More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0283 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0283  putative signal-transduction protein with CBS domains  100 
 
 		 148 aa  303  4.0000000000000004e-82  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.974941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0247  putative signal-transduction protein with CBS domains  89.19 
 
 		 148 aa  278  2e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.414289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0126  CBS  85.14 
 
 		 148 aa  271  2.0000000000000002e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0178  signal-transduction protein  85.14 
 
 		 148 aa  271  3e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1996  CBS  85.14 
 
 		 148 aa  266  8e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2345  putative signal-transduction protein with CBS domains  83.78 
 
 		 148 aa  266  1e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2718  putative signal-transduction protein with CBS domains  80.41 
 
 		 150 aa  262  1e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0307  signal-transduction protein  51.77 
 
 		 147 aa  161  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.400951 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0804  CBS domain containing protein  46.67 
 
 		 208 aa  106  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2061  protein of unknown function CP12  42.28 
 
 		 203 aa  100  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.419662 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4660  CBS domain-containing protein  41.32 
 
 		 199 aa  99  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4391  CBS domain-containing protein  42.86 
 
 		 204 aa  98.2  4e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2130  CBS domain containing protein  40.16 
 
 		 208 aa  94.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.418826 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3943  CBS domain-containing protein  38.89 
 
 		 197 aa  92.8  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00933631 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3706  CBS domain containing protein  37.7 
 
 		 208 aa  85.5  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.312715  normal  0.158217 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3652  CBS domain containing protein  37.7 
 
 		 208 aa  85.5  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004143  hypothetical protein  32.77 
 
 		 135 aa  79.3  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3468  signal-transduction protein  36 
 
 		 129 aa  80.1  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0167  hypothetical protein  33.33 
 
 		 132 aa  79  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.457357  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1223  signal-transduction protein  31.93 
 
 		 134 aa  75.9  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.173685 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0804  putative signal transduction protein with CBS domains  31.01 
 
 		 129 aa  70.9  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1594  signal-transduction protein  32.77 
 
 		 135 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0784  signal-transduction protein  28.35 
 
 		 213 aa  70.1  0.000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26594 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1950  CBS domain-containing protein  29.91 
 
 		 131 aa  70.1  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.675111  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1242  signal-transduction protein  28.26 
 
 		 213 aa  69.7  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1829  signal transduction protein  31.4 
 
 		 135 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0766712  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1090  putative signal transduction protein with CBS domains  28.12 
 
 		 130 aa  68.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1500  signal transduction protein  33.06 
 
 		 134 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.722324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0661  signal-transduction protein  30.47 
 
 		 129 aa  67.8  0.00000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0346092  normal  0.201572 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3476  signal-transduction protein  29.46 
 
 		 136 aa  65.9  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.52358 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1304  signal-transduction protein  32.81 
 
 		 148 aa  64.7  0.0000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000185547 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0013  signal-transduction protein  33.6 
 
 		 147 aa  64.3  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.371187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3328  putative signal transduction protein with CBS domains  31.15 
 
 		 212 aa  63.9  0.0000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2274  signal-transduction protein  29.41 
 
 		 134 aa  62.8  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000468461  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0214  putative signal transduction protein with CBS domains  31.75 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0152  signal transduction protein  31.13 
 
 		 160 aa  62.4  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0673  signal-transduction protein  29.27 
 
 		 165 aa  61.2  0.000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02457  hypothetical protein  27.82 
 
 		 626 aa  60.8  0.000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4216  Chloride channel core  30.08 
 
 		 863 aa  60.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.298005 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  26.89 
 
 		 147 aa  60.5  0.000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1768  signal-transduction protein  30.97 
 
 		 131 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00805181  normal  0.187228 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0262  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  26.36 
 
 		 586 aa  60.5  0.000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.141081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1794  signal-transduction protein  35.66 
 
 		 187 aa  60.5  0.000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.190963  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0310  hypothetical protein  31.45 
 
 		 284 aa  59.7  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  28 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003608  Signal transduction protein  27.27 
 
