More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_1712 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009092  Shew_2369  cyclic nucleotide-binding protein  74.47 
 
 
615 aa  972    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1697  CBS domain-containing protein  77.4 
 
 
615 aa  1008    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2856  CBS domain-containing protein  90 
 
 
620 aa  1168    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2672  signal-transduction protein  99.67 
 
 
615 aa  1266    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1751  cyclic nucleotide-binding protein  76.1 
 
 
615 aa  995    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0246988 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2751  CBS domain-containing protein  99.67 
 
 
615 aa  1268    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0342062 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1515  cyclic nucleotide-binding protein  90.97 
 
 
620 aa  1177    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0149843 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1582  cyclic nucleotide-binding protein  90.97 
 
 
620 aa  1177    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0380043 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1712  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  100 
 
 
615 aa  1269    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  hitchhiker  0.00000133647 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2835  CBS domain-containing protein  77.4 
 
 
615 aa  1008    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00609535 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1548  cyclic nucleotide-binding protein  77.07 
 
 
615 aa  1003    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2357  cyclic nucleotide-binding protein  93.82 
 
 
615 aa  1204    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1576  cyclic nucleotide-binding protein  91.45 
 
 
620 aa  1184    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00132625 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1524  CBS domain-containing protein  74.8 
 
 
618 aa  984    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0264  signal protein  60.98 
 
 
614 aa  769    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2637  signal-transduction protein  99.35 
 
 
615 aa  1262    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0699  CBS domain-containing protein  39.46 
 
 
625 aa  456  1e-127  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0116377  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1043  cyclic nucleotide-binding protein  38.9 
 
 
624 aa  447  1.0000000000000001e-124  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0051  cyclic nucleotide-binding protein  36.9 
 
 
629 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01888  hypothetical protein  37.02 
 
 
629 aa  437  1e-121  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0910  hypothetical protein  37.9 
 
 
637 aa  434  1e-120  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.529281  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003141  Signal transduction protein  36.23 
 
 
629 aa  428  1e-118  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1811  cyclic nucleotide-binding protein  35.7 
 
 
625 aa  425  1e-117  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003608  Signal transduction protein  35.94 
 
 
626 aa  421  1e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4954  CBS domain-containing protein  34.51 
 
 
624 aa  416  9.999999999999999e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0100  putative cyclic nucleotide binding protein  34.94 
 
 
626 aa  413  1e-114  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2504  cyclic nucleotide-binding protein  35.43 
 
 
628 aa  415  1e-114  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2321  nucleotidyltransferase  34.85 
 
 
627 aa  412  1e-113  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.477711  hitchhiker  0.00895935 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02457  hypothetical protein  35.52 
 
 
626 aa  412  1e-113  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4338  CBS domain-containing protein  36.07 
 
 
618 aa  409  1e-113  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0575  signal transduction protein  35.66 
 
 
606 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.513215  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0967  nucleotidyltransferase  34.57 
 
 
641 aa  409  1.0000000000000001e-112  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.151654 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2228  cyclic nucleotide-binding protein  35.82 
 
 
606 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.480608  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0506  CBS domain-containing protein  35.66 
 
 
606 aa  402  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.413474  normal  0.25412 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4543  CBS domain-containing protein  35.35 
 
 
639 aa  397  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.661781  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3713  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  36.95 
 
 
613 aa  394  1e-108  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000235103  unclonable  0.0000000288509 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0267  cyclic nucleotide-binding protein  33.28 
 
 
625 aa  388  1e-106  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3932  CBS domain-containing protein  36.9 
 
 
623 aa  382  1e-105  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.177243  normal  0.11098 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3667  cyclic nucleotide-binding protein  35.06 
 
 
606 aa  380  1e-104  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.773951  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0528  signal-transduction protein  35.4 
 
 
611 aa  380  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.766846  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0978  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  34.76 
 
 
635 aa  377  1e-103  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.082367  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3131  cyclic nucleotide-binding domain (cNMP-BD) protein  33.92 
 
 
633 aa  375  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00722  Signaling protein with a cAMP-binding, CBS domains and predicted nucleotidyltransferase domain  36.39 
 
 
613 aa  372  1e-102  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0837  cyclic nucleotide-binding protein  32.58 
 
 
629 aa  369  1e-101  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2007  CBS domain-containing protein  35.58 
 
 
623 aa  370  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232416  decreased coverage  0.00139706 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3557  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  35.66 
 
 
605 aa  366  1e-100  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0302  signal-transduction protein  32.31 
 
 
648 aa  367  1e-100  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4553  cyclic nucleotide-binding protein  34.78 
 
 
603 aa  367  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.984926  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1296  hypothetical protein  35.09 
 
