More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2061 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2061  protein of unknown function CP12  100 
 
 
203 aa  417  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.419662 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4391  CBS domain-containing protein  68.66 
 
 
204 aa  282  3.0000000000000004e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4660  CBS domain-containing protein  62.63 
 
 
199 aa  270  1e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3652  CBS domain containing protein  61.2 
 
 
208 aa  236  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3706  CBS domain containing protein  61.2 
 
 
208 aa  236  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.312715  normal  0.158217 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2130  CBS domain containing protein  57.07 
 
 
208 aa  235  3e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.418826 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0804  CBS domain containing protein  54.5 
 
 
208 aa  234  6e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3943  CBS domain-containing protein  51.83 
 
 
197 aa  196  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00933631 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0283  putative signal-transduction protein with CBS domains  42.28 
 
 
148 aa  100  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.974941  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0247  putative signal-transduction protein with CBS domains  40.8 
 
 
148 aa  97.4  1e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.414289  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1223  signal-transduction protein  39.17 
 
 
134 aa  97.8  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.173685 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0178  signal-transduction protein  40 
 
 
148 aa  96.7  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1500  signal transduction protein  39.84 
 
 
134 aa  96.7  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.722324  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2759  signal-transduction protein  39.02 
 
 
134 aa  96.3  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.210578  normal  0.0235109 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4077  protein of unknown function CP12  60 
 
 
74 aa  95.1  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0167  hypothetical protein  37.5 
 
 
132 aa  94  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.457357  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1996  CBS  37.6 
 
 
148 aa  93.6  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004143  hypothetical protein  37.5 
 
 
135 aa  93.2  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0914  protein of unknown function CP12  58.57 
 
 
74 aa  92.8  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0941  protein of unknown function CP12  58.57 
 
 
74 aa  92.8  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0126  CBS  37.6 
 
 
148 aa  92.8  3e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1829  signal transduction protein  35.16 
 
 
135 aa  91.7  7e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0766712  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2718  putative signal-transduction protein with CBS domains  38.4 
 
 
150 aa  91.7  8e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1950  CBS domain-containing protein  36.67 
 
 
131 aa  90.9  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.675111  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2345  putative signal-transduction protein with CBS domains  38.4 
 
 
148 aa  90.5  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1090  putative signal transduction protein with CBS domains  40 
 
 
130 aa  90.1  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4045  protein of unknown function CP12  60 
 
 
77 aa  88.6  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.661727  normal  0.0123729 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1594  signal-transduction protein  36.59 
 
 
135 aa  85.1  7e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2352  signal-transduction protein  36 
 
 
142 aa  82.4  0.000000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.103406  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0804  putative signal transduction protein with CBS domains  36.67 
 
 
129 aa  82.4  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1050  hypothetical protein  51.35 
 
 
78 aa  81.6  0.000000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00148004 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0361  hypothetical protein  55.56 
 
 
75 aa  81.6  0.000000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.803964  normal  0.324948 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2274  signal-transduction protein  33.33 
 
 
134 aa  79  0.00000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000468461  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1560  hypothetical protein  62.71 
 
 
80 aa  78.6  0.00000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.699568  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3389  protein of unknown function CP12  56.52 
 
 
75 aa  77.4  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.324137 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0661  signal-transduction protein  37.5 
 
 
129 aa  77.4  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0346092  normal  0.201572 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0307  signal-transduction protein  38.79 
 
 
147 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.400951 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  32.74 
 
 
185 aa  77  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  30.89 
 
 
148 aa  75.5  0.0000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3476  signal-transduction protein  32.17 
 
 
136 aa  74.3  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.52358 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1429  CBS domain-containing protein  37.4 
 
 
211 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1895  protein of unknown function CP12  58.93 
 
 
75 aa  73.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.561735  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1780  putative signal transduction protein with CBS domains  30.95 
 
 
141 aa  72.8  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3468  signal-transduction protein  31.62 
 
 
129 aa  72.4  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1057  CBS domain-containing protein  36 
 
 
149 aa  72  0.000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.486416  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2033  CBS domain-containing protein  36 
 
 
149 aa  72  0.000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2323  CBS domain-containing protein  36 
 
 
149 aa  72  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.195763  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1343  CBS domain-containing protein  36 
 
 
149 aa  72  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0784  signal-transduction protein  33.05 
 
