 141 aa  97.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460187  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3238  putative signal transduction protein with CBS domains  45.07 
 
 		 138 aa  97.4  6e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.365049  normal  0.128899 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5465  CBS domain-containing protein  42.15 
 
 		 143 aa  97.4  6e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00381239 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5536  CBS domain-containing protein  41.13 
 
 		 141 aa  97.1  7e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0354137 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6060  CBS domain-containing protein  40.5 
 
 		 143 aa  97.1  8e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.613406  normal  0.175834 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3605  hypothetical protein  41.18 
 
 		 139 aa  96.3  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.103373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4760  CBS domain-containing protein  42.34 
 
 		 141 aa  96.7  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462026  normal  0.418108 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2439  CBS domain-containing protein  41.61 
 
 		 145 aa  95.9  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6186  CBS domain-containing protein  41.84 
 
 		 141 aa  95.5  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1821  CBS domain containing protein  38.73 
 
 		 157 aa  95.5  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2035  CBS domain-containing protein  36.11 
 
 		 143 aa  94.7  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2080  signal-transduction protein  41.43 
 
 		 141 aa  94.4  5e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0446  putative signal transduction protein with CBS domains  46.67 
 
 		 136 aa  94.4  5e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0212406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1420  CBS domain containing protein  43.7 
 
 		 144 aa  92.8  1e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.384654  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4239  CBS domain-containing protein  44.07 
 
 		 143 aa  93.2  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.716364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2360  signal-transduction protein  42.86 
 
 		 142 aa  92.4  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0426332  normal  0.516588 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1740  signal transduction protein  36.97 
 
 		 138 aa  91.3  4e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247067 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5973  CBS domain-containing protein  43.22 
 
 		 143 aa  90.1  9e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.643427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2962  putative signal transduction protein with CBS domains  41.12 
 
 		 145 aa  90.1  9e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4391  CBS domain-containing protein  39.2 
 
 		 204 aa  89.7  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2012  CBS domain-containing protein  37.32 
 
 		 157 aa  89.7  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.345115 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2011  CBS domain-containing protein  40 
 
 		 286 aa  89.7  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0272  CBS domain-containing protein  38.05 
 
 		 145 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3985  CBS domain-containing protein  43.22 
 
 		 143 aa  89  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.134213  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4382  CBS domain-containing protein  43.22 
 
 		 143 aa  89  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0262346  normal  0.971701 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0202  CBS domain-containing protein  37.17 
 
 		 145 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.025801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3826  putative signal transduction protein with CBS domains  41.24 
 
 		 120 aa  88.2  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.950929 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08210  CBS domain-containing protein  39.1 
 
 		 139 aa  87.8  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3796  CBS domain-containing protein  41.53 
 
 		 143 aa  87.8  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.586823  normal  0.399094 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4261  CBS domain-containing protein  41.53 
 
 		 143 aa  87.8  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.808384  normal  0.229571 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1978  putative signal transduction protein with CBS domains  40.17 
 
 		 138 aa  87.8  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0602672  normal  0.871895 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0225  CBS domain-containing protein  37.17 
 
 		 145 aa  87.4  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.791993 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0100  putative signal transduction protein with CBS domains  38.46 
 
 		 143 aa  87.4  6e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2620  CBS domain protein  35.48 
 
 		 146 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3107  hypothetical protein  41.18 
 
 		 137 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0515224  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0706  CBS domain containing protein  39.86 
 
 		 144 aa  86.3  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0026  CBS domain-containing protein  40.15 
 
 		 141 aa  86.7  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2950  signal transduction protein  38.66 
 
 		 141 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.211508 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4660  CBS domain-containing protein  34.4 
 
 		 199 aa  84.3  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3231  signal-transduction protein  41.44 
 
 		 143 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00933533  normal  0.19525 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0228  CBS domain-containing protein  36.28 
 
 		 145 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3735  signal transduction protein  35.48 
 
 		 146 aa  84  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1449  signal transduction protein  36.59 
 
 		 153 aa  84  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3539  signal-transduction protein  34.75 
 
 		 146 aa  84  6e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.278615 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1637  CBS domain-containing protein  40.68 
 
 		 143 aa  84  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.817023  normal  0.200106 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3096  signal-transduction protein  38.52 
 
 		 139 aa  83.6  8e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4502  signal-transduction protein  38.21 
 
 		 236 aa  83.6  8e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0631  signal-transduction protein  41.35 
 
 		 142 aa  83.6  8e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0667586  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0040  CBS  34.75 
 
 		 146 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.847902  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3565  CBS domain-containing protein  38.76 
 
 		 138 aa  82.8  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5005  signal-transduction protein  40.98 
 
 		 144 aa  83.2  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  35.59 
 
 		 155 aa  83.2  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3706  CBS domain containing protein  37.6 
 
 		 208 aa  82.8  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.312715  normal  0.158217 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3278  putative CBS domain-containing signal transduction protein  40.52 
 
 		 145 aa  83.2  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.565248  normal  0.216437 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3652  CBS domain containing protein  37.6 
 
 		 208 aa  82.8  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1577  putative signal transduction protein with CBS domains  35.59 
 
 		 139 aa  82.4  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.011912  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0013  signal-transduction protein  38.89 
 
 		 147 aa  82.8  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.371187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0338  signal-transduction protein  36.36 
 
 		 147 aa  82  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0233  putative signal transduction protein with CBS domains  34.78 
 
 		 140 aa  82.8  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193926  normal  0.17761 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2061  protein of unknown function CP12  36 
 
 		 203 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.419662 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3788  putative signal transduction protein with CBS domains  38.76 
 
 		 139 aa  82  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.534948  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6938  signal-transduction protein  37.07 
 
 		 242 aa  81.6  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.335853 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>