 
601 aa  358  1.9999999999999998e-97  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.922257  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1584  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  35.83 
 
 
606 aa  338  1.9999999999999998e-91  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0450512 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2113  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  33.79 
 
 
644 aa  332  1e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000925  Signal transduction protein  30.55 
 
 
622 aa  331  2e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.334534  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0554  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  32.85 
 
 
637 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1866  cyclic nucleotide-binding protein  33.55 
 
 
615 aa  318  2e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.450839  normal  0.446941 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0629  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.6 
 
 
667 aa  303  5.000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1635  cyclic nucleotide-binding/CBS/putative nucleotidyltransferase  30.65 
 
 
646 aa  297  3e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.5663  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1266  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  30.27 
 
 
649 aa  286  7e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2478  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  30.81 
 
 
642 aa  286  9e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00776763 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3753  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  31.55 
 
 
601 aa  278  2e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.53341  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3695  cyclic nucleotide-binding protein  31.24 
 
 
603 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3836  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  31.39 
 
 
601 aa  276  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1025  cyclic nucleotide-binding protein  29.32 
 
 
645 aa  274  3e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0818  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  32.01 
 
 
603 aa  273  9e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.410169  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0769  hypothetical protein  33.21 
 
 
574 aa  272  1e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.463827  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0822  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  31.85 
 
 
603 aa  272  2e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2480  CBS domain-containing protein  28.01 
 
 
639 aa  271  2.9999999999999997e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.218166  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0770  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.85 
 
 
603 aa  270  5.9999999999999995e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.461269  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1304  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  29.54 
 
 
650 aa  267  5e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333083  normal  0.600467 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0090  CBS signal-transduction protein  28.8 
 
 
629 aa  267  5e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.382061 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0903  cyclic nucleotide-binding protein  29.05 
 
 
638 aa  267  5e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1034  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  29.42 
 
 
660 aa  266  8.999999999999999e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0124015 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0817  CBS domain-containing protein  32.17 
 
 
603 aa  266  1e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.175091 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2583  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  28.59 
 
 
648 aa  264  3e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3158  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29.82 
 
 
596 aa  263  6e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.664732  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0380  CBS domain-containing protein  28.91 
 
 
645 aa  261  3e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.488205  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4030  CBS domain-containing protein  29.21 
 
 
641 aa  261  3e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.210383  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1863  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  29.86 
 
 
625 aa  259  8e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0994673  normal  0.46863 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5185  cyclic nucleotide-binding (cNMP-bd) protein  27.88 
 
 
646 aa  258  2e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.255954  normal  0.285696 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0354  CBS domain-containing protein  28.59 
 
 
645 aa  258  3e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.466174 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05910  cyclic nucleotide-binding protein  27.52 
 
 
645 aa  257  4e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0914238  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2052  cyclic nucleotide-binding protein  28.08 
 
 
663 aa  257  4e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.19282 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4848  CBS domain-containing protein  28.59 
 
 
645 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.602391  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3274  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  29.98 
 
 
596 aa  253  6e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.877425  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3143  CBS domain-containing protein  30.08 
 
 
601 aa  253  7e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0382  CBS domain-containing protein  28.32 
 
 
645 aa  251  3e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.263171 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4097  CBS domain-containing protein  27.05 
 
 
643 aa  251  4e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4152  signal-transduction protein  32.48 
 
 
486 aa  250  4e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.729428 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4702  cyclic nucleotide-binding/CBS:putative nucleotidyltransferase  27.33 
 
 
644 aa  250  5e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1009  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.37 
 
 
649 aa  250  7e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.959275  normal  0.0476299 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2028  signal-transduction protein  33.77 
 
 
481 aa  248  2e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.240016 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1568  cyclic nucleotide-binding protein  29.18 
 
 
634 aa  246  9.999999999999999e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0471  nucleotidyltransferase, putative  27.38 
 
 
622 aa  244  3e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3824  CBS domain-containing protein  29.58 
 
 
605 aa  238  3e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00664828 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1022  cyclic nucleotide-binding protein  27.27 
 
 
613 aa  232  2e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2620  putative signal transduction protein with CBS domains  31.66 
 
 
480 aa  230  5e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0774627  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1849  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  28.38 
 
 
633 aa  228  4e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1809  putative signal-transduction protein with CBS domains  31.56 
 
 
478 aa  224  4e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3142  CBS domain-containing protein  28.22 
 
 
608 aa  217  4e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1543  putative signal-transduction protein with CBS domains  25.08 
 
 
600 aa  217  4e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00292919  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2002  cyclic nucleotide-binding protein  25.51 
 
 
641 aa  213  7.999999999999999e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>