 
213 aa  72  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.26594 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0252  hypothetical protein  45.21 
 
 
75 aa  71.2  0.000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  30.89 
 
 
147 aa  70.9  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3091  CBS domain-containing protein  35.33 
 
 
291 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.105353  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3710  hypothetical protein  47.3 
 
 
90 aa  68.9  0.00000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2858  putative signal transduction protein with CBS domains  35.77 
 
 
125 aa  68.9  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1242  signal-transduction protein  30.51 
 
 
213 aa  68.9  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4510  hypothetical protein  41.56 
 
 
92 aa  68.2  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3216  CBS domain-containing protein  35.33 
 
 
149 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17480  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  37.4 
 
 
191 aa  67.8  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2907  signal-transduction protein  34.84 
 
 
188 aa  66.2  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.986231 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0184  putative signal transduction protein with CBS domains  31.45 
 
 
142 aa  66.2  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2317  CBS domain-containing protein  35.77 
 
 
149 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.754062  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1198  CBS  34.75 
 
 
139 aa  63.5  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0631  signal-transduction protein  32.41 
 
 
189 aa  63.5  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0013  signal-transduction protein  34.86 
 
 
147 aa  62.8  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.371187  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2290  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  31.93 
 
 
589 aa  62.4  0.000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4974  putative signal-transduction protein with CBS domains  39.82 
 
 
147 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0816417 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2638  putative signal transduction protein with CBS domains  30.14 
 
 
144 aa  62.4  0.000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2665  putative signal transduction protein with CBS domains  32 
 
 
187 aa  62.4  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000148572  normal  0.84733 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1676  signal-transduction protein  39.82 
 
 
147 aa  62  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.780489  normal  0.354622 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1794  signal-transduction protein  32.47 
 
 
187 aa  61.6  0.000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.190963  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0859  XRE family transcriptional regulator  34.29 
 
 
170 aa  61.2  0.000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0673  signal-transduction protein  29.93 
 
 
165 aa  60.8  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06340  putative signal-transduction protein with CBS domains  31.09 
 
 
141 aa  60.8  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0214  putative signal transduction protein with CBS domains  32.17 
 
 
207 aa  60.5  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  26.27 
 
 
145 aa  60.1  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3316  CBS domain-containing protein  32.26 
 
 
144 aa  60.1  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011902  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2668  CBS domain containing membrane protein  37.12 
 
 
277 aa  60.5  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204246  normal  0.569108 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0896  putative signal transduction protein with CBS domains  34.19 
 
 
124 aa  60.1  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.711423 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02457  hypothetical protein  34.56 
 
 
626 aa  60.5  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  31.54 
 
 
215 aa  60.1  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3328  putative signal transduction protein with CBS domains  35 
 
 
212 aa  59.3  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0656  CBS domain containing protein  30.23 
 
 
142 aa  59.3  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1304  signal-transduction protein  31.03 
 
 
148 aa  59.7  0.00000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000185547 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1401  signal-transduction protein  35.54 
 
 
142 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0272  CBS domain-containing protein  32.03 
 
 
145 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0778  signal transduction protein  34.23 
 
 
140 aa  59.3  0.00000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0404956 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  34.43 
 
 
155 aa  59.3  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2219  CBS domain containing protein  31.97 
 
 
145 aa  58.9  0.00000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.338208  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7035  CBS domain-containing protein  35.48 
 
 
150 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.819335  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  30.77 
 
 
215 aa  58.2  0.00000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2731  CBS domain containing membrane protein  32.81 
 
 
214 aa  58.2  0.00000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0420  signal-transduction protein  37.5 
 
 
158 aa  57.8  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1449  signal transduction protein  31.67 
 
 
153 aa  57.8  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2231  signal-transduction protein  29.25 
 
 
188 aa  57  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.943647  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3826  putative signal transduction protein with CBS domains  36.36 
 
 
120 aa  57  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.950929 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0822  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  28.81 
 
 
603 aa  56.6  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0225  CBS domain-containing protein  32.79 
 
 
145 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.791993 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0967  hypothetical protein  25.44 
 
 
281 aa  56.2  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3292  signal transduction protein  32.79 
 
 
142 aa  56.6  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0695  putative signal-transduction protein with CBS domains  29.51 
 
 
140 aa  56.2  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0173289  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>