 		 626 aa  58.9  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0100  putative cyclic nucleotide binding protein  30.08 
 
 		 626 aa  59.3  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2102  signal transduction protein  28.47 
 
 		 292 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1198  CBS  33.87 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0272  CBS domain-containing protein  25.37 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4551  putative signal transduction protein with CBS domains  33.93 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.610614  normal  0.0178706 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4418  putative signal-transduction protein with CBS domains  33.93 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.577015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0381  CBS domain-containing protein  35 
 
 		 688 aa  58.2  0.00000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0243844 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2915  Chloride channel core  28.23 
 
 		 897 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0914  putative signal transduction protein with CBS domains  32.56 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0000312526  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2759  signal-transduction protein  24.79 
 
 		 134 aa  57.4  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.210578  normal  0.0235109 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03090  CBS domain-containing protein  28.24 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.17742  hitchhiker  0.000000481482 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  26.89 
 
 		 148 aa  57.4  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2962  putative signal transduction protein with CBS domains  31.03 
 
 		 145 aa  57.4  0.00000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2352  signal-transduction protein  29.06 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.103406  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0340  signal-transduction protein  33.06 
 
 		 120 aa  57  0.00000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0589746  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  29.41 
 
 		 688 aa  57  0.00000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0335  hypothetical protein  27.48 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3316  CBS domain-containing protein  29.84 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0910  hypothetical protein  27.41 
 
 		 637 aa  55.5  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.529281  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0228  CBS domain-containing protein  25.56 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3033  signal-transduction protein  27.87 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0966775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2907  signal-transduction protein  34.53 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.986231 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3292  signal transduction protein  32.77 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1877  Cl- channel voltage-gated family protein  31.34 
 
 		 859 aa  55.5  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1844  CBS domain-containing protein  30.25 
 
 		 688 aa  55.5  0.0000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1141  signal-transduction protein  34.65 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.403559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0420  signal-transduction protein  29.92 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2321  nucleotidyltransferase  27.74 
 
 		 627 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.477711  hitchhiker  0.00895935 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2290  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  22.31 
 
 		 589 aa  54.7  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  29.55 
 
 		 185 aa  54.7  0.0000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  27.27 
 
 		 426 aa  54.3  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0778  signal transduction protein  31.5 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0404956 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1050  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  25.2 
 
 		 600 aa  53.9  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0779  putative signal transduction protein with CBS domains  30.43 
 
 		 272 aa  53.9  0.0000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0978373  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0100  putative signal transduction protein with CBS domains  27.27 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0225  CBS domain-containing protein  25.37 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.791993 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0415  signal-transduction protein  28.47 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.682078  normal  0.0782148 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0568  signal-transduction protein  25.83 
 
 		 133 aa  53.9  0.0000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.706815 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0202  CBS domain-containing protein  25.37 
 
 		 145 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.025801  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2620  CBS domain protein  29.55 
 
 		 146 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  30.67 
 
 		 161 aa  53.5  0.0000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0054  putative signal transduction protein with CBS domains  29.1 
 
 		 292 aa  53.1  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1339  signal-transduction protein  27.42 
 
 		 160 aa  52.8  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.44426 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1150  CBS  29.2 
 
 		 154 aa  53.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0964  hypothetical protein  29.81 
 
 		 217 aa  53.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1447  Cl- channel voltage-gated family protein  30.89 
 
 		 598 aa  53.1  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000054528  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003141  Signal transduction protein  29.63 
 
 		 629 aa  53.5  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7033  signal-transduction protein  29.37 
 
 		 154 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.365249  normal  0.472984 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2672  signal-transduction protein  28.79 
 
 		 615 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1712  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  28.79 
 
 		 615 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  hitchhiker  0.00000133647 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0920  CBS domain-containing protein  28.97 
 
 		 149 aa  52.4  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3605  hypothetical protein  30.16 
 
 		 139 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.103373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1383  signal transduction protein  27.19 
 
 		 282 aa  52.4  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.56563 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1725  signal-transduction protein  29.93 
 
 		 155 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467768 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>